Content-Length: 214100 | pFad | http://b.hatena.ne.jp/ayaniimi213/Pajek/
Pajek + R でお手軽スケールフリーシミュレーション - tkenichi の日記
久しぶりに Pajek で遊んでみる。ネットワークの可視化ツールとしてデファクトだけれども、簡単なシミュレーションもできる。もちろん大規模のものを何度も繰り返す場合はマクロを書いたりしなければならないので面倒だけれども、本に載っている例をちょっと試したいとか、授業などの話のネタにやってみるぐらいなら簡単だ。また、R 形式でネットワークの隣接行列が出力できることがわかったので、これを利用してみる。 たとえば、おなじみスケールフリーネットワークを作って、次数分布のグラフを書く、なんてことをやろうとすると、 Pajek のメイン画面から Net > Random Network > Scale Free > Undirected を選ぶ Pajek でパラメータを選んでネットワークを作る Pajek のメイン画面から Draw で可視化 Pajek のメイン画面から Tools > R > Se
Networks / Pajek
In January 2008 this page was replaced by Pajek Wiki. Pajek runs on Windows and is free for noncommercial use. DOWNLOAD Pajek Data: test networks, GPHs, GEDs, PDB files. Screenshots; History; Manual (pdf); Papers/presentations; Applications; in News; Examples: SVG, PDF. How to ? English / Slovene / Japanese (problems with IE - download and use Acrobat reader). Pajek nicely runs on Linux via Wine,
Pajek入門 －巨大ネットワーク分析用フリーソフトウェア－: それゆけBioinformatics
Pajek official site Developed by Vladimir Batagelj and Andrej Mrvar at the University of Ljubljana, Slovenia. 1. Pajek概要 Pajekは、フリーのWindows (32 bit)用の巨大なネットワーク分析プログラムである。 Yeast two-hybrid (Y2H)法によるタンパク質－タンパク質相互作用ネットワークのような大量データ(多数のタンパク質がある)をネットワーク分析する際に、行列表示に基づく標準的なネットワーク分析ツールで効率的に扱うことは非常に困難である。大量なネットワークデータに対してPajekが出来ること・目指すゴールは以下の通りである。 (1) 巨大なネットワークを小さなネットワークへと分離・抽出する (2) ユーザにネットワークの強力な視覚化ツールを提
ネットワーク分析用フリーソフトウェア－Pajek: DESIGN IT! w/LOVE
不確実な時代をクネクネ蛇行しながら道を切りひらく非線形型ブログ。人間の思考の形の変遷を探求することをライフワークに。 ネットワーク科学に興味をもった方へ、 自分でネットワークを描いて、ネットワークの平均距離なんかを分析できちゃうツールをご紹介。 Pajek http://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/ このURLから日本語での簡単なチュートリアル（PDFファイル）もダウンロードできます。 http://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/howto/jp/pajek-AMR4-6-2.pdf また、このブログにも簡単な使い方が説明してあります。 http://bioinfo-goto.seesaa.net/article/566257.html あとは前に紹介した『「複雑ネットワーク」とは何か』という
Pajek の日本語Howto: それゆけBioinformatics
しばらくPajekのオフィシャルを見ていなかった(半年以上)ので、日本語のHowtoが出来てて、しかもそれはGBRCという団体の出版した『赤門マネジメント・レビュー』 Vol.4, No.5の中の記事だということを知りました。この記事自体の存在は以前から知っていましたが、無料で閲覧できないと自分で勝手に思い込んでいましたので、二度びっくりしてしまいました。 http://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/howto/jp/pajek-AMR4-6-2.pdf そういえば先日、ある知人がPajekでデータ処理することを「パヤくる」と申しておりました。Pajek (パエックorパヤック)と読む人が多いからでしょうか。 関連サイト Pajek Program for Large Network Analysis http://vlado.fmf.uni
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