王繼恩為宋太祖、宋太宗內侍。陳橋兵變後,宋太祖告訴王繼恩說:“早來前殿指揮一事,偶有誤失,史官必書之,故不樂也。”
《宋史》說宋太祖駕崩時,宋皇后急令王繼恩召太子趙德芳入宮,王繼恩卻拿著遺詔去找晉王趙光義。後來趙光義繼位,即宋太宗,但許多人相信有“斧聲燭影”之謀篡疑案,認為是趙光義謀殺宋太祖,因而即位。
宋太宗淳化四年(993年)王小波和李順造反,王繼恩、雷有終率兵討之。淳化四年(993年),李順陷成都時,繼恩任劍南西川治安使征討之,屠杀三万人。
宋太宗去世後,与参知政事李昌龄勾结,繼恩謀廢太子趙恆。呂端發覺陰謀,奉太子趙恆即位,並將王繼恩下獄。