Chem Sketch
Chem Sketch
Chem Sketch
Prof. DANA CAPBUN COLEGIUL NAIONAL PETRU RARE SUCEAVA 3 mai 2012 A. Scrierea unei reacii chimice (Structure mode) 1) formul chimic anorganic
2) semnul plus pentru reacie 3) sgeat
dac exist click pe formul Insert dac nu exist se scrie n spaiul gol (subscript pentru indici) Save Insert
Reaction Plus
7H2SO 4
6 FeSO 4
K 2SO 4
Cr2(SO4)3
3Fe2(SO 4)3
7H2O
1. Structure toolbar Draw Normal selecteaz atomul de carbon de pe Atoms toolbar pe pagina de lucru d click pentru a desena "CH4" dubluclick pe "CH4" pentru a desena "CH3-CH3" click pe "CH3" pentru a desena "CH3-CH2-CH3"
pentru a lungi catena de C click pe un C terminal pentru a ramifica click pe un C din interiorul catenei
2. Selecteaz atomul de oxigen de pe Atoms toolbar 3. D click pe gruparea "CH3" pentru a nlocui atomul de carbon cu atomul de oxigen pentru a reprezenta " -OH" 4. D click pe legtura "CH2-OH" pentru a obine: "CH=O" i dublu-click pe legtura C-C pentru a obine C C 5. References toolbar Table of Radicals 6. Table of Radicals Benzen .
7.
dac structura benzenului conine atomii de C i H sau nu transferul dintr-un tip de structur n cellalt se face astfel: se selecteaz figura Tools Structure Properties Common Show Carbons All (toi) / Terminal Apply
dac doreti s reprezini aromaticitatea : Tools Show Aromaticity (arat aromaticitatea) / Hide Aromaticity (ascunde aromaticitatea) Click pe atomul de C pentru a fixa radicalul fenil
2
Selecteaz structura pentru care vrei s-i calculezi proprietile Tools Calculate All Properties copiaz rezultatele n spaiul de lucru: apas tasta SHIFT sau CTRL click Copy to Editor.
C CH3
C
2
CH2
3
CH
4
CH3
C. Cum se reprezint legturile chimice (Structure mode) 1) Cum se reprezint legturile simple cu opiunea Draw Normal (Deseneaz Normal) (Structure mode)
se trage de un atom deja existent pe un spaiu liber
se scriu separat 2 atomi care apoi se leag ntre ei pentru a ramifica o caten se d dublu-click pe atomul de C ce urmeaz s capete o ramificaie
se deseneaz o legtur trgnd i innd apsat tasta SHIFT n meniul Options Preferences dialog box (Structure tab), sub Fixed, selecteaz Bond Angle (unghiul de legtur) i Bond Length (lungimea legturii), apoi, n casetele adiacente fixeaz lungimea legturii. Click OK i deseneaz legtura. Not: Dac Bond Angle (unghiul de legtur) i Bond Length (lungimea legturii) check boxes nu sunt sunt activate, aceasta nseamn c opiunea Snap on Grid i Show Grid din meniul Options sunt activate(trebuie dezactivate). Structure toolbar Clean Structure reprezentat pentru a egala toate legturile i unghiurile din structura
2) Cum se reprezint legturile simple cu opiunea Draw Continuous (Deseneaz Continuu) (Structure mode) 3) Cum se reprezint legturile simple cu opiunea Draw atom chains (Deseneaz zig-zag) (Structure mode)
la fel cu Cum se reprezint legturile simple cu opiunea Draw Normal (Structure mode)
(Deseneaz Normal)
se pot numra atomii din caten n timp ce tragem se ine apsat tasta TAB dac se dorete nchiderea atomilor ntr-un ciclu, se trage o linie ntre atomii ce urmeaz s se
nchid n ciclu (prin marcarea primului i ultimului C din ciclu ) Clean Structure
4) Cum se reprezint
legturile duble i triple (Structure mode) 5) Cum se reprezint legturile stereo, coordinative i cele speciale (Structure mode)
Structure toolbar, activeaz tipul de legtur dorit: click Up Stereo Bonds click Down Stereo Bonds click Coordinating Bonds click Special Bonds . , , , sau
6) Cum s editezi stilul unei structuri (Structure mode) 7) Transformarea unei structuri din 2D n 3D (Structure mode)
1. Selecteaz structura dorit. 2. menu ToolsStructure Properties Properties specific atributele pe care doreti s le modifici (atom i/sau legtur) Apply Selecteaz structura dorit Tools 3D Structure Optimization Sau Structure toolbar click Not: rotirea structurii n 3D: 3D Rotation trage de un atom Structure .
Rotirea unei structuri : selecteaz structura Structure toolbar 3D Rotation sau legtur pentru a roti structura
Rotirea unui fragment : : selecteaz fragmentul sau fragmentele innd apsat tasta SHIFT toolbar 3D Rotation trage de un atom sau legtur pentru a roti structura 3D Viewer
Pentru a aduga / terge atomii de H n structur Tools Add Explicit Hydrogens / Remove Explicit Hydrogens
F C Cl Br I
TEM:
D. Scrierea unor formule moleculare sau grupri funcionale mai complicate (Structure mode) 1) Scrierea unor formule moleculare sau grupri funcionale
1. Din Atoms toolbar, click Edit Atom Label 2. Click pe atomul pe care vrei s-l nlocuieti apare Edit Label alege gruparea care te intereseazdac este denumirea gruprii Expand apoi click-dreapta n spaiul liber pentru a dezactiva opiunea. Sau: 1. Selecteaz fragmentul sau structura dorit. 2. Din meniul Tools Expand Shorthand Formulae apoi efectueaz aceleai operaii ca i n primul caz. 1. Selecteaz structura dorit pentru a fi multiplicat. 2. Structure toolbar Instant Template . 3. Dac vrei s ataezi noua structur de o legtur click pe legtur 4. Dac vrei s ataezi noua structur de un atom click pe atom 5. Dac vrei s roteti structura / fragmentul dorit, ii apsat tasta TAB .
2) Cum s creezi un ablon (template) prin multiplicarea unei structuri deja existente(Structure mode)
3) Cum s inserezi un ablon existent n Template Window (fereastra de abloane) (Draw mode/ Structure mode)
1. 2. 3.
Structure toolbar Open Template Window / Table of Radicals Dac vrei s roteti structura / fragmentul dorit, ii apsat tasta TAB Dac vrei s nlocuieti un atom din structura preexistent cu structura /fragmentul din Template Window, ii apsat tasta SHIFT
Amino Acids, Anions, Aromatics, Arrows(sgei), C-Groups,Carbohydrates,Figures(de ex. miceliu),Lab Kit,Lattice (celule elementare), Lewis Structures , Monocyclic Alkanes, N-Containing Groups, Orbitals, Polymer Templates, Reaction Symbols, Rings (cicluri), Stereo Templates, Sugars : alfa D-Fur, Sugars : alfa D-Pyr, Sugars : beta D-Fur, Sugars : beta D-Pyr,Vitamins
TEM:
CH3 H2C O C O O
O CH O OH H2C H C HO C H OH C H H C OH C O C OH C H O H H S O OH H2C C H H C OH O
OH
N;
H C OH
(maltoza)
Select/Move Options Snap On Grid mutarea unui atom / legtur: marcheaz atomul / legtura trage ntr-o alt poziie Tip: dac vrei s nlocuieti un atom cu altul suprapune noul atom / grupare de atomi peste cel ce doreti s-l nlocuieti mutarea unei structuri / fragment : selecteaz fragmentul / structure trage de ele n poziia dorit mutarea unei structuri / fragment dar lsarea unei copii a fragmentului mutat :ine apsat tasta CTRL ct timp mui 1. n Structure toolbar, click Select/Rotate/Resize (selecteaz / rotete / redimensioneaz) 2. Selecteaz structura ce trebuie redimensionat.
1. n Structure toolbar, click Select/Rotate/Resize . 2. Selecteaz structura ce trebuie rotit apare o sgeat curb se rotete figura iar n acelai timp se ine apsat tasta SHIFT
Rotirea structurilor :
10
click pe legtur
click pe legtur
Flip on Bond
click pe legtur
click pe legtur
click pe legtur
selecteaz structura ce
11
12