EPCAM

EPCAM
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4MZV
Ідентифікатори
Символи	EPCAM, DIAR5, EGP-2, EGP314, EGP40, ESA, HNPCC8, KS1/4, KSA, M4S1, MIC18, MK-1, TACSTD1, TROP1, epithelial cell adhesion molecule, BerEp4, MOC-31, Ber-Ep4
Зовнішні ІД	OMIM: 185535 MGI: 106653 HomoloGene: 1764 GeneCards: EPCAM
Пов'язані генетичні захворювання
	congenital diarrhea 5 with tufting enteropathy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0032403 protein-containing complex binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cadherin binding involved in cell-cell adhesion;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • lateral plasma membrane; • мембрана; • bicellular tight junction; • клітинна мембрана; • cell surface; • міжклітинні контакти; • basolateral plasma membrane; • apical plasma membrane; • екзосома; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• ureteric bud development; • positive regulation of cell motility; • negative regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin; • signal transduction involved in regulation of gene expression; • negative regulation of apoptotic process; • stem cell differentiation; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of stem cell proliferation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • leukocyte migration; • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4072
	17075
	ENSG00000119888
	ENSMUSG00000045394
	P16422
	Q99JW5
	NM_002354
	NM_008532
	NP_002345
	NP_032558
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EPCAM (англ. Epithelial cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 34 932^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPPQVLAFG	LLLAAATATF	AAAQEECVCE	NYKLAVNCFV	NNNRQCQCTS
VGAQNTVICS	KLAAKCLVMK	AEMNGSKLGR	RAKPEGALQN	NDGLYDPDCD
ESGLFKAKQC	NGTSMCWCVN	TAGVRRTDKD	TEITCSERVR	TYWIIIELKH
KAREKPYDSK	SLRTALQKEI	TTRYQLDPKF	ITSILYENNV	ITIDLVQNSS
QKTQNDVDIA	DVAYYFEKDV	KGESLFHSKK	MDLTVNGEQL	DLDPGQTLIY
YVDEKAPEFS	MQGLKAGVIA	VIVVVVIAVV	AGIVVLVISR	KKRMAKYEKA
EIKEMGEMHR	ELNA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chong J.M., Speicher D.W. (2001). Determination of disulfide bond assignments and N-glycosylation sites of the human gastrointestinal carcinoma antigen GA733-2 (CO17-1A, EGP, KS1-4, KSA, and Ep-CAM). J. Biol. Chem. 276: 5804—5813. PMID 11080501 DOI:10.1074/jbc.M008839200
Muenz M., Zeidler R., Gires O. (2005). The tumour-associated antigen EpCAM upregulates the fatty acid binding protein E-FABP. Cancer Lett. 225: 151—157. PMID 15922867 DOI:10.1016/j.canlet.2004.11.048
Munz M., Fellinger K., Hofmann T., Schmitt B., Gires O. (2008). Glycosylation is crucial for stability of tumour and cancer stem cell antigen EpCAM. Front. Biosci. 13: 5195—5201. PMID 18508581 DOI:10.2741/3075
Ng V.Y., Ang S.N., Chan J.X., Choo A.B. (2010). Characterization of epithelial cell adhesion molecule as a surface marker on undifferentiated human embryonic stem cells. Stem Cells. 28: 29—35. PMID 19785009 DOI:10.1002/stem.221
Perez M.S., Walker L.E. (1989). Isolation and characterization of a cDNA encoding the KS1/4 epithelial carcinoma marker. J. Immunol. 142: 3662—3667. PMID 2469722

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EPCAM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11529 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-07-02 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P16422 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з EPCAM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11529 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-07-02 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P16422 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Література

Примітки

Див. також

Pfad - The Proxy pFad of © 2024 Garber Painting. All rights reserved.