Tutorial TotalChrom
Tutorial TotalChrom
Tutorial TotalChrom
Versin 6.2
CONTENIDO
Tutorial Parte I
q q
El Navegador del Totalchrom.................................................................... 3 Coleccionando su Primer Archivo de Datos.............................................5 Construyendo un Mtodo Rpido...................................................9 Construyendo una Lista de Viales................................................ 14 Inyectando su Estndar y Adquiriendo datos............................. 17 Revisando la Grafica.......................................................................18 Amplificando la Grafica......................................................19 Re escalando la Grafica.......................................................20 El reporte de default y la Grafica......................................21
Tutorial Parte 2
q
q q
q q
Optimizando un mtodo utilizando el Editor Grafico de Mtodo............ 22 Abriendo el Editor Grafico del Mtodo....................................... 23 Cambiando el display de la Grafica............................................. 26 Afinacin Fina de la Deteccin de Picos...................................... 29 Creando una Lista de Componentes ........................................... 34 Utilizando el Editor del Mtodo................................................................... 38 Fijando los parmetros de calibracin............................................. 38 Llevando a cabo una calibracin manual.......................................... 42 Guardando un mtodo......................................................................... 47 Construyendo un Formato de reporte...........................................................48 Construyendo una Secuencia..........................................................................51 Utilizando la Plantilla de la Secuencia.................................................51 Utilizando la Hoja de calculo de la Secuencia....................................54 Reprocesamiento en Lote de Archivos de una Secuencia.............................59 Revisar los Resultados utilizando el Reproceso de Resultados...................61
TUTORIAL (PARTE 1)
Navegador TotalChrom
Ud. puede accesar a las diferentes funciones del Totalchrom desde la ventana del Navegador . La forma ms conveniente de iniciar en el Navegador es desde la ventana de TCWS Links ( TCCS_Links para TotalChrom Cliente/Servidor), el cual es creado durante la instalacin Para abrir la ventana de Navegador: 1. Dar un click en el botn de inicio y seleccione Programas Seleccionar TotalChrom Workstation Ver6.2 Dar doble click en el icono de TCNav ,
Nota: Usted deber registrarse con una cuenta de usuario, la cual ha sido previamente autorizada por el gerente. Si usted tiene alguna pregunta, consulte a su gerente de sistemas.
____________________________________________________________Tutorial Parte I
2. Escriba su nombre de usuario y su contrasea. Despus seleccione OK. Aparecer la ventana de Totalchrom Navegator
Barra de titulo Barra de menu
Barra de status
La ventana de Navegador es una representacin grfica de las funciones principales del TotalChrom. El Navegador tiene cuatro reas principales: La barra del Ttulo y del Men en la parte superior El Tablero de Seleccin de instrumentos a la izquierda. Los iconos de las funciones en la parte central de la pantalla. La Barra del estado del instrumento en el fondo de la ventana.
Nosotros utilizaremos el tablero de seleccin de instrumento y algunos iconos de las funciones en este tutorial.
1. De la ventana de seleccin del Instrumento del Navegador, seleccione el instrumento que usted quiere utilizar para la coleccin de datos, (usted utilizar este instrumento a lo largo del tutorial)
____________________________________________________________Tutorial Parte I
2. Dar un click en el icono del Setup del Navegador.
Aparecer la ventana de dilogo identificada como Setup Instrument 3.En la ventana de dilogo de Setup Instrument , seleccione Quick Star en la opcin de Setup type
3. Dar un click en el folder de la Lnea de Raw File Path (tal como se muestra arriba)
____________________________________________________________Tutorial Parte I
8. En la ventana de Default Base Name, seleccionar None en el cuadro del Separador y escriba TEST en el cuadro del Nombre de archivo Base.
Este dilogo es acerca de archivos simblicos (una nueva caracterstica de la versin 6.2). Por favor consulte la Gua de Usuario para una descripcin ms detallada sobre esta opcin.
Todos los archivos relacionados con este mtodo rpido que estamos creando - el crudo, el de resultados , el mtodo, y la secuencia de archivosutilizarn este nombre de archivo base. El TotalChrom adicionar tres dgitos a una corrida un nmero de ciclo a este nombre (basado en el nmero de dgitos especificado en la ventana del Nombre del Archivo Base ) cuando este crea los nombres del archivo crudo y de resultados 9. Dar un click al botn de OK para cerrar la ventana de dialogo de Nombre de archivo base 10. Deje las opciones de " Suprimir el proceso" y" Suprimir reports/plots" sin checar , tal como se muestra en la ventana de SetupInstrument Nosotros queremos procesar el archivo de datos inmediatamente despus de la corrida, y tambin imprimir un reporte y la grafica al final de la corrida 11. Todava no de un click al botn de OK Usted ha fijado las entradas en el cuadro de dilogo del Setup El siguiente paso es construir un mtodo rpido.
Para informacin adicional sobre el cuadro de dilogo del Setup, ver " Adquirir y Ver datos" en Captulo 12 de la Gua del Usuario de TotalChrom.
La ventana de Editor de Mtodo Rpido se abrir , mostrando la ventana de dilogo de la Documentacin. ste es el primero de la serie de ventanas que se desplegarn automticamente. 2. Usted puede escribir cualquier informacin descriptiva sobre el mtodo o dar un click en Next para dejar el espacio en blanco. No Seleccione audit Trail. La siguiente ventana que aparecer es la identificada como Instrument Notes
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Si usted conoce que tan amplio esta su pico ms estrecho de la lnea base , seleccione By peak width at base y fije el nmero de segundos en el cuadro de texto. TotalChrom utilizar este valor para calcular la velocidad de muestreo ptima para ese pico
Elija "By sampling rate y seleccione fije una (dependiendo del instrumento).
Las velocidades de muestreo sugeridas son :
GC capilar = HPLC o CI = Columna Empacada GC = 20 pts/sec 5 pts/sec 2 pts/sec
velocidad
11
___________________________________________________________Tutorial Parte I
7. Nosotros queremos guardar la corrida completa en lugar de utilizar el delay y run times para almacenar solamente parte de esta. Para un instrumento controlado por LINK , seleccione Select all data for run Para una Interface series 900/NCI, deje "Delay Time en 0, y fije un "Run Time " que corresponda a l tiempo de su corrida
8. Seleccione NEXT para mostrar la primera de una serie de ventana de dilogo para el instrumento que usted selecciono 9. Complete cada una de la seriede ventanas de dilogo utilizando los valores apropiados para la muestra y equipo. (Debido a que las personas que siguen esta gua didctica estn utilizando una variedad de equipo, nosotros no podemos anticipar las entradas especficas.)
Nota: Presionando la tecla F1 cuando una ventana de dilogo esta abierta desplegara la Ayuda en lnea para esa ventana
Los cuadros de dilogo desplegados en el resto de esta serie dependern del instrumento que usted seleccion y de los mdulos del instrumento. Nosotros no fijaremos ningn parmetro de procesamiento para este mtodo rpido. Es a menudo ms fcil fijar estos parmetros en la ventana de Editor Grafico del Mtodo. Nosotros utilizaremos esta funcin en la Parte 2 del Tutorial Cuando usted llegue a la ventana de dilogo de los Componentes, la cual es la ltima ventana de la serie para todos los instrumentos , dar un click en Finish
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1.
Elija Save del men File para guardar el mtodo. El mtodo rpido es guardado utilizando el nombre de archivo base que usted fijo en el cuadro de Setup adems de la extensin .MTH (Por ejemplo, TEST.MTH para este tutorial). Elija Exit del men File para regresar a la ventana del dilogo del Setup del Instrumento
Para mayor informacin sobre parmetros del instrumento , Ver el capitulo 6 Desarrollando Parmetros del Instrumento en el Metodode la Gua de Usuario del Totalchrom Para mayor informacin acerca de mtodos rpidos, Ver Utilizando Metodos Rapidos. En el Captulo 12 de la Gua del Usuario de TotalChrom.
2.
Aunque no se requiere para todas las configuraciones del instrumento, la prxima tarea a realizar en esta gua didctica ser construir una lista de viales para especificar las muestras a ser inyectadas
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Setup
Para construir una Lista de Viales:
14
b. c. 3.
Seleccione el tipo de charola instalada en su automuestreador del men desplegable de la lista de charolas Dar un click en OK.
En la ventana de Informacin de la secuencia, seleccionar la primera celda de la columna de viales, haciendo un click en esta.
4.
Para un automuestreador controlado por LINK , fije el numero de vial de acuerdo a la posicin en donde este colocado el vial de la muestra
Para todas las otras configuraciones del instrumento, deje la entrada predefinida.
5.
No fije Ninguna entrada de vial , por el contrario borre las lneas del 2 al 5
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____________________________________________________________Tutorial Parte I 6.
Resalte la fila 2 y despus despliegue el men Edit Note que usted tiene varias opciones por manipular las filas en la hoja de clculo y que cada una tiene un men corto
7. 8.
Elija Delete del men de Edit . La lnea 2 se borra y las lneas 3 y 5 se desplazan hacia arriba en la hoja de calculo Borre la lneas remanentes de la misma manera
Usted ha completado la lista de viales y esta listo para guardar la informacin e iniciar la corrida
1.
Seleccione Save del men File La lista de viales es guardada como una secuencia (de 1 ciclo en este caso), utilizando el nombre base del archivo que usted fijo en el cuadro de dilogo del Setup, adems de la extensin .SEQ (TEST.SEQ en este tutorial)
2. 3.
Seleccione Exit del men File para cerrar la ventana de lista de viales y regresar a la ventana de dilogo del Setup Instrument Elija OK del cuadro de dilogo del Setup Instrument para inicializar el instrumento y regresar al Navegador.
Para ms informacin, revise " Construyendo una Lista de Viales en el Captulo 12 de La Gua de Usuario de TotalChrom.
Usted ha completado todo lo que necesita para adquirir datos Usted est listo para inyectar su estndar y adquirir los datos.
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Para iniciar la adquisicin de datos: La manera en que usted iniciara la corrida depender de sus instrumentos y de cmo estn conectados. Para un Automuestreador controlado por LINK , dar un click en el icono de RUN y despus elija STAR RUN del menu
Para un cromatografo con automuestreador conectado a A/D , el A/D debera ser sincronizado para iniciar el muestreo cuando el automuestreador inyecte . En este caso solamente inicie su instrumento Para un instrumento sin automuestreador, inyecte su estndar en el cromatografo . Si su cromatografo esta conectado a una LINK , presione STAR en el cromatografo. Si su cromatografo esta conectado a A/D , entonces presione el botn de star en el panel frontal Cuando inicia la corrida, la ventana de Status indica que el instrumento esta activo y muestreando
Para ms informacin, vea" Controlando la Adquisicin de datos" en el Captulo 12 de la Gua del Usuario de TotalChrom.
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Los parmetros para el display inicial vienen de la ventana de Real Time Plot que usted complemento en el mtodo rpido aceptando valores predeterminados. Hay varios cosas que usted puede hacer en la ventana de la Grafica de tiempo real . Nosotros experimentaremos con cambios en el display del menu de OPTIONS Los cambios del display son temporales y afectan solamente a la corrida actual , no cambian los valores del mtodo y no afectan la adquisicin de datos.
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2. Elija Zoom In (para el canal que usted quiera ver) 3. Elija Zoom In de nuevo hasta que el vista sea tan grande como usted quiera ver 4. Elija Zoom out hasta que la grafica regrese a su tamao original
Nota: Usted puede amplificar o reducir la grafica con las teclas F5 y F6 mientras la muestra este corriendo
Zoom In y Zoom Out actan sobre el valor de la escala completa para el eje del voltaje , reduciendo y aumentando el valor de este respectivamente . El siguiente paso ser cambiar el valor del voltaje explcitamente de la ventana de la opcin de Rescale
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1. En la ventana de Real Time Plot , elija Rescale del men de Options para abrir la ventana de dilogo de Rescale.
Abajo del Eje de Voltaje, el valor de la escala completa es el valor que se esta usando actualmente para la grafica .. Este valor puede ser (a) del mtodo, (b) si es alterado por el amplificador o (c) como usted lo especifico en esta ventana 2. Doble el valor en el cuadro de Full scale , despus elija OK La grafica vuelve aparecer con un nuevo valor en el eje de las Y, lo cual reduce a la mitad el tamao de pico desplegado (el mismo efecto que el zooming out) Usted puede continuar experimentando con la grafica mientras la corriendo. 3. Permita que la corrida termine y los datos sean procesados. Si la corrida aun no termina y usted est listo para continuar con el tutorial, usted puede detener la corrida seleccionando Stop Run del men Run . Esto sera til si por lo menos un pico se ha detectado. 4. Para cerrar la ventana de Real Time Plot , elija Exit del men de Instrument para regresar ala ventana del Navigator. Cuando la corrida termine (o ud. la detenga), se imprimir el reporte y la grfica
Para mayor informacin, revise la seccin de " Graficas de Tiempo real del Capitulo 12 de la Gua del Usuario del Totalchrom
muestra esta
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Nota: Cada paso en el resto del tutorial se construye y es una continuacin de pasos previos . Por consiguiente, usted necesita completarlo en conjunto.
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____________________Tutorial Parte 2
Optimizacin de un Mtodo utilizando el Editor Grafico
En esta parte del tutorial utilizara algunas de las funciones bsicas del Editor Grafico del mtodo para: Cambiar la vista de la grafica Ajustar los parmetros de deteccin de pico Crear una lista de componentes
Un mtodo contiene los parmetros que determinan cmo analiza los datos crudos el TotalChrom. Con el Editor Grfico del Mtodo, usted puede ajustar aquellos parmetros del mtodo y observar los efectos del cambio inmediatamente. El Observar los datos en forma grfica ayuda a determinar si los picos estn siendo detectados correctamente, si la lnea base est colocada apropiadamente, y si los tiempos de retencin esperados y las ventanas de investigacin para los componentes estn identificando a los picos exactamente Para editar un mtodo en el Editor Grfico del Mtodo, usted especifica un archivo de datos crudos, el cual representa un cromatograma del anlisis que usted quiere optimizar. TotalChrom procesa el dato crudo con el mtodo que es referenciado en el ttulo del archivo crudo y entonces muestra el cromatograma, mostrando el resultado de la integracin y la identificacin de picos.
Para mayor informacin acerca el Editor Grfico del Mtodo, vea Captulo 10 en La Gua de Usuario de TotalChrom.
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Nota: Debido a que nosotros necesitamos trabajar con algo conocido en esta parte del tutorial , no
utilizaremos el mtodo rpido y archivo resultante de la Parte 1.
Para abrir el Editor Grafico del Mtodo y cargar un archivo: 1. En el Navegador, dar un click en el icono de Grphic Edit Editor Grafico
La ventana del Editor Grfico del Mtodo se abre , as como una ventana de seleccin de archivos mostrando una lista de los archivos crudos
2. Seleccione el directorio de Examples del path del TotalChrom Quick de la lista de directorios.
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___________________________________________________________Tutorial Parte 2
3. De la lista de archivos del directorio de Ejemplos, seleccionar halo003.raw
4. Elija Open La grafica de default muestra un chromatograma de trabajo en el rea principal de la ventana y un chromatograma de referencia arriba de este . El nombre del archivo crudo de datos aparece en la barra de status y el nombre del mtodo utilizado para procesar los datos aparece en la barra del ttulo.
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Tutorial Parte 2
En los siguiente pasos, nosotros exploraremos algunas de las maneras que se puede utilizar para optimizar un mtodo y llegar a alcanzar este tipo de resultados.
Nota: Para este tutorial , nosotros crearemos un mtodo poco satisfactorio, de modo que nosotros tengamos algo para optimizar . El paso de abajo es para ese propsito; este no es el procedimiento normal.
Para regresar los parmetros del mtodo a los valores de default : Elija New del Menu de File Los parmetros de default del mtodo son aplicados al archivo halo003.raw.
Antes de cambiar cualquier parmetro del mtodo cambiaremos la manera en que la informacin cromatogrfica se muestra
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2. Suelte el botn del mouse El cromatograma de trabajo se expande para igualar el rea resaltada del cromatograma de referencia. Note que el cromatograma de trabajo iguala el rea resaltada exactamente, de modo que cualquier pico cuya altura completa no se seleccione ser truncada .
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4. Oprima el botn izquierdo del mouse y arrastre el rectngulo de seleccin a otro parte del cromatograma de la referencia.
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Tutorial Parte 2 Si usted movi el rectngulo ms de una vez, oprima el botn derecho del mouse hasta que el cromatograma regrese a su escala original. Un mensaje ser desplegado cuando no haya ms expansiones
Enseguida nosotros cambiaremos la vista alterando directamente los valores que definen este . Nosotros queremos ver slo el rea que esta antes del primera pico para tener una vista detallada del ruido de la lnea base , de modo que nosotros empecemos optimizar el mtodo.
Para reescalar la grafica y mostrar el rea de inters: 1. Con el cromatograma de regreso a su posicin original mostrando la corrida completa , elija Rescale Plot del men Display
2. En la ventana de dialogo de Rescale Plot, efecte los siguientes cambios: a. Cambie el Star time a 55. b. Cambie el offset a 0 c. Cambie el Full Scale a 10 3. De un click en OK para re dibujar la grafica con los nuevos valores.
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Para informacin adicional sobre cambiar la vista , vea las "Opciones del Cambio del Display Captulo 10 de la Gua del Usuario de TotalChrom.
1. Elija ThresholdNoise/Area del men de Process La barra de status de le sugiere sombrear la seccin de la lnea base que usted quiera utilizar calculando un nuevo nivel del umbral.
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El TotalChrom ha calculado los umbrales ptimos sugeridos (stos debern ser aproximadamente 80 y 400). 4. De un click en OK para reprocesar los datos y re dibujar la grafica utilizando los umbrales sugeridos.
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Elija Samplig Rate/ Bunching Factor del men de Process El mensaje de la barra de status le dice como sombrear el pico mas estrecho para utilizar en el calculo .
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2.
Libere el botn del mouse para mostrar la ventana de dialogo de Sampling Rate/Bunching Factor
En el ejemplo de arriba el Totalchrom ha calculado un bunching factor de 2 (comparado con el bunching factor anterior de 1 del mtodo de default). 4. Con la opcin de bunching factor seleccionada , seleccione OK para reprocesar el dato y re dibujar el cromatograma utilizando el nuevo bunching factor
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Para mayor informacin , ver la seccin de Fijar los Parmetros de Procesamiento del capitulo 10 de la Gua de Usuarios del Totalchrom Ud. ha optimizado el mtodo para la deteccin de picos e integracin. El siguiente paso es asignar el nombre a algunos de los picos y calcular la cantidad (concentracin) de los picos. Para hacer esto debe de crear una lista de componentes
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2. 3.
Dar un click al pico 5 (tiempo de retencin de 2.81) para mover el rectngulo a este pico Seleccione el cuadro de Ref. para que este componente acte como pico de referencia para los otros componentes. El pico de referencia se utiliza para ajustar los tiempos de retencin esperados durante la identificacin de los componentes
4.
Seleccionar el cuadro de ISTD para que este componente acte como el estndar interno de los otros componentes
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5. 6.
7.
8.
Nota: Para guardar la informacin del componente, usted debe elegir Next, Prev Return. Si ud. se mueve a otro pico en lugar de hacer lo anterior, los cambios no se guardaran. Esto por el contrario descarta las entradas que ud. no quiere guardar.
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Para el pico 4 , escriba 1,2 Dichloroetheno como el nombre del componente. En la ventana de Reference y ISTD, seleccione Chlorotoluene En la ventana de Absolute Window cambie el valor a 5 (deje el valor de 3 en el cuadro de Relative Window) Seleccione el cuadro de Find Tallest Peak. La ventana deber ser igual que el ejemplo de abajo:
13.
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Su cromatograma deber estar etiquetado con los tres componentes que usted acaba de editar
Para mayor informacin revise Trabajando con componentes del capitulo 10 de la Gua de Usuarios del Totalchrom
Ud ha finalizado la edicin de la Lista de componentes que necesitamos para este tutorial. El siguiente paso es modificar el Editor del Mtodo y fijar los parmetros de calibracin para cada componente
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Ud. utilizara el Editor del Mtodo para desarrollar un mtodo completo. Esto incluye los parmetros que no estn disponibles a travs del Editor Grafico del mtodo cuando en el desarrollo de un mtodo rpido.
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Tutorial Parte 2___________________________________________________________ 2. Seleccione Edit Component del men de Components , para abrir la ventana de componentes
Los nombres de los componentes que queremos identificar en el anlisis ,estn en el lado izquierdo de la ventana. La informacin para el componente seleccionado esta en el lado derecho. Nosotros editamos esta informacin existente para adicionar un nivel de calibracin para cada componente.
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________________________________________________________Tutorial Parte 2___ 2. Seleccione Chloroform, y enseguida Calibration para abrir la ventana de calibracin para este componente.
Nota: Los valores de arriba son los valores iniciales del Totalchrom. Los valores de default pueden ser diferentes en su sistema
4. 5. 6.
Seleccione Use curve como el tipo de calibracin Esto crea una curva de calibracin basada en los datos recolectados del estndar Seleccione Area como la opcin de Respuesta. Esto indica al Totalchrom como calibrar y cuantificar utilizando el rea del pico. Seleccione Point to Point como el tipo de curva
Esto promedia todas las replicas (cantidades y respuestas) en cada nivel de calibracin para derivar un punto . Cada par de puntos ser conectado por un segmento de lnea recta para formar una curva de calibracin
7. 8.
Seleccione None en Scaling y Weighting. En el cuadro de Origin Treatment, seleccione Include Esto adicionara (0,0) a la calibracin (cantidad cero, respuesta cero)
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9. 10. 11.
Dar un click en el cuadro de Level y escriba 1 Se recomienda escribir un valor alfanumrico en este cuadro. Dar un click en el cuadro de Amt y escribir 30 El valor del rea ser calculado y llenado cuando se corra un estndar Si existen valores de default , seleccione cada entrada y oprima la tecla de Delete para borrar. Este es el procedimiento para borrar un nivel de calibracin.
Una vez que usted seleccione el cuadro de Level 2, su pantalla deber estar igual que en el siguiente ejemplo:
12.
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14. 15.
Elija Next para mostrar la informacin de calibracin para Chlorotoluene. Haga lo mismo para el Chlorotoluene , excepto que en el nivel de calibracin escriba 20 en lugar de 30:
16.
Elija Apply , despus Ok para regresar a la ventana de Resumen del mtodo Ahora que ud. ha terminado de adicionar un nivel de calibracin para cada componente, tenemos todo lo necesario para llevar a cabo una calibracin manual
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Seleccionar el cuadro de Open. Este ser el archivo que nosotros definiremos como el estndar de calibracin
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5.
6.
7.
Elija Ok para llevar a cabo la calibracin utilizando la informacin de la lista de File Name/Cal Type/ y regresar a la ventana de resumen del mtodo.
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Tutorial Parte 2___________________________________________________________ 8. Para ver la calibracin actualizada , regrese a la ventana de calibracin.
seleccionando Edit Components del men de Components
9. 10.
Observe que el rea ha sido calculada y se muestra en la columna derecha de la ventana. Elija Ok para regresar a la ventana de resumen del mtodo. Para observar la curva de calibracin , ud. puede elegir Component List del men de Window para cambiarse a la ventana de resumen del mtodo
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Para informacin adicional acerca de los parmetros de calibracin, vea el capitulo 8 de la Gua de Usuario del Totalchrom
A pesar de que existen muchas maneras de personalizar un mtodo , esto complementa lo que haremos en este tutorial. Nuestro siguiente paso ser guardar lo que hemos hecho
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3. 4.
Esto guarda el mtodo como (C:\penexe...\practice.mth) 5. Elija Save para guardar el mtodo
Ud. ha terminado de optimizar este mtodo y lo ha guardado para usos futuros El siguiente paso ser crear un formato para el reporte que se imprimir en un anlisis que utilice este mtodo
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Creando un formato de reporte nuevo: 1. En la ventana de editor de mtodo, seleccione la opcin de Report Format Editor del men Others.
Debido a que no se le dado un nombre al formato de reporte, el Totalchrom utiliza el nombre del mtodo que usted ha abierto con los valores de default para fijar un nuevo formato de reporte.
El primer paso ser cambiar el titulo del reporte 2. Seleccionar Title del men de User Notes 3. En el cuadro de Title , cambie el titulo de default a TUTORIAL REPORT 4. Dar un click en OK para mostrar el reporte con el nuevo titulo
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7. En la ventana de Component Name cambie el numero de la columna de 9 a3 8. Seleccione Insert/Add. Ud. observara que se inserta una columna con los nombres de los componentes antes de la columna del rea La letra se hace mas pequea ,de tal forma que el reporte se ajuste en la pantalla, y se utilizara un tamao de letra comprimido cuando se imprima el reporte.
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10. 11.
En la ventana de Adjusted Amount, cambie el numero de la columna de 10 a 7 Seleccione Replace La columna de Adjusted Amount es adicionada a la columna 7, en lugar de rea normalizada
El ultimo cambio que haremos antes de guardar el archivo ser borrar una columna del reporte 12. 13. 14. Seleccione Delete column del menu Edit En la ventana de Delete column escriba el 9 para borrar esta columna (area/altura) Seleccione OK
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15. 16.
Elija Save del men File Elija Exit del men File para regresar al resumen del mtodo. No cierre la ventana de Editor del Mtodo
Para informacin adicional de formatos de reportes, vea el capitulo 9 de la gua del usuario del Totalchrom
Ahora que se ha optimizado y guardado el metodo practice, construiremos una secuencia que especifica este archivo de mtodo optimizado
Utilizando la Plantilla de Secuencia La plantilla de secuencia simplifica el proceso de crear una secuencia ya que permite definir la estructura bsica en una ventana de dialogo. Para construir una secuencia utilizando una plantilla:
1. Con la ventana de Editor del mtodo aun en la pantalla , elija Secuence Editor del men Others
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3. En el cuadro de Build Parameters, seleccione el nombre de su instrumento en el cuadro de Instrument 4. Seleccione From Template de la opcin de Build 5. Dar un click en el cuadro de configuration
6. Seleccionar Single en la opcin de Inyection Type 7. Seleccionar One per row para la opcin de Methods
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La ventana de dialogo es en donde se escribe toda la informacin que se necesita para crear una secuencia bsica 10. En el cuadro de Study , escribe el nombre de tutorial para identificar el anlisis que se esta llevando a cabo 11. En el cuadro de Method, dar un click en el flder amarillo para seleccionar C:\pnese\...\practice.mth Utilizaremos el mtodo optimizado para reprocesar un archivo crudo ya existente 12. Escriba HALO como el nombre base del archivo para el canal A
Nota: HALO es el nombre de un grupo de archivos crudos que vienen como parte de los ejemplos del Totalchrom. No podemos utilizar el archivo crudo que ud. adquiri en la Parte I de este tutorial debido a que cada usuario tiene uno diferente
Este ser el nombre base del archivo crudo y de resultados que se enlistara en la hoja de calculo de secuencia 13. En el cuadro de calibracin, desactive la opcin de Include calibration standars. Nosotros ya hemos calibrado el mtodo manualmente en el Editor del mtodo
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Su hoja de calculo de la secuencia deber tener 3 renglones, es decir el numero de muestras que ud. especifico en la plantilla. Cada rengln contiene informacin relacionada con la muestra y los valores que sern utilizados cuando el archivo crudo sea reprocesado. Para ver las siguientes columnas e informacin tendr que recorrer la ventana de la hoja de calculo a la derecha: La columna de Method muestra el nombre del archivo del mtodo La columna de Report es el nombre del archivo de formato de reporte que ser utilizado para generar el reporte La columna de Data identifica los archivos que sern reprocesados Cuando construya una secuencia para adquirir una serie de inyecciones, esta entrada ser el nombre base del archivo delos archivos crudos que sern creados. Los parmetros que no cambie contienen lo valores de default
Nota: Las columnas que son mostradas dependen de las opciones que fueron seleccionadas en Parmetros Globales, en el cuadro de configuracin o definidas por el usuario
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2. Escribir 3 en la lnea final 3. Escribir un asterisco * en el cuadro de Path to change 4. En el cuadro de New Path, dar un click en el flder amarillo
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6. Seleccione OK Ud. observar que la ruta completa es ahora mostrada en la columna de Data y que este ahora seala al directorio de Ejemplos
Para cambiar la informacin de la impresora en la secuencia. 1. Recorra la ventana de la hoja de calculo horizontalmente hasta que las columnas de la impresora y del plotter se puedan observar. Estn se encuentran a la derecha de la hoja de calculo. 2. Seleccione la celda de la lnea 1 de la columna dando un click en el interior de esta
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3. Dar un click en el cuadro de Printers y seleccione la impresora que ud. desee 4. Haga lo mismo para la columna del Plotter 5. Elija Fill down del men de change para copiar el valor de la lnea 1 a a cada celda de la misma columna
Para guardar esta secuencia como una secuencia nueva: 1. Elija Save as del men File 2. Cuando se abra la ventana de dialogo escriba cualquier informacin que quiera almacenar con el archivo de la secuencia. No seleccione audit trail
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5.
Elija Save para cerrar la ventana de dialogo y guardar el nuevo archivo de la secuencia
Para mayor informacin de la secuencia , ver el capitulo 11 de la Gua del Usuario del Totalchrom
Ahora estamos listos para utilizar esta secuencia con la funcin de Reprocesamiento de Lotes
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2. Dar un click en el flder amarillo de la lnea de Actual data path para buscar el directorio de Ejemplos. La ruta de datos es el directorio en donde los archivos crudos y de resultados estn almacenados. Si usted utiliza la ruta completa para sus archivos de datos en la hoja de calculo de la secuencia, la cual se elaboro en el ejercicio anterior, ud. puede dejar este campo en blanco.
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3. Dar un click en ok 4. Seleccionar PEAK DETECTION en el cuadro de Star REPLOT GENERATION en el cuadro de End Anlisis Anlisis y
5. Seleccionar Local (si ud. tiene Client/Server) Interactive (si ud. tiene Worktation) para la impresin de las corridas 6. 7. Seleccionar Overwrite existing result files Seleccionar Ok para aceptar el resto de los valores de default
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8.
Seleccin Star del men de Reprocess para empezar con el procesamiento de los datos. Ud. puede iniciar el proceso del lote dando un click en la flecha verde de la barra de herramientas. Las corridas de la lista son borradas mientras estn son reprocesadas. El reporte y replot para cada archivo sern impresos una vez que el anlisis del dato este completo. Para cerrar la ventana de Batch Reprocessing y regresar al Navegador , seleccione Exit del men File.
Para mayor informacin sobre reprocesamiento de lotes, ver el capitulo 15 de la Guia de Usuario del Totalchrom.
9.
61
3.
Ud. notara que el archivo Halo003.rst ahora tiene los parmetros del mtodo aplicados a esta corrida , los cuales se especificaron en el mtodo practice.mth que ud. creo en el Editor Grafico del Mtodo 5. Utilizando Printer Preview o revisando el reporte impreso, ud. notara que el mtodo de procesamiento que fue utilizado para este archivo de datos es el metodo practice.mth que usted creo
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Felicidades
Ud. ha terminado exitosamente el Tutorial completo del Totalchrom
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