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Faculté de Médecine et Pharmacie

REMEDIATION BIOLOGIE
Questions ouvertes
(examens antérieurs)

PAMART Laurence
EXAMEN – JANVIER 2014

Question 1 (Biologie cellulaire et organique)

L'aldostérone est une hormone stéroïdienne sécrétée par les glandes


corticosurrénales en réponse à une élévation de la kaliémie (concentration
plasmatique en potassium). Sa libération dans le sang permet de rétablir
l’homéostasie potassique notamment via son action sur la pompe Na/K-ATPase
membranaire, appelée ici la protéine K. En vous basant sur vos connaissances des
voies de signalisation, des mécanismes de transcription et de traduction, ainsi que
de l’adressage des protéines, détaillez la succession des événements qui
permettront à l’aldostérone de réguler l’expression de la protéine K au niveau des
membranes plasmiques des cellules rénales. Vous pouvez vous aider de schémas
clairement annotés, si nécessaire.
Système endocrinien

L’hypothalamus va libérer des « facteurs de libération » qui sont transmis à


l’hypophyse où ils régulent la libération des hormones trophiques.

L’hypophyse (ou glande pituitaire), se situe à la base du cerveau et contrôle le


fonctionnement de la plupart des autres glandes endocrines grâce à la libération
« d’hormones trophiques » qui stimulent l’activité des autres glandes. Dans ce cas-
ci, l’hypophyse sécrète de l’Acth qui va être véhiculé par le sang jusqu’aux glandes
corticosurrénales (cortex surrénalien). Ces dernières vont sécréter l’aldostérone.

L’aldostérone est sécrétée par les glandes corticosurrénales. Elle est libérée dans le
sang et va aller agir sur des cellules cibles, à savoir les cellules rénales. On parle de
communication endocrine : basée sur la sécrétion par les cellules glandulaires d'une
hormone, c’est-à-dire une substance chimique déversée dans le sang et agissant à
distance sur les cellules cibles équipées d'un récepteur spécifique.
Le taux d’hormones dans le sang et la libération des hormones endocrines de leurs
glandes productrices sont sujets à un mécanisme de contrôle rétroactif (feedback). Ceci
signifie que le sang renvoie au cerveau des informations sur le taux d’hormones
présentes dans la circulation sanguine. Si, comme dans l’exemple, le taux sanguin de
potassium est trop élevé, le cerveau le détecte. Par conséquent, l’hypothalamus sécrète
le facteur de libération de l’aldostérone et stimule l’hypophyse à sécréter plus d’Acth et
ceci stimule les glandes corticosurrélaliennes à sécréter plus d’aldostérone.
L’aldostérone agit au niveau des cellules rénales. Une fois que le taux sanguin de
potassium est rétabli, la libération de facteur de libération de l’aldostérone diminue et,
donc, la sécrétion d’aldostérone est ralentie.
Communication intercellulaire

L’aldostérone étant une hormone stéroïdienne, elle est liposoluble. Elle franchit donc
facilement la membrane cellulaire cible. Elle diffuse librement ainsi à travers la double
couche de phospholipides de la membrane plasmique (effet direct sans second
messager). Ensuite, elle va se fixer directement sur un récepteur qui se trouve dans le
noyau. On parlera de récepteur nucléaire car la finalité se trouve au niveau du noyau.
Ce récepteur occupe un élément de contrôle du gène cible et est pourvu d’une
protéine répressive qui empêche la transcription du gène. La fixation de l’aldostérone
sur son récepteur va provoquer le départ de la protéine répressive. Le complexe
aldostérone/récepteur va alors recruter des protéines co-activatrices ainsi que l’ARN
polymérase pour réaliser la transcription.
Des facteurs de transcription se positionnent sur la région promotrice (boîte TATA) du
gène qui code pour la protéine K. La transcription se réalise : l’ARN polymérase copie
un des brins d’ADN (le brin matrice) et synthétise un ARNm.
En fait, nous obtenons d’abord un ARN prémessager qui va subir la maturation au sein
du noyau pour devenir un ARNm :
- ajout d’une queue poly A à l’extrémité 3’
- ajout d’une coiffe à l’extrémité 5’
- épissage qui élimine les introns et soude les exons

L’ARNm mature va rejoindre le cytosol par les pores nucléaires pour être traduit par les
ribosomes libres se trouvant dans le cytosol. Les ribosomes se déplacent le long de
l’ARNm et effectuent la traduction ou synthèse de la protéine K. La traduction
commence lorsqu’un codon initiateur (AUG) est lu. A chaque cycle d’élongation, un
nouvel acide aminé est apporté par l’ARNt spécifique qui le transporte. Chaque ARNt
porte un anticodon qui correspond au codon qui est lu au niveau de l’ARNm. Chaque
nouvel acide aminé est attaché à la chaîne peptidique en voie d’élongation par la
formation d’une liaison peptidique. La traduction se termine lorsque c’est un codon stop
(UAA, UAG, UGA) qui est lu auquel aucun ARNt ne correspond.
Dès la mise en place des 1ers acides aminés, une séquence signal va apparaître. En
effet, la protéine K est une protéine membranaire et doit donc suivre la 2ème voie
d’adressage des protéines. La traduction de la protéine K commence dans le cytosol
mais se poursuit donc au niveau du réticulum endoplasmique rugueux. Ensuite, vu
que la protéine ne présente pas le signal de rétention dans le réticulum, elle va être
acheminée vers l’appareil de golgi. En traversant le golgi, la protéine K va passer de
saccule en saccule tout en subissant une maturation (ajout et diversification de
chaînes glucidiques) pour, finalement, se retrouver au niveau de la membrane
plasmique où elle joue son rôle (fonction de pompe Na+/K+ ATPase). Une fois arrivée à
destination (intégrée dans la membrane plasmique), la protéine K permet de diminuer
la kaliémie. En effet, la pompe fait entrer 2 K+ contre 3 Na+ en utilisant l’hydrolyse de
l’ATP. Une fois la kaliémie abaissée à un taux normal, la sécrétion d’Acth par
l’hypophyse s’arrête et, donc, aussi la sécrétion d’aldostérone par les glandes
surrénaliennes.
Question 2 (A propos des télomérases)

a. A quelles familles (fonctionnelle et structurelle) appartiennent-elles ?


b. Quel rôle essentiel jouent-elles dans les cellules des Vertébrés ?
c. Existe-t-il une différence dans l’efficacité des télomérases dans une cellule
somatique et une cellule germinale ? Si oui, expliquez cette différence
d. Que deviennent les télomérases dans les cellules cancéreuses ? Pourquoi ?
a. A quelles familles (fonctionnelle et structurelle) appartiennent-elles ?

- Famille fonctionnelle : enzymes


- Famille structurelle : ribonucléoprotéines (assemblage d’ARN et de
protéines)
b. Quel rôle essentiel jouent-elles dans les cellules des Vertébrés ?

Elles permettent le parachèvement des extrémités (télomères) de chaque chromosome.


Elles permettent de conserver la longueur du chromosome en ajoutant une structure
spécifique à chaque extrémité : le télomère. Elles catalysent l’addition d’une séquence
répétée spécifique à l’extrémité des chromosomes. Cette séquence est riche en
nucléotides T et G (TTAGGG)n chez les vertébrés (donc chez l’espèce humaine) avec un
nombre de répétitions « n » de l’ordre de quelques centaines à quelques milliers. Le
composant ARN de la télomérase sert de matrice pour la synthèse de l’ADN.
c. Existe-t-il une différence dans l’efficacité des télomérases dans une cellule
somatique et une cellule germinale ? Si oui, expliquez cette différence

Il existe une différence. Les télomérases sont plus actives dans les cellules germinales.

d. Que deviennent les télomérases dans les cellules cancéreuses ? Pourquoi ?

Les télomérases sont surexprimées dans les cancers : les télomères ne se raccourcissent pas
EXAMEN – JUIN 2014
La figure ci-contre représente les structures cellulaires
Question 1 impliquées dans l'absorption du glucose. Le glucose
présent dans l’intestin pénètre dans les cellules
bordant l’intestin et ressort de l’autre côté de la cellule
pour gagner le liquide interstitiel et le sang. Tout le
glucose présent dans l'intestin finit par être absorbé.
C'est donc dire que, même si la concentration
intestinale du glucose est très faible, celui-ci continue
à traverser les cellules de l’intestin pour parvenir au
sang. Les transporteurs membranaires situés du côté
de la cellule faisant face au contenu de l’intestin (le
haut de l'image) sont différents de ceux situés du côté
en contact avec le liquide interstitiel et le sang (le bas
de l'image). Le côté de la cellule dirigé vers le sang
contient environ 150 000 structures B. Il n'y en a pas
du côté orienté vers la nourriture à l'intérieur de
l'intestin.
N.B. L’équation ATP → ADP + P indique qu’il y a une
dépense d’énergie.
Le tableau suivant montre les concentrations normales du Na+, du K+ et du glucose à
l’intérieur de la cellule et dans le liquide interstitiel (côté sang).

a) Quelle est la nature chimique (lipide, glucide, protéine ou autre) des structures A, B et C ?

b) Quel serait le nom précis de la structure A ?


c) Pourquoi le glucose se dirige-t-il de l’intérieur de la cellule au sang (et non l’inverse) ?
Expliquez.

d) Sachant que la membrane n’est pas totalement imperméable au Na+ (il peut la traverser
par de nombreux petits canaux qui ne sont pas illustrés sur le schéma de la question), est-
ce que le gradient de concentration en sodium (voir le tableau des concentrations) entre
l’intérieur de la cellule et le sang changerait si la structure B cessait de fonctionner ? Si oui il
changerait dans quel sens (plus grand ou plus petit) ? Expliquez pourquoi.

e) Si la structure B cessait de fonctionner, le glucose ne pourrait plus passer de l’intestin


au sang SAUF si sa concentration dans l’intestin est plus grande que celle dans le sang.
Pourquoi?
a) Quelle est la nature chimique (lipide, glucide, protéine ou autre) des
structures A, B et C ?
Ce sont des protéines.

b) Quel serait le nom précis de la structure A ?


C’est une perméase (symport du glucose et du Na+).

c) Pourquoi le glucose se dirige-t-il de l’intérieur de la cellule au sang (et non


l’inverse) ? Expliquez.
La concentration intracellulaire de glucose est égale à 5mM tandis que la
concentration extracellulaire de glucose (dans le compartiment sanguin) est de 0.005
mM. Le glucose va donc passer par un transport passif (diffusion facilitée) grâce à
une perméase (structure C) dans le sens de son gradient (du compartiment le plus
concentré vers le compartiment le moins concentré).
d) Sachant que la membrane n’est pas totalement imperméable au Na+ (il peut la
traverser par de nombreux petits canaux qui ne sont pas illustrés sur le schéma de la
question), est-ce que le gradient de concentration en sodium (voir le tableau des
concentrations) entre l’intérieur de la cellule et le sang changerait si la structure B
cessait de fonctionner ? Si oui il changerait dans quel sens (plus grand ou plus petit) ?
Expliquez pourquoi.
Oui, le gradient en sodium serait plus petit. En effet, la structure B est une pompe
Na+/K+ ATPase qui permet un transport actif utilisant l’ATP pour maintenir une
différence de concentration en Na+ et K+ de part et d’autre de la membrane. La
pompe permet la sortie de 3 Na+ et l’entrée de 2 K+. Si la structure B cessait de
fonctionner, le Na+ rentrerait dans la cellule selon son gradient de concentration (plus
grande concentration à l’extérieur qu’à l’intérieur de la cellule) via les petits canaux
membranaires mentionnés. Cela provoque une diminution du gradient et irait jusqu’à
atteindre l’équilibre.
e) Si la structure B cessait de fonctionner, le glucose ne pourrait plus passer de l’intestin
au sang SAUF si sa concentration dans l’intestin est plus grande que celle dans le sang.
Pourquoi?
Si la pompe Na+/K+ ATPase cessait de fonctionner, il y aurait accumulation de Na+ dans la
cellule. La structure A qui fait entrer du Na+ dans la cellule cesserait aussi de fonctionner.
En effet, la structure A est un symport qui fait passer simultanément dans le même sens
(de la lumière intestinale vers l’intérieur de la cellule) du Na+ de manière passive dans le
sens de son gradient et le glucose qui profite du transport du Na+ pour entrer dans la
cellule par ce même transporteur. Si la structure A ne fonctionne pas, le glucose qui est
trop volumineux pour traverser sans transporteur la membrane n’entre plus de la
lumière intestinale vers la cellule. De ce fait, il y aura moins de glucose dans la cellule et,
donc, moins de glucose qui pourra passer de la cellule vers le compartiment sanguin.
Mais, si la concentration en glucose est plus grande dans l’intestin que dans le sang,
alors le glucose sortira quand même dans le sens de son gradient (structure C).
Question 2

A l’aide d’un exemple, expliquez le concept d’émergence en biologie.


A chaque niveau de l’organisation biologique, nous pouvons établir une corrélation entre la
structure (la forme, l’anatomie) et la fonction qu’exerce cette structure (la physiologie, le
fonctionnement).

A chaque niveau d’organisation biologique, de nouvelles propriétés, qui n’existaient pas au


niveau inférieur, apparaissent. Et les propriétés nouvellement acquises à un niveau donné
sont utilisées pour construire le niveau supérieur. L’organisation du monde vivant est
hiérarchisée c’est-à-dire que chaque niveau se construit sur le niveau sous-jacent.
→ On parle d’émergence.

Exemple :
- La cellule est une entité supérieure à la somme de ses parties. C’est une unité
structurelle et fonctionnelle dont la capacité d’action, les fonctions sont supérieures à
celles des différentes parties qui la constituent.
- Au sein du même cellule, les organites cellulaires travaillent ensemble de manière
complémentaire.
- Le tissu est formé de l’association de cellules et réalise des fonctions que chaque cellule
prise individuellement ne pourrait accomplir.
Question 3

La digoxine est un glycoside cardiotonique extrait de la feuille de Digitale.


Nous avons étudié son mode d’action dans l’atelier relatif aux principes actifs.
Sachant cela, répondez aux questions suivantes :

1. Qu’est-ce qu’un principe actif ?


2. Après son administration par voie orale, décrivez le parcours de cette
substance jusqu’à sa cible moléculaire.
3. Expliquez le mode d’action permettant à la digoxine d’améliorer l’insuffisance
cardiaque.
4. A partir des valeurs normales de la diastole et de la systole, représentez
graphiquement l’insuffisance cardiaque et l’effet d’une overdose de digoxine.
5. Après sa libération de la cible, expliquez comment cette substance est
éliminée de l’organisme.
1. Qu’est-ce qu’un principe actif ?

= substance développée par les plantes au cours de l’évolution


= composant, matière première incorporé en petite quantité dans une plante lui
conférant son activité thérapeutique
→ entre dans la composition de nombreux médicaments

2. Après son administration par voie orale, décrivez le parcours de cette substance
jusqu’à sa cible moléculaire.

La digoxine passe par la trachée, l’œsophage et se retrouve dans l’estomac. Ensuite, elle
va être transportée vers l’intestin. Elle va passer de la cellule intestinale vers le
compartiment sanguin. Par ce biais, elle va être amenée au niveau des cellules
cardiaques et provoque une augmentation de la contraction du cœur.
3. Expliquez le mode d’action permettant à la digoxine d’améliorer
l’insuffisance cardiaque.
4. A partir des valeurs normales de la diastole et de la systole, représentez
graphiquement l’insuffisance cardiaque et l’effet d’une overdose de digoxine.
Overdose de digoxine

Conditions normales

Insuffisance cardiaque
5. Après sa libération de la cible, expliquez comment cette substance est éliminée de
l’organisme.
La digoxine est en partie dégradée par le foie qui joue un rôle de détoxification.
Mais son élimination est principalement rénale, après filtration glomérulaire.
EXAMEN – AOUT 2014

Question 1
Sur base de vos connaissances des différents phylums depuis les organismes les plus
primitifs jusqu’à l’homme, expliquez l’évolution du métabolisme intermédiaire ?

Le métabolisme intermédiaire est l’ensemble de toutes les réactions biochimiques


destinées à produire de l’énergie permettant le bon fonctionnement cellulaire.
Chez les espèces procaryotes primitives anaérobies, le métabolisme intermédiaire
repose sur la glycolyse et la fermentation lactique. C’est à partir de glucose que
l’organisme unicellulaire est capable de synthétiser de l’ATP. Le rendement énergétique
est relativement faible.
Chez les espèces eucaryotes plus évoluées et aérobies, la production d’énergie se
fait à partir de la respiration cellulaire qui comprend la glycolyse, le cycle de Krebs
et la chaîne transporteuse des électrons. La complexité de l’organisme acquise au
cours de l’évolution se marque par l’existence de différents compartiments
(cytosol, mitochondrie, …). Le rendement énergétique est alors beaucoup plus
élevé.
Question 2
Comment peut-on savoir qu’une protéine est transmembranaire sur la base de sa
structure primaire ?
La structure primaire de la protéine correspond à la séquence des différents acides
aminés qui la constituent. En étudiant la nature de ces différents acides aminés,
certaines parties sont constituées d’acides aminés hydrophobes. Ce sont ces parties
qui, si elles sont assez longues, vont s’insérer au sein de la membrane (double
couche très hydrophobe en son centre) et constituer la partie transmembranaire de
la protéine.
Par ailleurs, les parties de la protéine faites d’acides aminés hydrophiles se logeront
hors de la membrane, en périphérie de celle-ci.
Question 3
Quelle serait la conséquence d’une mutation entraînant la perte d’un facteur de
transcription ?

Les facteurs de transcription sont des protéines qui sont indispensables pour que le
processus de transcription se déroule correctement (initiation, élongation et
terminaison).
Si une mutation (modification de la séquence génétique) entraîne la perte d’un
facteur de transcription, la transcription du gène n’aura pas lieu et la protéine
codée par ce gène ne sera pas synthétisée. S’il s’agit d’une protéine essentielle au
métabolisme cellulaire (enzyme, transporteur, antigène, …), les conséquences
seront lourdes pour l’individu.
Question 3
Apportez les arguments démontrant que les Echinodermes et les Chordés sont des
phylums étroitement apparentés.

- Ce sont tous deux des Métazoaires car leurs cellules sont différenciées en tissus.
- Ce sont tous deux des Coelomates car ils possèdent une cavité interne.
- Ce sont tous deux des Deutérostomiens car le blastopore va donner l’anus et non
la bouche.
- Ce sont tous deux des triploblastiques car ils ont 3 feuillets : l’ectoderme,
l’endoderme et un 3ème feuillet, le mésoderme.
- Ce son tous deux des épineuriens car leur système nerveux est dorsal.
- Ils montrent tous deux une symétrie bilatérale.
- Ils possèdent des appareils développés.

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