共用機器センターでは、利用者自身が自ら機器を操作して測定を行うユーザー測定を推奨しています。これにより、機器の利用率が向上し、測定料金も安価に設定できます。

センター内に「設備サポート室」を設け、研究設備の共用環境の整備支援と、それを活用する人材の育成などを行っています。これは文部科学省が推進する「設備サポートセンター整備事業」の一環です。