Hem B
| Hem B | |
 | |
 | |
| Všeobecné vlastnosti | |
| Sumárny vzorec | C34H32O4N4Fe |
| Fyzikálne vlastnosti | |
| Molárna hmotnosť | 616,487 g/mol |
| Ďalšie informácie | |
| Číslo CAS | 14875-96-8 |
| Pokiaľ je to možné a bežné, používame jednotky sústavy SI. Ak nie je hore uvedené inak, údaje sú za normálnych podmienok. | |
Hem B je najbežnejší druh hemu.[1] Nachádza sa napríklad v hemoglobíne a myoglobíne, čo sú bielkoviny, ktoré prenášajú kyslík. Enzýmová rodina peroxidáz takisto obsahuje hem B. Cyklooxygenázy COX-1 a COX-2 takisto obsahujú hem B na jednom zo svojich dvoch aktívnych miest.
Štruktúra
[upraviť | upraviť zdroj]Hem B je štruktúrne najmenší zo základných hemov. Na uhlíkoch 3 a 8 obsahuje vinylovú skupinu a na uhlíku 18 má metylovú skupinu.[2]
Štruktúru hemu B a hemu S ako prvý určil nemecký chemik Hans Fischer.[3]
Väzba
[upraviť | upraviť zdroj]Hem b sa na bielkovinu viaže nekovalentne.[1][2] Všeobecne je hem B naviazaný na bielkovinu (apoproteín bez koenzýmu) pomocou jednej koordinačnej väzby medzi iónom železa a bočným reťazcom aminokyseliny. Najčastejšie je touto aminokyselinou histidín, okrem neho sa však v axiálnej polohe vyskytuje aj cysteín, metionín, tyrozín a lyzín.[2] V hemoglobíne i myoglobíne tvorí túto koordinačnú väzbu evolučne zachovaný histidín. Syntáza oxidu dusnatého a cytochróm P450, ktoré takisto obsahujú hem B, majú evolučne zachovaný cysteín.
Keďze ión železa je v bielkovinách obsahujúcich hem B viazaný na štyri atómy dusíka porfyrínu (ktoré sú v rovine) a jeden atóm proteínu (z bočného reťazca aminokysliny), tento ión sa často nachádza v pentakoordinovanom stave (tvorí päť väzieb). Pri naviazaní kyslíku alebo toxického oxidu uhoľnatého sa železo dostáva do hexakoordinovaného stavu.
Referencie
[upraviť | upraviť zdroj]- ↑ a b BOWMAN, Sarah E. J.; BREN, Kara L.. The chemistry and biochemistry of heme c: functional bases for covalent attachment. Natural Product Reports, 2008, roč. 25, čís. 6, s. 1118. Dostupné online [cit. 2022-08-25]. ISSN 0265-0568. DOI: 10.1039/b717196j. (po anglicky)
- ↑ a b c LI, Ting; BONKOVSKY, Herbert L; GUO, Jun-tao. Structural analysis of heme proteins: implications for design and prediction. BMC Structural Biology, 2011-12, roč. 11, čís. 1, s. 13. Dostupné online [cit. 2022-08-25]. ISSN 1472-6807. DOI: 10.1186/1472-6807-11-13. (po anglicky)
- ↑ FISCHER, H.; ORTH, H.. Die Chemie des Pyrrols. Liepzig : Akademische Verlagsgesellschaft, 1934.
Zdroj
[upraviť | upraviť zdroj]Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Heme B na anglickej Wikipédii.