Proteínas Colorímetro
Proteínas Colorímetro
Proteínas Colorímetro
Auxiliares docentes:
Bioq. Mariana Paula CID
Biól. Diego Alberto GUZMAN
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PROGRAMA ANALÍTICO DE QUÍMICA ORGÁNICA-BIOLÓGICA 2005
5. Estructura química de los ácidos nucleicos. Bases púricas y pirimídicas. Nucleósidos y nucleótidos:
nomenclatura. Acido desoxirribonucleico (ADN) : estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.
Estructura de los ácidos ribonucleicos: mensajero(ARNm), de transferencia(ARNt) y ribosomal (ARNr).
9. Metabolismo de los glúcidos. Gluconeogénesis : reacciones. Ciclo de Cori: rendimiento de ATP del
lactato. Via de las pentosas-fosfato. Biosíntesis del ácido ascórbico. Degradación intracelular del almidón
y del glucógeno: reacciones. Digestión. Interconversión de hexosas. Biosíntesis del glucógeno, almidón y
celulosa: reacciones. Regulación del metabolismo del glucógeno via AMPc. Biosíntesis de disacáridos.
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10. Metabolismo de lípidos. Biosíntesis y degradación de los triglicéridos, glicerofosfolípidos y
esfingolípidos. Biosíntesis del colesterol a partir de acetato. Formación de colecalciferol y ácidos biliares
11. Metabolismo de los ácidos grasos, degradación por b -oxidación de ácidos grasos saturados de
cadena par e impar y de ácidos grasos insaturados. Balance energético. a y w-oxidación. Ubicación
subcelular. Biosíntesis: sistema del citosol, reacciones. Sistemas microsomal y mitocondrial.
12. Metabolismo de los aminoácidos. Ciclo de fijación del nitrógeno. Degradación de los aminoácidos:
reacciones de tipo general: desaminación por transaminación, desaminación oxidativa, desaminación no
oxidativa y descarboxilación, ejemplos. Transporte del amoníaco. Ciclo de la urea: reacciones.
Metabolismo del triptofano, fenilalanina, tirosina, histidina y glutamato.
13. Metabolismo de los ácidos nucleicos. La replicación de ADN en procariotas: ADN polimerasas,
reacciones, mecanismo de polimerización, etapas de iniciación, elongación y terminación. La replicación
en eucariotas. Transposones. Biosíntesis del ARN: ARN polimerasa y transcripción. Degradación del
ARN: polinucleótido fosforilasa.
15. Fotosíntesis: ecuación global. Ubicación del proceso en el cloroplasto, pigmentos. Reacción de Hill.
Las reacciones luminosas: fotosistemas I y II. Cadena transportadora de electrones. Formación de ATP y
NADPH. Bioenergética. Mecanismo de formación de ATP. Reacciones enzimáticas: ciclo de Calvin.
Eficiencia de la fotosíntesis.
16. Regulación metabólica. Regulación por modificación de la actividad de la enzima: activación por
precursor e inhibición por producto final. Control de la expresión genética en procariotas. Operón lac y
operón trip: inducción y represión. Control en eucariotas.
17. Ingeniería genética: aplicaciones y obtención del gen: por corte del ADN con endonucleasas de
restricción, por síntesis orgánica y a partir del ARNm. Unión de segmentos de ADN de distinto origen:
método de las colas homopoliméricas. Vectores: plásmidos semisintéticos y derivados del bacteriofago l:
características deseables. Introducción del vector a la celula huesped. Selección del clon con el ADN
recombinante.
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15. Fotosíntesis.
16. Regulación metabólica.
17. Ingeniería genética.
18. Vitaminas liposolubles.
19. Metabolismo de porfirinas.
TRABAJOS PRACTICOS
1. Fotocolorimetría
2. Cinética Enzimática
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TRABAJO PRACTICO Nº 1
FOTOCOLORIMETRIA
OBJETIVOS
INTRODUCCION
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Ir
λ λ
Ia
I0 It
Fig. 1. Fenómenos involucrados cuando un haz de radiación monocromático incide sobre una cubeta
con una solución que absorbe en la longitud de onda incidente (λ).
Io = Intensidad del haz incidente,
Ir = Intensidad del haz reflejado, resultado de las diferencias del índice de refracción entre la especie
absorbente y el ambiente,
Ia = Intensidad del haz absorbido por el medio,
It = Intensidad del haz transmitido.
La mayor parte de los procedimientos que involucran absorción de luz, son realizados con
soluciones homogéneas y transparentes, de tal modo que la intensidad de la radiación dispersada, Id,
puede ser considerada despreciable. De esta forma, puede considerarse que la intensidad de la
radiación incidente parte es absorbida por la solución y parte es transmitida. La ecuación que resume
esto es
I0 = Ia + It
La intensidad incidente (Io) y transmitida (It) pueden ser medidas directamente. Por lo tanto, la
parte absorbida (Ia) puede ser determinada como la diferencia entre Io e It.
LEYES DE LA ABSORCION
Las primeras investigaciones sobre la relación existente entre las intensidades de radiación
incidente y las intensidades de radiación transmitida, se destacan los experimentos de Pierre Bouguer
(1729) y de Johann Heindrich Lambert (1760) que enunciaron que
It = K . I0
6
La intensidad de luz transmitida disminuye exponencialmente con el aumento del espesor de la
capa del cuerpo homogéneo. Donde
It = I0 . 10-ab
a = absortividad
b = espesor de la capa o paso óptico
A=a.c
It = I0 . 10-acb
It = 10-acb
I0
A= a.b.c
De este modo
7
A= ε.b.c
ESPECTRO DE ABSORCIÓN
0,7
0,6
0,5
0,4
Α
0,3
0,2
0,1
0,0
λ (nm )
CURVA DE CALIBRACION
En la práctica, para conocer la concentración de una solución problema se debe construir una
curva de calibración (gráfico que expresa la relación entre absorbancia y la concentración) de la especie
de interés. Cuya función es determinar gráficamente la concentración de la solución a cuantificar y
verificar si se cumple la ley de Lambert y Beer. Fig. 3.
8
1,2
1,0
0,8
Absorbancia
0,6
0,4
0,2
0,0
0 20 40 60 80 100 120
C (mg/ml)
Fig. 3 - Curva de calibración para una solución de albúmina sérica bovina en λ = 700 nm y un paso
óptico de 1 cm.
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GUIA DE ESTUDIO
1. Qué relación existe entre velocidad de una radiación electromagnética, la longitud de onda, la
frecuencia y la energía de la misma.
2. Defina luz blanca y luz monocromática. Tipos de monocromadores
3. ¿Qué efecto produce la absorción de la luz por una molécula?
4. ¿Existe alguna restricción con respecto a la longitud de onda de la luz que una sustancia puede
absorber? J.S.R.
5. Definición de espectro de absorción ¿Cuál es la utilidad?
7. ¿Qué es la fotocolorimetría o espectrofotometría? Cuál es su uso.
8. Analizar la siguiente figura de un espectrofotómetro.
b
d
a
e
a = fuente de luz, b = monocromador, c = cubeta para contener la muestra, d = detector de intensidad
lumínica y e = sistema de registro.
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PROBLEMAS
1- Los siguientes son los resultados de la cuantificación de SO H en una misma muestra realizado
4 2
por un método "A" por cuatro analistas diferentes:
a- 50,00 % P/P, densidad= 1,3952 g/ml
b- 70,00 % P/V
c- 7,00 M
d- 7,10 mM
De acuerdo al enunciado anterior diga:
a-¿Cómo procede para comparar los resultados anteriores?
b-¿Que puede decir acerca de la precisión del método empleado en la cuantificación?
DATOS: PM SO H = 98,08
4 2
3. Una solución de proteínas de concentración desconocida, se diluye 5 veces con agua destilada. A
partir de esta dilución, se vuelve a diluir 3 veces con agua destilada. Esta última dilución dio por
método Biuret una absorbancia de 0,12 (testigo de concentración = 4 mg/ml, dio 0,25 de
absorbancia).¿Cuál es la concentración de la solución original de proteínas? R = 28,8 mg/ml.
4- Una solución de proteínas de concentración desconocida, dio por método de Biuret una A = 0,09
(testigo de concentración 4mg/ml dio A = 0,25 ).De dicha solución se desea tomar 100 µg. ¿Qué
volumen de dicha solución se debe pipetear? R = 69 ul.
5- Interprete el significado de las curvas de calibración para cuantificación de proteínas por método de
Biuret, que se muestran en la Fig.3. ¿Cuál de ellas corresponde a un esquema de trabajo correcto?
Fig. Curvas de Calibración
Absorbancia 1 2
Concentración (mg/ml)
6- Los datos de la Tabla 1 corresponden a absorbancias de una solución de flunitrazepam 25 µM
en etanol 3% v/v y en buffer Tris-HCl 50 mM, pH 7,4 medidos a diferentes longitudes de onda:
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300 310 320 330 340 350 360 370
NaCl 1ml
ADN 100µg/ml 1 ml
en Nacl 1M
ADN [ ] desc en
NaCl 1M
difenilamina 2ml
Volumen final
4 0 0 4 5 0 5 0 0 5 5 0 6 0 0 6 5 0 7 0 0
L o n g itu d d e o n d a ( n m )
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9- Calcular la absorbancia que corresponde a cada uno de los siguientes valores de transmitancia:
a) 0% b) 0,2% c) 0,8% d) 1,52% e) 2.
10- Calcule el coeficiente de extinción molar del p-nitrofenol si A = 0,2 y la concentración es 11,428
nmoles/1, = 410 nm y b = 1 cm. R = 17.500
11- Se cuantificó una solución de tirosina por absorción al UV. Esta solución dio A = 0,16; calcule la
concentración nM de tirosina considerando que dicha solución había sido diluida primero 3 veces
y luego 2 veces más. ε = 1.400 l.mol-1 . cm-1 , λ = 274 nm. R = 6,85.10-5 nM.
12- Una solución de una sustancia de PM 600. a una concentración de 40 µg/ml tiene A = 0,3 a 540
nm, medida en una cubeta de 1 cm de paso óptico. Calcule el coeficiente de extinción molar. R =
4.500.
13- Una solución contiene dos flavonoides : flavonoide 1 (F1) y flavonoide 2 (F2). Se quiere
cuantificar ambos sin una purificación previa. Analizando la Fig. 6 se observa que entre 220 nm y
420 nm sus espectros se superponen, por lo tanto la cuantificación de cualquiera de ellos
interfiere con la del otro. A longitudes de onda superiores a 420 nm sólo absorbe F1. Calcule la
concentración molar de F1 y F2 en ésa solución sabiendo que:
F1
F2
Testigo de F1 Testigo de F2
A c1 = 15 µM c2 = 15 µM
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EJERCITACION ADICIONAL
2. ¿Qué cantidad de glucosa (PM=180)tiene que pesar para preparar una solución 0,05 M ?
R = 1,8 g.
4. Si tiene 3 litros de una solución de Na(OH) 0,5 M, ¿Cuántos moles y que concentración molar poseen
los siguientes volúmenes: a) 50ml. b) 0,25ml. c) 1 litro
R = a)0.025 moles, 0.5 M. b) 1.25 x 10-4 moles, 0.5 M. c) 0.5 moles, 0.5 M
5. ¿Qué molaridad tiene una solución que contiene 60 gr de NA(OH) (PM=40) por litro?
R = 1.5 M.
6.¿ Qué cantidad de NA(OH) (PM=40) estan contenidos en 3 litros de una solución 2.5 M ?
R = 300gr.
9. Una solución de ácido sulfúrico al 98% P/P, cuya densidad es 1.8 g/cm3, ¿ qué molaridad tiene ?
R = 18 M.
10.¿Cuál será la normalidad de una solución de ácido clorhídrico (PM=36.5) al 37% P/P cuya densidad
es 1.19 g/cm3 R = 12 N
11.¿Cómo procedería para preparar 2 litros de una solución de ClK 10 mM a partir de una solución 3 M ?
R = tomar 6.67 ml (3 M). colocarlos en un matraz de 2 litros enrasar con agua destilada.
12.Se quieren preparar 6 litros de una solución 0.25 N de ácido sulfúrico a partir de: una solución 63%
P/P (densidad=1.7 g/cm3 ). ¿Qué volumen debe tomar? R = 68.61 ml.
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TRABAJO PRACTICO Nº 2
SOLUCIONES Y FOTOCOLORIMETRIA
PARTE PRÁCTICA
Objetivo
Cuantificar albúmina sérica humana por método de Biuret (Gornall, A.G et al., 1949, J. Biol.
Chem., 177-766).
Esta reacción coloreada la dan: a) sustancias que contengan dos grupos -CONH2 ; -CH2NH2;
-C(NH)(NH2); o -CSNH2, unidos, sea directamente entre sí, o a través de un átomo de carbono o
nitrógeno; y b) estructuras peptídicas que contengan como mínimo dos
enlaces peptídicos.
Sensibilidad del Método desarrollado por Gornall y col. permite cuantificar soluciones que contengan
entre 1 y 10 mg de proteínas por mililitros.
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Materiales
- Solución de albúmina sérica humana de concentración desconocida.
- Solución de albúmina sérica bovina de concentración 5 mg/ml en agua destilada.
- Agua destilada.
- Reactivo de Biuret: Disolver 1,5 g de sulfato de cobre (CuSO4.5H2O) y 6 g de tartrato de sodio y
potasio tetrahidratado en 500ml de agua destilada. Agitando constantemente, añadir 300 ml de Na
(OH) al 10%. Diluir hasta 1 litro con agua destilada y guardar en frasco de plástico.
- Tubos de ensayo, gradillas, pipetas de 1, 2, 5 y 10 ml.
- IMPORTANTE!!! PAPEL MILIMETRADO.
Método
Colocar en un tubo, el tubo blanco, 1 ml de agua destilada. Preparar por dilución los tubos
testigos colocando distintos vol. de solución testigo de albúmina y agua destilada de acuerdo a lo
resuelto por cada grupo de trabajo. Finalmente colocar 1 ml de la solución de concentración desconocida
en el tubo problema. Agregar a cada uno de los tubos 4 ml de reactivo de Biuret, agitar y dejar en reposo
a temperatura ambiente durante 30 minutos.
Leer en el espectrofotómetro el tubo blanco descontando la absorbancia de los reactivos que
acompañan a la reacción y llevando la A = 0 en el espectrofotómetro (λ de lectura = 550 nm).
Posteriormente, leer los tubos testigos y el tubo problema y construir la correspondiente curva de
calibración.
En el siguiente paso se deberá calcular GRÁFICAMENTE la concentración de la solución
problema.
RESULTADOS
T1
T2
T3
DISCUSIÓN
Oportunamente se discutirán los resultados obtenidos entre los diferentes grupos de trabajo de cada
Comisión coordinados por el Jefe de T. P.
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BIBLIOGRAFIA
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TRABAJO PRACTICO Nº 3
CINETICA ENZIMATICA
OBJETIVOS
• Conocer el mecanismo por el cual transcurren las reacciones catalizadas por enzimas.
• Comprender como influyen el tiempo de incubación, la concentración de enzima, la concentración de
sustrato, temperatura, pH, y la presencia de inhibidores sobre la velocidad inicial y la concentración
de producto formado en reacciones catalizadas por enzimas Michaelianas. - Interpretar el significado
de las constantes cinéticas Km y Vm.
• Valorar la importancia del trabajo prolijo y ordenado para la obtención de resultados confiables.
INTRODUCCION
Las enzimas son catalizadores biológicos de naturaleza proteica. Una determinada enzima (E) se combina
con un determinado sustrato (S) formando un complejo enzima-sustrato (E-S) el cual se descompone para dar el
producto (P) y enzima libre (E):
E+S ES E+P
V= d[P] = d{S]
dt dt
v
[E] = cte
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[S]
E + S K1 ES K2 E + P
K-1 K-2
v = K2 . [S]
Donde K2 también recibe el nombre de Kcat. La concentración de la enzima será mucho menor que la de
sustrato porque no se consume. Las enzimas que siguen esta cinética se dice que siguen la cinética de Michaelis-
Menten. Al aumentar la concentración de enzima la gráfica es igual pero por arriba.
La mayoría de las reacciones biológicas transcurren lentamente si no son catalizadas; las enzimas hacen que el
equilibrio de esas reacciones sea alcanzado rápidamente. Varios factores como a) el tiempo de incubación; b)
concentración de enzima; c) concentración de sustrato; d) pH y e) temperatura del medio influyen en el transcurso
de la reacción.
[ P]
b) Concentración de la enzima:
Vo
1
(a)
(b)
Vo
Vmax
Vmax 1
2 Vmax
1
1 [ S]
[ S] KM
A partir de estos gráficos se puede determinar las constantes cinéticas que caracterizan a una enzima: Km
(constante de Michaelis) y Vm (velocidad máxima), para un sustrato y condiciones determinadas.
KM: el valor de KM corresponde a la concentración de sustrato necesaria para alcanzar una velocidad igual a la mitad
de la Vmax
Vmax: es la velocidad que se alcanza cuando la enzima está saturada con sustrato (a altas concentraciones de
sustrato).
e) Efecto del pH del medio de incubación: cambios moderados en del pH afectan el estado iónico de la enzima y
con frecuencia también del sustrato. En general , la actividad óptima se encuentra entre pH 5 y pH 9 como la
tripsina. ver Fig.5., sin embargo algunas enzimas como la pepsina Fig.6 tiene su óptimo a valores de pH bastante
alejados de dichos límites. A valores extremos de pH se produce desnaturalización de la enzima.
Actividad Actividad
6 8 10
2 4 6
pH pH
GUÍA DE ESTUDIO:
1. Catalizadores.
2. Concepto de ley de acción de masas.
3. Enzimas. Características. Sitio activo de una enzima: características. Cofactor. Coenzima. Holoenzima.
4. Clasificación de enzimas.
5. Ubicación de las enzimas en la celula.
6. Mecanismo de acción de las enzimas.
7. ¿Alteran las enzimas el equilibrio de la reacción?
8. ¿A que se llama sustrato y producto?.
9. ¿Cómo se mide la concentración de una enzima?.
10. ¿Qué es la actividad específica de una enzima y en qué unidades se expresa?.
11. Factores que influyen en una reación catalizada por enzimas.
12. Función de Michaelis Menten. Representación gráfica.
13. Velocidad inicial. Velocidad máxima. Unidades.
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14. ¿Porqué se debe trabajar a velocidad inicial?
15. Km. Unidades. ¿Cómo se determina?
16. Ecuación de Lineweaver-Burk. Representación gráfica.
17. Inhibición reversible e irreversible, concepto. Inhibidores competitivos y no competitivos, concepto. ¿Cómo se
diferencian? ¿cómo son las curvas de las directas e inversas de la velocidad en función de la concentración de
sustrato?.
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PROBLEMAS
tiempo
3. ¿Qué relación existe entre Km y la afinidad de una enzima por un determinado sustrato?
5 ¿Qué relación exíste entre Km y sustrato cuando la reacción catalizada por enzima alcanza el
80% de la Vm?
9 A partir de los siguientes datos de una reacción enzimática, determinar a) tipo de inhibición b)
KM del sustrato.
2 139 88
3 179 121
4 213 149
10 313 257
15 370 313
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TRABAJO PRACTICO Nº 4
CINETICA ENZIMATICA
PARTE PRÁCTICA
Objetivo
Determinar los parámetros cinéticos, KM y Vmax, de la fosfatasa ácida de hígado de rata.
Fundamento de la reacción
La enzima fosfatasa ácida de hígado cataliza la siguiente reacción
El sustrato p-nitrofenil-fosfato disódico es una sustancia artificial que tiene la propiedad de ser hidrolizado
por la fosfatasa ácida del hígado y de otros tejidos, por ello puede ser usado para estudiar dichas
enzimas. La reacción es medida siguiendo la cantidad de producto formado, el p-nitrofenöxido de sodio,
que en un medio alcalino desarrolla un color amarillo, el cual se puede cuantificar mediante la técnica de
la fotocolorimetría a 410 nm (Coeficiente de extinción molar: 17500) (ref. Methods Enzimology ed.
Colowick-Kaplan vol. XXXI).
Materiales
Sustrato: p-nitrofenil-fosfato, 25 mM. PM 371,12.
Buffer: acido acético- acetato de sodio 0,1 M, pH 5.
Enzima: homogeneizado de hígado a una concentración final de 1mg/ml.
Activador: Cl2Ca 11 mM.
Preparación de la enzima
Homogeneizar (en homogeneizador de vidrio con émbolo de teflón) 0,25 g de hígado en 15 ml de agua
destilada. Dejar en baño de hielo durante 10 min. En esas condiciones hipo-osmóticas, se rompen los
lisosomas que contienen la enzima, quedando soluble.
Llevar la suspensión a 30 ml con buffer acético-acetato de sodio 0,2 M y pH 5 y una concentración de 1
mg de proteína por ml.
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Método
Colocar en cada tubo todos los componentes menos la enzima. La reacción comienza con el
agregado de la enzima y la incubación a 37°C. Mezclar rápidamente y continuar la incubación durante 10
min. La reacción se detiene por el agregado de 5 ml de NaOH 0.1 M. El álcali, por un lado inactiva a la
enzima y por otro da el medio alcalino necesario para que el producto (p-nitrofenol) desarrolle color. Es
importante hacer en cada caso un tiempo de cero de incubación, este tubo contiene lo mismo que los
tubos problema pero con la enzima agregada después del NaOH. Este tubo se usa como blanco para
leer en el espectrofotómetro.
Incubar a 37°C durante 10 min. Luego agregar a cada tubo 5 ml de NaOH 0.1 M. RECORDAR: En el
tubo blanco la enzima se añade despues del alcali. Leer cada tubo en el espectrofotómetro a 410 nm y
calcular los µmoles de P formado.
Análisis de datos
a) Calcular las inversas de la concentración de sustrato indicadas en la tabla;
b) Calcular las inversas de µmoles de producto formado en cada tubo;
c) graficar 1/Vo en función de 1/[S].
d) Determinar los valores de Km y Vm.
RESULTADOS
Curva de Concentración de Sustrato
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Tubo No 1/V 1/[S]
GRÁFICO
DISCUSIÓN
Oportunamente se discutirán los resultados obtenidos entre los diferentes grupos de trabajo de cada
Comisión coordinados por el Jefe de T. P.
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BIBLIOGRAFÍA
. Lehninger A.L, Bioquímica. Ed. Omega, Barcelona 1984.
. Stryer L. Bioquímica, Ed. Reverté, España 1976.
. Harper H.A, Manual de química fisiológica. Ed. El manual moderno 1980
. Neilands J.B., Stumpf P.K., Principios de enzimología. Ed Aguilar. 1967.
. Morris J., Fisicoquímica para biólogos.
. Bezkorovainy, A, Rafelson M.E. Concise Biochemistry. Ed. Marcel Dekker, New York, 1996.
. Horton R.H, Moran L.A., Ochs R.S., Rawn J.D., Scrimgeour K.G. Pentice Hall, Hispanoamericana, SA.
Mexico, 1995.
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