Papers by Florence Valence
ISME Communications, Jan 11, 2024
HAL is a multidisciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific re... more HAL is a multidisciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific research documents, whether they are published or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers. L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés. Distributed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Jul 1, 2022
Le système de management de la qualité d'une structure est un outil d'appui au pilotage. Cet arti... more Le système de management de la qualité d'une structure est un outil d'appui au pilotage. Cet article présente plusieurs systèmes déployés, ou en cours d'élaboration, dans les centres de ressources biologiques de l'Infrastructure de Recherche RARe. Ils constituent un panel des situations existantes dans chacun des cinq piliers (animal, environnement, forêt, microorganisme et plante), et présentent la diversité existante en termes de maturité, de normes de certification, de contextes spécifiques. Pour chacun des cas présentés, nous analysons les bénéfices perçus et les difficultés traversées. La reconnaissance externe du niveau d'organisation qu'apporte la certification est un attendu de l'infrastructure de recherche. C'est pourquoi elle propose aux centres de ressources biologiques des animations pour favoriser le partage d'expériences et la montée en compétences des collectifs. MOTS-CLÉS Système de management de la qualité, centre de ressources biologiques, RARe, diversité biologique, infrastructure de recherche, normes, ISO 9001.
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Jul 21, 2022
Enrichir les catalogues des CRB : l'exemple des collections microbiennes des Centres de ressource... more Enrichir les catalogues des CRB : l'exemple des collections microbiennes des Centres de ressources biologiques du CIRM CORRESPONDANCE
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Jun 8, 2022
Fermentation of Chlorella vulgaris, a microalga used in human food, by 89 strains of lactic bacte... more Fermentation of Chlorella vulgaris, a microalga used in human food, by 89 strains of lactic bacteria. CONTEXT & AIM STRATEGY RESULTS ✓ Microalgua are photosynthetic unicellular organisms rich in nutriments, constituting a biomass with high potential for food applications. Microscopic observations (X100) of a non-inoculated suspension of C. vulgaris at T0 (A) and after 24 hours (B) of incubation at 30°C. Blue arrows indicate Chlorella vulgaris and red arrow shows native spoilage flora. ➢ A native flora was present in the suspension of Chlorella vulgaris around 3 log 10 CFU/ml at T0, enumerated on BHI-YE. ➢ The spoilage flora was identified by sequencing of DNAr16S as Bacillus sp. ➢ After 24h of incubation at 30°C, the concentration of the native flora reached 8 log 10 CFU/ml in the non-inoculated suspension. ➢ When the algal suspension was inoculated with LAB, the spoilage flora was not enumerated on BHI-YE (data not shown). ✓ We confirmed the ability of LAB to ferment a freeze-dried Chlorella vulgaris biomass. To our knowledge, this is the first study of microalgae fermentation by such a large number of LAB strains. ✓ The LAB were able to inhibit the native spoilage flora, identified as the genus Bacillus sp.. ✓ The addition of glucose allowed to optimize the acidification rate with a targeted pH around 4.5 after 24h of fermentation. ✓ Work is in progress to extend the screening to other freeze-dried microalgae species as well as to fresh microalgae supensions.
Current Microbiology, Jun 29, 2016
The milk produced in regions with different traditions in Brazil is used for artisanal product pr... more The milk produced in regions with different traditions in Brazil is used for artisanal product production, which is characterized by different sensorial characteristics. This study aimed to identify the bacterial ecosystem of farms located in a traditional dairy region in the state of Minas Gerais and to characterize Lactococcus lactis strains, the species of interest in this study, using a multilocus sequence typing (MLST) protocol and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) technique. Samples were collected from raw milk and dairy environment from six farms. A total of 50 isolates were analyzed using 16S rRNA sequencing and species-specific PCR. Five genera were identified: Lactobacillus, Leuconostoc, Lactococcus, Enterococcus, and Staphylococcus, from ten different species. MLST (with six housekeeping genes) and PFGE (with SmaI endonuclease) were used for the characterization of 20 isolates of Lactococcus lactis from a dairy collection in this study. Both methods revealed a high clonal diversity of strains with a higher discriminatory level for PFGE (15 pulsotypes), compared to MLST (12 ST). This study contributes to the preservation of the Brazilian dairy heritage and provides insights into a part of the LAB population found in raw milk and dairy environment.
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Jul 6, 2021
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Nov 16, 2022
HAL is a multidisciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific re... more HAL is a multidisciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific research documents, whether they are published or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers. L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés. Distributed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License
Springer eBooks, Jun 28, 2006
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), May 24, 2018
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Sep 29, 2015
International audienc
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Mar 22, 2019
Molecular Ecology, Aug 12, 2022
Current Microbiology, Jul 3, 2019
Fermented cereals are part of the main traditional diets of many people in Africa, usually obtain... more Fermented cereals are part of the main traditional diets of many people in Africa, usually obtained from artisanal production. The intensification of their manufacturing, responding to the consumers demand, requires a better control to ensure their sanitary, nutritional, and taste qualities, hence, the need of selecting accurate and safe starter cultures. In the present study, 48 lactic acid bacteria (LAB) strains, previously isolated from Algerian fermented wheat lemzeiet, were analyzed for different technological properties. 14 LAB strains, belonging to Pediococcus pentosaceus, Enterococcus faecium, Lactobacillus curvatus, Lactobacillus brevis, and Leuconostoc mesenteroides species, decreased rapidly the pH of the flour extract broth close to 4 or below. 91% of strains showed extracellular protease activity, but only 12% were amylolytics. 18 LAB strains inhibited or postponed the growth of three fungal targets Rhodotorula mucilaginosa UBOCC-A-216004, Penicillium verrucosum UBOCC-A-109221, and Aspergillus flavus UBOCC-A-106028. The strains belonging to Lactobacillus spp., Leuconostoc fallax, L. mesenteroides, and Weissella paramesenteroides were the most antifungal ones. Multiplex PCR for biogenic amines' production did not reveal any of the genes involved in the production of putrescine, histamine, and tyramine for 17 of the 48 strains. The obtained results provided several candidates for use as starter culture in the future production of lemzeiet.
Chez lactobacillus helveticus et propionibacterium freudenreichii, deux bacteries impliquees dans... more Chez lactobacillus helveticus et propionibacterium freudenreichii, deux bacteries impliquees dans la fabrication et l'affinage de l'emmental, l'essentiel des enzymes participant a la maturation de ce produit sont intracellulaires. Leur liberation par autolyse est donc susceptible d'avoir un impact sur la vitesse et la qualite de l'affinage. Trois series de fabrications d'emmental (echelle 1/100#e) ont ete realisees avec des souches industrielles de l. Helveticus et p. Freudenreichii. Des marqueurs de lyse espece-specifique et leur detection immunologique dans les extraits aqueux de fromage ont ete mis au point : la dipeptidase pepd pour l. Helveticus et la methylmalonylcoenzymea mutase (mmcoa) pour p. Freudenreichii. L'autolyse de l. Helveticus a ete demontree : chute de viabilite, bacilles endommages en microscopie electronique, et apparition dans le fromage de la pepd, ainsi que d'une autre enzyme cytoplasmique, la lactate deshydrogenase. L'autolyse survient des la fin du pressage. La precocite et l'ampleur de la lyse sont apparus clairement souche-dependant. Les peptidases de l. Helveticus liberees suite a l'autolyse restent actives a l'etat libre plusieurs semaines. L'autolyse de l. Helveticus a ete egalement montree dans des fromages a pate presse cuite commerciaux, soutenant l'idee du caractere general du phenomene dans l'affinage de ces fromages. Plusieurs autolysines ont ete extraites a partir de la paroi de l helveticus islc5 : a 43. 2 kda et b32. 8 kda. La specificite dominante impliquee dans l'hydrolyse des parois est une n-acetylmuramidase. Ces enzymes ont ete etudiees par electrophorese dite renaturante (sds-page suivi d'une renaturation en presence de triton x100) et ont ete purifiees par electrophorese preparative. A est presente dans les parois de cellules en croissance et pourrait etre impliquee dans le phenomene de division cellulaire ; b reste associee aux cellules mortes apres la croissance maximale. A et b sont presentes chez 34 autres souches de l. Helveticus demontrant la forte conservation de ces enzymes au sein de l'espece. L'autolyse de p. Freudenreichii dans le fromage est d'ampleur limitee et survient apres l'affinage, pendant la periode de stockage au froid des fromages ; sa demonstration repose principalement sur l'apparition de mmcoa.
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Nov 8, 2022
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), 2010
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Nov 17, 2015
Le lait est un aliment tres riche (proteines, sucres) extremement favorable au developpement de n... more Le lait est un aliment tres riche (proteines, sucres) extremement favorable au developpement de nombreuses especes de microorganismes incluant les bacteries, les levures et les champignons filamenteux. Il est tres vite contamine a la sortie du trayon par une importante diversite microbienne (microorganismes pathogenes et d'alteration mais aussi microorganismes "utiles"). Les microorganismes que l'on retrouve dans le lait proviennent majoritairement de l'environnement lie au lieu de collecte et de transformation. La diversite microbienne des laits est tres grande : diversite de genres et d'especes mais aussi des souches au sein d'une espece donnee (diversite intra-specifique). On observe, parallelement a l'amelioration des pratiques d'hygiene au sein des lieux de collecte et de transformation des laits, une baisse globale de la diversite microbienne presente dans le lait. Cette baisse de diversite concerne l'ensemble des microorganismes, les pathogenes mais aussi les microorganismes utiles qui, dans le cas des produits laitiers fermentes, peuvent selon les technologies de transformation employees, jouer un role important dans la typicite et les caracteristiques final des produits fabriques. La conservation de ces microorganismes d'interet au sein de structures dediees, les Centres de Ressources Biologiques (CRB), presente des lors un enjeu majeur. Sachant, qui plus est, que bon nombre des proprietes technologiques et pathogenes des souches, sinon toutes, sont souches dependantes, la diversite-intra specifique doit etre prise en compte dans le choix des ressources microbiennes a preserver au sein de ces CRB. Les CRB microbiens ont pour role de conserver, identifier, diffuser et valoriser les ressources microbiennes. Ils ont un role patrimonial et doivent rendre ces ressources accessibles a l'ensemble des communautes scientifiques et industrielles a des fins de recherche et de valorisation. Ils doivent garantir la tracabilite et la fiabilite des donnees associees aux souches mais aussi garantir que la reglementation internationale liees a ces souches est respectee (Convention sur la Diversite Biologique et Protocole de Nagoya). L'existence de CRB thematiques, centres sur une categorie de ressources microbienne en lien avec une application potentielle, qui prennent en compte la diversite intra-specifique, est essentielle. En permettant le criblage de la diversite microbienne ils sont des acteurs majeurs de l'innovation. Ils sont de ce fait complementaires des grandes collections de microorganismes de renommee europeenne ou internationales qui regroupent l'ensemble des souches type de microorganismes.
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Mar 19, 2019
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