Protein I
Protein I
Protein I
2013
PROTEINI
Prof dr Ivan Stankovi
PROTEINI
proteos - prvi, najvaniji
prisutni u svim ivim organizmima od virusa do biljaka i
ivotinja
ulaze u sastav svake elije: protoplazama, jedro
(nukleoproteini)
uloga u organizmu:
gradivna (primarna funkcija)
kontraktilna (miogen)
katalitika (enzimi)
regulatorna (hormoni)
transportna (hemoglobin)
imunoloka (antitela)
energetska (17.2 kJ/g)
6.11.2013
elementarni sasatav:
C, O, H, N, S, (P)
hemijska definicija:
Proteini su makromolekulska jedinjenja izgraena od
polipeptidnih lanaca koji se sastoje iz -L-aminokiselina
povezanih peptidnom vezom.
Telesni sastav mukarca (25 god., 70kg) i ene (25 god., 58kg)
pol
mukarac
ena
telesni sastav
kg
kg
proteini
11.90
17.0
4.93
8.5
masti
9.45
13.5
12.76
22.0
ugljeni hidrati
1.05
1.5
0.87
1.5
voda
43.4
62.0
35.96
62
mineralne mat.
4.20
6.0
3.48
6.0
ukupno
70.0
100
58
100
6.11.2013
krv
10
masno tkivo
3-4
koa
9-9.5
kosti
18-19
miii
46-47
RDA
(g proteina/dan)
0.0-0.5
0.5-1
1-3
23
4-6
30
7-10
34
11-14, mukarci
45
56
11-18, ene
46
44
graviditet
+30
laktacija
+20
6.11.2013
individualni faktori:
1. veliina tela
vilje i krupnije osobe imaju vee potrebe
2. starost
za vreme rasta potrebe su 2-3 puta vee po jedinici telesne mase
3. pol
mukarci imaju vee potrebe po jedinici mase jer imaju razvijeniju
muskulaturu
4. nutricioni status
pothranjene osobe i osobe na dijeti sa niskim sadrajem ugljenih
hidrata imaju vee potebe
5. Graviditet i laktacija
vee potrebe za razvoj fetusa i sintezu proteina mleka
6. klima
pri niskim temperaturama nije potreban povean unos proteina
ukoliko se energija obezbeuje iz ugljenih hidrata.
pri visokim temperaturama potrebno je malo poveati unos proteina
zbog poveanog gubitka azota tanspiracijom
7. fizika aktivnost
osobe koje treniraju ili se oporavlju posle mirovanja imaju vee potrebe
8. dijetarne komponente ishrane
osobe koje unose proteine niske bioloke vrednosti moraju da ih unose u
veoj koliini
vaan je i odnos ugljenih hidrata i proteina u hrani jer ugljeni hidrati tede
proteine
9. emocionalna stabilnost
pokazano je da stresna stanja dovode do izluivanja vee koliine azota i
promena u hormonskom profilu
10. bolesti
uglavnom poveavaju potrebu za proteinima zbog regeneracije tkiva,
poveanog bazalnog metabolizma kod hipertermije, poveane siteze
antitela, perspiracije
6.11.2013
sadraj (%)
meso
18-20
ribe
18-20
jaja
12.5
mleko
3.5
itarice
10-12
suve leguminoze
25-37
svee povre
1-3
svee voe
oko 1
15-50
Prosti proteini
aminokiselina:
(homoproteini)
sastoje
se
iskljuivo
od
1. albumini
rastvorljivi u vodi i razblaenim rastvorima soli
taloe se u zasienom rastvoru amonijumsulfata
koaguliu na toploti
siromani su u glikokolu
rasprostranjeni su u biljnom i ivotinjskom svetu.
2. globulini
nerastvorljivi u vodi, rastvorljivi u razblaenim rastvorima soli
koaguliu na toploti
taloe se
dodatkom zasienog rastvora amonijumsulfata
(poluzasienje), kao i uklanjanjem soli iz rastvora (dijaliza)
nalaze se u krvi, belancu jajeta, mleku i dr.
6.11.2013
3. prolamini
4. glutelini
5. globini
prosti proteini koji se jedine sa pigmentima (hem) i daju
hromoproteine (hemoglobin, mioglobin i dr.)
sadre histidin u veoj koliini
pH oko 7
6. skleroproteini (albuminoidi)
nerastvorljivi, ivotinjskog porekla
po fizikim i hemijskim osobinama dele se u tri grupe:
a) keratini
rastvorni u koncentrovanim rastvorima kiselina i baza uz zagrevanje,
ali i uz razlaganje i u sulfidima alkalnih i zemnoalkalnih metala.
svi vrsti keratini imaju aminokiseline histidin, lizin i arginin u
odnosu: 1:4:12
glavni sastojci egzoskeletnih struktura: koa, kosa, nokti, rogovi,
perje
6.11.2013
b) kolageni
imaju oblik dugakih, delimino kristalnih vlakana
sastojci vezivnog tkiva, kostiju, ila, hrskavice
kuvanjem se rastvaraju, pri emu se hidrolizom oslobaa jedan deo
aminokiselina i nastaje elatin koji hlaenjem rastvora prelazi u gel
koji se lako vari i dobro iskoriava
elatin spada u nepotpune proteine
Karakteristine aminokiseline: hidroksiprolin i hidroksilizin
c) elastini
razlikuju se od kolagena po tome to kuvanjem ne daju elatin
sastojci utih elastinih vlakana vezivnog tkiva
7. histoni
rastvorljivi u vodi, razblaenim kiselinama i alkalijama, a nerastvorni
u razblaenom rastvoru amonijumhidroksida
toplota ih ne koagulie
bogati su u argininu
alkalni proteini, obino se nalaze u obliku soli sa kiselim jedinjenjima
(npr. nukleinskim kiselinama)
ima ih u ikri riba
8. protamini
slino se rastvaraju kao histoni s tim to se rastvaraju i u amonijum
hidroksidu
male molekulske mase (peptidi)
toplota ih ne koagulie
bogati su u argininu
alkalni proteini, obino se nalaze u obliku soli (nukleoproteini)
taloe druge proteine iz rastvora
ima ih u ikri riba: salmin (ikra lososa)
6.11.2013
HO
P
HO
O CH2 CH
COOH
NH2
fosfoserin
Ca-kazeinat + 2H+
kazein + Ca2+
renin
Ca-kazeinat
Ca-parakazeinat + peptid
2. glikoproteini
satoje se iz proteina i heksoza ili heksozamina
teko hidrolizuju
mukoidi (ovomukoid belanceta) i mukoproteini (hondro-mukoprotein
hrskavice)
3. lipoproteini
kompleksi proteina sa lipidima
znaajni za transport lipida
lipovitelin, lipovitelenin
6.11.2013
4. nukleoproteini
sastoje se iz alkalnih proteina protamina i histona i RNA i DNA
nalaze se u ikri riba, kvascu, klici itarica
5. hromoproteini
sastoje se iz prostih proteina npr. globina i neke obojene supstance
(prostetina grupa)
hemoglobin, mioglobin, citohromi, flavoproteini, hlorofil, rodopsin,
karotenoproteini
proteini
Vrsta
% u namirnici
meso
miogen
mioalbumin
miozin
aktin
mioglobin
ostali
albumin
albumin
globulin
globulin
hromoprotein
....
ukupno
2.0
1.2
10.4
4.2
0.2
2.0
20.0
mleko
kazein
laktoalbumin
laktoglobulin
fosfoprotein
albumin
globulin
ukupno
2.7
0.2
0.4
3.3
jaje
ovoalbumin
lizozim
ovoglobulin
ovomukoid
vitelin
fosfitin
ostali
albumin
globulin
globulin
glikoprotein
fosfoprotein
fosfoprotein
lipoproteini
ukupno
6.1
0.4
0.4
0.5
5.1
0.4
0.5
13.4
6.11.2013
namirnica
proteini
vrsta
% u namirnici
pasulj
fazeolin
fazelin
ostali
globulin
globulin
....
ukupno
20.5
2.0
1.0
23.5
graak
legumilin
legumin
vicilin
proteoze
ostali
albumin
globulin
globulin
proteoze
....
ukupno
2.0
10.0
10.0
1.0
1.5
24.5
penino brano
glijadin
glutenin
globulin
leukozin
proteoze
ostali
prolamin
glutelin
globulin
albumin
proteoze
....
ukupno
3.9
4.2
0.6
0.4
0.4
1.1
10.6
kukuruzno brano
zein
zeanin
majsin
globulin
proteoze
ostali
prolamin
glutelin
albumin
globulin
proteoze
.....
ukupno
3.0
3.2
0.5
0.6
0.4
2.3
9.0
2. fibrilarni
odnos duina-irina molekule vei od 10
10
6.11.2013
AMINOKISELINE
CH
COOH
NH2
-L-AMINOKISELINE PROTEINA
1 . a l if a t i ~ ne m onoa m i no- m onok a rbos k e k i s e l i ne :
gl i k ok ol i l i gl i c i n, G l y
- a m i nos i r} e t na k i s e l i na
CH2 COOH
NH2
a l a ni n, A l a
- a m i nopropi ons k a k i s e l i na
CH3 CH COOH
NH2
v a l in, V a l
- a m i noi z ov a l e ri ja ns k a k i s e l ina
CH 3
CH CH COOH
CH 3
le uc i n, Le u
- a m i noi z ok a prons k a k i s e l i na
NH2
CH 3
CH CH2 CH COOH
CH 3
iz ole uc i n, I le
- a m i no- - m e t il - - e t il propi ons k a k i s e l i na
NH 2
CH 3
CH CH2 CH COOH
C2H 5
NH 2
s e ri n, S e r
- a m i no- - hi drok s i propi ons k a k i s e l i na
CH2 CH COOH
OH
t re oni n, T hr
- a m i no- - hi drok s i but e rna k i s e l ina
CH3
NH2
CH CH COOH
OH
NH2
11
6.11.2013
HOOC CH2 CH
a s pa ra gi n, A s n
a m i d a s pa ra gi ns k e k i s e l i ne
H2NOC CH2 CH
COOH
NH2
COOH
NH2
gl ut a m i ns k a k i s e l i na , G l u
- a m inogl ut a rna k i s e l i na
gl ut a m i n, G l n
a m i d gl ut a m i ns k e k i s e l i ne
NH2
NH2
a rgi nin, A rg
- a m ino- - gv a ni di nov a l e ri j a ns k a
k i s e l i na
NH2
NH
NH2
NH2
hi s t i di n, H i s
- a m ino- - i m i da z ol i l propi ons k a k i s e l i na
CH2 CH COOH
HN
NH2
4 . a mi n ok i s e l i ne s a s um po ro m:
c ist ein, Cy s
- a mi n o- - t i opro pi on s k a k i s e l i n a
c istin
d i - ( - a mi n o- - t i op ro pi on s k a k i s e l i n a )
CH2 CH
SH
HOOC
COOH
NH 2
CH CH 2 CH 2 CH
S
COOH
NH2
CH CH2 CH COOH
m e t i o ni n, M e t
- a mi n o- - me t i l t i obu t e rna k i s e l i na
CH3
NH 2
5 . a roma t i ~ ne a mi n ok i s e l i ne
f e ni l a l a ni n, P he
- a mi n o- - f e ni l p ropi o ns k a k i s e l i na
CH 2 CH COOH
t i ro z i n, T y r
- a mi n o- - p- hi d rok s i f e ni l pro pi ons k a
k i s e l i na
CH 2 CH COOH
NH2
NH2
OH
6 . h e t e roc i k l i ~ n e a m i nok i s e l i n e
t ri p t o f a n, T rp
- a mi n o- - i nd ol i l prop i ons k a
k i s e l i na
CH 2 CH COOH
NH2
NH
p rol i n, P ro
p i rol i di n - 2 - k a rbo ns k a k i s e l i na
COOH
NH
HO
h i drok s i prol i n , H p r
4 - hi drok s i pi ro l i di n- 2 - k a rbon s k a k i s e l i n a
COOH
NH
12
6.11.2013
COOH
H2N
H
H
OH
H
HO
COOH
D-treonin
H2N
HO
HO
CH3
L-alotreonin
(enantiomeri)
COOH
H2N
CH3
CH3
L-treonin
NH2
CH3
D-alotreonin
(enantiomeri)
13
6.11.2013
esencijalne
aminokiseline
poluesencijalne
aminokiseline
neesencijalne
aminokiseline
metionin
arginin
alanin
valin
histidin
asparagin
fenilalanin
asparaginska kiselina
treonin
cistein
triptofan
cistin
izoleucin
glutamin
leucin
glutaminska kiselina
lizin
glicin
prolin
serin
tirozin
14
6.11.2013
H2N-CHR-COOH H2N-CHR-COO- + H+
kiselina
H2N-CHR-COO- + H+ H2N-CHR-COOH
baza
H2N-CHR-COOH + H+
+H N-CHR-COOH
3
baza
+H N-CHR-COOH
3
H2N-CHR-COOH + H+
kiselina
15
6.11.2013
+H N-CHR-COOH
3
+H N-CHR-COO3
H2N-CHR-COO-
H2N-CHR-COOH
(pH < pI)
(pH = pI)
+H N-CHR-COO3
+ NaOH
16
6.11.2013
a) teoretske (neoperativne):
b) eksperimentalne (operativne):
17
6.11.2013
izoelektrini pH aminokiselina:
neutralne: 4.8-6.3
kisele: 2.7-3.2
bazne: 7.8-10.8
2. alkilovanje
18
6.11.2013
3. arilovanje
COOH
NH
R
NO2
NO2
CH
+
H2N
COOH
-HF
NO2
NO2
N-aril sulfonil derivati se esto koriste za identifikaciju Nterminalnih aminokiselina. Hidrolizom peptidnih veza
izdvajaju se aminokiseline od kojih je samo N-terminalna
supstituisana
SO2Cl
SO2
H2N
NH
CO
NH
CO
R'
CH
CH
CH
CH
R'
CO
NH
CO
-HCl
19
6.11.2013
4. dezaminacija
CH
COOH
HONO
NaNO3
CH
NH2
COOH
+ N2 + H2O
OH
reakcija je kvantitativna i predstavlja osnovu Van Slykeove metode odreivanja azota -amino grupa
aminokiselina, peptida i proteina
oksidativnom dezaminacijom pod dejstvom oksidacionih
sredstava kao to su KMnO4, H2O2 ili u tkivima
katalitikim dejstvom enzima dehidrogenaza nastaju
prvo -iminokiseline, a zatim -ketokiseline uz
oslobaanje amonijaka
CH
COOH
dehidrogenaza
NH2
COOH
-NH3
NH
COOH
3N
CH
HOH2C
COO-
+ 2HCHO
CH
COOH
HOH2C
ova
20
6.11.2013
2. estri aminokiselina
R
H2N
CH
COOH + HO
HCl
R'
-H2O
ClH3N
CH
R
NaOH
COOR'
H2N
-NaCl
-H2O
CH
COOR'
CH3
CH2OH
CH
H2N
CH
COOC2H5
H2N
CH
CH2OH
CONH
CH
COOC2H5
NH
CO
diketopiperazin
HOH
CH
CH2OH
CONH
CH
alanilserin
COOH
CH2OH
H2N
CH
CH3
CONH CH
COOH
serilalanin
21
6.11.2013
3. hloridi aminokiselina
R
CH3CONH
CH
COOH
+ PCl5
CH3CONH
R
CH3CONH
CH
CH
COCl + HCl
ClN3H
CH
COCl
hlorid hidrohlorida
aminokiseline
ako
se
za
zatitu
aminogrupe
upotrebi
karbobenzoksihlorid pri hloriranju sa fosfopentahloridom
dobie se karbobenzoksihlorid aminokiseline koji se
koristi za sintezu polipeptida.
4. dekarboksilacija aminokiselina
CH2 -CH(NH2)-COOH
HN
N
histidin
CH2-CH2-NH2
-CO2
HN
N
histamin
22
6.11.2013
5. stvaranje helata
CH2
O
C
H2N
OH
CH2
O
C
O
Cu2+
Cu
O
OH
H2N
H2N
C
CH2
C
CH2
23
6.11.2013
2. formiranje tioestara
O
R
OH
OH
R'
SH
O
OH
R' + H2O
S
R'
6. reakcije sa sulfitima
24
6.11.2013
V bojene reakcije
aminokiselina
reagensi
trivijalni naziv
glicin
o-ftalaldehid
arginin
-naftol, hipobromit
metionin
jodoplatinat
histidin
diazosulfanilna kiselina
histidin
triptofan
p-dimetilaminobenzaldehid
Ehrlich-ova reakcija
tirozin
Millon-ova reakcija
tirozin
-nitrozo--naftol
prolin
izatin
Sakaguci-jeva reakcija
Pauli-jev test
nitroprusid
sve a.k.
ninhidrin
peptidna veza
bakar-sulfat, hidroksid
biuretska reakcija
Ninhidrinska reakcija
25
6.11.2013
PEPTIDI
26
6.11.2013
4.
linran
rvt zbog prutva damnomonokarbonkh i monoamnodkarbonkh
kelna
mkln uled tvaranja ntramolekulkh vdninh veza
27
6.11.2013
TRUKTURA PROTENA
1. rmrn truktura
N termnalna analza
a) angerov potupak (dntrofenl potupak)
28
6.11.2013
b) Edman-ova degradacija
C terminalna analiza
a) Enzimska metoda
Enzim karboksipeptidaza katalizuje hidrolizu peptidne
veze kojom je vezana C terminalna aminokiselina
Sekvencioniranje DNK
Sekvencioniranje DNK gena koji kodira ispitivani protein
29
6.11.2013
30
6.11.2013
2. Sekundarna struktura
31
6.11.2013
Postoje tri tipa sekundarme strukture: -plisirani list, spirala i slobodni niz
1. -plisirani list
32
6.11.2013
2. -spirala
33
6.11.2013
imino grupa prolina je deo krutog prstena i nema rotacije oko N-C veze
a.k. sa naelektrisanim ili voluminoznim R grupama elektrostatiki ili
fiziki remete formiranje heliksa
3. Slobodan niz
3. Tercijerna struktura
34
6.11.2013
4. Kvaternerna struktura
35
6.11.2013
Mm peptida: do 10 000
Odreivanje Mt proteina:
1. Ultracentrifugiranje (6 000 o/min)
2. SDS PAGE
3. Gel filtracija
36
6.11.2013
1. neapsorptivne interakcije:
polarizacija
difrakcija x zraka
optika anizotropija
refrakcija i disperzija
skatering
2. apsorptivne interakcije
apsorpcija u UV oblasti
apsorpcija u IR oblasti
funkcionalna grupa
maksimum apsorpcije
Em
tirozin
fenol
275
1340
triptofan
indol
280
5010
fenilalanin
fenil
258
206
cistin
disulfid
250
cistein
tiol
200
metionin
alkilsulfid
200
37
6.11.2013
38
6.11.2013
Denaturacija proteina
denaturisanjem proteini
prelaze iz visoko
organizovanog u
neorganizovano stanje uz
promenu konformacije
(odmotavanje, ispravljanje
molekula)
39
6.11.2013
koagulacija proteina
AZOTNA RAVNOTEA
1.
2.
3.
40
6.11.2013
41
6.11.2013
6,88
Treonin
5,01
Valin
6,75
Metionin
5,71
Izoleucin
8,70
Leucin
6,20
Tirozin
4,10
fenilalanin
5,65
42
6.11.2013
-amino grupe
i asparaginske
sternih smetnji
mleka je vea
43
6.11.2013
Cistein
Serin
CH2
baza
+L-lizin
C
-H2S
-H2O
dehidroalaninski
ostatak
C-H
(CH2)4
NH
CH2
*C-H
LAL
R-NH2
H-C-NHR
H-C-OH
HO-C-H O
H-C-OH
H-C
H2C-OH
Amadorijevo
2
H-C=O
HO-C-H
H-C-OH
H-C-OH
H2C-OH
premestanje
aldozamin
CH2-NHR
U prvoj fazi kondenzuje se karbonilna grupa eera i slobodna
H-C-OH
amino grupa proteina (lizina ili terminalna) pri emu se formira
aldozamin ili ketozamin
HO-C-H
Druga faza je Amadorijevo premetanje pri emu nastaje NH-C-OH O
supstituisana-1-amino-1-dezoksi-2-ketoza
U treoj fazi dolazi do stvaranja vie stotina razliitih jedinjenja
H-C-OH
koja su odgovorna za za brojne arome boju i ukus termiki
H2C
tretirane hrane, a na kraju nastaju tamni pigmenti melanoidini.
1-amino-1-dezoksi-2-ketoza
44
6.11.2013
DIGESTIBILNOST PROTEINA
Faktori koji utiu na digestibilnost proteina:
poreklo (biljni proteini imaju manju digestibilnost zbog manje
digestibilnih elijskih memebrana)
fizikohemijski faktori (konformacija molekula, tipovi veza)
prisustvo sastojaka hrane koji modifikuju digestiju (vlakna, tanini)
prisustvo antifiziolokih faktora koji utiu na digestiju (tripsin
inhibitori, lektini)
termiki tretman (Millard-ova reakcija, stvaranje lizinoalanina,
racemizacija i dr.)
Izraunavanje digestibilnosti:
[Ni - (Nf - Ne)] x 100
Ni
Ni - uneti azot
Nf - fekalni azot
Ne - endogeni fekalni azot (na dijeti bez proteina, oko 14mg/kg za
odrasle, 20 mg/kg za decu)
45
6.11.2013
Namirnica
Belance jajeta
97
95
95
94
Polirani pirina
88
Sojino brano
86
Integralna penica
86
Kukuruzni proizvodi
86
Integralni pirina
84
pasulj
69
DIJETE
SAD
96
Kina
94
93
Filipini (urbana)
88
82
Meksiko (ruralna)
80
Gvatemala (ruralna)
79
Brazil (ruralna)
78
Indija (vegetarijanska)
78
46
6.11.2013
DIGESTIJA PROTEINA
1. usta
mehaniko
usitnjavanje hrane
2. eludac
pepsin
- prekurzor: pepsinogen, aktivator: HCl, pH 12 raskida endogene peptidne veze proteina, naroito
izmeu aromatinih i dikarbonskih kiselina pri emu
nastaju proteoze i peptoni
- potrebno prisustvo Ca2+, pH 4 dovodi do
koagulacije mleka pri emu kazein prelazi u
parakazein pa se due zadrava u eludcu. Vaan je
kod dece dok ga kod odraslih nema. Koristi se u
proizvodnji sira.
renin
3. tanko crevo
a) enzimi pankreasnog soka:
tripsin (prekurzor: tripsinogen, aktivator: enterokinaza, pH 7.9) raskida endogene peptidne veze proteina, proteoza i peptona,
naroito izmeu baznih aminokiselina pri emu nastaju polipeptidi i
dipeptidi
himotripsin (prekurzor: himotripsinogen, aktivator: tripsin, pH 8) raskida endogene peptidne veze proteina, proteoza i peptona,
naroito izmeu neutralnih aminokiselina pri emu nastaju polipeptidi
i dipeptidi
47
6.11.2013
APSORPCIJA PROTEINA
48
6.11.2013
METABOLIZAM PROTEINA
Ponoviti iz biohemije
49
6.11.2013
Ponoviti iz biohemije
Ponoviti iz biohemije
Sinteza proteina
50
6.11.2013
ANALITIKA PROTEINA
1. odreivanje ukupnih proteina
- metoda po Kjeldahl-u
koncentrovana
sumporna kiselina vri razaranje
materijala pri emu se ugljenik oksidie do ugljendioksida, vodonik do vode, a azot se redukuje do
amonijaka koji se destilie vodenom parom i hvata u
odreenu zapreminu kiseline poznatog titra, nakon ega
se viak kiseline se retitrira bazom
U zavisnosti od sadraja azota u proteinima pojedinih
namirnica (FAO tablice) sadraj proteina se izraunava
mnoenjem dobijenog sadraja azota faktorom iz tablice
(npr. 5.7 za proteine penice, 6.25 za proteine drugih
itarica)
CH
+
COOH
N(CH2OH)2
O
H
R
H
CH
COOH
51
6.11.2013
sekvenciona analiza
rentgenske metode
52