Saccharomyces Cerevisiae
Saccharomyces Cerevisiae
Saccharomyces Cerevisiae
As, desde fines del siglo XIX se reconocieron algunas de las ventajas que ofrece
el uso de la levadura de pan, Saccharomyces cerevisiae, como modelo biolgico
en la investigacin: por un lado, la facilidad con la que se obtienen grandes
cantidades de este microorganismo; y por otro, el hecho de que S.
cerevisiae posee un ciclo de vida que al incluir una fase sexual (Fig. 3), permite
abordar estudios con las herramientas que provee la gentica formal.
El genoma nuclear
El genoma no-nuclear
La transformacin es un proceso por medio del cual molculas del ADN desnudo
pueden ser introducidas a una clula. La adquisicin de este ADN resulta en un
cambio heredable. Por ejemplo, si nosotros tenemos una clula alterada en un gen
que codifica para una de las enzimas implicadas en la biosntesis de uracilo, y por
tanto es una mutante ura- auxotrofa para uracilo, si logramos introducir dentro de
esta mutante la secuencia silvestre del gen mutado de manera permanente, la cepa
se transformar en URA+ y por tanto ser prottrofa para uracilo.
Los cromosomas eucariotes estn constituidos por fibras de ADN y una variedad
de estudios han demostrado que cada cromosoma est constituido por una sola
doble cadena de ADN (7). Debido a la longitud de los cromosomas, desde hace
mucho tiempo se postul que debera existir un sistema de empaquetamiento
muy eficiente. La mezcla de materiales de los que se componen los cromosomas
se denomina cromatina y est constituida por ADN y protenas. Cuando la
cromatina se extrae y se trata con concentraciones crecientes de sal se pueden
observar, bajo el microscopio electrnico, diferentes grados de compactacin. A
concentraciones bajas de sal se observa una estructura de 10nm de dimetro que
semeja un collar de perlas; dado que el hilo presente entre perla y perla puede ser
digerido con ADNsa, se puede concluir que se trata de ADN. Las perlas del collar
se denominan nucleosomas (Fig. 17), y se ha demostrado que consisten de
protenas llamadas histonas y de ADN. Las histonas se encuentran constituidas
por octmeros conteniendo dos molculas de cada una de las siguientes histonas:
H2A, H2B, H3 y H4; y el ADN se encuentra enrollado alrededor del octmero
(Fig. 17). Cuando se utiliza una mayor concentracin de sal para extraer la
cromatina, se identifica una estructura llamada solenoide, que tiene 30 nm de
dimetro y cuya conformacin se mantiene por medio de la histona H1 (Fig. 18).
A su vez, los solenoides se organizan en asas que se encuentran ancladas a un
andamiaje, por medio de secuencias de ADN denominadas regiones de unin al
andamiaje (Fig. 19) (7). Es evidente, que la organizacin nucleosomal del ADN
constituye una barrera fsica que debe ser vulnerada para que el aparato
transcripcional pueda interaccionar con el ADN.
Cromosomas artificiales
Una estrategia que se ha utilizado para asignar una funcin a un ORF dado, es la
de estudiar su secuencia y tratar de predecir, en base a comparaciones con
secuencias de otros genes, cual podra ser su funcin. Sin embargo existen genes
cuya funcin no se conoce, a pesar de que se han estudiado por dcadas y se han
hecho estudios genticos exhaustivos, y cuando se analiza su secuencia sta no
presenta una homologa significativa con secuencias previamente identificadas, y
por tanto no es posible asignarles una funcin utilizando este criterio. En otros
casos, an cuando algunos ORFs tengan homologa significativa con secuencias
encontradas en las bases de datos, sto no es suficiente para determinar el papel
real de dicha protena. Una estrategia que se ha desarrollado ha sido el estudio de
la expresin de todos los ORFs de levadura de manera eficiente y sistemtica (5).
Para este efecto, se cuenta con la coleccin completa de todos los ORFs que
constituyen el genoma de la levadura. Por medio de un robot se coloca, de
manera ordenada, una pequea gota de cada uno de los ORFs sobre una laminilla
de vidrio (Fig. 24 y 25), esto constituye lo que se denomina un arreglo de genes
(array o microarray). Estos arreglos se utilizan para llevar a cabo hibridizaciones
con una variedad de productos marcados, por ejemplo, cADN obtenido de ARN
mensajero extrado de clulas crecidas en diferentes condiciones. As, si nosotros
obtenemos cADN a partir del ARN mensajero de clulas de levadura cultivadas
de manera independiente en medio rico y en medio rico adicionado de NaCl 1M,
y marcamos cada uno de los dos cADNs con diferentes pseudocolores, podremos
hibridizar nuestra laminilla con una mezcla de ambas poblaciones de cADN. La
laminilla posteriormente se lee por medio de un microscopio de fluorescencia
acoplado a una computadora apropiada, lo que nos permitir generar una
imagen (Fig. 23 y 24). El anlisis de los colores y su intensidad nos permitir
determinar cules de los 5800 ORFs incrementan o disminuyen su expresin
cuando las levaduras se encuentran en presencia de sal. As se ha iniciado el
estudio de la funcin de genes cuya secuencia no presentaba homologa con
genes conocidos, y por ende era imposible asignarles una funcin (16).
Cun veraces son esas aseveraciones? Qu son los radicales libres? Cmo y dnde se
producen? Se puede prevenir o revertir el estrs oxidativo con el empleo de antioxidantes?
Qu consecuencias puede tener para la clula y para un organismo viviente el estrs oxidativo?
El efecto de cualquier tipo de oxidante se contrarresta con cualquier tipo de antioxidante?
Por ltimo, hay fuerte inters en conocer la asociacin entre estrs oxidativo y actividad fsica.
Varios trabajos demuestran que existe induccin de estrs oxidativo en individuos sujetos a
intensa ejercitacin fsica, pero al mismo tiempo se ha comprobado que en estos individuos
aumentan las defensas antioxidantes tanto enzimticas como mediadas por atrapantes de
radicales libres de bajo peso molecular. Por otra parte, se ha comprobado que la actividad fsica
conlleva una variacin en la naturaleza de las lipoprotenas plasmticas, favoreciendo el
contenido del llamado colesterol bueno frente al malo, con la consiguiente disminucin de riesgo
coronario. Hay varios trabajos que demuestran la implicancia de la peroxidacin lipdica de las
fracciones proaterognicas en el desarrollo de la aterosclerosis, la cual podra prevenirse, por lo
tanto, mediante un adecuado entrenamiento fsico.
El estrs oxidativo
El estado de xido - reduccin de la clula est determinado por el equilibrio entre las contrapartes
oxidadas y reducidas de los distintos compuestos biolgicos presentes en ella, principalmente de
aquellos que se encuentran en mayor proporcin. El tripptido glutation (GSH, g-L-glutamil-L-
cisteinil-glicina), debido a su alta concentracin intracelular (5-10 mM), se considera un regulador
homeosttico del estado de xido- reduccin celular. Este metabolito se encuentra presente en su
forma oxidada en slo un 1 % del total, es decir que predomina ampliamente su forma reducida
(GSH) sobre la oxidada (GSSG). Esto trae como consecuencia que un ligero desplazamiento del
equilibrio hacia la forma oxidada afecta drsticamente el estado de xido-reduccin general,
debido a su participacin en muchos equilibrios de xido reduccin acoplados. En particular esto
es crtico para la regulacin (prendido o apagado) de algunos factores de transcripcin , cuya
actividad depende del estado de xido-reduccin en el que se encuentren. El siguiente esquema
representa los procesos que pueden ocurrir, relacionados al prendido y apagado de genes, bajo
condiciones de estrs (-S* grupo sulfhidrilo modificado):
Cuando un grupo -SH crtico sufre una modificacin oxidativa la protena afectada puede perder su
funcionalidad. La siguiente serie de reacciones muestra los distintos equilibrio en los que puede
participar un residuo cistena:
Las principales especies reactivas del Oxgeno son: el radical superxido (O 2-.), el perxido de
Hidrgeno (H2O2) y el radical oxidrilo (HO.). Una de las principales fuentes de EROs es la cadena
respiratoria, donde pueden ocurrir las siguientes transferencias de electrones:
con la participacin de un complejo de protenas, que por estrs oxidativo sufren modificaciones
conformacionales, exponiendo distintos sitios de interaccin proteica, que le permiten unirse a 2
ferro-protenas integrales de membrana. De esta manera queda formado un complejo proteico con
actividad NADPH-oxidasa (6). La activacin de este complejo est mediada por el sistema Ras.
Las protenas Ras forman parte de una superfamilia de protenas con afinidad por GTP (7).
Cuando Ras se une a GTP, se activa su actividad GTPasa, se hidroliza un fosfato, Ras pierde
afinidad por el nucletido resultante (GDP), y luego por GAP (la protena activante de su actividad
GTPasa). La energa liberada durante este ciclo se usa para producir modificaciones
conformacionales en distintos sistemas proteicos, que conducen a la activacin de complejos
enzimticos. Un ejemplo de este complejo mecanismo es la activacin de la NADPH oxidasa
arriba mencionada, la cual se ha comprobado que, bajo condiciones de estrs oxidativo provocado
por invasin por patgenos, se activa a travs de un mecanismo regulado por Ras. En un medio
aerbico se desarrollarn las siguientes reacciones:
Existen otras dos EROs, con caractersticas especiales: el Oxgeno singulete ( 1O2) y el hipoclorito
(en su forma no protonada ClO- o protonada, llamado tambin cido hidrocloroso).
Esta especie reactiva tiene gran tendencia a reaccionar con molculas orgnicas ya que, al tener
un momento de espn igual a cero, comparte con stas el estado singulete. El 1O2 puede
originarse por transferencia de energa desde otra molcula reactiva, por reacciones fotoqumicas
o por reacciones en ausencia de Oxgeno. Las siguientes ecuaciones representan su formacin en
esta ltima situacin, que ocurre especialmente en neutrfilos, ricos en cloroperoxidasas (que
aceleran la primera reaccin) y en H2O2 (el cosustrato en la segunda reaccin):
H2O2 + OCl- 1
O2 + H2O + Cl-
Se ha demostrado que el 1O2 es un mediador de los efectos citotxicos inducidos por la radiacin
UVA, produciendo activacin del factor de transcripcin AP-2, activa la cascada de seales que
involucra otros factores de la cascada de seales tales como las quinasas de la regin N terminal
de c-Jun (JNK, p38-MAPK y NF-kB), participando en el sistema de transduccin de seales, que
lleva a apoptosis o a recuperacin de la clula , dependiendo del estado inicial de la misma. Entre
los daos a macromolculas que puede ejercer el 1O2 , est el dao al ADN, debido a la oxidacin
de residuos guanina a 7-hidro-8-oxo deoxignanosina (8 oxo-Gu). Este nucletido lleva luego a la
transversin de G:C a T:A, provocando as mutaciones que pueden llevar a la muerte celular.
Las protenas cuya traduccin se ha reportado que es inducida por 1O2 son, entre otras: la
hemooxigenasa 1 (HO-1), la colagenasa instersticial (metaloproteinasa 1, de la matriz o MMP-1),
las interleuquinas IL-1 a/be IL-6, la molcula de adhesin intercelular ICAM-1 y el ligando Fas.
La HO (que se induce tambin por radiacin UVA y por H 2O2 y est modulada por niveles de GSH)
cataliza la primera de las siguientes reacciones, que llevan a la produccin de dos especies
antioxidantes, la bilirrubina y la biliverdina:
Otra fuente de EROs est relacionada a la cupla xantino/xantino oxidasa (oxidasas catablicas,
presentes en los peroxisomas) (10). La acumulacin de hipoxantina y xantina, bajo condiciones
anaerbicas, de isqumia/reperfusin (deficiencia en la irrigacin sangunea -que empobrece la
llegada de sangre y, por consiguiente, de Oxgeno a un tejido- con posterior reflujo sanguneo y
consecuente afluencia de Oxgeno) o de bajo contenido energtico, puede desembocar en la
produccin de EROS, segn la siguiente cascada de reacciones:
Especies reactivas del Nitrgeno (ERNs)
Las principales ERNs son el xido ntrico (NO.) y el peroxinitrito (ONOO-.) considerado como uno
de los ms potentes oxidantes biolgicos (11). Las ERNs pueden daar y matar clulas por
distintos mecanismos: inactivacin de los distintos complejos de la cadena respiratoria (12), dao
a protenas y a lpidos (3, 4, 13, 14), inhibicin de sntesis proteica o de ADN (15, 16), deplecin de
GSH o de ATP (17, 18).
El ONOO- est en equilibrio con una forma activada de estructura desconocida, que
reacciona con metionina para dar metilsulfxido o, en presencia de CO 2, un derivado con
actividad nitrante de compuestos aromticos (3). La principal fuente de ERNs, en clulas de
mamferos, es la oxidacin enzimtica de L-arginina por la NO sintasa (19).
El NO. es una molcula de seal ubicua, que funciona en la regulacin de distintos procesos en
los sistemas nervioso, cardiovascular e inmune (20, 21). Est asociado a procesos inflamatorios
neurotxicos y de isquemia/reperfusin. Se ha propuesto que el NO . actuara induciendo la
produccin mitocondrial de peroxinitrito. Este producira a su vez la inhibicin del complejo I de la
cadena respiratoria (NADH:Ubiquinona reductasa), lo cual tiene un efecto crtico sobre el
suplemento de energa en varios tejidos (22) y sobre la produccin de EROs. Los efectos del
NO. sobre la generacin de EROs mitocondrial son complejos (11), la produccin de EROs y
ERNs inducida por NO y su posterior modulacin son iniciados por la reaccin entre NO y el
ubiquinol llevando a la formacin y autooxidacin de la ubisemiquinona. Posteriormente se forma
una intrincada red de equilibrios de xido-reduccin, involucrando al ubiquinol, al anin
superxido, al peroxinitrito y al xido ntrico, que cubre un amplio campo en los aspectos
regulatorios y protectores contra el estrs oxidativo. El balance final de dao por estrs oxidativo o
de proteccin por defensas antioxidantes en mitocondrias, depender del contenido de ubiquinol y
de NO en el estado estacionario, del nivel de enzimas antioxidantes y de la extensin de la
inhibicin inducida en el Complejo I en la membrana mitocondrial.
Otro tipo de especies reactivas que se pueden producir durante procesos de estrs oxidativo, son
las llamadas especies bioluminiscentes (BLUE) de larga vida (23). En nuestro laboratorio, en
estudios experimentales de alcoholismo crnico y de intoxicacin crnica con hidrocarburos
aromticos polihalogenados, pudimos comprobar que se generan estas BLUE, cuya deteccin
permite hacer un seguimiento de la evolucin de las patologas asociadas (24). El hecho que
ambos tratamientos producen especies reactivas (24, 25) avalan la hiptesis que las BLUE
provendran del estrs oxidativo desencadenado por este tipo de tratamientos.
Defensas antioxidantes
Si bien todos los organismos vivos soportan numerosos factores endgenos y exgenos de estrs
oxidativo, al mismo tiempo poseen numerosos sistemas de defensas antioxidantes regulables,
enzimticos y no enzimticos.
Existen enzimas que actan especficamente sobre determinadas especies reactivas (5). As, la
superxido dismutasa dismuta (reaccin a travs de la cual dos molculas iguales se transforman
en otras dos molculas distintas) al O2-. a O2 y H2O2, la catalasa transforma al H2O2 en O2 y agua,
la GSHperoxidasa cataliza la reduccin de perxidos (ROOH, inclusive al H 2O2) a alcoholes
(ROH), aprovechando el potencial reductor del GSH. Existen otras enzimas, tales como las
quinonas reductasas y hemo oxigenasa, que pueden prevenir la formacin de EROs, por ciclado
de electrones.
El gen de las SOD, conjuntamente con el de otras protenas sensibles al estrs est regulado por
el reguln SoxRS. Un reguln es un grupo de genes regulados coordinadamente. En el caso del
reguln SoxRS, el factor activante es el aumento en la concentracin del O 2.-. Algunos de los
productos resultantes al activarse SoxRS son: la Mn SOD (enzima encargada de
eliminar O2.-), la Glu 6p deshidrogenasa (que asegura el suplemento de NADPH), la
endonucleasa IV (miembro del sistema de reparacin del ADN daado), la ferredoxina reductasa
(que activa las Fe-S protenas, reparando su centro 4Fe-4S, daado por el estrs oxidativo), la mic
F (disminuye la porosidad de la membrana mitocondrial interna, ayudando as a recomponer el
potencial de membrana). El pptido SoxR, es el sensor de xido-reduccin, que en su estado
oxidado activa a la protena SoxS. La SoxS activa vuelve a unirse al reguln SoxRS, activando su
opern y causando la activacin transcripcional. El reguln SoxRS representa la mitad de la
defensa antiestrs intracelular. Existe otro reguln, el OxyR, que es independiente de SoxRX y
responde al H2O2, dando cuenta del otro 50 % de la defensa antioxidante, desencadenada por
estrs oxidativo.
Algunos metales, tales como el Se y el Zn, por su participacin como cofactores de enzimas
antioxidantes (GPx y SOD citoplasmtica, respectivamente), contribuyen a aumentar las defensas
antioxidantes.
La melatonina (el principal producto de la glndula pineal) es un atrapante de radicales libres ( .OH,
NO. , 1O2 y ONOO-), penetra distintas barreras intracelulares, se acumula en los ncleos,
donde protege al ADN de distintos factores de estrs (efecto de metales, radiaciones ionizantes,
etc.). Entre los distintos tratamientos que se estn aplicando para aminorar o revertir los daos
provocados por el estrs oxidativo, el uso de melatonina parece muy promisorio. Wenbo y col. (27)
probaron los efectos de melatonina, manitol y trolox (atrapante de radicales libres) para inhibir la
formacin de 8OH Gu (indicador de dao al ADN), en un sistema experimental de dao por el
cido d-aminolevlico (dALA), en presencia de hierro. Sus resultados indican que:
Entre las defensas antioxidantes no enzimticas, tiene un lugar predominante el glutation (GSH).
Esta pequea molcula protege a la clula contra diferentes especies oxidantes y se ha
comprobado su participacin clave en numerosos desrdenes neurodegenerativos (28). Tanto el
GSH como otras molculas conteniendo tioles, tienen alto poder reductor y, por consiguiente,
poseen propiedades antioxidantes, ya que pueden cederle un electrn a las EROs y/o ERNs,
disminuyendo de esta forma su reactividad. Se dice que este tipo de compuestos de bajo peso
molecular actan como atrapantes de radicales libres. Entre ellos podemos citar a la tiorredoxina
(Trx) y a la vitamina C o cido ascrbico (hidrosoluble) y a las vitaminas liposolubles E o alfa
tocoferol (unida a membrana) y A o axeroftol.
Antioxidantes en la alimentacion
Estudios epidemiolgicos indican que la ingestin de frutas y vegetales confiere proteccin contra
el desarrollo de cncer, frecuentemente asociado a estrs oxidativo. Si bien se ha propuesto que
el efecto benfico de este tipo de alimentos radica en las propiedades antioxidantes de las
vitaminas (29, 30) que contienen, cuando se administran vitaminas C y E y carotenoides puros no
se obtienen resultados tan concluyentes. A partir de este estudio Potter (30) concluye que frutas y
vegetales actuaran como una polifarmacia contra el desarrollo de enfermedades crnicas,
conteniendo no slo vitaminas sino tambin otros agentes antioxidantes, tales como los
polifenoles (con propiedades de atrapantes de radicales libres y quelantes de metales), formando
una compleja trama antioxidante. Los flavonoides son polifenoles antioxidantes, presentes en
plantas y posiblemente los beneficios de la ingestin de frutas, vegetales y vino tinto, pregonado
por los nutricionistas, radique en su alto contenido en estos antioxidantes polifenlicos. Los
polioles (ej: sorbol) tambin activan fuertemente los caminos de seales sensibles a estrs (31).
2- Gran compartimentalizacin celular, lo que trae como consecuencia que las EROs y sus
fuentes no siempre estn cerca de sus blancos de accin.
3- Varios factores estructurales de los cidos nucleicos favorecen su proteccin ante el estrs
oxidativo: la cromatina compacta, la presencia de histonas, la formacin de complejos.
Destino celular
Cuando las especies reactivas oxidantes superan las defensas antioxidantes se produce el estrs
oxidativo, hay dao a macromolculas. La siguiente tabla resume los principales daos.
Glosario
Trx: tiorredoxina
OCl-: hipoclorito
1
O2: Oxgeno singulete
ONOO-.: peroxinitrito
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