Manual Laboratorio BQ
Manual Laboratorio BQ
Manual Laboratorio BQ
Manual de Prácticas
de Bioquímica para
la Carrera de MVZ
COLABORADORES:
1
ÍNDICE
Contenido Página
Horarios de impartición de la asignatura de bioquímica para el semestre 2018-I, 1
plan 2007 MVZ FES Cuautitlán
Presentación 2
Objetivo general del programa experimental de bioquímica para MVZ 3
Reglamento general para los laboratorios 4
Reglamento interno del laboratorio de bioquímica 6
Evaluación del curso experimental de bioquímica 7
Calendarización de prácticas 8
Método científico experimental 10
Introducción al laboratorio de bioquímica 15
Material de vidrio del laboratorio de bioquímica
Preparación de soluciones 20
pH y sistemas amortiguadores
Práctica 1. Titulación volumétrica y medición del pH 24
Práctica 2. Regulación del equilibrio ácido – base 30
Métodos de separación e identificación de aminoácidos y proteínas
Práctica 3. Separación e identificación de aminoácidos por cromatografía 32
en papel
Práctica 4. Separación e identificación de proteínas lácteas por 37
electroforesis en gel de poliacrilamida – SDS (SDS-PAGE)
Medición de la actividad enzimática
Práctica 5. Cinética de la enzima ureasa 42
Métodos de cuantificación de biomoléculas
Práctica 6. Cuantificación de proteínas por el método de Bradford 48
Práctica 7. Cuantificación de los niveles de glucosa 54
Práctica 8. Cuantificación de colesterol en suero sanguíneo por el método 55
de Liebermann – Burchard
Práctica 9. Aislamiento y cuantificación del ADN 59
Apéndice 1. Soluciones, ácidos, bases e indicadores de pH 63
Apéndice 2. Funciones y uso del equipo e instrumentos empleados en el 65
laboratorio de bioquímica
Apéndice 3. Hojas de seguridad de los diferentes reactivos empleados en el 72
laboratorio de bioquímica
2
HORARIOS DE BIOQUÍMICA plan 2007 MVZ
L M M J V
3
PRESENTACIÓN
Bioquímica es una de las asignaturas básicas que contribuyen al proceso formativo
de los estudiantes que cursan cualquier carrera del área Químico Biológica, ya que en ella,
los estudiantes, además de desarrollar habilidades y destrezas, aprenden aspectos
relacionados con la composición química, así como los procesos metabólicos y los
mecanismos moleculares que explican los procesos hereditarios tanto a nivel celular como
integral en los seres vivos. Es de esa manera, la disciplina proporciona conceptos
imprescindibles para su desarrollo profesional, al tratar de comprender el funcionamiento
de las células y organismos animales.
La asignatura de Bioquímica para la carrera de Medicina Veterinaria y Zootecnia
(MVZ) en la Facultad de Estudios Superiores (FES) Cuautitlán, está conformada por un
programa teórico-práctico, el cual incluye nueve temas de teoría y diez prácticas de
laboratorio que se desarrollan a lo largo de un periodo lectivo de dieciséis semanas.
El manual esta diseñado en seis componentes importantes a considerar para el curso
de Bioquímica, estos son:
Método Científico Experimental
Introducción al Laboratorio de Bioquímica
pH y Sistemas Amortiguadores
Métodos de Separación e Identificación de Aminoácidos y proteínas
Medición de la Actividad Enzimática Métodos de Cuantificación de
Biomoléculas
Los colaboradores del presente manual, expresamos nuestro deseo de que, mediante la
aplicación del programa de prácticas, los estudiantes adquieran un sustento teórico y
metodológico que les permita estar mejor preparados y capacitados para aplicar dichas
bases en otras asignaturas subsecuentes que las requieran. De igual manera, esperamos que
a través del desarrollo y la aplicación directa de las técnicas aquí contenidas, sean capaces
de desarrollar las habilidades y destrezas necesarias dentro de su formación técnica, lo cual
se vea acompañado de un incremento sustantivo en la capacidad de observación, de saber
plantear preguntas, de aprender a buscar y procesar información, para que con todo ello,
fomente la capacidad de re-construir el conocimiento a través de su formación científica.
4
OBJETIVO GENERAL DEL PROGRAMA EXPERIMENTAL DE
BIOQUÍMICA PARA MVZ
5
6
7
REGLAMENTO INTERNO DEL LABORATORIO DE BIOQUÍMICA
1. Para el trabajo en el laboratorio, cada grupo se organizará en equipos. El número de
integrantes por cada equipo será determinado por sus profesores.
3. Iniciada la práctica, las mochilas o bolsas serán retiradas de las mesas de trabajo, solo
se podrá usar una libreta para hacer las anotaciones pertinentes.
4. Cada equipo deberá contar con un plumón indeleble, masking tape y toallas absorbentes
para rotular o etiquetar el material de vidrio que se les proporcionará en cada práctica,
cuando sea necesario. De manera individual, deberán traer guantes desechables de latex,
vinilo o contra ácidos, cubrebocas y en el caso de que la práctica lo amerite, gafas
protectoras.
6. No se deberá manejar el material y/o equipo, hasta que el profesor haya explicado su
correcto uso.
7. En el caso de los reactivos y/o soluciones, estas deberán manejarse con cuidado y, de
preferencia, mantenerse en un lugar fijo. De acuerdo a lo que indique la hoja de
seguridad de dichos reactivos. Al terminar de usarse, se deberá tapar el recipiente en el
que estén contenidas aquellas.
8. No deberá pipetear con la boca. Para ello se hará uso de las propipetas.
9. Se deberá usar una pipeta diferente para cada solución a medir, con el fin de no
contaminarlas con otras sustancias.
10. Se deberá comunicar al profesor cualquier tipo de accidente que ocurra durante la
práctica.
8
EVALUACIÓN DEL CURSO EXPERIMENTAL DE BIOQUÍMICA
El total de la calificación del laboratorio, equivale al 25% del curso de Bioquímica. En caso
de no obtener un promedio aprobatorio en el laboratorio, el alumno podrá presentar
exámenes finales A y B. Los criterios para realizar la evaluación son los siguientes:
Evaluación previa 33%
Evaluación del proceso 33%
Informe escritos de prácticas 33%
50%
Exámenes 40%
Trabajo de investigación 10%
Examen previo o cuestionario: El profesor realizará una actividad para poder verificar
que los estudiantes tengan claros los conocimientos teóricos, los cuales les posibilite
comprender las actividades experimentales.
Evaluación durante la práctica: Durante la sesión experimental se evaluará a los
estudiantes la manera en cómo es que se acerca a la adquisición del conocimiento.
Informe escrito de las prácticas: Estos se entregarán a la semana siguiente de haber
realizado la práctica. Los puntos que debe incluir serán los que indica el manual en el
apartado “Método Científico Experimental”. Deberán ser entregados con puntualidad.
Exámenes: Estos son programados en la misma semana para todos los grupos de
Bioquímica, sin embargo, cada profesor elaborará su examen y lo aplicará en su horario.
Trabajo de investigación: Consiste en la investigación de un tema que puede ser sugerido
por el profesor o bien, ser propuesto por los alumnos. Esta se desarrollará a lo largo del
semestre por equipo y será periódicamente revisado por los profesores, tanto de teoría como
de laboratorio. Cabe señalar que esta investigación deberá tener un enfoque bioquímico,
así como el de otras asignaturas que se cursen en el bloque. El trabajo concluido deberá ser
entregado por escrito en la forma y tiempo que el profesor indique.
9
UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO
FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES CUAUTITLÁN
DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
SECCIÓN BIOQUÍMICA Y FISIOLOGÍA AGROPECUARIA
CÓDIGO: FPE-CB-DEX-01-02
CALENDARIZACIÓN
N° Revisión: 00
ASIGNATURA Bioquímica
GRUPO(S) Todos los grupos SEMESTRE 21-I CARRERA MVZ
SEMANA
FECHA CUMPLIÓ
SEM
EXAMEN OBSERVACIONES
(SEMANAL) SI NO
6 2 al 6 Nov 1er Examen de laboratorio
10 30 Nov.- 4 Dic. 2º Examen de laboratorio
14 18 al 22 Enero 3er Examen de laboratorio
15 25 al 29 Enero Entrega de calificaciones (publicación)
Elaborado por: MVZ SILVIA LETICIA BONILLA OROZCO
10
NOMBRE DE LA PRÁCTICA Número y nombre de unidad
No. de temática en el programa de la
práctica asignatura
1 Titulación volumétrica y medición del pH 1 Equilibrio ácido-base
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MÉTODO CIENTÍFICO EXPERIMENTAL
INTRODUCCIÓN
Conforme fue aumentando el acervo de los conocimientos del hombre, se hizo
necesario: primero, distinguir entre el conocimiento adquirido por experiencias diarias y el
conocimiento científico
Los primeros conocimientos científicos fueron el resultado de un análisis minucioso
y disciplinado de la experiencia diaria; usa lenguaje especializado, debían ser precisos, es
decir, cada pregunta debía tener una respuesta y cada fenómeno una explicación, y estar
sujetos a comprobación.
Para hacer ese análisis disciplinado y ordenado de los fenómenos naturales, es
necesario seguir ciertas reglas; las reglas deben partir de algunas bases.
Cuando dichas reglas se aplican entonces podemos decir que se está aplicando un
método. Y el método científico permite al hombre de ciencia: obtener deducciones de los
conocimientos científicos ya existentes y buscar otros nuevos que contesten a las preguntas
que surjan.
Método científico es el conjunto de reglas que señalan el procedimiento para llevar
a cabo una investigación, cuyos resultados sean aceptados como válidos por la comunidad
científica. Es necesario mencionar que existen algunos métodos de carácter cualitativo que
para este caso específico no se utilizan.
El método científico auxilia constantemente al hombre no sólo en la investigación
científica sino en sus problemas cotidianos, aunque a veces es ignorado y en otras se resiste
a reconocerlo; inclusive, existen científicos que se expresan despectivamente de él, pero
siguen sus etapas con todo rigor.
El método experimental tiene siete reglas que se deben cumplir al realizar una
investigación; son las siguientes:
12
El equipo disponible y su precisión.
El tiempo y dinero disponibles.
13
Si el experimento se ha planeado con detalle, lo más probable es que producirá datos
valiosos, por lo que deberán ser analizados escrupulosamente para obtener los resultados
buscados.
14
Los requisitos para elaborar un informe escrito es; la claridad, orden y exactitud,
aunque también es indispensable aplicar las reglas gramaticales de ortografía, puntuación y
redacción.
De una manera más detallada, los informes pueden estructurarse de diversas formas
dependiendo de su complejidad, contenido y objeto.
En general, todos los informes de resultados que serán entregados en el laboratorio
de Bioquímica deberán contener las partes que veremos a continuación:
Sección preliminar
a) Portada
Institución
Dependencia
Carrera
Título y número de la práctica
Nombre de los integrantes del equipo en orden alfabético
Número de equipo
Nombre de los profesores
Grupo
Fecha
b) Índice
c) Resumen
Una cuartilla expresando los puntos más relevantes de la práctica, desde
objetivos, breve descripción de la técnica empleada en el experimento,
resultados y conclusiones más sobresalientes.
d) Introducción
Planteamiento claro y ordenado del tema de la investigación, de su importancia e
implicaciones. En este punto debe recurrirse a referencias bibliográficas (1 a 2
cuartillas).
Marco teórico:
Revisión bibliográfica relacionada con el tema En este punto deben incluirse las
referencias bibliográficas a lo largo del texto ( Autor, año) (mínimo 3 cuartillas)
e) Objetivos
Identifican la finalidad hacia la cual se dirigió el experimento para dar
cumplimiento a los propósitos académicos. El objetivo debe responder a la
pregunta "qué", “cómo” y "para qué".
15
c) Discusión
Es el análisis de los resultados obtenidos y está debe además explicar aquellos
resultados inesperados que invaliden total o parcialmente alguna de las hipótesis
iniciales del trabajo. Debe comparar los resultados obtenidos en relación con los
de otros trabajos e indicar las posibles aplicaciones o implicaciones teóricas.
e) Conclusiones
Aceptación o rechazo de los objetivos
Síntesis de los aspectos fundamentales
f) Recomendaciones y sugerencias
Referencias
a) Bibliográfica
Laguna, J. y Piña, E. 1992. Bioquímica. Salvat. México.
b) Hemerográfica
Jaubert, A. and Martin, P. 1992. Reverse-phase HPLC analysis of goats caseins.
Indication of s1 and s2 genetic variants. Lait 72 : 235-247.
c) Otras fuentes
Revistas arbitradas científicamente
Páginas de la Internet (para figuras y/o tablas exclusivamente)
BIBLIOGRAFÍA CONSULTADA
1. De la Vega, L. F. C. 1994. Método Científico. 2ª ed. Instituto Politécnico Nacional. México.
2. Munich, L. y Ángeles. E. 1990. Métodos y técnicas de investigación. 2ª ed. Trillas. México.
3. Rosas, L y Riveros, H. G. 1990. Iniciación al método científico experimental. 2ª ed. Trillas. México.
16
INTRODUCCIÓN AL LABORATORIO DE BIOQUÍMICA
OBJETIVOS
Conocer el material de vidrio y equipo con el que cuenta el laboratorio de Bioquímica.
Conocer la aplicación y uso correcto del material de vidrio.
17
Matraz Erlenmeyer y vasos de precipitados. Son útiles para medir volúmenes variables y
tienen una variación en su exactitud de 5%, la cual viene inscrita en este material
Probeta y matraz volumétrico. Sirven para medir volúmenes fijos, en ellos podemos
aforar soluciones. En el caso de los matraces volumétricos, no encontraremos ningún tipo
de inscripción solamente presenta una línea de afore, la cual indica el volumen que se
puede verter en ellos.
18
Bureta. Son empleadas por lo general para hacer titulaciones ácidas o básicas. Miden
volúmenes variables y presentan en la parte final del cuerpo una llave, la cual permite el
paso o no de la solución que la contenga.
19
Embudo. Material útil para verter soluciones o solutos de material de vidrio estrecho, tales
como buretas o matraces. Existen tanto de vidrio como de plástico.
Tubo de ensaye y gradilla. Los tubos de ensaye son útiles para realizar diluciones de
volumen relativamente pequeño y/o hacer lecturas en aparatos como el fotocolorímetro.
Durante el manejo de los tubos, debe emplearse una gradilla a fin de mantenerlos en un
lugar fijo y seguro.
20
Bibliografía Consultada
1. Masterson, W.L., Slowinski, E.J. y Stanitski, C.L. 1987. Química general superior.
4ª ed. Interamericana. México.
2. Rosas, G.B. y Rico, P.J.L. 1998. Bases químicas e introducción al manejo de
muestras biológicas. Subcomisión de Capacitación y Área de Bioquímica y
Genética de MVZ. FES Cuautitlán, UNAM. México.
3. Skoog, D.A. y West, D.M. 1984. Análisis instrumental. 2ª ed. Interamericana.
México.
21
PREPARACIÓN DE SOLUCIONES
INTRODUCCIÓN
La mayoría de las reacciones estudiadas en bioquímica se llevan a cabo en solución,
de las cuales, las concentraciones basadas en una cantidad disuelta de soluto por unidad de
volumen, son las más ampliamente usadas en bioquímica.
Las soluciones se definen como mezclas homogéneas de dos o más sustancias, sus
componentes son el soluto (es el que se va a disolver) y el solvente o disolvente (es el que
disuelve al soluto). Por lo general, el soluto se encuentra en menor cantidad y proporción
con respecto al solvente. En el laboratorio, es muy importante saber preparar soluciones de
todo tipo, ya que el estado líquido es el más adecuado para trabajar, puesto que, es difícil
efectuar reacciones entre sólidos y gases sin contar con una gran cantidad de equipo en el
laboratorio. Los líquidos se mezclan con bastante rapidez, pueden medirse exacta y
eficazmente con equipo volumétrico.
El disolvente más común es el agua, tomándola como un disolvente típico,
examinaremos el proceso de disolución. Las moléculas del agua son muy polares por lo
que atraen a otras moléculas polares y a los iones, por ejemplo: si un cristal de cloruro de
sodio (NaCl) se introduce en agua, los iones de la superficie cristalina atraen a las
moléculas polares de agua y gradualmente los rodean separándolos de los iones
superficiales, por lo tanto, los iones se hidratan y ya no se quedan sujetos al cristal,
gradualmente, se desplazan del cristal a la solución, ésta separación iónica se llama
disociación.
Si los líquidos son completamente solubles entre sí, entonces son miscibles como el
agua y el alcohol, sin embargo, si no se disuelven entre sí son inmiscibles, como el vinagre
y el aceite.
OBJETIVOS
Conocer los conceptos de las soluciones más empleadas en el laboratorio de
Bioquímica.
Aplicar estos conceptos en la realización de ejercicios, así como conocer algunas
medidas de precaución en la preparación de dichas soluciones.
SOLUCIONES EMPÍRICAS
La relación que existe entre el peso del soluto y el peso del solvente recibe el
nombre de concentración. De acuerdo con la concentración una solución puede ser:
Solución diluida. Aquella que contiene una cantidad relativamente pequeña de
soluto por unidad de volumen, es decir, la cantidad de soluto es menor en relación a
la cantidad de solvente.
Solución concentrada. Aquella que contiene una cantidad relativamente grande de soluto y
éste sigue siendo soluble en el solvente.
Solución saturada. Es aquella en la cual la sustancia disuelta se encuentra en
gran cantidad de soluto,
equilibrio con la sustancia no disuelta, es decir, al agregarse
éste no se disuelve, se asienta en el fondo del recipiente.
Solución sobresaturada. Aquella que contiene mayor cantidad de soluto que la
saturada, es decir, existe exceso de soluto y al añadirle más, se cristaliza parte del
que estaba ya disuelto. Para disolver dicha cantidad de soluto, la temperatura debe
ser mayor a la ambiental lo cual hace que la solución al enfriarse sea inestable.
22
SOLUCIONES VALORADAS
Existen varios métodos para determinar con exactitud la concentración de una solución
acuosa:
Solución porcentual (%). Representa los gramos de soluto presentes en 100 partes de
solución (g o mL), pudiendo ser la concentración porcentual en masa o volumen.
Solución molar (M). Es el peso molecular (PM) del soluto, expresado en gramos
(moles) por cada 1000 mL de solución (1 L).
M = moles / 1000 ml
Solución normal (N). Es el número de equivalentes del soluto por cada 1000 mL de
solución.
N = equivalentes químicos / 1000 mL
El número de equivalentes se obtiene dividiendo el PM entre el número de valencia
+ –
de la sustancia en cuestión, el cual corresponde al número de H o OH
intercambiables.
Solución molal (m). Son los moles de soluto por cada 1000 g de solvente (o 1 Kg)
m = moles / 1000 g
4 g --------------1000 mL
X < ------------- 350 mL X = 1.4 g
Se pesan 1.4 g de NaOH y se afora a 350 mL con agua destilada
de agregar la base, disolver perfectamente,
El matraz debe contener un poco de agua antes
posteriormente aforar al volumen requerido.
23
Normales (N = equivalentes químicos / 1000 mL)
Preparar 1 L de H2SO4 al 1 N
la densidad que en
Como se trata de un reactivo líquido, se requiere conocer
este caso es de 1.53 g / mL y la pureza que es de 95 %.
Determinar PM del soluto:
H (1 x 2 ) + S ( 32 ) + 0 ( 16 x 4) = 98 g
Determinar el número de equivalentes químicos. Como esta sustancia
tiene por fórmula 2 H , el PM se divide entre 2: 98 / 2 = 49 g , lo cual
corresponde a 49 equivalentes por cada litro.
Recordando que la densidad es D= m / V, donde m = masa y V = volumen y
como el reactivo es líquido, requeriremos tomar un volumen determinado por
ello despejamos V = m / D, sustituyendo: V= 49 g / 1.53 g/mL, tenemos que V =
32 mL.
La mayoría de los ácidos tienen un grado de pureza menor al 100%, por
lo tanto, para preparar una solución con 100% de pureza se realiza el siguiente
cálculo: 32 mL x 100 / 95 = 33.7 mL. Esto significa que se deben tomar 33.7 mL
del reactivo y se afora a 1000mL. Es importante aclarar que, tratándose de ácidos
concentrados, se debe agregar primero una cantidad de agua en el matraz donde
se verterá el ácido, posteriormente se debe aforar al volumen requerido.
Preparar 500 mL de NaOH al 0.1 N
Al tratarse de un sólido no requerimos densidad ni pureza
Determinar el PM del soluto:
Na ( 23 ) + O ( 16 ) + H ( 1 ) = 40 g
de equivalentes = 40 g Dado
La fórmula posee un solo OH por ello el número
que se requiere una solución 0.1N:
40 g ------------ >1 N
X <------------- 0.1 N X=4g
4 g ------------->1000 mL
X <------------- 500 mL X=2g
Se pesan 2 g de NaOH y se afora a 500 mL con agua destilada
El matraz debe contener un poco de agua antes de agregar la base,
disolver perfectamente y posteriormente aforar al volumen requerido.
Para la preparación de reactivos se debe saber el manejo de sustancias y líquidos. Las
sustancias corrosivas son de uso delicado y deben de manejarse con precaución, pues al
entrar en contacto con la piel o la ropa pueden producir quemaduras.
RECOMENDACIONES
Nunca se vierta agua en ácido o álcali concentrado. Viértase siempre lentamente el ácido en
el agua, al mismo tiempo que se mezcla.
Nunca “pruebe” el sabor ni el olor de cualquier reactivo químico.
Si su piel tiene contacto con cualquier reactivo sólido o líquido, lávese inmediatamente con
abundante agua.
Para pipetear utilizar la propipeta. Nunca pipetear con la boca.
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PREPARACIÓN DE SOLUCIONES A PARTIR DE SOLUCIONES STOCK
Las soluciones stock o madre pueden ser útiles para la preparación de otras más
diluidas. Esto permite que ahorrar reactivos y aprovechar soluciones concentradas para
otras más diluidas. Para comprender mejor lo anterior, emplearemos un ejemplo.
Tenemos una solución stock de HCl a una concentración de 1.0 M y un volumen de 250
mL. ¿Cuántos mililitros se necesitan de esta solución para preparar 50 mL a una
concentración de 0.3 M?
Utilizaremos la siguiente fórmula para su preparación
C1 V1 = C2 V2
En donde
C1= Concentración de la solución stock
V1= Volumen requerido de la solución stock
C2= Concentración de la solución requerida
V2= Volumen de la solución requerida
De acuerdo a la ley de acción de masas, la quedaría de la siguiente manea
V1= (C2) (V2)
C1
Sustituyendo
V1= (0.3 M) (50mL) = 15 mL
1M
stock y se afora a 50 mL con agua destilada para obtener
Se miden 15 mL de la solución
la concentración requerida.
BIBLIOGRAFÍA CONSULTADA
1. Hess, G. G. y Uno, K. 1998. Química General Experimental. CECSA, México.
2. Farías, M. G. 1988. Química Clínica. 9ª. El Manual Moderno, México.
3. Holkova, Ludmila. 1988. Química Analítica Cuantitativa. Trillas, México.
25
PH Y SISTEMAS AMORTIGUADORES
INTRODUCCIÓN
Las soluciones empleadas en volumetría y cuyas concentraciones deben ser
conocidas con mayor exactitud, cuanto mejores resultados analíticos se desee obtener,
reciben el nombre de soluciones valoradas o soluciones tituladas.
Para determinar la concentración de una solución desconocida se utiliza una
segunda solución de concentración conocida, que al mezclarse con la primera experimenta
una reacción química específica. La solución de concentración conocida se llama solución
valorada. Valoración o titulación es el proceso de determinación del volumen necesario de
la solución valorada para reaccionar con una cantidad determinada de la solución a analizar.
En la determinación de la concentración desconocida de un ácido se utiliza una base de
concentración conocida. En la determinación de la concentración desconocida de una base
se utiliza un ácido de concentración conocida. Se realizo una acidimetría o una alcalimetría
respectivamente. En la reacción de neutralización, los iones de hidrogeno provenientes del
ácido y los iones oxhidrilo de la base reaccionan formando agua:
Los aniones del ácido y los cationes de la base son iones espectadores, la reacción que
verdaderamente tiene lugar es:
+ -
H (ac) + OH (ac) H2O (1)
Cuando se han mezclado cantidades equivalentes de ácido y de base se dice que se llega al
+
punto de equivalencia de la titulación. En el punto de equivalencia el número de H debe
-
ser igual al número de OH .
Utilizando un reactivo indicador, que tiene distinto color en solución ácida o en
solución básica, el cambio de color indica que toda la solución problema se ha neutralizado.
INDICADORES DE PH
Los indicadores (Cuadro 1) usados en alcalimetría y acidimetría son sustancias
orgánicas de carácter ácido o básico muy débil, y que tienen la propiedad de cambiar de
coloración cuando el medio pasa de un pH determinado a otro.
26
ESCALA DE PH
+ -
La escala de pH representa las concentraciones de H y OH en cualquier solución
acuosa. Srensen (1909), la propuso como el logaritmo recíproco de la concentración de
dichos iones, expresión que en forma simplificada se conoce como pH, con la siguiente
ecuación:
+
pH = log 1 = -log H
+
H
El valor de 7 para el pH de una solución exactamente neutra no es una cifra escogida de
manera arbitraria, proviene del valor absoluto del producto iónico del agua a 25° C. Las
soluciones que tienen un pH superior a 7 son alcalinas o básicas; las soluciones con un pH
inferior a 7 son ácidas. La escala de pH es logarítmica, no aritmética. Decir que el pH de
dos soluciones difiere en 1 unidad de pH significa que una solución tiene una concentración
+
de H cien veces superior al de la otra, pero no nos dice cual es el valor absoluto de la
diferencia. Se puede medir aproximadamente el pH de una solución acuosa utilizando
diversos colorantes indicadores, entre ellos el tornasol, la fenoftaleína y el rojo de fenol,
que experimentan cambios de color cuando se disocia un protón de la molécula de
colorante.
Las determinaciones precisas del pH en el laboratorio de químico se hacen con un
+
electrodo de vidrio que es selectivamente sensible a la concentración de H pero que es
+ +
insensible al Na , K y otros cationes. En un potenciómetro se amplifica la señal de un
electrodo de este tipo y se compara con la señal generada por una disolución cuyo pH se
conoce con exactitud.
El pH afecta a la estructura y actividad de macromoléculas biológicas; por ejemplo
la actividad catalítica de las enzimas tiene una gran dependencia del pH, el pH de orina y
sangre es útil para diagnosticar enfermedades, etc.
La definición de ácidos y bases de Brönsted y Lowry, menciona que un ácido, es un
compuesto capaz de donar protones y una base es un compuesto capaz de aceptarlos. Esta
definición también puede ser formulada como la disociación de un ácido en una base y un
protón: ecuación (1)
+
Ácido Base + H
Los ácidos y las bases pueden ser clasificados como fuertes o débiles dependiendo
de su grado de ionización. Un ácido fuerte es aquel que dona protones con facilidad, el
cual, en la ecuación (2) procederá rápidamente a la derecha; debido a que el ácido es
totalmente ionizado.
Los ácidos débiles por definición, se ionizan sólo parcialmente en soluciones
acuosas.
+ -
HA H +A
27
OBJETIVOS
Preparar y valorar soluciones ácidas y básicas.
+ -
Aprender a realizar los cálculos para conocer la concentración de H y/o OH de
soluciones con normalidad o molaridad desconocida.
+ -
Evaluar el pH de una solución con una concentración determinada de H y/o OH
antes y después de su titulación.
Determinar el pH por medio de un potenciometro de algunas muestras
y posteriormente comparar este pH adicionando naranja de metilo
MATERIALES
Material y equipo Reactivos y soluciones
2 Matraces volumétricos de 50 Ml Ácido clorhídrico (HCl) concentrado
2 Matraces Erlenmeyer de 250 mL Hidróxido de sodio (NaOH)
2 vasos de precipitados de 250 mL Naranja de metilo 0.04%
1 Pipeta de 1 mL Solución problema 1 y 2 de HCl
2 Pipetas de 10 mL Solución problema 1 y 2 de NaOH
1 Bureta de 25 o 50 mL Agua destilada
1 Soporte universal con pinzas para bureta
1 Embudo
1 Propipeta
Potenciómetro
METODOLOGÍA
1. Realice los cálculos para preparar 50 mL de una solución 0.20 N de HCl. Las
propiedades del HCl se encuentran en el apéndice 1, cuadro 3.
2. Para preparar la solución 0.2 N de HCl, vierta primero al matraz volumétrico
aproximadamente 20 mL de agua desilada. Prepare la pipeta de 1 mL con la propipeta,
nunca aspire con la boca, emplee la propipeta y tome la cantidad de ácido obtenido
del punto anterior. Vierta el ácido al matraz volumétrico ( que previamente debe tener
un volumen de agua destilada).
3. Después de haber agregado el ácido en el matraz afore a 50 mL y mezcle
perfectamente.
4. Rotule el matraz indicando el tipo de solución.
5. Realice los cálculos para preparar 50 mL de una solución 0.20 N de NaOH. Las
propiedades del NaOH se encuentra en el apéndice 1, cuadro 3.
28
6. Pesar la cantidad obtenida en los cálculos realizados anteriormente y adicione al otro
matraz volumétrico.
7. Adicione un poco de agua destilada, agite muy bien hasta que el NaOH quede
completamente disuelto y afore a 50 mL con agua destilada.
8. Rotule la solución preparada.
Valoración acidimétrica
1. Llene la bureta de 50 mL con la solución de NaOH estándar. Es muy importante
sacar el aire de la punta de la bureta para lo cual deberá poner un vaso de precipitados
bajo ésta, abra la llave de la bureta permitiendo que el aire salga cuando fluya la
solución y cierre. Anote el número de la graduación en donde quedó su solución para
posteriormente anotar los mililitros que gasta en la titulación.
2. Mida 10 mL de la solución ácida problema 1 con la pipeta y viértalos en el matraz
Erlenmeyer, adicione 2 gotas del indicador naranja de metilo 0.04%. Anote el color
que adquiere la solución y mida el pH con el potenciómetro.
3. Titule la solución colocando el matraz debajo de la bureta, abra la llave con la mano
izquierda y regulando un goteo lento, agite suave y continuamente con la mano
derecha. Evite que la punta de la bureta roce con el matraz pues el material puede
romperse.
4. En el momento que la solución problema comience a cambiar de color (virar), a
una coloración canela (o durazno), cierre la llave de la bureta y anote la cantidad en
mililitros de NaOH estándar agregado.
5. Mida nuevamente el pH de la solución problema y anote los resultados.
6. La solución problema de HCl 1 ya titulada, deberá verterla en el vaso de
precipitados rotulado como “CONTENEDOR DE RESIDUOS”
7. Realizar nuevamente los pasos del 2 al 6 para la solución ácida problema 2.
8. En caso de que la solución titulada tome una coloración amarilla, indicará un exceso
de NaOH estándar agregado, lo cual traerá como consecuencia errores en la
determinación de la concentración del ácido problema. Si se da este caso, volver a
titular.
9. Una vez realizadas las dos titulaciones vierta la solución de NaOH estándar que
tiene la bureta en el otro vaso de precipitados que rotulará como “CONTENEDOR DE
RESIDUOS”.
10. Enjuague la bureta con agua destilada estando la bureta en el soporte universal. El
agua de los enjuagues será vertida al contenedor de las soluciones de NaOH.
11. Para obtener la normalidad de la solución ácida problema se utiliza la siguiente
fórmula:
N1V1 = N2 V2
En donde:
N1 = Concentración (N) de la solución ácida problema
V1 = Volumen de la solución ácida problema
N2 = Concentración (N) de la solución de NaOH estándar
V2 = Volumen de la solución de NaOH estándar
Valoración alcalimétrica
1. Llene la bureta de 50 mL con la solución de HCl estándar. Es muy importante sacar el
aire de la punta de la bureta para lo cual deberá poner el vaso de precipitados bajo ésta,
abra la llave de la bureta permitiendo que el aire salga cuando fluya la solución y
29
cierre. Anote el número de la graduación en donde quedó su solución para
posteriormente anotar los mililitros que gasta en la titulación.
2. Mida 10 mL de la solución alcalina problema 1 con la pipeta y viértalos en el matraz
Erlenmeyer, adicione 2 gotas del indicador naranja de metilo 0.04%. Anote el color
que adquiere la solución y mida el pH con el potenciómetro.
3. Titule la solución colocando el matraz debajo de la bureta, abra la llave con la mano
izquierda y regulando un goteo lento, agite suave y continuamente con la mano
derecha. Evite que la punta de la bureta roce con el matraz pues el material puede
romperse.
4. En el momento que la solución problema comience a cambiar de color (virar), a una
coloración canela (o durazno), cierre la llave de la bureta y anote la cantidad en
mililitros de HCl estándar agregado.
5. Mida nuevamente el pH de la solución problema y anote los resultados.
6. La solución problema de NaOH 1 ya titulada, deberá verterla en el vaso de
precipitados rotulado como “CONTENEDOR DE RESIDUOS”
7. Realizar nuevamente los pasos del 2 al 6 para la solución alcalina problema 2.
8. En caso de que la solución titulada tome una coloración rosa, indicará un exceso de
HCl estándar agregado, lo cual traerá como consecuencia errores en la determinación
de la concentración del ácido problema. Si se da este caso, volver a titular.
9. Una vez realizadas las dos titulaciones vierta la solución de HCl estándar que tiene la
bureta en el vaso de precipitados que rotuló como “CONTENEDOR DE RESIDUOS”
10. Enjuague la bureta con agua destilada estando la bureta en el soporte universal. El
agua de los enjuagues será vertida al contenedor de las soluciones de HCl.
11. Para obtener la normalidad de la solución ácida problema se utiliza la siguiente
fórmula:
N1V1 = N2 V2
En donde:
1. Una vez concluidas las cuatro titulaciones se procederá al desecho de las soluciones
de los contenedores. (Esto se realizará posteriormente a través de la neutralización
de las soluciones ácidas con las soluciones alcalinas, hasta llegar a un pH 7, el cual
se medirá con el potenciómetro.)
2. Lave el material de vidrio que se le proporcionó con detergente y elimine el exceso
de agua de la parte externa del material con toallas absorbentes.
30
Resultados
1. Complete el siguiente cuadro con los resultados obtenidos en cada una de las etapas
de la práctica, muéstrelos a los profesores y posteriormente discútalos con en grupo.
Ácida 2
Alcalina 1
Alcalina 2
MuestrapH
31
PRÁCTICA 2. REGULACIÓN DEL EQUILIBRIO ÁCIDO-BASE
INTRODUCCIÓN
El sistema de regulación ácido-base protege al organismo contra las modificaciones
de pH debidas principalmente a la continua formación de diversos ácidos producidos en el
curso del metabolismo; de hecho, el pH del líquido extracelular es muy constante entre 7.35
y 7.45. En los mamíferos, la vida es incompatible con valores de pH en la sangre menores
de 7 o mayores de 8.
MECANISMOS DE REGULACIÓN
MECANISMOS COMPENSATORIOS
Cuando se presenta una alteración en el equilibrio ácido-base, participan dos tipos
de compensación: respiratoria y renal. En la respiratoria, participan los cambios en la
frecuencia y volumen respiratorios que afectan el transporte de oxígeno en la sangre, el
efecto amortiguador de la hemoglobina y la eliminación del H2CO3 (en forma de CO2) a
través de los pulmones. La cantidad de CO2 en los pulmones, aumenta o disminuye a
medida que crecen o decrecen la velocidad y profundidad de las respiraciones. A su vez, el
pH y la pCO2 en la sangre influyen en la amplitud y frecuencia de los movimientos
respiratorios. Por ejemplo, una elevación en la concentración sanguínea de H2CO3 se
refleja en una mayor pCO2 en la sangre y una disminución del pH; ambos factores, a través
del sistema nervioso central, estimulan los movimientos respiratorios y así eliminan más
CO2, por los pulmones; con ello baja progresivamente la pCO2 en la sangre, sube el pH y
desaparece el estímulo de los movimientos respiratorios; éstos ajustan su frecuencia y
amplitud y se expulsa menos CO2, disminuyendo la concentración de H2CO3. Se restablece
-
así la relación [HCO3 ]/ [H2CO3] normalmente de 20 a 1 moles, respectivamente.
En el mecanismo compensatorio renal se lleva a cabo la eliminación de los ácidos
+ -
fijos, o sea, los H ; mientras éstos se excretan se combinan con el HCO 3 impidiendo así
cambios importantes en el pH. Los ácidos fijos producidos en el metabolismo son cerca de
100 mEq diarios; el riñón los elimina al mismo tiempo que recobra la reserva alcalina
-
(HCO3 ) para que el organismo siga contando con capacidad amortiguadora. El ajuste en el
32
+
pH urinario depende de la disponibilidad de ácidos fijos, H , necesarios para acidificar la
-
orina o la de HCO3 necesario para alcalinizarla.
ECUACIÓN DE HENDERSON-HASSELBALCH
-
Para conocer el pH de un sistema amortiguador como el del HCO3 /H2CO3, se
emplea la ecuación (1) de Hendersson-Hasselbach, sin embargo es necesario conocer el pK
del ácido débil del para el par amortiguador, en este caso el pK del H2CO3 es de 6.1.
-
pH = pKa + log [HCO 3 ] (1)
[H2CO3]
OBJETIVOS
Discutir casos clínico auxiliándose de los conocimientos adquiridos en teoría,
acerca del tema por equipo.
Discutir los mecanismos compensatorios del desequilibrio ácido-base que se
presentan en el mismo caso clínico con ayuda de los profesores
METODOLOGÍA
1. Lea con su equipo el caso clínico y discuta con sus compañeros el tipo de alteración
que se presenta en el equilibrio ácido-base.
2. Una vez que el equipo haya determinado la alteración que se está presentando en el
animal al que hace referencia el caso clínico, discuta como compensan los mecanismos
renal y/o respiratorio dicha alteración.
3. En el caso de la compensación renal y con base a su discusión en equipo, especifiquen
si el riñón produce orina ácida o alcalina.
4. Al término de la práctica, se discutirá cada caso clínico frente al grupo.
33
MÉTODOS DE SEPARACIÓN E IDENTIFICACIÓN DE
AMINOÁCIDOS Y PROTEÍNAS
CROMATOGRAFÍA EN PAPEL
Esta técnica se basa en la separación de una mezcla de compuestos, los cuales se
asocian de manera preferencial, con relación a su naturaleza química, a dos fases distintas,
una que es la fase móvil (constituida por una mezcla de solventes a la que se le denomina
“eluyente”) y otra, que es la fase estacionaria, misma que en tal caso está representada por
las moléculas de agua inmersas entre las moléculas de celulosa que conforman al papel.
Este tipo de cromatografía resulta ser muy versátil y sus métodos se han empleado
con mucha frecuencia en los protocolos de separación de moléculas. Aunque, diversas
clases de compuestos pueden ser separados por este método, la separación va a depender de
la selección del adsorbente y el sistema de solventes, para lo cual es necesario considerar la
polaridad de la muestra, misma que está determinada por el número y tipo de grupos
funcionales presentes en los compuestos por separar.
La aplicación de la técnica puede ser muy variada, así, por ejemplo, suele emplearse
para la separación de aminoácidos en sangre y orina, en humanos como una prueba
preliminar para fines de diagnóstico a nivel pediátrico. En medicina veterinaria este tipo de
análisis puede resultar de interés al momento de desarrollar proyectos específicos de
investigación, o bien, con fines diagnósticos también, como en el caso de cistinuria en
perros, así como en estudios comparativos de excreción renal en mamíferos. Cabe señalar
34
al respecto que, en perros alimentados con una dieta rica en proteínas se ha observado
excreción anormal de aminoácidos en cantidades excesivas de taurina y glutamina.
SEPARACIÓN DE AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos con grandes cadenas laterales no polares, tales como: Leu, Ile,
Fen, Trp, Val, Met y Tir, migran más lejos sobre un cromatograma, en comparación con
aquellos que presentan cadenas laterales más cortas no polares (Pro y Ala) o con los que
tienen cadenas laterales polares (Tre, Glu, Ser, Arg, Asp, His, Lis, Cis). Ello es
consecuencia de que existe una mayor solubilidad relativa de las moléculas polares en una
fase estacionaria hidrófila, así como una mayor afinidad de las moléculas no polares en
solventes orgánicos.
DETERMINACIÓN CUALITATIVA
Existen sustancias que detectan de manera específica a los aminoácidos, resultando
de gran utilidad para la identificación de aquellos, dentro de la cromatografía. Tales
sustancias son, entre otras, la ninhidrina y la fluorescamina. La ninhidrina, que es la
sustancia que será utilizada en esta práctica, lo que hace es descarboxilar, por oxidación, a
los alfa-aminoácidos, convirtiendo a los grupos funcionales Carboxilo y Amino, en CO2,
NH3, respectivamente, resultando también la formación de un aldehído que va a presentar
un átomo de carbono menos con respecto del aminoácido precursor. Una vez que la
ninhidrina (la cual fue reducida durante la reacción) interacciona con el amoniaco liberado,
se forma un complejo coloreado azul, mismo que puede ser identificado mediante un
espectrofotómetro, ya que absorbe la luz dentro de una longitud de onda de 570 nm. Cabe
señalar que la prolina y la hidroxiprolina, se comportan de diferente manera, ya que, en
lugar del color azul, producen un color amarillo al reaccionar con la ninhidrina, pues
presentan su máxima absorción a 440 nm. La reacción de la ninhidrina con los aminoácidos
se muestra en la
Figura 1.
OBJETIVOS
Conocer el principio de separación por cromatografía en papel y a través de ello,
comprender su importancia al ser empleada como técnica de separación de
moléculas, tales como los aminoácidos
Realizar la separación de aminoácidos por cromatografía en papel e identificar los
aminoácidos presentes en una mezcla a través del uso de aminoácidos patrón.
35
MATERIALES
Material Reactivos y soluciones
1 Pieza de papel Whatman No. 3 (10 x 8 cm) Solución de Fenilalanina 1%
1 Cámara cromatográfica Solución de Leucina 1%
6 tubos capilares Solución de Prolina 1%
1 Parrilla eléctrica Solución de Glicina 1%
Solución de Histidina 1%
Solución de Ninhidrina 0.05%
Material que deberá traer cada equipo Eluyente: v/v/v/v
Regla y lápiz Butanol/acetona/ácido acético/agua
2 Pinzas de disección sin dientes de ratón 7.0/7.0/1.5/4.5
1 Par de guantes de látex Muestra biológica
Cubre bocas por cada integrante Mezcla de aminoácidos
METODOLOGÍA
1. Sujete el papel de cromatografía (cromatograma) por los bordes empleando pinzas
de disección , pues las yemas de los dedos no deben tener contacto con la superficie
del mismo.
2. A 0.5 cm del extremo inferior del cromatograma, marque, con lápiz, seis cruces
muy finas y bien distribuidas a lo largo de los 10 cm. de este, las cuales indicarán la
posición respectiva para cada aminoácido y de la mezcla.
3. Coloque con un capilar, en el centro de la primera cruz, una pequeña muestra del
aminoácido Histidina, en la segunda la Fenilalanina, en la tercera la Prolina, en la
cuarta la Glicina y, en la quinta, la Leucina (estos 5 aminoácidos serán los
aminoácidos patrón). En la sexta, se coloca la mezcla de aminoácidos problema, tal
como se ilustra en la Figura 2.
X X X X X X 0.5 cm
His Phe Pro Gly Leu Mezcla
4. Una vez que se hayan secado las aplicaciones, es conveniente realizar una segunda
en el mismo orden.
5. Proceda a colocar el cromatograma dentro de la cámara de cromatografía (Figura 3),
la cual habrá sido previamente preparada con el eluyente saturado dentro de las 24
horas anteriores a su uso. Al momento de colocar el papel dentro de la cámara,
deberá tener cuidado de que no se rebase el nivel de aplicación de las muestras,
antes de comenzar a ascender por capilaridad.
36
Figura 3. Forma de colocar el comatograma dentro de la cámara cromatográfica
(nota: el eluyente será transparente)
RESULTADOS
Anexe en el informe escrito el cromatograma ya revelado, con base en lo que obtuvo su
equipo durante el desarrollo de la práctica. Además, realice los cálculos para obtener el
Rf de cada aminoácido patrón, el cual se calcula de la siguiente manera:
Las medidas se toman desde el lugar donde se aplicó la muestra y debe tenerse presente
que el valor de Rf nunca podrá ser mayor a la unidad.
37
BIBLIOGRAFÍA CONSULTADA PARA ESTA PRÁCTICA
1. Alexander, R. and Griffiths, J. 1993. Basic biochemistry methods. 2a. ed. Ed. Wiley-
Liss. E.U.A.
a
2. Bohinski, R.C. 1998. Bioquímica. 5 . ed. Addison-Wesley Iberoamericana. EUA.
3. Bowen R.W. and Baxter D.W. 1980. Experimental cell biology: an integrated
laboratory guide and text. 2a. ed. Ed. Macmillan. E.U.A.
4. D „ Ocon, M.C. y col. 1999. Fundamentos y técnicas del análisis bioquímico. 1ª. ed.
Ed. Acribia. España.
5. Gonzalez de Butrago, A. y col. 1979. Conceptos, técnicas y problemas de bioquímica
básica. 2ª ed. Ed. Alhambra. España.
6. Laguna, J. y Piña, E. 1992. Bioquímica. Salvat. México.
7. Lehninger, A.1998. Bioquímica, Ed. Omega, Barcelona.
8. Murray, R.K., Granner, D.K., Mayes, P.A. y Rodwell, V.W. 2000. Bioquímica de
a
Harper .15 . ed. Manual Moderno. México.
38
PRÁCTICA 4. SEPARACIÓN E IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS
LÁCTEAS POR ELECTROFORESIS EN GEL DE POLIACRILAMIDA-
SDS (SDS-PAGE)
INTRODUCCIÓN
Las proteínas usualmente poseen una carga neta positiva ó negativa, que refleja la
mezcla de aminoácidos que contienen. Si un campo eléctrico es aplicado a una solución que
contiene una proteína, ésta migrará en un rango que depende de su carga neta, de su tamaño
y de su forma. Esta técnica, conocida como electroforesis, fue usada originalmente para
separar mezclas de proteínas, tanto en solución acuosa como incluidas en una matriz porosa
como el almidón.
Las proteínas no están en un medio acuoso convencional, sino que incluye un detergente de
carga muy negativa, el dodecilsulfato de sodio (SDS, por sus siglas en inglés) lo que
provoca que las proteínas migren hacia el electrodo positivo cuando es aplicado un voltaje.
En la ténica de SDS-PAGE, se mezclan las proteínas con el detergente SDS para formar
complejos desnaturalizados. La técnica de SDS-PAGE posee un alto poder de resolución.
Lo anterior se deriva del uso de un sistema electroforético discontinuo, formado de dos
geles de distinta porosidad y pH, que primero compactan las muestras (en el gel superior o
compactador) y luego las separan (en el gel inferior o separador)
Los geles de poliacrilamida constituyen un excelente medio de soporte para separaciones
electroforéticas, dado que reúnen una serie de propiedades idóneas: transparencia,
elasticidad, porosidad controlable y compatibilidad con una gran variedad de compuestos
químicos. La poliacrilamida se forma por copolimerización de dos compuestos, la
acrilamida y la bis-acrilamida (N,N'-metilén-bis-acrilamida), en una reacción iniciada por la
tetrametiletiléndiamina (TEMED) y el persulfato de amonio. El radical persulfato activa
al TEMED, el cual a su vez activa al monómero de acrilamida para que polimerice. Las
cadenas de poliacrilamida son entrecruzadas al azar por la bisacrilamida, formándose así
una red de porosidad bastante uniforme, que puede ser regulada variando las condiciones de
la reacción y las concentraciones de los monómeros.
Si la muestra ha sido reducida con 2-mercaptoetanol los enlaces disulfuro intra- e inter-
catenarios son disociados, la estructura cuaternaria se pierde y las subunidades se separan
como cadenas peptídicas individuales
39
Figura 1. SDS-PAGE de leches de cabra y fracciones separadas por RP-HPLC (muestras A, B, C y D). Las
muestras 1 y 2 son leches de cabras heterocigotas para las variables E/F y homocigotas para las variables A/A
para el locus s1-Cn.
OBJETIVO
Comprender los principios de la separación de proteínas por medio de la técnica de
electroforesis.
Conocer la importancia de los marcadores de peso molecular para la identificación de
las proteínas separadas.
Identificar las proteínas separadas y determinar su peso molecular
MATERIALES
Material Reactivos y soluciones
Cámara de electroforesis (una por cada 2 equipos)
Acrilamida 30%/bisacrilamida 0.8%
2 Placas de vidrio (por equipo) Tris-Cl 4X/SDS pH 8.8
1 Fuente de poder (por c/dos equipos) Tris-Cl4X/SDS pH 6.8
Micropipeta de 2-20 µL (por c/dos equipos) TEMED 8.4%
Micropipeta de 20-200 µL (por c/dos equipos) Persulfato de amonio 10%
Micropipeta de 200-1000 µL (por c/dos equipos)Buffer de corrimiento pH 8.6
Puntas para micropipetas β-mercaptoetanol
3 Pipetas de 5 mL Buffer regulador
Propipeta Solución de Azul de Coomassie
Solución desteñidora
Solución de albúmina de suero bovino
Material que deberá traer cada equipo Muestra biológica
1 par de guantes de latex y cubre bocas (por Leche de cualquier especie animal,
integrante) preparada previamente con buffer regulador
Charola de plástico con tapa de 12x12 cm de muestra pH 8.6 y -mercaptoetanol.
Plumón de tinta indeleble
40
METODOLOGÍA
1. Se usarán guantes de latex y cubre bocas durante todo el experimento.
2. A cada equipo se le proporcionará un par de placas de vidrio que limpiaran con SDS al
0.2% y toallas absorbentes.
Gel concentrador
Reactivos o soluciones Volumen
Agua destilada
Acrilamida 30% / Bis-acrilamida 0.8%
Tris-Cl 4X/SDS pH 6.8
Persulfato de amonio (APS) 10%
TEMED 8.4%*
c) Primero preparare el gel separador, vacíe esta mezcla se entre los cristales con una
micropipeta, dejando espacio para el gel concentrador, de aproximadamente 1.5 cm.
Debe tener cuidado de no dejar burbujas dentro de la mezcla, para evitar
distorsiones durante el corrimiento electroforético de la muestra.
d) Agregue cuidadosamente 200 µL de agua, sin mezclar con el gel separador, para
que cuando éste gelifique, se diferencie el gel del agua.
e) Una vez gelificado, retire el agua y seque la superficie del gel cuidadosamente con
papel filtro.
f) Agregue posteriormente el gel concentrador y antes de que gelifique, introduzca el
peine para formar los pozos donde serán agregadas las muestras.
g) Una vez gelificado, retire el peine.
41
h) Sin separar las placas de vidrio, el gel coloque en la cámara de electroforesis y se
procederá a llenar esta cámara con el amortiguador de corrimiento.
Amortiguador
Gel Ánodo
Amortiguador
Tinción
1. El gel se colocará en un recipiente con solución acuosa de azul de Coomassie para su
tinción.
2. Colocar el recipiente en un agitador orbital con movimiento moderado, las bandas de
proteínas teñidas pueden verse en menos de una hora si el colorante esta recién
preparado o al día siguiente si ya ha sido usado.
3. Posteriormente se destiñe con solución desteñidora, se vuelve a poner con esta solución
en el agitador.
4. Finalmente se observan las bandas de proteínas al día siguiente.
42
RESULTADOS
1. Calcule los valores de peso molecular de las proteínas obtenidas, con ayuda del
marcador de peso molecular (Albúmina de suero bovino).
2. ¿Cuántas proteínas contiene la muestra que recibió?
3. ¿Cuál es la más abundante y como determina esto a simple vista?
NOTA:
La acrilamida es NEUROTÓXICA. Al pesar el reactivo sólido debe usarse guantes y
mascarilla. Limpie cualquier residuo de acrilamida en la balanza y sus alrededores, pues la
inhalación es tan nociva como el contacto con la piel.
Al preparar geles es necesario usar guantes e igualmente, limpiar cualquier derrame. Los
sobrantes de solución de monómeros no deben ser vertidos en el desagüe, es mejor
polimerizarlos y descartarlos en forma de gel ya que EL POLÍMERO PIERDE LA TOXICIDAD.
43
MEDICIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
ENZIMA UREASA
La ureasa fue de las primeras enzimas en ser caracterizadas por Sumner en 1926.
Esta enzima tiene especificidad absoluta por un solo sustrato, la urea. La ureasa cataliza la
reacción que hidroliza este compuesto nitrogenado en dos moléculas del ión hidróxido de
amonio y una de bióxido de carbono, dicha reacción se muestra en la Figura 1. Para llevar
2+
a cabo su actividad requiere del ión Ni .
2 NH+3
Figura 1. Reacción de la hidrólisis de la urea por la enzima ureasa
44
bacterias ruminales permite obtener el ión amonio que es reabsorbido como amoníaco y
utilizado para la formación de aminoácidos. Conocida esta propiedad fisiológica de los
rumiantes, con fines zootécnicos de alimentación se ha extendido la práctica de suministrar
urea como fuente de nitrógeno no proteico, especialmente en explotaciones intensivas.
La ureasa tiene un peso molecular de 483 Kd y un punto isoeléctrico de 5.0. Consta
de seis subunidades idénticas. Además de ser producida por las bacterias del rumen,
también es producida por diversos invertebrados marinos, así como ciertas plantas
leguminosas como el frijol de soya y el haba.
CINÉTICA ENZIMÁTICA
La cinética enzimática comprende el estudio de la velocidad de reacción de una
enzima determinada y de las condiciones que la modifican. Las variables importantes en los
estudios cinéticos son las concentraciones de sustrato (S) y producto (P), temperatura,
presión, el efecto de ciertos disolventes, cambios de pH, fuerza iónica del medio, tiempo, la
presencia de inhibidores, así como la estereoquímica y la estequiometría de las moléculas
involucradas, entre otros factores.
En forma práctica, la velocidad de reacción de una enzima puede determinarse
utilizando cualquiera de los siguientes procesos:
a) Medir la disminución en la concentración de sustrato en una unidad de tiempo
determinada.
b) Medir el aumento en la concentración de producto final en una unidad de tiempo
determinada.
c) Medir el cambio en la concentración de una coenzima en una unidad de tiempo
determinada, como medición indirecta de la actividad de la enzima.
Los primeros conocimientos sobre el comportamiento enzimático se deben a V.
Henri (1903) y más adelante a L. Michaelis y Maud L. Menten (1913). Henri y el equipo de
Michaelis y Menten propusieron en esencia al mismo modelo, pero los segundos basaron el
suyo en datos obtenidos mediante experimentos de laboratorio cuidadosamente diseñados y
controlados.
El trabajo experimental de Michaelis y Menten se realizó con un extracto de
levaduras ricas en invertasa, enzima que cataliza la hidrólisis del carbohidrato sacarosa. Se
recopilaron datos sobre los cambios en la velocidad inicial v0 de dos experimentos
independientes que consistían en:
1) Cuando la concentración de sustrato [S] se mantuvo constante mientras se hacía
variar la cantidad de enzima [E], se observó un incremento lineal en la velocidad al
aumentar la concentración de enzima presente.
2) En experimentos de tipo inverso, cuando la concentración de la enzima [E] se
mantuvo constante y se hizo variar la cantidad de sustrato [S], lo que se observó fue
una reacción hiperbólica entre la velocidad y la concentración de sustrato [S].
Se propuso que la enzima podía cambiarse de modo reversible con el sustrato para
formar un complejo intermediario integrado por la enzima y el sustrato, ES, el cual se
descompone luego para formar los productos P y la enzima libre en su forma original.
E+SESP+E
45
OBJETIVO
Determinar los diversos factores que influyen en la actividad de las enzimas y la
manera en la que pueden ser observados y medidos en el laboratorio, tomando como
ejemplo a la ureasa producida por el frijol de soya.
Determinará la influencia del inhibidor Bicloruro de Mercurio (HgCl2), en la
reacción catalizada por la ureasa.
MATERIALES
Material y equipo Reactivos y soluciones
5 Tubos de ensaye grandes Urea 0.25 M.
3 Pipetas (1, 5 y 10 mL) Amortiguador de fosfatos 0.05 M, pH 7.2.
2 Matraces Erlenmeyer de 250 mL Amortiguador de fosfatos de pH diferentes
1 Bureta de 25 o 50 mL Bicloruro de mercurio al 1%.
1 Soporte universal Ácido clorhídrico 0.1 N.
1 Pinzas de bureta Rojo de metilo al 0.04%.
1 Propipeta MUESTRA BIOLÓGICA
Gradilla para tubos de ensaye Extracto de ureasa proveniente de frijol de soya
Vórtex
1 Piseta Termómetro
Baño María
Material que deberá traer cada equipo
Guantes de latex Toallas de papel
Plumón indeleble Detergente
METODOLOGÍA
Determinación del efecto de la variación en la concentración de sustrato (urea)
sobre la velocidad de reacción de la ureasa.
Prepare la siguiente serie de tubos:
Tubo 1 2 3 4 5
Urea 0.25 M 0.5 1 2 5 7.5
Amort. fosfatos pH 7.2 1 1 1 1 1
Agua destilada 8 7.5 6.5 3.5 1
Incubar en baño María durante 5 min. a 50ºC
Ureasa 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Incubar en baño M aría durante 30 min a 50ºC
HgCl2 al 1% (gotas) 4 4 4 4 4
Cada volumen agregado a los tubos será en mL, excepto donde indica gotas.
46
además que se trata de una solución ácida y no es correcto titular un ácido con otro
ácido.
3. Cuando la solución sea amarilla, proceda a titular, agregando lentamente al matraz
ácido clorhídrico 0.1N por medio de la bureta, hasta que el color del indicador vire a
canela. Anote los mL de HCl utilizados en la titulación.
4. Titule 5 mL de cada uno de los tubos restantes de este experimento en su respectivo
matraz, tal como se realizó con el tubo inicial.
5. El contenido de las soluciones tituladas se verterá en un contenedor etiquetado
como RESIDUO
6. El HCL 0.1 N de la bureta se reciclará en el mismo matraz de donde lo obtuvo.
47
Determinación del efecto de la variación del pH del medio sobre la velocidad de
reacción de la ureasa.
Prepare la siguiente serie de tubos:
Tubo 1 2 3 4 5
Urea 0.25 M 5.0 5.0 5.0 5.0 5.0
4,5 mL de fosfatos con pH 4.5 6 7,2 8.5 10
Incubar en baño María durante 5 min. a 50ºC
Ureasa 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 ml
Incubar en baño María durante 30 min. a 50ºC
HgCl2 al 1% (gotas) 4 4 4 4 4
Cada volumen agregado a los tubos será en mL, excepto donde indica gotas .
Realice la titulación de cada tubo, como se indica del punto 2 al 6 de esta metodología.
RESULTADOS
Calcule lo que se pide en los siguientes cuadros.
Para calcular los M de urea inicial, se debe considerar que ésta se preparó a 0.25 M, es
decir, hay 250 M por cada mL y cada tubo tendrá un volumen final de 10 mL. Esto se
48
Determinación del efecto de la variación en la concentración de enzima (ureasa) sobre
la velocidad de reacción de la misma.
Tubo mL de enzima inicial mL gastados M de urea
en cada tubo (x) hidrolizada (y)
1
2
3
4
5
Se procederá a graficar* las μM de urea hidrolizada en el eje de las ordenadas (y) y los mL
de enzima inicial en el eje de las abscisas (x).
Determinación del efecto de la variación del pH del medio sobre la velocidad de reacción de la
ureasa
Tubo pH del medio (x) mL gastados M de urea
hidrolizada (y)
1
2
3
4
5
Se procederá a graficar* las μM de urea hidrolizada en el eje de las ordenadas (y) y el pH
del medio en el eje de las abscisas (x).
*Reportar sus cálculos y gráficas elaboradas en una hoja de cálculo (Excel).
Analizar acerca de los resultados obtenidos en cada uno de los ensayos efectuados
para determinar el efecto de la concentración de sustrato, la concentración de enzima, la
temperatura y el pH en la actividad de la ureasa.
49
MÉTODOS DE CUANTIFICACIÓN DE BIOMOLÉCULAS
50
Estructura secundaria α-hélice
Estructura primaria
Estructura terciaria
Estructura cuaternaria
Figura 1. Niveles de organización o estructuras tridimensionales de las proteínas.
51
fluorescencia de soluciones estándar preparadas con proteínas purificadas. Este ensayo
puede ser usado para cuantificar soluciones con concentraciones de 5-50 mg/mL.
Existen otros métodos para la cuantificación de proteínas basados en la unión de un
colorante. Ejemplos de ellos son:
Bradford: Se emplea azul brillante de Coomassie. Está diseñado para cuantificar de
1-10 mg de proteína. Las determinaciones de proteína en el rango de 10-100 mg
pueden ser realizadas incrementando el volumen de la solución del colorante 5
veces y usando tubos más grandes o placas de cultivo (microBradford).
Lowry: Cuantifica el color obtenido de la reacción entre el reactivo de Folin-fenol
Ciocalteu con los residuos tirosil de una proteína desconocida Este ensayo está
diseñado para cuantificar de 1-20 mg de proteína. Las determinaciones de proteína
en el rango de 5-100 mg puede realizarse incrementando todos los volúmenes 5
veces. Este método no es apropiado para proteínas que no contengan residuos de
tirosina, dado que el ensayo se basa en la reacción de estos residuos con el reactivo
de Lowry. Además, aunque es un método sensible, la cantidad de color producido
varía con diferentes proteínasy en ocasiones el color no es estrictamente
proporcional a la concentración.
Biuret: Se base en el uso una solución de sulfato de cobre a un pH altamente alcalino,
+
permitiendo que los iones de Cu en presencia de proteínas formen complejos químicos
conocidos como quelatos y obteniendo finalmente una
coloración azul-púrpura.
Los métodos colorimétricos más frecuentemente usados para cuantificar proteínas
son; Bradford y Lowry. El método de Bradford, es más rápido que el de Lowry.
CURVA DE CALIBRACIÓN
En la cuantificación de proteínas, independientemente el método de elección, debe
compararse la absorbancia obtenida de la muestra de proteína contra la de una proteína
conocida con concentración conocida (estándar). Para ello, se realizan una serie de
diluciones de la proteína estándar, se determina la absorbancia de cada una y finalmente
se realiza una curva estándar o curva de calibración (absorbancia vs concentración). Una
vez realizada esta curva, se podrá comparar la absorbancia de la muestra y determinar su
concentración. La proteína estándar preferentemente empleada es la albúmina de suero
bovino (BSA por sus siglas en inglés).
OBJETIVOS
Determinar la concentración de proteínas de una muestra a través del método de Bradford.
Realizar una curva de calibración para cada método.
Aprender el uso del espectrofotómetro para medir la absorbancia.
52
MÉTODO DE BRADFORD
MATERIALES
Material y equipo Reactivos y soluciones
10 Tubos Eppendorf Albúmina de suero bovino (BSA): 1g/L
Micropipeta 2-20 L (por c/dos equipos)
Micropipeta 20-200 L (por c/dos equipos) Reactivo de Bradford
Micropipeta 200-1000 L (por c/dos equipos) Agua destilada
Puntas para micropipetas Muestra biológica
Espectrofotómetro Suero sanguíneo, leche o calostro
Celdas de lectura
METODOLOGÍA
1 A partir de los tubos de BSA de 1000 µL de agua destilada, preparar la siguiente serie de tubos (1 al 6)
completando con agua destilada hasta un volumen de 1000 µL
BSA
Tubo Agua destilada (µL)
(µg/µL)
1 0 1000 Blanco
2 125 875
4 500 500
5 750 250
6 1000 0
2. Al tubo 1 se le adicionará 300 µL del reactivo de Bradford, se vaciará a la celda del espectrofotómetro y se
procederá a calibrar a cero (Tubo blanco). Se realizará la lectura a 595 nm. Dejar en la celda por si es
necesario volver a calibrar
3. Cuando el espectrofotómetro esté calibrado, se adicionarán 300 µL del reactivo de Bradford a cada tubo (2
al 7) e inmediatamente se procede a realizar la lectura (volumen total de cada tubo 1300 µL)
4 .La lectura se hará del tubo 2 al tubo 6 para realizar la curva de calibración, vaciar de uno en uno el tubo en
la celda y leer. En éste orden no es necesario enjuagar la celda (Solo se cuenta con una celda para lectura )
Tener cuidado del orden de los tubos.
5. Se realizará la lectura de la muestra problema en una celda limpia.
6. Anotar toda las lecturas teniendo cuidado del orden de lectura,
53
RESULTADOS
1. Realizar la curva estándar con las lecturas obtenidas de los tubos 1 al 6 en papel
milimétrico graficando los g/L de BSA en el eje de las abscisas (X) y la absorbancia
de cada una de estas concentraciones en el eje de las ordenadas (Y). Indicar en esta
gráfica la absorbancia del problema e interpolar el eje de las abscisas para determinar la
concentración de proteína de la muestra Figura 2.
Absorbancia
(Y)
2. Realizar otra curva estándar en una hoja de cálculo (Excel) y calcular la concentración
de la proteína muestra por regresión lineal con la fórmula:
y= mx+b
Despejando x:
y b
x m
en donde:
x= concentración de proteína de la muestra
y= absorbancia del problema
b= ordenada al origen
m= pendiente
3. El valor obtenido corresponderá al total de g de proteína en el volumen de muestra
usado. Si la muestra se diluyo, el valor obtenido deberá multiplicarse por la dilución
para obtener la concentración de proteína en la muestra en el orden de g/L.
4. Efectuar una discusión en equipo en torno al logro del objetivo, desarrollo
metodológico y resultados obtenidos.
54
BIBLIOGRAFÍA CONSULTADA PARA ESTA PRÁCTICA
1. Bradford, MM. 1976. A rapid and sensitive method for the quantitation of micrograms
quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Analytical Biochem.
72:248-252.
2. Bohinski, R.C. 1991. Bioquímica. 5ª ed. Addison Wesley Iberoamericana. EUA.
3. García, AH. y Vázquez DR. 1998. Cuantificación de proteínas: una revisión. Bitácora.
BioTecnología. 3: 77-88
4. Laguna, J. y Piña E. 2002. Bioquímica. 5ª ed. Manual Moderno. México.
5. Murray, RK., Mayes, PA., Granner, DK. y Rodwell, VW. 2000. Bioquímica de Harper.
15ª ed. Manual Moderno. México.
6. Mathews, CK., Van Holde, KE. y Ahern, KG. 2002. Bioquímica. 3ª ed. Addison 7.
Wesley. España
8. McKee, T. Y McKee, JR. 2003. Bioquímica. La base molecular de la vida. 3ª ed.
McGraw-Hill. España. pp. 125-138
55
PRÁCTICA 7. CUANTIFICACIÓN DE LOS NIVELES DE GLUCOSA
INTRODUCCIÓN
Los carbohidratos tienen como fórmula general (CH2O)n Se clasifican en
monosacáridos, disacáridos, oligosacáridos y polisacáridos, dependiendo del número de
azúcares simples que los forman. Los monosacáridos o azucares simples, están constituidos
por un único polihidroxialdehido o bien por una sola polihidroxicetona. Los oligosacáridos
contienen de 2 a 10 unidades monosacáridas unidas por enlaces glucosídicos. Los
polisacáridos están constituidos por cadenas muy largas de unidades monosacáridas que
pueden ser lineales o ramificadas.
En la biósfera hay mas hidratos de carbono que toda la demás materia orgánica, ya
que el almidón y el glucógeno (2 polímeros de la glucosa) son un material de reserva
energética en la mayoría de las células.
GLUCOSA
La glucosa es el azúcar más importante ya que de ella obtenemos nuestra principal
fuente de energía. Sin embargo, existen alteraciones que pueden provocar que esta circule
por la sangre en niveles altos o bajos. Estas alteraciones pueden tener causa fisiológica,
(generalmente mediada por hormonas), aunque también pueden ser de tipo anormal
(patológico).
En el caso de que los niveles de glucosa sean altos, se le denomina hiperglucemia. Esta
puede ser producida por insuficiencia de la hormona insulina, lo cual impide que la gran
mayoría de las células del cuerpo puedan introducir la glucosa a su citoplasma y esta
permanece circulante en la sangre. Esta condición es conocida como diabetes y afecta al
hombre y a algunos animales domésticos como el perro y el gato. Cuando los niveles de
glucosa son bajos, se conoce como hipoglucemia. Esto también puede ser producido por
efecto de las hormonas. Esta condición también tiene causa hormonal (fisiológica o
patológica). En la producción porcina, la hipoglucemia de los lechones es un evento común
no deseable porque puede ser mortal y genera pérdidas económicas.
Debido a lo anterior, es importante en ocasiones llevar a cabo una medición de los
niveles de glucosa sanguínea, preferentemente en ayunas, para realizar un diagnostico
clínico de apoyo en aquellas enfermedades relacionadas con el metabolismo de
carbohidratos. Un método rápido, relativamente sencillo, basado en la lectura de
absorbancia es el método de Dubowsky.
OBJETIVOS
Conocer la importancia de la cuantificación de glucosa en sangre en el diagnóstico clínico.
Explicar las posibles alteraciones en el metabolismo de glucosa con respecto a la
cuantificación de los niveles de glucosa en sangre
Realizara por equipo la revisión de artículos arbitrados relacionados con el tema en
medicina veterinaria
BIBLIOGRAFÍA CONSULTADA PARA ESTA PRÁCTICA
1. Anderson, N.V., 1966. “Laboratory Diagnosis Of The Canine Pancreatic Diseases” Southwest.,
Vet 19 p 119
2. Devaux, Guy , et al ,1999. Técnicas de Bioquímica Clínica, Editorial Jims. Barcelona.
3. Kaneko, JJ 1989, Clinical Biochenistry of Domestic Animals. 4a ed. Academic Press, New
York.
56
PRÁCTICA 8. CUANTIFICACIÓN DE COLESTEROL EN SUERO
SANGUÍNEO POR EL MÉTODO DE LIEBERMANN-BURCHARD
INTRODUCCIÓN
Los esteroles son derivados lipídicos, que se encuentran presentes en la mayoría de
las células eucariotas. Su estructura característica es un núcleo esteroide que consiste en
cuatro anillos fusionados, tres de ellos con seis carbonos y uno con cinco; a este grupo de
anillos también se le llama grupo ciclopentano-perhidrofenantreno. El núcleo esteroide es
casi plano y relativamente rígido, los anillos fusionados no permiten la rotación alrededor
de los enlaces C-C.
COLESTEROL
Es el principal esterol en tejidos animales, el cual es un compuesto anfipático, con un grupo
de cabeza polar (el grupo hidroxilo en C-3) y un cuerpo hidrocarbonado apolar (el núcleo
esteroide y la cadena lateral hidrocarbonada en C-17) que es casi tan largo como un ácido
graso de 16 carbonos en su forma extendida Figura 1. Los esteroles de todas las especies se
sintetizan a partir de subunidades isopropeno de cinco carbonos (lo mismo que las
vitaminas liposolubles, las quinonas y los dolicoles).
En algunos seres vivos se encuentran esteroles similares al colesterol, por ejemplo
el estigmasterol (en plantas) y el ergosterol (en hongos). Por otra parte, cabe señalar que,
con pocas excepciones, las bacterias carecen de esteroles.
57
IMPORTANCIA DE LA CUANTIFICACIÓN DE COLESTEROL
La importancia de determinar cuantitativamente el colesterol radica en conocer los
niveles de dicho compuesto en el suero, ya que constituye un indicador del estado
metabólico y fisiológico del organismo animal. Es así como podemos llegar a darnos cuenta
de un posible riesgo en la acumulación de lípidos y estrechamiento gradual de las arterias
en los animales.
En la presente práctica, se realizará la determinación de este compuesto a través de un
reactivo que es capaz de reaccionar selectivamente con el colesterol, para ello, se deberá
haber precipitado previamente las proteínas del suero. Para lograr esta precipitación se
utilizará una solución alcohólica de hidróxido de potasio (KOH) y éter de petróleo. La
reacción del colesterol con el reactivo de Liebermann-Burchard modificado, dará como
resultado una variación en la intensidad de la coloración en diferentes diluciones patrón de
colesterol. La concentración de colesterol de la muestra de suero será determinada a través
de la curva de calibración.
OBJETIVOS
Comprender el significado metabólico y fisiológico de la variación de las
concentraciones de colesterol en la sangre del organismo animal.
Familiarizarse con una técnica utilizada en la determinación cuantitativa del
colesterol en el suero sanguíneo, como herramienta para el diagnóstico de
alteraciones en la concentración del mismo en los animales.
MATERIALES
Material y equipo Reactivos y soluciones
2 Tubos de ensaye grandes Estándar de colesterol (0.4 mg/ml)
6 Tubos medianos Solución alcohólica de KOH
6 Tubos para espectrofotómetro Éter de petróleo
1 Gradilla para tubos de ensaye Anhidro acético
2 Pipeta de 1 mL Ácido sulfúrico
2 Pipetas de 5 mL Ácido acético glacial
2 Pipetas de 10 ml
1 Propipeta
Espectrofotómetro Muestra biológica
2 Parrillas eléctricas (por grupo) Suero sanguíneo
4 Vasos de precipitados 250 mL (por grupo)
1 Termómetro (por grupo)
1 Vórtex
Material que deberá traer el grupo
1 rollo de papel aluminio
Material que deberá traer cada equipo
Toallas absorbentes Masking tape
Plumón indeleble Pinzas de disección sin dientes de ratón
Detergente líquido
Material que deberá traer de manera individual
Gafas protectoras, guantes y cubre bocas
58
RECOMENDACIONES PARA LA REALIZACIÓN DE LA PRÁCTICA
Durante todo el desarrollo de la práctica, deberá usar cubre bocas,guantes, y gafas protectoras,
además de seguir las indicaciones que mencionen los profesores.
contacto con el reactivo de Liebermann-Burchard debe
El material de vidrio que entra en
trabajarse perfectamente SECO.
deberá regresarse LIMPIO Y PERFECTAMENTE SECO al término de la
El material
práctica.
METODOLOGÍA
Los profesores le proporcionarán a cada equipo dos tubos grandes, los cuales fueron
preparados de la siguiente manera:
Tubos
Estándar Problema
Estándar de colesterol 5.0 ---
Suero sanguíneo --- 2.0 ml de suero
Solución alcohólica de KOH 5.0 5.0
Agitación e incubación a 40º C por 55 minutos
Enfriamiento a temperatura ambiente
Éter de petróleo 10 10
Agua destilada 1 1
Agitación vigorosa por 1 minuto
Las unidades de medición son en ml.
1. Mida con la pipeta ___ ml del éter de petróleo del tubo problema y transfiera a un tubo
mediano. Rotule con plumón indeleble con la letra P.
2. Del tubo estándar, mida del éter de petróleo, los mL que le indique su profesor los
cuales se pasarán a 6 tubos medianos cada medida. Rotule perfectamente sus tubos
como E1, E2 y así sucesivamente.
3. Coloque los tubos en baño maría dentro de la campana de extracción hasta que se
evapore el éter de petróleo. Cabe señalar que se deberá secar perfectamente
cualquier residuo de agua, ya que de lo contrario, al agregar el reactivo de
Liebermann-Burchard, se puede producir una reacción de combustión, con la
consecuente explosión.
4. Enfríe los tubos a temperatura ambiente y envuélvalos en papel aluminio.
5. Agregue 3.5 mL del reactivo de Liebermann-Burchard modificado, el cual será
preparado por el profesor en la campana de extracción de la siguiente forma:
a) 20 volúmenes de ácido acético anhídro (enfriado previamente por 10 min. a 10º C)
más un volumen de ácido sulfúrico concentrado. Mezclar suavemente y refrigerar
por 9 min. Este reactivo deberá usarse dentro de la primera hora de elaboración.
b) Después de enfriar la mezcla anterior, agregar 10 volúmenes de ácido acético
glacial y mezclar perfectamente.
Es importante recordar que debido a su composición química, el reactivo de
Liebermann-Burchard no deberá entrar en contacto con el agua.
59
6. Agite gentilmente y colóquelos en baño María a 25º C por 30 min., tapando la boca de
sus tubos. Al sacar del baño María tenga cuidado de no salpicar sus muestras ni las de
los demás compañeros
7. Calibre el espectrofotómetro con un tubo blanco, el cual contendrá 3.5 ml del reactivo
de Liebermann-Burchard, a una longitud de onda de 575 nm.
8. Deberá cerciorarse que los tubos para realizar la lectura en el espectrofotómetro
estén perfectamente secos antes de verter la mezcla, que salió de incubación, ya que
como se ha mencionado reiteradamente, dicho reactivo no debe entrar en contacto con
el agua. Para asegurarse, seque perfectamente la parte interna de los tubos con un trozo
de toalla de papel auxiliándose con unas pinzas de disección sin dientes de ratón.
9. Realice la lectura de absorbancia de cada tubo y anote sus resultados.
10. Al terminar sus lecturas pase la gradilla de sus tubos cerca de la tarja para que el
profesor se haga cargo de los residuos generados.
11. El contenido de los tubos que aun contienen éter de petróleo deberá vaciarlo en el
contenedor que estará etiquetado como RESIDUO
12. LAVE Y SEQUE PERFECTAMENTE TODOS LOS TUBOS.
RESULTADOS
Realice la curva de calibración en papel milimétrico y en hoja de cálculo (Excel)
como se explica en la Práctica “Cuantificación de proteínas por el método de Bradford ”. El
eje de las ordenadas representará la variable de absorbancia y el eje de las abscisas la de
concentración de colesterol estándar (mg/mL). Calcule los mg de colesterol por mL de
suero con la ecuación:
x= y-b/m
60
PRACTICA 9. AISLAMIENTO Y CUANTIFICACIÓN DEL ADN
INTRODUCCIÓN
Las células procariotas carecen de núcleo y tienen un solo cromosoma, pero también es
posible que tengan ADN no cromosómico en forma de plásmidos.
El ADN es un polidesoxirribonucleotido que contienen muchos
monodesoxirribonucleotidos unidos mediante enlaces fosfodiéster. Excepto por unos
cuantos virus que contienen ADN de cadena sencilla, el ADN existe como una molécula de
doble cadena, que forma una doble hélice. En las células eucariotas, el ADN se encuentra
relacionado con varios tipos de proteínas (conocidas en conjunto como nucleoproteínas),
presentes en el núcleo, en tanto que en los procariotas el complejo proteína-ADN se
encuentra en el nucleoide.
5. F
ig 1
Debido a que el tamaño del núcleo celular impediría la existencia de las cromosomas en
forma extendida, el ADN se compacta formando estructuras superenrolladas. Para lograr
esto es necesaria la interacción del ADN con una gran cantidad de proteína, cada una de las
cuales realiza una función específica en el empacamiento ordenado de estas largas
moléculas de ADN. El ADN eucariota se relaciona con proteínas básicas unidas con
firmeza llamadas histonas. Sirven para ordenar el ADN en unidades estructurales básicas
llamadas nucleosomas y que se parecen a las cuentas de un collar. Los nucleosomas se
disponen además en estructuras cada vez más complejas que organizan y condensan las
largas moléculas de ADN en cromosomas que pueden separarse durante la división celular.
61
La extracción se basa en técnicas de ruptura celular por métodos físicos (maceración,
filtración y centrifugación) y químicos, donde la lisis celular es llevada a cabo por
exposición a agentes que afectan la integridad de la membranas celulares:
NaCl, es una sal que degrada las membranas celulares por su carácter negativo.
Papaína, es una enzima que desnaturaliza proteínas.
El dodecil sulfato de sodio (SDS), es un detergente iónico que actúa separando las
grasas (lípidos) y las proteínas que constituyen las membranas que rodean la célula
Una vez que estas membranas se han roto, el ADN es liberado de la
y el núcleo.
célula.
Figura 2. Ejemplifica la apetencia que tiene el detergente sobre las proteínas que
conforman la membrana celular
62
OBJETIVOS
Comprender la importancia del ADN celular
Realizar la técnica de extracción del ADN de un tejido animal
Cuantificar a través de espectofotometría, el ADN extraído
MATERIALES
METODOLOGÍA
63
10. Calibre el espectrofotómetro con un tubo blanco que contenga 5 mL de NaOH al
8mM. Lea a una absorbancia de 340 nm
RESULTADOS
1. Alberts, B. y col. 1994. Molecular biology of the cell. 3a.. Garland. E.U.A.
Barrera, S.H.A. 1992. Interacción genética: su estructura, función y manipulación.
CONACYT. México.
2. Bowen, R.W. y Baxter, D.N. 1980. Experimental cell biology: an intejnted laboratoy
guide and text. 2a ed. Mc Millan. EUA.
3. Curtis, H. y col. 2000. Biología. 6ª. Médica Panamericana. España.
4. Champe
5. Glauert A. 1991. Fixation, dehydration and embedding of biological specimens. 8a.
North-Holland Publishing Company. E.U.A.
6. Hernández-Montes, H.G.,Iglesias, S. y Mujica, A. 1973. Solubilization of mammalian
spermatozoa structures. Explt. Cell Res. 76: 437-440.
7. Holtzman, E. y Novikoff B., A. 1988. Estructura y dinámica celular. 3a. Interamericana.
México.
8. Lehninger, A.A. 1993. Principles of biochemistry. 2a ed. Worth. EUA.
www.arrakis.es/~rfluengo/anucleico.html
www. Ceniap.gov.ve/pbd/Revistas técnicas/ceniaphoy/guillen at.pdf
64
APÉNDICE 1
SOLUCIONES, ÁCIDOS, BASES E INDICADORES DE PH
65
Cuadro 2. pH de algunas sustancias o soluciones y coloración que adquieren
diferentes indicadores
66
APÉNDICE 2
FUNCIONES Y USO DEL EQUIPO E INSTRUMENTOS EMPLEADOS EN EL
LABORATORIO DE BIOQUÍMICA
Balanza granataria: Esta es utilizada para pesar de 0.1 a 100 g. Algunas presentan un solo
plato y otras dos. Están hechas de metal.
(c)
(b)
(a)
(d)
Balanzas granatarias
67
Balanza analítica: Este tipo de balanza nos permite pesar de 0.0001 hasta 200 g. Es
más precisa que la granataria. Es importante tomar en cuenta que debe permanecer
en un lugar fijo, ya que el movimiento la descalibra fácilmente.
Balanza analítica
(a)
(d) (b)
(e)
(c)
68
7. Para pesar debemos abrir la puerta derecha y colocaremos en el centro del platillo el
recipiente donde se pesará la muestra.
8. Mover la palanca hacia arriba y ajustar el cero de la escala en la marca, esto permitira
descontar el peso del recipiente.
9. Proceder a mover la escala al peso que se desea y posteriormente bajar la palanca.
10. Agregar poco a poco la muestra hasta obtener el peso deseado.
11. Poner la palanca en posición horizontal.
12. Abrir la puerta derecha y sacar el recipiente. Colocar las pesas en cero.
13. Limpiar el platillo de la balanza y cerrar las puertas.
Baño María: Nos sirve para realizar algunas incubaciones a temperaturas superiores a la
del medio ambiente. Existen algunos tipos de baño María que tienen integrado un
mecanismo de movimiento, lo cual permite que la solución adquiera la temperatura deseada
de manera homogénea.
(b) (c)
(a)
69
Algunos potenciómetros deben calibrarse con dos soluciones buffer una con pH
ácido y otra con pH básico.
Potenciómetros
(a)
(b)
70
Partes del fotocolorímetro
El fotocolorímetro Klett-Summerson consta esencialmente de las siguientes partes,
las cuales se pueden apreciar en el siguiente esquema.
1. Fuente luminosa o lámpara que emite la luz.
2. Dispositivo colimador. Para alinear los rayos luminosos, formando un haz de rayos
paralelos.
3. Selector de longitud de onda, comúnmente llamado filtro, el cual tiene como
función eliminar del haz de luz las radiaciones de longitud de onda que se desee,
para obtener así luz monocromática. Existen tres tipos de filtros, mismos que se
seleccionan dependiendo del color de la solución por estudiar. El filtro azul presenta
una escala espectral de 400 a 465 nm, el verde de 500 a 570 nm y el rojo de 640 a
700 nm.
4. Fotocelda. Transforma la energía luminosa que incide sobre la solución de energía
electrónica.
5. Potenciómetro. Mide la corriente generada en la fotocelda, con escala graduada en
unidades Klett; las cuales presentan equivalencia con las unidades de densidad
óptica (D.O.) de acuerdo a la siguiente fórmula:
1
2 3 4
1 4
2 3 A 5
71
3. Encienda la lámpara con el apagador de la luz (e) y deje que el instrumento
se caliente 5 minutos, hasta que se equilibre para su operación.
4. Ajuste la escala del potenciómetro (b) a cero, moviendo la perilla (a).
5. Coloque el tubo con el blanco de reactivo en el orificio (f) que presenta el
aparato en la parte superior.
6. Encienda el interruptor (h) y con la perilla (g) ajuste la lectura.
7. Una vez calibrado el aparato, se apaga el interruptor (h) y se saca el tubo blanco.
8. Para leer la absorbancia de cualquier tubo, éste es colocado ahora en el orificio (f)
y se debe utilizar nuevamente el sistema de encendido (h). La aguja (c) se desviará
de su posición central hacia un extremo, entonces mueva la perilla (a) que gira la
escala (b), hasta que la aguja (c) marque el trazo central.
9. Anote la lectura en unidades Klett que se tiene en la escala (b) y que posteriormente
se debe convertir a densidad óptica (D.O.) al dividir entre 500. Este es el valor de
absorbancia de la solución colorida que se esta leyendo y no olvide que las lecturas
menores de 25 y mayores de 500 no son confiables.
Fotocolorímetro
(c)
(h) (e)
72
4. Entre sus detectores fotosensibles, cuenta con fotoceldas de capa interpuesta,
tubos fotoemisores y tubos fotomultiplicadores que junto con un miliamperímetro
permiten la obtención de los valores precisos de absorbancia y transmitancia.
(d)
(a)
(c)
(b)
ESPECTROFOTÓMETRO
Cámara de elctroforesis
Fuente de poder
73
APÉNDICE 3
HOJAS DE SEGURIDAD DE LOS DIFERENTES REACTIVOS EMPLEADOS EN EL
LABORATORIO DE BIOQUÍMICA
74