El 23 d'agost de 2016, l'Acadèmia del Cinema Europeu va publicar la llista de selecció de 50 pel·lícules, per a les quals els vint països amb més membres de l'acadèmia podien votar directament una pel·lícula cadascun, mentre que la resta eren decidides pel comitè de selecció de l'EFA. La llista de nominats al premi es va donar a conèixer el 6 de novembre de 2016 al Festival de Cinema Europeu de Sevilla.[3] Els curtmetratges van entrar a la categoria de millor curtmetratge europeu en l'ordre cronològic de cada festival de cinema nominat.
El 2016, l'Acadèmia de Cinema Europea va fer diversos canvis. Per tal de centrar l'atenció en una professió cinematogràfica important, el ventall de premis es va ampliar a set amb una categoria, és a dir, el millor artista europeu de perruqueria i maquillatge, en què un jurat especial de set membres decideix a quins creadors tècnics i artístics de la pel·lícula se'ls reconeix el Premi de Cinema Europeu d'una selecció realitzada.[4] La composició professional del jurat de set membres el 2016 va ser la següent: un director de fotografia, un muntador de cinema, un dissenyador visual, un dissenyador de vestuari, un perruquer i maquillador, un compositor i un dissenyador de so.
Com a conseqüència de l'ampliació, el nombre de premis de cinema europeu es va incrementar fins a 22, dins dels quals el nombre de premis votats directament pels membres acadèmics serà de deu, i els atorgats pel jurat especial serà de set, que es complementaran amb els dos premis del públic i tres reconeixements addicionals atorgats per la junta directiva.
Per tal de donar més temps als membres de l'acadèmia per votar, aquest any s'ha canviat la data límit per a la nominació de pel·lícules per a la selecció preliminar, del 15 de juny al 31 de maig. Paral·lelament, s'ha avançat un mes la data de la "primera projecció oficial" de les pel·lícules: a partir del 2016, en comptes de l'1 de juliol anterior, l'1 de juny serà la data d'inici de la presentació pública de les pel·lícules que poden ser nominades per als premis de l'any següent.
La pel·lícula més nominada va ser Toni Erdmann amb cinc nominacions (millor pel·lícula, director, actriu, actor i guió), seguida de I, Daniel Blake amb quatre i Julieta de Pedro Almodóvar amb tres.[5] La gran guanyadora va ser Toni Erdmann, que va guanyar els cinc premis de les categories a les que estava nominada. L'actor espanyol Javier Cámara havia estat nominat al premi al millor actor per Truman, però no va obtenir el premi.[6][7]
Pel que fa als premis honoraris, l'actor irlandès Pierce Brosnan va rebre el premi al mèrit europeu,[8] mentre que l'actor i guionista francès Jean-Claude Carrière va rebre el premi a la trajectòria,[9] i el director polonès Andrzej Wajda va rebre a títol pòstum el Premi d'Honor del President i la Junta de l'EFA.[10] A la gala Alekhina, membre de Pussy Riot, va tenir un record pel director ucraïnès Oleh Sentsov, empresonat a Rússia per dissidència política.[11]
Els nominats es van anunciar el 25 d'octubre de 2016. Dues pel·lícules nominades a la millor pel·lícula d'animació es van estrenar al Festival de Canes. Una pel·lícula (La vida d'en Carbassó) ha estat presentada a l'Oscar a la millor pel·lícula de parla no anglesa als 89ns Premis de l'Acadèmia. La vida d'en Carbassó també a la selecció oficial per al Premi LUX del Parlament Europeu.[13]
L'anunci de les cinc nominacions als Premis de Cinema Universitari Europeu va tenir lloc durant el Filmfest Hamburg el 5 d'octubre de 2016. Les pel·lícules van ser seleccionades per: Feo Aladag (director/Alemanya), Dagmar Brunow (acadèmic, Universitat Linnaeus/Suècia), Luis Martínez López (periodista, EL MUNDO/Espanya), Myroslav Slaboshpytskiy (director/Ucraïna) i Patrick Sobelman (productor/França). Es van projectar i discutir cinc pel·lícules nominades a les classes respectives i cada universitat va votar la seva pel·lícula preferida.
Van participar les següents 13 universitats de 13 països europeus:
República Txeca: Universitat Carles/Praga
França: Université Sorbonne Nouvelle Paris 3
Alemanya: Universitat de Rostock
Grècia: Universitat de l'Egeu/Mytilini (Lesbos)
Hongria: Universitat Catòlica Péter Pázmány/Budapest
)
Cristian Mungiu
Paul Verhoeven
Valeria Bruni Tedeschi
Trine Dyrholm
Tomasz Wasilewski
Ilya Demutsky
Líban / 
Kosovo / 
Xile / 
Lituània
Maren Ade, millor pel·lícula, director i guionista
Hannes Holm, millor comèdia
Sandra Hüller, millor acriu
Peter Simonischek, millor actor
Claude Barras, millor pel·lícula d’animació
Małgorzata Szumowska, premi del públic
Ken Loach, premi universitari
Gianfranco Rosi, millor documental
Ilia Demiutski, millor música
Pierce Brosnan, mèrit europeu
Jean-Claude Carrière, premi a la trajectòria
Andrzej Wajda, premi especial
