Ampullaviridae

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Ampullaviridae

Virion der gattung Bottigliavirus (Schema)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: nicht klassifiziert[1]
Reich: nicht klassifiziert[1]
Phylum: nicht klassifiziert[1]
Klasse: nicht klassifiziert[1]
Ordnung: nicht klassifiziert[1]
Familie: Ampullaviridae[1]
Gattung: Ampullavirus
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: flaschenförmig
Hülle: behüllt
Wissenschaftlicher Name
Ampullaviridae
Links
ICTV Taxon History: 201902481
NCBI Taxonomy: 573053 (Familie),
573054 (Gattung)
ViralZone (Expasy, SIB): 3016 (Familie),
623 (Gattung)

Ampullaviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom, die Archaeen der Gattung Acidianus, Crenarchaeota infizieren.[2] Bisher ist vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) in dieser Familie nur die einzige Gattung Bottigliavirus (früher Ampullavirus) bestätigt, anfänglich mit der Spezies (Art) Bottigliavirus pozzuoliense (fr+her Bottigliavirus ABV, mit dem Acidianus bottle-shaped virus).[3][4]

Etymologie

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Der Name der Familie ist vom lateinischen Wort für Flasche, ampulla abgeleitet; der Name der Gattung stammt vom italienischen Wort für Flasche, bottiglia. Dies weist darauf hin, dass die Virionen die Form einer Flasche haben und die Familie erstmals bei einer Untersuchung der mikrobiellen Flora von heißen Quellen in Italien beschrieben wurde.[5]

Aufbau und Genom

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Negativ-Kontrast.EM-Aufnahme von ursprünglichen (links) und teilweise degradierten Virionen von ABV. Rechts unten Schemazeichnung nach Häring et al. (2005).[2][6][Anm. 1]

Ampullaviren haben eine sehr spezifische Morphologie. Die Virionen (Virusteilchen) sind flaschenförmig mit einem schmalen Ende auf der einen Seite, wobei sich die Gestalt zum anderen Ende fließend erweitert. Die Gesamtlänge beträgt etwa 230 nm bei einer Breite (am weiten Ende) von etwa 75 nm. Das schmale Ende ragt über die Virushülle hinaus und dient wahrscheinlich der Injektion der viralen DNA in Wirtszellen. Das breite Ende besitzt etwa 20 dünne Filamente, die regelmäßig in einem Ring verteilt sind. Im Inneren der Hülle befindet sich eine trichterförmige Proteinhülle, die die virale DNA beherbergt.[2]

Das Genom der Ampullaviren ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem linearen doppelsträngigen DNA-Molekül mit einer Länge von etwa 23,8 kbp (Kilobasenpaaren). Es enthält schätzungsweise 56 oder 57 offene Leserahmen (en. Open Reading Frames, ORFs), die für mindestens sechs Strukturproteine kodieren.[2][7]

Reproduktionszyklus

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Die virale Replikation erfolgt im Zytoplasma der Wirtszelle. Der Eintritt in die Wirtszelle erfolgt nach die Anheftung des Virus an die Wirtszelle. Die Transkription erfolgt durch Ablesen des dsDNA-Genoms (en. DNA templated transcription). Als natürlicher Wirt dienen Archaeen der Gattung Acidianus. (Crenarchaeota) Die Übertragung der Virusteilchen geschieht durch passive Diffusion.[8][9]

Systematik

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Die innere Systematik der Familie ist mit Stand Mai 2024 nach ICTV und NCBI wie folgt:[10][11]

Familie: Ampullaviridae

  • Gattung: Bottigliavirus (früher Ampullavirus)
    • Spezies: Bottigliavirus krisuvikense (früher Bottigliavirus ABV3) mit Acidianus bottle-shaped virus 3 [strain ABV3] (ABV3)[12]
    • Spezies: Bottigliavirus pozzuoliense (früher Bottigliavirus ABV, ehem. Typus) mit Acidianus bottle-shaped virus (ABV)
    • Spezies: Bottigliavirus puteoliense (früher Bottigliavirus ABV2) mit Acidianus bottle-shaped virus 2 [strain ABV2] (ABV2)[13]

Bezüglich der äußeren Systematik schlugen Kim et al. (2019) folgendes Kladogramm vor (vereinfacht):[14][15]

 ​​​ 
 ​ 

Ovaliviridae


 ​​​ 
 ​ 

Salasmaviridae: Picovirinae


   

Tectiviridae (monoderm hosts: Gram-positive Bakterien)



 ​ 

Tectiviridae (diderm hosts: Gram-negative Bakterien)


   

Autolykiviridae[16][17]





 ​ 

Ampullaviridae


 ​ 

Thaspiviridae: Nitmarvirus (Stämme Nitrosopumilus spindle-shaped virus 1,2 und 3; NSV1–3)[18][19]


 ​ 

Halspiviridae: Salterprovirus (His 1 virus)


   

Pleolipoviridae: Gammapleolipovirus (His 2 virus)






Vorlage:Klade/Wartung/Style

Anmerkung: Die Picovirinae wurden zwischenzeitlich vom ICTV von der ehemaligen Familie Podoviridae in die neue Familie Salasmaviridae verschoben.

Anmerkungen

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  1. ↑ Das Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.
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Einzelnachweise

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  1. ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35).
  2. ↑ a b c d Monika Häring, R. Rachel, X. Peng, R. A. Garrett, D. Prangishvili: Viral diversity in hot springs of Pozzuoli, Italy, and characterization of a unique archaeal virus, Acidianus bottle-shaped virus, from a new family, the Ampullaviridae. In: Journal of Virology. 79. Jahrgang, Nr. 15, 2005, S. 9904–9911, doi:10.1128/JVI.79.15.9904-9911.2005, PMID 16014951, PMC 1181580 (freier Volltext).
  3. ↑ D Prangishvili, M Krupovic, ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Ampullaviridae. In: The Journal of General Virology. 99. Jahrgang, Nr. 3, 8. Februar 2018, S. 288–289, doi:10.1099/jgv.0.001023, PMID 29458532, PMC 5882107 (freier Volltext).
  4. ↑ ICTV: Taxon Details: Genus Bottigliavirus. EC 52, Online meeting, October 2020; Email ratification March 2021 (MSL #36).
  5. ↑ David Prangishvili, Mart Krupovic: Family: Ampullaviridae. ICTV Report vom Februar 2018, Stand Juni 2022.
  6. ↑ Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell: ICTV Online Report/ampullaviridae Ampullaviridae, Genus: Ampullavirus (Memento des Originals vom 20. September 2020 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org (ICTV)
  7. ↑ X. Peng, T. Basta, M. Häring, R. A. Garrett, D. Prangishvili: Genome of the Acidianus bottle-shaped virus and insights into the replication and packaging mechanisms. In: Virology. 364. Jahrgang, Nr. 1, 2007, S. 237–243, doi:10.1016/j.virol.2007.03.005, PMID 17412384.
  8. ↑ ICTV Online Report Ampullaviridae. Abgerufen am 2. Mai 2020.
  9. ↑ Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 2. Mai 2020.
  10. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  11. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  12. ↑ Acidianus bottle-shaped virus 3 (no rank). NCBI.
  13. ↑ Acidianus bottle-shaped virus 2 (no rank). NCBI.
  14. ↑ Jong-Geol Kim, So-Jeong Kim, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Woon-Jong Yu, Joo-Han Gwak, Mario López-Pérez, Francisco Rodriguez-Valera, Mart Krupovic, Jang-Cheon Cho, Sung-Keun Rhee: Spindle-shaped viruses infect marine ammonia-oxidizing thaumarchaea. In: PNAS, Band 116, Nr. 31, 30. Juli 2019, S. 15645–15650; doi:10.1073/pnas.1905682116, ResearchGate, Epub 16. Juli 2019.
  15. ↑ Jong-Geol Kim, Mart Krupovic, Sung-Keun Rhee: Thaspiviridae Proposal 2019.092B (ZIP-Member 2019.092B.A.v1.Thaspiviridae_1nfam.docx), 2019 – accepted.
  16. ↑ Scientists Find New Type of Virus in World’s Oceans: Autolykiviridae. In: sci-news, 25. Januar 2018.
    Forscher entdecken ein mysteriöses Virus, das die Ozeane dominiert. In: business insider, 29. Januar 2018.
    Never-Before-Seen Viruses With Weird DNA Were Just Discovered in The Ocean. In: sciencealert, 25. Januar 2018.
    David L. Chandler: Researchers Discover a Missing Link in Virus Evolution. In: SciTechDaily, 25. Januar 2018.
  17. ↑ Autolykiviridae (family). NCBI.
  18. ↑ ICTV Taxonomy history: Nitmarvirus NSV1. ICTV, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35).
  19. ↑ ICTV Master Species List 2020.v1. ICTV, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36).
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