Enzimas PDF
Enzimas PDF
Enzimas PDF
o UNIVERSIDAD POLITECNICA
~
o
z MADRID
o
a:
CJ
<(
t/'J
oa:
w
-z COMPLEMENTOS DE BIOQUIMICA
w INDUSTRIAS AGRICOLAS
CJ
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e
a:
o
-
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ENZIMAS
-z
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(J
w
1-
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...1
w
:::> PROF:
(J
t/'J PILAR CARBONERO ZALDUEGUI
w
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...1
"N'
577.15
CAR
ENZ
UrliVEASíDAO POUTECNICA OE MADfiiD
11111111111111111111111111111111111
ilC!8614!t44"'
34
COMPLEMENTOS DE BIOQUIMICA
INDUSTRIAS AGRICOLAS
ENZIMAS
PROF:
1 .,
e ~, .
,
.
i lh-.
\.. ___ --- - -
INTRODUCCION
Introducción.
Cinética de reacciones catalizadas por enzimas.
Reacciones de un solo sustrato.
Modelo de Michaelis-Menten.
Modelo de Briggs-Haldane.
Modelo general.
Linealizaciones.
Representación doble recíproca de Lineweaver- Burk.
Representación de Eadie-Hofstee.
Términos utilizados en cinética enzimática.
Inhibición enzimática.
Inhibición competitiva.
Inhibición no competitiva.
Inhibición incompetitiva.
Inhibición por exceso de sustrato.
Active GiÓn enzimática.
Activación ordenada acoplan te.
Activación con asociación al azar.
1
Efectos del pH.
Efectos de la temperatura.
4. P.NZIMAS ALOSTERICOS
Características generales.
Principales modelos de enzimas alostéricos.
Modelo de interacción progresiva o secuencial.
Modelo concertado o simétrico.
Enzimas de tipo K.
Enzimas de tipo V.
El caso de la aspartato transcarbamilasa de Escherichia coli.
Introducción.
Clasificación y nomenclatura de enzimas.
Especificidad enzimática.
Especificidad absoluta.
Especificidad de grupo absoluta.
Estereoespecificidad.
Especificidad re la ti va.
Especificidad para distinguir entre grupos quimicamente
idénticos.
Transcurso de las reacciones catalizadas por enzimas.
2
7. MECANISMOS DE REGULACION ENZIMATICA
Introducción.
Mecanismos de regulación de la concentración enzimática.
Regulación a nivel de transcripción.
Regulación a nivel de traducción.
Regulación a nivel de compleción del enzima funcional.
Regulación a nivel de degradación de la proteína enzimática.
Mecanismos de regulación de la actividad enzimática.
Compartimentación de enzimas y metabolitos.
Factores ambientales inespecíficos.
Propiedades catalíticas intrínsecas.
Interconversión de formas moleculares del enzima.
Efectores específicos.
Retroinhibición ( "feed-back ") de un paso ca talizado.
por más de un enzima.
Retroinhibición concertada.
Retro inhibición coopera ti va.
Retroinhibición acumula ti va.
Introducción.
Pardeamiento enzimático catalizado por fenolasa.
Sustratos de la fenolasa.
Control del pardeamiento enzimático producido por fenolasa.
Aplicación de calor.
i\nhidrido sulfuro y sulfitos.
Exclusión de oxígeno.
Aplicación de ácidos.
Reacción de Maillard.
Caramelización.
Caramelización a pH-ácido.
Caramelización a pH-alcalino.
Oxidación del ácido ascórbico.
Inhibición del pardeamiento no enzimático.
3
9. LOS ENZIMAS EN LA INDUSTRIA DEL.A ALIMENTACION
Introducción.
Apliaaciones de los enzin1as en la industria alimentaria.
Carbohidrasas.
Proteasas.
Lipasas.
Oxidoredu eta sas.
Inactivación de enzimas en la industria alimentaria.
lnactivación térrnica.
Inactivación por radiación
Inactivación por sustancias quÍnlicas.
Disponibilidad comercial de enzimas.
Enzirnas ligados.
4
CINETICA DE LAS REACCIONES ENZIIV1ATICAS(I)
INTRODUCCION
5
aislada de extractos de g_~nn~v:_a!i~~.!1-~)1:fO_!.!_l1.is. Summer demostró
que los cristales se hallaban constituidos por proteína y llegó a la
conclusión, contraria a la opinión que prevalecía por aquel entonces,
1
de que los enzimas son proteínas. Sus puntos de vista no fueron aceE
tados inmediatamente sin embargo, y hasta el período comprendido
entre 1930 y 1936, durante el cual Northrop aisló la pepsina cristaliza
da, la tripsina y la quimotripsina, no quedó bien establecida la natura
leza proteica de los enzimas.
6
respecto al sustrato que transforman.
7
(concentración de A)
- da
V = =Ka (1)
dt
K
A + B p + Q ••••
V = - da :::
- db
= dp = K. a. b (2)
dt dt dt
.,
Esta reacc1on es globalmente de segundo orden puesto que su
velocidad es proporcional al producto de 2 términos de concentración
(_~, b) y es de primer orden en a y de primer orden en ~· La constante
K en este caso tiene las dimensiones de concentración-1 tiempo-1.
K
q A+ r B + ... \ productos
- da
V = n=q+r+ .•.
dt
8
tercero ó de orden mixto ó incluso fraccionario globalmente, dependie~
do de cuales sean las etapas limitantes de la velocidad.
-da ,.
ln v = ln ( - - ) = ln K + q ln a
dt
-(~;),.,,
9
Si en una reacción de segundo orden la concentración de uno
de los reactivos es muy superior a la del otro, su concentración permane
cerá virtualmente constante a lo largo de todo el proceso. Esto signifi-
ca que la reacción cinéticamente aparece como de primer orden (seudo-
primer orden). En cinética enzimática frecuentemente se determinan
solo velocidades iniciales de modo que esencialmente la concentración
del sustrato permanece constante (s = s 0 ).
La mayoría de las reacciones químicas homogéneas pueden
ser aceleradas en presencia de un catalizador, que permanece inaltera
do en concentración durante el progreso de la reacción. La ley de
velocidad para una reacción que implique un reactivo A y un cataliza-
dor C a concentraciones instantáneas a y c respectivamente sería:
A + C p
v=Kac = K'a
Ki K3
A + C --->x 'P+C
_ da
= K1 a c - K
2
x
dt
10
dx
dt
de
<K 2 + K 3 lx-K ac
1
d1
dp
= K~x
dt
e:
•O
·~
~
8
e
8
" I
2 4 1 10 12 16 11 I
11
inicial durante el cual no es válida la aproximación del estado estacio-
nario.
dx
-
dt
::::t o - K 1 a c - (K 2 +K 3 )x K
1
a c ·- (K2 + K3) X
c = K2 + K3
X
Kl a
X
X = Co - •
a
K 1 . a. c 0
X =
K 3 K 1 a c0
V =- da = dp = = ( 3)
dt dt K 1 a+K 2+K 3
Va
V = (4)
Ka+ a
12
catalizador que se recicla es de orden mixto (cero y primer orden).
Hay que distinguir dos casos límites
V= V
V
v= . a=K'.a
Ka
y ----------------------------
"
2
13
Análogarnente, la variación de la velocidad con la concentra-
ción de sustrato para un gran número de !eacciones catalizadas por
en~i!!las queda descrita por la figura 3 y por la ecuación 4. Esta es la
ecuación denominada de Michaelis-Menten. Se .suelen emplear S y su
concentración ~. para el sustrato y E y e para el enzima. Los dos pará
metros cinéticos V (velocidad máxima) y Kn1 (constante de Michaelis)
son ambos necesarios y suficientes para definir explícitamente la ley
de velocidad para estas reacciones siempre que:
= ( 5)
14
REACCIONES DE UN SOLO SUSTRATO
V . so
=
15
_Modelo ~e_ :S._i:_i_g_g~ -""~~~_!.~ane, Estos autores propusieron 11n
modelo de mayor amplitud que el de Michaelis-Menten. Supusieron un
tiempo inicial lo suficientemente corto como para que no se formase
apenas X a p artir de E y de P, por ser la concentración de este Último
1
E+ S
e 1 1
s = Km • s
:::::
•
X
V ::: dp =
dt
V X
- = ·-- = 1
=
1
=
V. s
V
V e+ X e +1 Km·_!+ 1 Km+s
X s
16
el complejo enzima-sustrato se pueda formar también a partir del
producto P y del enzin1a ~-
S + E
~ = K 3 x - K 4 . p. e
dt
dx
=o X = . e
dt
e = eo - . e
, siendo
X =
17
con lo que la velocidad
V =
e 0 (K 1K3 s - K2 K4 p)
V =
(K +K 3 )+K 1 s +K 4 p
2
K 1 K 3 e0 s
= =
K 2+K 3+K 1 s
+S
K2 K4 eo p
= =
K 2 + K 3 +K 4 p
Siendo K'
m
=
18
Por definición P eq / Seq = Keq , constante de equilibrio
--= = Keq
V
= (N 1 s - N 2 p) ( 6)
En donde N1 =K 1 K3 e 0
N2 = K2 K4 eo
Co = K2 + K3
C1 = Kl
C2 = K4
y por tanto:
Vl =K 3 e0 = N l / C l
V2 =K2 e0 :::
N2/C2
Km = Co/C1
K' = Co/C2
m
19
N2 Nl N2 N2 N2
--·-
(N 1 s - N 2 p) C1C2
-
C1
. c2. s -- . -C2 • p
C1
v= = --- -·
(C 0 +C 1 s+C 2 p) N2
----- Co
- . N2 - . -- . s+
- +t1
N2 <f:-2 . -N2 . p
C1C2 c1 C2 t1 C2 <t-2 C1
Vl V s - V V l p /K eq
v= - - - 2- - ·----2- - - - - - - - -
Km V 2 + V 2 s + V l p /Keq
Si p =o ; V = V =
Si s =o V = =
V2 p
Ecuación que es de la forma V = , ya que
K'+P
rn
= K'm
ó lo que es lo mismo
20
V'
'"rn
Keq = , que es la relación de Haldane
Km
ción global.
TABLA 1
Restricciones impuestas a V /V por la relación de Haldane
1 2
Peq/ Seq = Keq = V 1 K~/V 2Km
Keq 1
1 10 2 10 4 106 108
10- 2 1 10 2 10 4 10 6
10- 4 10-2 1 1 o2 10 4
10- 6 10- 4 10- 2 1 10 2
10- 8 10- 6 10- 4 10- 2 · 1
21
Las reacciones enzimáticas disminuyen su velocidad, confo!
me se aproximan al equilibrio, no solamente por virtud de la reacción ter
modinámicamente inversa, sino también porque conforme E aumenta, una
mayor proporción de enzima se inmoviliza en forma de complejo EP.
Este efecto cinético de inhibición por producto es una propiedad intrínse
ca de cualquier mecanismo de catálisis enzimática. Como se verá más
adelante, este tipo de inhibición es una inhibición competitiva, en que
no se altera la velocidad máxima, pero si se afecta la Km.
V s
V =
Km+s
1
=
Km 1 + 1
V V s V
22
1 1 1
Para =o =
s V V
1 1 1
Para =o =
V s Km
V s
V =
s
. Km+ v = V
V V
= v+-
s Km
V V
Para V =o - =
s Km
V
Para - =o V =V
s
23
-1 ~.
s
" i
V
K~
3
y
Pendient~=-J_
2 K-.
y V
1
1 2K
1 "'
1
1
1
1
.,
1
1
-- -1 2
-K,,. -f1 y y V ..
K~ K"' i 2
(a) (t-)
Rendimiento
= Activf~ad total (etapa n)
Actividad total (referencia)
24
Constante catalítica =Moles producto/min/mol de enzima
puro
25
CINETICA DE LAS RE/\CC!< >\E~ ENZIMATICAS(II)
,/) - D - galactosll - O - R + H
2
o -~galactosa -t- R - OH
- Las quinasas
- Las deshidrogenasas
26
REACCIONES ENZIMATICAS DE DOS SUSTRATOS
~EA~
E~ ~EAB
~EB~
Este sistema, con fijación al azar de sustratos, conduce, tra
tado por el método del estado estacionario, a un sistema de 8 ecuacio-
nes lineales con 7 incógnitas, cuya solución introduce formas cuadráticas
de las concentraciones,que es totalmente inutilizable.
K - .'J- << K6
K_;) << K,..,
1
Kl
E + A ---.)> EA
K_l
EA + B (EAB, EPQ) - - - EQ + p
EQ E+Q
28
Siguiendo la representación esquemática de Cleland:
A B P Q
EA E'+ p
K4
E' + B <ir---- E'B - - - - E+Q
K_3 K_4
A P B Q
,
Las transaminasas funcionan segun este mecanismo de ping-
29
pong. Por ejemplo la transarninasa glutámica-oxalacética, con piridoxal
fosfato con10 coenzima.
A = L- asparta to P = oxalaceta to
B = «. - cetoglu tara to Q = L-glutamato
E = forma piridoxal del enzima E' = forma piridoxamina del enzima
E+A EA
IZ_ 1
EA+ G EQ + p
E+ Q
A B P Q
30
nvf r"'r t"NISMO CON FI.T A CION AL AZAR EN CONDICIONES OE Qll ASI
EQUILIBRIO
Ecuaciones de equilibrio:
Kª e . a
E + A E.L\
s
=
el
Kb e .b
E + B ER
s
=
e2
a
e2 • a Km
EB+ A EAB Kª = e2 = e3 a
m e3
Kb
Kb el. b . m
EA+ B EAB = el = e3--
m es ' b
31
Multiplicando Kª por Kb
s m
el Kª Kb
Kª Kº e . a h s m
= ·-- e = e3·
s m el e3 a b
Kb a
Multiplicando por K
s m
Kb Kª
Kb e- -
. -h e2 a s n1
Kª ::. --- e = e3
s m e2 e3 a b
. ., ,
=
~
la velocidad máxima
Vo e3 e3 1
= = =
V1 eo e
e+ e 1 + e 2 + e 3 - + ei + e2+1
e3 e3 e3
b a
e Km Ks
=
e3 b a
Kb
el m
=
e3 b
32
=
y sustituyendo:
vl
o=
V
Kb Kª Kb Kª
m s m m
b a
+
b
+ a
.... 1
b
Si De multiplica numerador y denominador por a
Kb + b
m
• a . a
V : =
o
a b
a+--------
a b
V. s
Vo =
s +Km
de reducir a V . a
V
o
= a
a+K
m
33
K~ es pues la concentración de ~~, que a saturación de -ª1 da una veloci
dad inicial igual a la mitad de la velocidad máxima. Esto justifica el
empleo del sin1bolo Km para las constantes de disociación del comple-
jo ternario EA B.
(KI~
Kª Kb Kª
1 1 1 s m m
Para - = o
a
--
VO
=
Vl
•
a
+ b
+· a
+ 1
1
VO
=
1
V1 (i + ~¡~)
Al disminuir la concentración de b, aumenta la ordenada en
el origen.
1
+ + 1 = V1 •
a
b Kb Kb
Kª K Kª Kb
m 1 m 8 m Kª m m .
+ a
+ 1
-
a
.bl a b2
• s =
b2
- bl '
Kb - Kb Kb
1
= m· bl m b2 m ( b 1 - b2} - 1
a
= b a
=
Kb Kª b Kb Kªb K . K (b1-b 2 ) Kª
m s 2 m s 1 m s s
34
1
y de ordenada = 1 -
Kª Kb
1 1 m m
V
::
1 - --+ = 1 -
o V1 Kª b
s
a
K
m
1
1 -b1
a
1
--
VO v1
Kb Kª
1~----
m s
Kª b
m
. a! + lv
1
(~~ +1)
b
1
--
VO
Kb
m
V1
t: +~.
a !+l
b v
1
~+ K~~
a
35
Int Pend.
1 1
b b
Int Pendiente
e . a e2 . a a
= :: Kª = K
e.3 s m
el
.,
y la expres1on de la velocidad se simplifica
Kª Kb Kª Kb
a + Kb
vl a+ K b
m m m n1 rn m
= 1+ + + =
VO a b ab a b
a b
o= V1
V •
36
De nuevo las constantes se obtienen gráficamente llevando
~ en función de ~ para distintos valores
Se obtienen rec de~ fijos.
a
tas que se cortarán en un punto del eje de abscisas ( -1 /K , O).
m
1 Int.
11
1 + "'- rn 1i -
,,, ,,, ""
- - -·----
v1 V1
1- --1
a 1 b
Kb
m
K
E + S - - ES + S - - ESS - - E + SS
e . s
v0 = K e 2 vl = K e o
Vo = e2 = 1
=
1
-
V¡ e e1
(~~2 + ~+1
eo - + + 1 K
e2 e2
s
37
La representación gráfica de _v:_ en función de s será de tipo
! (~Y
2
una recta. Para valores grandes de s , es pequeno, y se
Ks
puede despreciar como sumando frente a
a
la ecuación se aproxi
-
Ks
ma a la ecuación de Michaelis. Para s pequeno , - se puede des-
s
(~:)
2
preciar como sumando frente a y la representación de
~ = f (!) 2
será una parábola.
1
V
o
... K
.··· s
.. ·,.. .. ····~ V1
..•......1._ ... ········ .. .
1
1
s s
K2 .;... K3
E+ A EA+ B - - - EAB -r---- E+ p
La velocidad V:::
dp =
dt
38
Si se denominan:
e =
[E J [EA]
e2 =
[EAB]
el =
[Et] [Et] [Et J
a= [A] b = [B] p = [P]
la ecuación de conservación:
dt
= 1
39
1 1 1
o -(K_1+K 2 h) K -2
o K2b -(K_2+K3)
e = -----
1 1 1
K 1a -(K_ 1+ K 2 b) K -2
K -3P K 2b -(K_2+K3)
K_ 1 K_2+ K_ 1 K 3+ a (Kl K_2+ K 1 K3)+K2K 3 b+K1K2ab+ (K_2K ... 3+K_ 1K_3) p+K 2 K_ 3bp
1 1 1
Kla -(K_ 1+ K 2 b) o
K_3p K b
2
o
e2=
1 1 1
Kla -(K_ 1+ K 2 b) K -2
K _3P K b -(K_2+K3)
2
K 1 K 2 ab1-K_1K_3p+K 2 K_3 bp
e2 = - ------------ ------
K _ 1 K_2+ K_ 1K3+ a (K 1 K_ 2+ K. K 3 )+K 2 K 3 b+K 1 K 2 ab +(K_ 2 K_ 3+ K_ 1K_3) p+ K 2 K_ 3bp
1
v = [Et J (K 3 e 2 - K _ 3 e p )
40
V =[Et} K3 (K1 Kzab+ K_ 1K-3p+ KzK_ 3bp) - K_ 3p (K_ 1K-2+ K3K-1 + K2K3b) =
K_ ¡K-2+ K_ ¡K3+ (K 1 K_2+K1K3)a +K K 3 b+K 1 K 2 ab+(K_ 2K- 3+K_ 1K_ 3)p+K 2K_ 3bp
2
K 1K 2K 3 ab - K_1K-2K_3p
v =[Et]---·-------------
K_1K-2+K_1 K 3+(K1K_2-tK1 K 3 )a+K2K3b+ K 1K2ab+(K_2K_3+K_ 1K_3)p+K 2K_3bp
K 1K 2K 3ab
Vo = [Et] -----------------
K_1K_2+K_1 K3+(K 1K_2+ K 1K 3) a+K 2K 3b+K 1K 2ab
K3
vo=[Et]
.- + ~
K_1 K_2+ K3 1 K_2 + K3 1 1
• .-+ • - +1
Kl K2 ab K2 b Kl a
.
I =
se obtiene
41
V
Vo =
Kª Kb Kª Kb
1+~
m s m
a
+ +
b ab
Kª
m
1 I
ra / KªKb
K I/ s m
s I /,
/
/
:JI'
/
.,
' .,._.
1 1 f ( l)
= f (l ) =
V a V b
Int. Int.
1
Kª
m /'
/
-1 Kª
1
b a
1 1 m 1
In t. = Int. -
a
--+-
b vl v1
42
MECANISMO DE THEORELL-CHANCE
V
V =
Kª Kb Kª Kb
m m s m
1+ + +
a b ab
V=K
3 .[Et]
K3 K3 K_l
Kª = ,. Kb = Kª =
m Kl m K2 s Kl
E+A~- EA
K_l
EA+ B - - - EQ + p
E+ Q
MECANISMO DE PING-PONG
AX+ E AEX AE + X
K_2 (E')
43
K3
AE + Y .!\EY E + AY
(E') K_3 r-: -4
V
V =
Kª Kb
m m
1+--- +
a b
Siendo V = ,.
= y la representación de Lineweaver-Burk da
a b
1 1 Km 1 Km
-+ (1 + - )
V a V V b
para a fijo:
b a
1 1 Km 1 Km
= ---- + (1+ - )
V b V V a
44
1
1
VO VO \ª
}b
a
Kb
.____ 1+
-----
m
---o
1+ Km
a
V1 V1
1 1
-
a b
45
l l
1 1
a b
1 1
1 1
-
a h
1
V
o
1 1
a b
Es posible analizar la formación de complejos por técnicas
de diálisis hasta el equilibrio, etc, y estudiar las constantes de disocia
ción (KD). Se puede estudiar el efecto de protección ejercido por el
sustrato ó los _efe~tos inh_~Eido!'es por el producto, etc. También se
empleal'l técnicas de cinética rápida que permiten acceder a las constan
tes de velocidad de las reacciones parciales, etc.
47
MODIFICACION DE LA ACTIVIDAD ENZIMATICA
48
reacción, se alcanzará un equilibrio.
E + S....----- ES E+ p
49
E + I El
i . e y =
=
y e
La velocidad máxima: V = K 3 • e0
La ecuación de conservación: e0 = e+ x + y ,.
VO X 1 1 1
= - = e y
= :::
V eº Km 1 Km
-
X
+ 1+ X
--+ l + -
s K¡ --
s
V
ó lo que es lo mismo:
siendo
~o
concentraciones de inhibidor, se cortan en un mismo punto del eje de or
denadas ( 1 /V y y respectivamente) pero la pendiente de las mismas
varía con la concentración de I.
1 1 Km
= s V
+ _!_
V
,
La pendiente de esta recta seria:
Km Km 1
Pendiente = + •
V K1 V
1
1
V Kr s
+ V
1
Por tanto varía de forma lineal en función de i . Si la
Vo
concentración de s es muy grande el primer término tiende a anularse
y la velocidad se hace independiente de I e igual a la máxima V (recta
paralela al eje de abscisas).
1
El punto de intersección de la familia de rectas = f ( i)
, VO
sera~
i
Km
VK 1 s1
+
1
V (i+ ~~) = 1
Km
VK 1 s2
+-
1
V (i +~:)
51
(1+ JI)
(H ~j) (~1
que para s =/= s 2 y cualesquiera
1
i - - K1
1
1 + -- = o
I<1 1
1
=
Vº V
COOH..........._ /H
e = e
H/ "cooH
, .
Ac. succ1n1co Ac. fumárico
52
El estudio de la inhibición competitiva por una serie de análo
gos del sustrato permite obtener datos sobre dimensiones, naturaleza,
etc., del centro activo. A sí, en la acetilcolinesterasa de las conexiones
colinérgicas del sistema nervioso se han observado dos tipos de inhibido
,
res competitivos: a) los compuestos de amonio cuaternario y b) los éste-
res.
CH 3
1
CH -COOH+HOCH -CH - N°': CH
3 2 2 1 3
CH
3
Nombre Fórmula
M etilamonio
Grupo a
Prostigmina
Es erina
Grupo b
53
agrupación amonio cuaternario (sede aniónica). Para que el enzima actúe
es preciso que el sustrato se fije convenientemente a estas dos sedes.
Considerando análogos de acetilcolina cuyas agrupaciones éster y amo-
nio cuaternario están más o menos alejadas se ha podido demostrar que
·'
la separac1on entre sedes es aproximadamente de 7 A.o
a b
Pendiente - Khi = - Km (1 _I
K¡ )
1
V
1
s
A. Inhibición competitiva
Pendiente - Km
1 Vo
s s
1 B. Inhibición no competí ti va
1
s
C. Inhibición incompeti ti va
54
Inhibición no competitiva. En este caso el inhibidor se com-
bina con el enzima independienten1ente del sustrato, sin modificar la
afinidad del enzima por el sustrato, pero dando un complejo ternario
inactivo. El inhibidor se fija al enzima en un sitio distinto del centro
activo
Kl K3
E+ S ES E+P
K2
[E]. [I] e. 1 y 1
E +I~EI K1 = = -- e
::: -
K¡
[EI] y
[ES] ·[I] X • i z
ES+ I ~ESI = z X
=
[ESI]
La velocidad inicial
La velocidad máxima V= K
3
e 1
X
= s
=
Yo X 1 1
= - = =
V eo e y z Km i Km
- + 1+ + -+1+- + _l_
X X X s K¡ s Ks¡
Km
1+ - 1 +
Ksr s
55
p Kn1 Km 1
Pendiente = r +
K l \' V
-r-.r
T,.
., ""
-
....:".....
,,,~- -~---------
s-. 00
I I
A. Inhihición competitiva
p Int 1
V
o
/
/
/ /
-KI /./""
r /~-- I
B. Inhibición no competitiva
Int 1 1
Int = I -- + -
K¡V V
I I
C. Inhihición incompetitiva
56
i
Si se divide numerador y denominador por 1+--
KsI
tendren1os
V
1
1 +
Ks¡
VO =
i
Km KI
1 +
s 1
1+
Ks1
V'
que es de la forma
K'm
1+
s
V
K' = K V'= • En este
m m
1 1
-+-
s V
1
la familia de rectas = f ( .! ) resultante para distintos valores de i
V S
se cortarán en un punto del eje de abscisas ( -K~, O). Si K1 f K5¡ ,
las rectas !V = f (!
S
) no se cortarían en el eje de abscisas sino en un
punto que estaría por encima ó por debajo del mismo según los valores
relativos de K 1 y K 81 • El inhibidor modifica pendientes e intersecciones
57
_cor~--~l eje de ordenadas.
K3
E + S ;:::=::==::= ES ----J.. E + P
K¡
ES+ I ~--ESI
[ES]·[I] X • i y = i
Donde KI = = y X K¡
[ESI]
Vo 1
La ecuación de velocidad: :::
=
V e + X + ]_
X X X
e
X
= S
58
v/{i + {i¡
V = ---
----------
Km i
+ 1+ - 1+ Km ( 1.
s K¡
s 1+-1-
K¡
(Figura 2C).
1 1 1
V
= VK i+
V
1
59
La posibilidad de inhihición por el propio sustrato se debe a
que la sede de fijación de éste en la superficie del enzima puede ser
relativan1ente grande. teniendo varias subsedes de fijación capaces de
interaccionar con distintas partes del sustrato.
K1
E+ s---- E S - - - - P+E
K
2
F:S + S SES
sede anióníca sede es 1 erasi.ca
__p~ 1
íO\__
CH 3 ~ N ·- Cl-l ~ · CH 1 - O -- C 11
1
CH ~
~---~--
=N --
CH3 cHJ e =·· o b
1 1
~H, O
1
CH 2
CH 2
CH 3 - - ~ ·_ - CH 3
CH, CH 3
hO
:::
K3 [ES] :::
X
K3 [Et] e+x+y
e Km
Kl. e . s = (K2+ K3) X -
X
:::
s
[Es] [s] s y s
K¡ = -- = X •
= -
y X K¡
[sEs]
VO 1 1 s
V
= e y
= Km s
=
-- +1+ ..+ 1 + - Km+ s s2
X X s +-
K¡ KI
!+ _!_-t- s
s V VK¡
1
Para s grande, se puede despreciar como sumando y se
s
obtiene una recta cuya prolongación corta al eje de abscisas en (- K¡. O)
1
y cuya pendiente es
V.K 1
1
= _!_
V
+ 1
VK¡
. s
1
Para~ pequen.o, el término en domina y se obtiene una
s
. , de 1 -- f (-1 ) _! _ J._-'- Km 1
recta en 1a representac1on V ' V s cuya
V S
61
extrapolación sobre el eje de ahscisas perniite calcular Km .
1
\'
o
,,, /
/
/
/ /
~ / /
/ /
s 1 s
1 s 1
--
Km Kr
ACTIVACION ENZIMATICA
62
Se considerarán a continuación los activadores capaces de
formar asociaciones reversibles y nos restringiremos a un par de
casos simples en condiciones de "qua si- equilibrio".
E + A EA
EA + S -c-~EAS ---"'E + P + A
=
[EA] . [s] ~l = Km
Km s
[EAS] [EAS]
La ecuación de velocidad
[EAS] 1 1
= = =
1Et] Km Ka Km
1+ +---
s ª· s
V
Km
1+
s
Ka
A saturación de activador, es despreciable y tenemos
a
V
la ecuación de Michaelis V :::
Km
1+-
s
63
Linealizando según Lineweaver- Burk
1 1 1
(1 + .Ka.ª ) . s
La represen tac1on de
., 1 = f
- (-~) dará una familia de rectas
V a
1
VO
.:::
1
V
(1 + K2~) +
Km Ka
--------
V. s
1
a
1 1
Si s--+ oo; = V
independiente de a, es una recta paral~
la al eje de abscisas.
1 1
~a
'
,, / __ / s~ oo
""':::-- --i-----------
1
1
1
'
1 1 1
s a
Kn1
1
FIGURA 5. Activación ordenada acoplante. a) representación de
V
.,
b) representac1on 1 -- f ( _1 )
V a
64
K
E+ p
/ES'
E
K'
ESA - - - E + P + A
~EA~
Además, tanto ES como ESA son complejos activos, si bien
K' ) K. Si la activación fuera total, K = O. En el caso más simple la
~S()ciación es independiente, o sea, la fijación del activador no modifi-
Se denominan:
[ES] = el Ks ::
e . s . e = e1
Ks
el ' s
e . a a Ks a
[EA] = e2 Ka = e2 = e - = el - ·-
s Ka
e2 Ka
a
[EAS] = e3 Ka ei. a = el -
= e3
Ka
e3
V el el 1 1
-
V
= = e+ e 1 + e 2 1' e3
:: =
eo e e2 e3 Ks Ks a a
-+l+-+- -+1+- • K +K
el el e1 s s a a
V
V =
v' e3 e3 1 1
= = e+ e + = =
V' eº 1 e2 + e3 e ei e2 KsKa Ka Ks
-+-+- + 1 - - · - + - + - ... 1
e3 e3 e3 s a a s
V'
v' =
·----
s
.
y la velocidad total: V
o = \' + V
1
sKa V s a V'
+
Ka a
VO =
s
• - . ------
a
v+
s
• ----
• V'
K8 + s a a+ Ka K 8
;- s Ka+ a
Ka
v. a
+V'
V
o =
s a (V. -Ka8:_ + v•) = ---
Ks Ka Ks Ka
K 8+ s a + Ka 1+ - · + +
s a sa
a
V=O V'
s
y en condiciones saturantes de sustrato -- 1
a
V = V'
66
EFECTOS DEL pH
67
Considerando el esquema siguiente de una reacción enzimáti-
ca con un solo sustrato:
E ES
s +
Jf
EH
Kel K l
_ _ _ ___.:i., H
EHS
Kes1
K3
EH+ P
Jr Ke2
K2
j[ Kes2
EH2 EH 2 S
I
Se supone que solo es capaz de reaccionar un estado de ioni-
zación del sustrato S .Y uno del enzima EH y que el enzima se ioniza
como un ácido dibásico en el que son totalmente inactivas en la fijación
del sustrato, tanto la forn1a comple1amente desprotonada E como la
bíprotonada EH .
2
Si las reacciones de ionización son rápidas comparadas con
la reacción enzimática propiamente dicha, los distintos estados de ioni
zación estarán en equilibrio y la ecuación del estado estacionario sería:
V:::
V'- -s
-
S4-K'
H+ Ke2
1 + + H +-
V Ke1
V' = K' = Km
H-t- Kes2 H+ Kes2
1 +-- -- + --H -t 1+--- -.~
H -t-
Kes1 Kes1
V' V 1
= K .
K' m 1+
68
I ,a función V' = f ( pH) sólo depende de las constantes de
ionización del complejo enzima sustrato Kesi y Ke 82 . La función
. lf..
lo g V' = lo g V - lo g 1+
( Kes1
¡¡+
En la zona de pH ácido, domina sobre los otros su-
Kes1
mandos
En la zona neutra
69
Velocidad
,/
I'
(•)
'
~~~----,_.._~~~-
pH
(b) 1
1
t'
1
log V' 1
1
1
,...
'
1
1
1
1
1 1
1 1 1 1
_j_ _ _l _ _
(C') 1 1
~----t--- --¡---~,--
1 t
1 1 ' 1 1
1 1 1
1 '1
V' 1 1 1
- ,,
1
log K' f 1
j
' -~ .......
1-...
.......
.....
i " 1
1
1 1
1 1
1 1
1 1
70
Razonamientos análogos se aplican a las representaciones grá
V'
ficas delog - - = f ( pH) y log K::O = f (pH) y a partir de ellas a la
K'
m
determinación de las constantes Ke 1 y Ke 2 (Figura 6)
EFECTOS DE LA TEMPERATURA
dT d T- 1
71
La desnaturalización proteica, suele producirse con bastante
brusquedad dentro de un intervalo de temperaturas relativamente estre
cho. Puede implicar cambios puramente conformacionales en una sola
cadena polipeptídica, modificaciones en el grado y tipo de asociación de
tales subunidades elementales en agregados más complejos, formación
o disrupción de puentes disulfuro [(n(- SH)~n/2(- S - S - )] y combina
ciones de todos ellos.
Kd
[nativa J---- [desnaturalizada]
72
ENZIMAS ALOSTERICOS
CARACTERISTICAS GENERALES
73
COOH-CH-CH-CH 3 --. COOH-C-CH 2 -CH -+ --+-+ COOH-CH .. CH-CH -CH
1 1 .. 11 3 1 t 2 3
NH 2 OH ~ O NH CH
2 3
1
1
treonina 1 Acido oxobutírico isoleucina
1
1
~-------------------------J
V 1
V /
/
/
/
/
/
/
/
/
s 1
a) b) s
FIGURA l. Representaciones gráficas en un enzima alostérico: a) Grá-
fico de velocidades iniciales frente a concentraciones del sustrato. b)
Representación de Lineweaver-Burk. ---- enzima michaeliano;
enzima alostérico.
74
encuentra un n = 1, 37, lo que implica la existencia de al menos dos
receptores con un efecto cooperativo (Figura 2).
V
log--
V-v
log s
V
FIGURA 2. Represenu:1c1u11 u~ nu.L log
V - V
= f (log s). n = 1 indica
un solo receptor por molécula; n = 1, 37 indica al menos dos.
75
\
\
\
''' .......
[1]
FIGURA 3. Representación gráfica de velocidades iniciales frente a
concentraciones de inhibidor ,para s e constante.
enzima michaeliano; enzima alostérico.
76
enzima sobre el sustrato. Al rnismo tiempo el enzima reemprende una
cinética hiperbólica (michaeliana) cesando el efecto homotrópico coope ...
rativo del sustrato. l~n general.cuando desaparecen los efectos hetero-
trópicos desaparecen también los efectos homotrópicos.
77
resultando un cambio en las constantes de afinidad para las sedes no
ocupadas. Por ejemplo, si la constante de afinidad de la primera molé
cula de sustrato por el enzima es K . la constante para la segunda
8
molécula de sustrato que se una a la nüsma molécula de enzima puede
alterarse a iKB. La segunda molécula de sustrato al unirse cambia la
constante por otro factor j (ij KB) y a_sí sucesivamente.
~\ 4 A3 BS A 2 B2 S2 A B 3 s3 B4S4
+s +s _::...
+s +S
00
Kb iKb ijKb 88
El modelo concertado o simétrico de Monod, Wyman y
Changeux se basa en los siguientes postulados:
78
5) Las afinidades para uno o por varios de los ligandos son
diferentes según que la proteína se halle en uno u otro de los estados.
En casos extremos, uno solo de los estados conformacionales tendrá
afinidad por el ligando.
79
L
Ro + S Ro--- To To + S
R
1
+ S---
R +S~- R T
n-1 n n
Ro+ R1 + .... + R 11
R = =
(Ro+ R l + .... + Rn) + (To+ T l + .... + T n)
y =
L ( 1 + c 1r!)n + (1 +o( )n
siendo o( = e =
80
cociente de las constantes de disociación microscópicas)es pequeño
(KT >> KR). En el caso de que c---+ O, la función de saturación Y se
transforma en:
y =
(1 + °' )n-1
L + ( 1 + «. )n
y ,
•P 1,0 e= 0,00
e -O
- ,\0
\c=0,04
o,s
e= 0,00 L=ICOO
nc4 n=4
ºo 1 2 10 (1 o 2 s 10 15 20 <x
81
de saturación de sustrato. A concentraciones elevadas de activador ,el
equilibrio entre R y ~ estará co1npletamente desplazado a favor de R y
para la variación de la velocidad en función de la concentración de sus
trato ,deberá obtenerse una cinética de tipo hiperbólico, como de hecho
se obtiene.
82
que todos los fenómenos de activación e inhibición enzimáticas se puedan
explicar con el citado modelo. Por ejemplo, las respuestas homotrópi-
cas anticooperativas no pueden ser explicadas por él.
83
EL CASO DE LA ASP.~HTl\TO TRANSC'i\RBAMILASA DE ESCHERICHIA
COLI
o o- o
11 1 + (1
NH -C-0-P=O + CC)o·--cH 2 -CH-NH 3 ---+·~ NH
2 ~C-NH-CH-CH
2 -COO""
2 1
o c!:oo- NH2 c':oo- l
o
"
o
11
o
il
0l~ l
-O-P-0-P-O-P-O- CH2x
• • 1 O~ ... - - - - -
(
-o - o - o
H'r-(1'-i
OH OH
84
La representación gráfica del comportamiento catalítico de
la ATC-asa aparece en la Figura 4, donde puede observarse la carac
terística curva sigmoidal de los sistemas alostéricos, con una activa ..
ción "autocatalítica" por el sustrato.
K
E + S _ _s___..
[E] [s]
[s~
Km [sE*]
=
s [sE*s]
La ecuación de la velocidad:
Yo 1 1
- - = =
V [E] + [SE*] [SE*S]
[SE*SJ [sE*s] + [SE*S]
85
En presencia de CTP, la forma sigmoidal del gráfico v 0 = f (s)
es aún más pronunciada, pero a concentraciones altas de sustrato se
alcanza la misma velocidad máxima en presencia que en ausencia del
CTP. El tipo de "inhibición competitiva" por el CTP, se puede descri
bir por el siguiente mecanismo:
K1
E + I IE' (inactivo)
Ks
E+ S SE* (activo)
Kl K3
SE*+ S SE*S SE*+ P
K2
que implica dos tipos de formas alostéricas del mismo enzin1a, designa
dos E' y E*.
1 1
= = =
[E] [rE 1
] [sE*] [sE*s]
---+ + + ----
[sE*s] [?E*s] [?E*s] (§E*s]
V
VO =
K K K
1+~ + _!_TI--ª
[s] [s]2
86
La cinética de inhibición por el CTP, es de tipo sigmoidal con
E+ A - - - - - AE*
Kl K3
AE* + S _ ___.... AE*S ---A-e" + P
[E] [AJ
[AE*]
Km _ (AE*]
[s] - [AE*s]
La ecuación de la velocidad:
Yo [AE*S] 1 1
= = =
V ET [E] (EA*) (AE*SJ KmKA Km
-+ + + + 1
6" E*S] {Í\ E*S] ~ E*S] [s] ~1 [s]
V
VO =
1+
Km
[s] (i· ~)
87
Lo que muestra una cinética hiperbólica normal, con la mis-
ma velocidad n1áxima y con una constante de 1Vlichaelis aparente igual a
Km
(i (j)
+
[A sparta to]
(a) Enzima nativo
V
Enzima tratado
sin tratar
[A sparta to]
(b) Efecto del tratamiento con Hg.+-+
88
En todos estos mecanismos están implicados más de una sede
de unión y más de un estado conformacional del enzima. Hoy en día, se
ha demostrado inequívocamente que E* y~· son dos conformaciones dis
tintas del mismo enzima y que las sedes para el CTP y para el sustrato
(aspartatd) son químicamente distintas. En primer lugar, se han descu
bierto una serie de tratamientos que convierten la curva sigmoidal en
hiperbólica; por ejemplo, si se calienta el enzima a 60QC durante 4 mi-
nutos, ó se le trata con soluciones de urea o simplemente ensayándolo
en presencia de Hg 2+ ó p-mercuribenzoato, es posible eliminar la acti
vación por sustrato, la activación por ATP y la inhibición por CTP.
89
De las anteriores observaciones experimentales se puede
deducir un modelo del enzima nativo (Figura 5). Para justificar el
peso molecular de 310.000 del rnismo se proponen dos componentes C
y tres componentes R. De algun modo el Hg 2 + ó el p-mercuribenzoato
rompen las fuerzas de interacción entre los dos tipos de subunidades,
provocando su disociación en subunidades individuales. La estructura
cristalina de la A TC-asa revela un eje de simetría binario y otro
ternario. Por todo ello, parece claro que la molécula de A TC asa
consta de 6 subunidades de peso molecular 3 3.000 en la proteína C y
6 subunidades de peso molecular 17.000 en la proteína R. La proteí-
na C activa y estable es un trímero C , la proteína R activa y estable
3 -
es un dímero R y la molécula A TC-asa intacta tiene una composición
2
molecular (R ) - (C 3 ) 2 . Además.al quitar el mercurio de cada una de
2 3
las subunidades aisladas y mezclar las subunidades C y R en las propor
ciones adecuadas, se ha logrado un componente de coeficiente de sedi-
mentación 11, 8 S con todas las propiedades del enzima nativo (curvas
sigmoidales de velocidad, inhibición por CTP y activación por A TP).
90
Proteína-e
ATCasa unidad catalíticamente activa
Hg++ 2w=r=J
+
3
Subunidad-C Su bu ni dad- R
(a)
CTP
Sustratos
91
m a e iones dí fer en res de 1a i\ T C -·as a .
92
MECANISMO DE ACCION ENZIMATICA(I)
93
EP
Coordenada de reacción
S '--·
.... ,, X*~-·
,,L. • • •, p
E+S~ES*~ES ~ EX*~EP~ EP-~P+E
t'iJ (a)
ctl
,.-4 d E** (sin enzima
tl.G
~
Q) ~(con enzima
e
Q)
e
o
(.)
fEX* fx*
1 1
o
...... f
as 1
~ 1 1
~
en 1 1
::l
en 1 1
1
'
Q)
'O
1 1
en 1 1
ro
........
::l
<:.>
\Q)
........ Energía
'
o
s (b)
95
De este modo se puede identificar cada enzin1a 1111.:·d1an1e una serie de
I'
96
4) Oxigenasas; estos enzimas catalizan la incorporación de to
da una molécula de oxígeno a sus sustratos en el curso de la degradación
oxidativa de un enlace carbono-carbono.
97
TABLA l. CLASIFICACION Y NOMENCLATURA DE ALGUNAS REACCIONES CATALIZADAS POR OXIDOREDUCTASAS
l. OXIDOREDUCTASAS
1. 1. Que actúan sobre donadores CH-OH
l. l. l. Actuando como aceptar NAO ó NADP
l. l. l. l. Alcohol: NAO-oxidoreductasa Alcohol deshidrogenasa Alcohol+NAO"'~Aldehido ó cetona+NAOH+W
l. l. l. 27. L-Lactato: NAO-oxidoreductasa Lactato deshidrogenasa L-Lactato + NAD+ ~ Piruvato + NADH + H+
1. 2. Que actúan sobre donadores de grupos aldehido o cetona
1. 2. 1. Con NAO ó NAOP como aceptor
l. 2. l. 12. D..Gliceraldehido-3-fosfato: NAO- Gliceraldehidofosfato 0-Gliceraldehido- 3- P + Pi -t NAO~~
-oxidoreductasa (fosforilante) deshidrogenasa Acido 1, 3-D-difosfoglicérico + NADH + H+
ESPECIFICIDAD ENZIMATICA
H
1
coo-- c = c coo- + NH+4 (' 4
coo- - CH 2 - CH -
1
coo-
1
H NH 2
99
La aspartasa posee tarnbién una rígida ~s~ere<?_~_s_pecificidaq_
y especificidad geométrica: por tanto no desamina al D-aspartato ni
adiciona amoniaco al malea to, que es el isómero geométrico cis del
fumara to.
100
y sitúa su n1olécula adecuadamente sobre el centro catalítico • Este gru
po de unión suele tener alguna relación geométrica específica con el en-
lace que ha de escindirse. En el caso de la acetilcolinesterasa es ataca
do el enlace éster entre la colina y el grupo acetilo; el grupo amonio
cuaternario, positivamente cargado, es necesario para la unión del sus
trato, a pesar de hallarse algo distanciado del enlace atacado. El gru-
po enlazante de carga positiva es también necesario en la estructura de
los inhibidores competitivos de la acetilcolinesterasa.
101
aceptores de acilo distintos del agua, tales como amonia('o, algunos
aminoácidos y ciertos alcoholes. Investigaciones más recientes han
mostrado que los anillos aromáticos~ que se creía tradicionalmente que
eran necesarios para la acción de la quimotripsina, no son indispensa-
bles. Por ejemplo, cuando en lugar del anillo bencénico de un péptido
de fenilalanina se pone el anillo del ciclohexilo satura do no ocurre un
gran descenso de actividad. Además no es necesario siquiera el
grupo ex; -amino del aminoácido aromático, ya que puede ser sustituí
CH 3
1 '
CH 3 -CCH 2 CH Ct0CH 3
1
2 ll
CH O
3
102
e) Especificidad para distinguir entre grupos químicamente
idénticos. Este es uno de los aspectos de la especificidad enzimática
que merece especial consideración. Consideremos dos ejemplos de
este tipo. El primero es la gliceroquinasa
CH
2
0H CH 20H
1
H-C-OH+ATP '
H-C-OH +ADP
1
1 o11
CH 0H
2 CH 2 -0-P-OH
1
o-
TH 2 0P03H-
C =O
*I
HO-C-H
*I
H-C-OH
1
H-C-OH
1
CH 20P0 3H-
103
la glucosa, puesto que si esta molécula fuera 1xatada simétricamente
la fructosa-1, 6-difosfato se hubiese marcado también en las posiciones
1 y 6 además de hacerlo en las 3 y 4.
o
11
CH 3 C-SCoA -HSCoA ~H2-C02H aconi tasa CH 2 -co 2 H
1
O== C-C0 H
2
* HO-C-CO H H-C-C0 2 H
1 1 2 1
CH 2 -co 2 H CH 2 -*co 2 H OH-C-C*0 2 H
1
H
C0 H
1 2
CH 2
1
CH
1 2
-2H
e== o
1
*C0 H
2
104
átomo Caabc' con una superficie enzimática asimétrica, coloca a cada
. ., , .
uno de los grupos a en una pos1c1on un1ca.
Superficie
A del enzima
coo-
c
105
Con los isótopos suelen efectuarse dos tipos de experimentos:
los estudios de incorporación de isótopos, que informan primordialmente
sobre la posición del enlace roto o formado, pero que también pueden uti
lizarse para identificar los intermediarios, y los estudios de intercambio,
en los que se sustituye determinado grupo presente en una sustancia por
otro similar marcado y que sirven especialmente para obtener datos rela
tivos a la existencia de intermediarios. Como ejemplo del primer grupo
de estudios podemos tratar de la escisión de la glucosa-1-fosfato cataliza
da por la fosfatasa alcalina (monoéster ortofosfórico fosfohidrolasa). Es-
ta reacción podría concebirse con ruptura del enlace C-0 ó del P-0; si
se lleva a cabo en presencia de agua enriquecida en H 2 o18, la primera
ruta dará glucosa que contiene un átomo de 018:
+ o18H + H PO -
2 4
OH OH
OH + H POlB-
2 4
OH OH
La presencia de un átomo de 018 en el fosfato inorgánico demuestra que
el enlace P-0 es la zona de ruptura del sustrato. Casi todas las reac.
ciones catalizadas por fosfatasas parecen seguir esta ruta.
106
indicanque las fosfatasas son enzimas que transfieren grupos fosforilo
y que las fosforilasas transfieren grupos glucosilo.
107
Un ejemplo de reacción de intercarnhio de isótopos que permi
te conclusiones más definitivas es el de la reacc..:ión catalizada por la
aldolasa:
CH 2 -0P0 3H-
C=O ' CH 0P0 H- CHO
1 2 3
HO-C-H
1
'
C=O +
1
H - C - OH
H-C-OH
1
' 2 0H
CH
1
CH 0P0'3H-
2
H-C-OH
t
CH -0P0 H-
2 3
o
11
HO-CH -C-CH -0P0 3H- - -
2 2
o O OH
•• 11
Ho-='c-C-R + " t
/C-CH-CH 2 0P0 3H- ~ fructosa-1, 6-difosfato
1
H H
108
Los pocos ejemplos citados indican el tipo de datos, relati-
vos a las rutas de las reacciones catalizadas por enzimas, que pueden
obtenerse mediante estudios con isótopos radiactivos.
1 09
EL CENTRO .t\CTl VO DE LOS ENZIMAS
110
ción del complejo enzima-sustrato, o se halla próxima al contacto direc
to con este Último. Este hecho constituye el arranque del concepto de
centro activo de las reacciones enzimáticas. El centro activo de un en-
zima está formado por las cadenas laterales de aminoácidos y los enla-
ces peptÍdicos que están en contacto físico directo con el sustrato (qui-
...
zá a través de moléculas de agua), y asimismo por las cadenas latera-
les y los enlaces peptídicos, que, aunque no estén en contacto directo
con el sustrato, ejercen una función directa en el proceso catalítico.
R,ºr
)· )
/' .;'
I J
R, ¡ ,'
.. \
i
R• / .¡
.........
/
' l ·'
~, ... R! R,
·'
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.
'·,_ '. l 1 ~ .··
.
~: .... - ... - ~\
..,..,,,,, R
' . , ..... ,..,... # _ ........___.. ,,·
'
. .__ '• R / -
'-· .- ___..... -- '
'
\ ~- 1 • _/
. .¡
u /, /-.....
"'' \.....__. / R,
111
mantener Jos componen tes del centro activo en la conformación tridi-
mensional necesaria para una catálisis específica y eficaz. La nece-
sidad de este esqueleto estructural es mayor debido a las espectacula
res al te raciones de la actividad enzimática que .suelen producirse al
alterarse la conformación de la proteína a través de cualquier proceso
de desnaturalización (calor, urea, disolventes orgánicos, etc). Desde
luego, es posible que una parte de la molécula enzimática no desempe-
ñe papel alguno en el proceso catalítico, pudiendo eliminarse; por
ejemplo, porciones considerables de la cadena peptÍdica de la miosina,
enolasa ( 2-D- fo sfo glicera tohidroliasa) y r ibonu clea sa ( polirribonu cleó
tido-2-oligonucleÓtidot.ransferasa) sin una alteración acusada de las
propiedades catalíticas.
112
activo de la segunda clase es mucho más difícil.
113
a la proteína. En ambos casos, la hidrólisis completa de la proteína
conduce a la identificación de N- f - gliceril lisina entre los productos
de hidrólisis. Estas reacciones deben implicar la formación de una
base de Schiff entre la función ceto de la molécula de. sustrato y el
grupo f. -amino del residuo de lisina, que se reduce entÓnces con bo-
rohidruro sódico para dar una amina secundaria estable
114
complejo covalente enzima--sustrato, es una tarea muy difícil. Así,
numerosos enzimas reaccionan con el p-hidroximercuribenzoato o
con el p- cloromercuribenzosulfonato mediante mercuración de los
grupos sulfhidrilo expuestos, dando un producto catalíticamente inac
tivo. Sin embargo, en la mayoría de estos casos no se sabe si se ha
bloqueado un grupo sulfhidrilo esencial del centro activo o si la mer-
curación se ha producido sobre un grupo sulfhidrilo del esqueleto y ha
causado una alteración conformacional que, aunque pequefia, puede
inactivar el enzima. La falta de carácter específico de los reactivos
de aminoácidos de este tipo frente a los restos localizados en el centro
activo puede superarse, en teoría, mediante la técnica de marcado de
afinidad, que se basa en una idea bastante simple. El problema radica
en introducir la marca, específicamente, en el centro activo; para ello
se hace reaccionar el enzima con un reactivo Sus-X en el que Sus está
estructuralmente relacionado con el sustrato normal del enzima, y X
es una función reactiva, covalentemente unida a Sus, que puede reac-
cionar con una o más cadenas laterales de aminoácidos. En virtud de la
semejanza estructural entre el reactivo y el sustrato del enzima, Sus-X
se fija específicamente sobre el centro activo y el marcado buscado se
efectúa por reacción de X con los restos disponibles.
115
protector quedan expuestos los restos sensibles del centro activo, que
pueden reaccionar entonces con el reactivo (marcado) en la segunda
reacción. A sí pues, reaccionan todos los residuos sensibles al reacti
vo utilizado, pero sólo los del centro activo llevan la marca isotópica
por la que pueden ser fácilmente ídentificados.
116
ble. A partir de estas curvas de titulación se puede calcular el pKa del
grupo participante y se puede también intentar su identificación compa-
rando este valor con los valores de pKa de las cadenas laterales. Pero
este proceso ofrece algunas dificultades; en primer lugar, y como con-
secuencia de la interacción con los grupos vecinos de la misma proteí-
na, con los sustratos o con el tampón, el pKa de un grupo ionizable de una
proteína puede diferir significativamente del valor correspondiente al del
grupo libre en solución Los valores de pKa para varios grupos titula-
bles de las proteínas se yuxtaponen considerablemente. Así, por ejem
plo, un grupo con un pKa de 10 puede tomarse por un grupo amino, un
grupo hidroxilo fenÓlico, o posiblemente, por un grupo sulfhidrilo. Para
asignar un pKa a determinado grupo, a veces, conviene determinar el
AH de la ionización. En ocasiones resulta imposible asignar determina
do pKa a un grupo específico determinado. En segundo lugar, el com-
portamiento en función del pH puede refleJar la titulación de varios res
tos y no la de uno solo. Finalmente, a veces se quiebran los perfiles
de pH-veloC"'idad a causa de otros factores distintos de la titulación, ta
Les con10 c1er1os. an1h1ns s11fr1dos por la etapa dt--'t'ríl11nan1e de la velo
cidad. Afortunadamente no siempre se presentan todas estas dificulta-
des, siendo además frecuente que otras técnicas permitan corroborar
las asignaciones hechas basándose en efectos de pH. Así, por ejemplo,
varios enzimas parecen tener un resto de histidina implicado en el pro
ceso catalítico si se tienen en cuenta los efectos del pH sobre las veloci
dades máximas. En el caso de la quimotripsina, esta conclusión queda
reforzada por la observación de que una clorocetona análoga de un sus-
trato de la quimotripsina reacciona específicamente con un resto de his
tidina y la inactiva. La variación de la velocidad en función del pH su-
giere la presencia de un grupo sulfhidrilo en el centro activo de la papaí
na; esta sugerencia está también reforzada por la inhibición de la papaí
na por los reactivos de grupos sulfhidrilo.
117
Otro método empleado en la identificación de los restos de
aminoácidos que toman parte en la actividad enzimática es el estudio dt-
la pérdida del poder catalítico uriginada por la modificación df.' i.os cita
dos aminoácidos. Un ejemplo de dicha modificación es 1a reacción del
p-hidroximercuribenzoato con los grupos sulfhidrilo. Este método se
ve considerablemente entorpecido en su eficacia porque la ma:,or parte
de los reactivos de los aminoácidos no son específicos para un solo ti-
po de resto y por la variabilidad de las reactividades de los grupos fu~
Q)
100
'O 80 X5
o o 70
Q) 'O X50
+-'
e:
.....
C)
60
a.> 'as 50
e: o
e:
"'E
Q)
·.-4
s
40
as
~X2_
'-4
e: 30
'"O
as Q)
'"O o
• ...,¡
'O X4 X1 X20
> •.-4 20 --
•.-4
+-' e:Q) X10
C)
X40
as +'e:
(l) o
'O c..>
tf. 10
tiempo de reacción
118
antinnacÍdica. Rstos experin1e11tos dan constantes de seudoprimer or-
den para la n1odi ficación de los restos afectados y para la pérdida de
la actividad enzin1ática. En la figura 2 pueden verse los resultados de
un experirnen to modelo en el que se modificaron varios aminoácidos.
Es evidente que los aminoácidos que desaparecen más rápidamente que
la actividad enzimática son innecesarios para la catálisis; en cambio,
los que se pierden más lentamente pueden ser imprescindibles. El re
síduo X4 no puede ton1ar parte en el proceso catalítico, puesto que se
destruye a una velocidad superior a la de pérdida de actividad, pero x1
y X2 sí pueden hacerlo. La suma de las constantes de velocidad de pér
dida de X 1 y X2 es igual a la constante de velocidad de pérdida de la
actividad enzimática, lo que sugiere que estos restos participan real-
mente en la actividad enzimática. El aminoácido X5 no se ha modifica
do, por lo que no es posible sacar conclusiones de ningún género res-
pecto al papel que desempena en el proceso catalítico. Esta técnica se
ha aplicado, por ejemplo, a la fosfoglucomutasa, y en este caso se ha
visto la necesidad de la intervención de un resto de metionina en el pro
ceso catalít~o y de otro de histidina para lograr la actividad plena, pe-
se a que su pérdida no inactiva el enzima por completo. Parece tenta-
dor considerar que la histidina en cuestión es la localizada en posición
adyacente a la serina reactiva del enzima.
119
disponían forrnando un molde relativamente rígido al que podía fijarse
el sustrato; esta hipótesis de la llave y la cerradura explica el carác-
ter específico enzimático suponiendo que la rigidez del molde causaría
la repulsión estérica de las moléculas estructurtümen.te distintas del
sustrato nor.mal. En cambio, Koshland ha abogado por la teóría del
ajuste inducido para explicar el carácter de las reacciones enzimáticas.
En esta teoría se adoptan tres postulados: 1) cuando el sustrato
por la sacarosafosforilasa:
~s
B'l B'2
120
La hipótesis de llave y cerradura predice que, en ausencia de fructosa
como aceptar de un grupo glucosilo, ocurre una reacción medible de la
glucosa-1-fosfato con el agua. En ausencia de fructosa, la glucosa-1-
fosfato está fijada al enzima, y, además hay agua presente en el centro
activo; en consecuencia el agua deberá funcionar como aceptar del gru
po glucosilo. Sin embargo, no es posible detectar la reacción de la
glucosa-1-fosfato con el agua en presencia de sacarosafosforilasa. Tal
vez la explicación más directa de esta observación sea la de que la fruc
tosa, al fijarse al centro activo, altera la geometría del mismo y le
confiere la conformación catalíticamente activa. Existen otras obser-
vaciones relacionadas con la anterior que sugieren la inadecuación de
la teoría clásica. La hipótesis del ajuste inducido se apoya en las obse!:
vaciones químicas que sugieren la modificación de la conforn1ación del
enzima al fijarse al sustrato.
121
puntos reactivos de tal forma que permita que la reacción se produzca
con más facilidad. Esta catálisis puede implicar efectos de proximidad,
es decir, aumentos de velocidad debidos exclusivamente a la aprozirna-
ción de los reaccionantes, y _efectos_ de orientación, en los que intervie-
nen grupos orientadores en una configuración favorable a la reacción.
122
TABLA l. Comparación entre las velocidades enzimáticas observadas y las calculadas por la teoría de la frecuencia
de colisión
--------------- - - - - - - - - - - - - - ------------
VE/Va
Calculado
basanctose V E /V 0 observado
Observado en la,
Enzirna Sustrato y concentración
----------·--- -----------------
Vo teor1a V E/Va calculado
Glucosa-1-fosfato 0,016 M
11
Fosforilasa 5 X ¡o-15 1, 6 X 1 a-3 2, 5 1, 4 X 1a
Glucógeno 1 o-5 M
Ni\.D 0,0004 M
/\ lroholcieshi 4 X la- 7 6 X 10- 12 2, 7 X 10- 3 0,5
drogenasa Etanol 0,04 M
124
o
"
O-C-CH3 k 2 =1, 2 x 10 6 M-1. min-1 OH
NH2 OH-
C/
11
o
o o
k~20 M-1. min-1 u
OH-
02N
D OH+
CH/
c, /c
3
N
11
'CH
H 3
125
La catálisis rle la hidrólisis del p-nitrofenil ester de leucina
por benzaldehido, es observable en soluciones diluidas de benzaldehido
( 1 o-4M). La reacción parece irnplicar la formación de un aminoalcohol,
por adición del grupo amino de la leucina al grupo carbonilo del benzal-
dehido.
O H, /R
11 e
O CHO+NH 2 -CHR-C-0R' - - HN/
1
'e = O
f.¡
0 ?-o-(oR
H
126
bles por su especificidad que por el incremento global en la velocidad ·
de reacción. Las constantes de asociación para la inclusión de los dos
ésteres en la cavidad son similares, el derivado meta debe formar un
complejo en que los grupos hidroxilo de la ciclo dextrina estén próxi-
mos a la función acilo del éster, mientras que el derivado para no lo
forma. Se observan cinéticas de saturación respecto a la concentra-
ción de sustrato, al igual que en las reacciones enzimáticas. Reaccio
nes de este tipo pueden servir de modelo no solamente para reacciones
enzimáticas sino también para procesos de transporte a través de mem
branas.
127
CATALISIS ACIDC>-BASE EN LAS HEACCIONES ORGANICAS
OH
OH
OH OH
128
TABLA 2. Efecto de Ja concentración del tampón sobre la constante de
velocidad de pr·írnt->r orden de 1a n1urarotación de la glucosa
-- ---~- - ·------- ---------------- ------------- - -
/\ cido acé1ieo .A. e eta to kobservada
(IVI) ( l\l) (min-1)
·------·--· ·------- - - ---- -------
129
el catalizador actúa como dador o aceptor de protones,
o
11
CH -C-CH -COOH + RNH _ _
3 2 2
H, /R
tfi ~ 0'-
.
CH3-C-CH2-C ~
o
130
El grupo imidazolio de la histidina resulta particularmente
versátil como catalizador. No solamente es un catalizador ácido
general sino que también es una base de Lewis, y además estas propie
dades son muy notorias a valores de pH próximos a la neutralidad
(pKa del grupo imidazolio 6, O).
o OH
11
-C-CH 3 '
-C=CH 2
B
•
••
H1
••
?t ~
- C- C --- H --- A
1
H
131
o
11
CH 3 -C-CH 3 + RNH
2
132
o"--.... ¿. ().
pp
o/ 'o
estado
s +
~
fj}-(f)
A4 K~ fa*
v;-v ~ +
E'S ~
Producto
133
suponer que las rnayores fuerzas de ligamiento de los buenos sustratos
se han empleado para inducir una mayor tensión en ellos, lo que se tra
duce en mayores velocidades. no en mayores afinidades.
Cbz, carbobenziloxi
134
~Productos-~
R~N~ R-7-oH
o
Sustrato
H O H O
l J
1 11 1 11
R'-N--C-R R'-N•-c-R
.. ~ 1
"---
··-'
~
~ ..
r
... 11-0 HN N;···H -O HN N~········H-0
i
1 1 . 1 1 1
l==i CHi
-
CHs
1 - 1
(His~195]
1
(His~195)
135
aromáticos, este experimento apoya fuertemente la hipótesis del acil
enzima.
136
MECANISMOS DE REGULACION ENZllVIATICA
137
y representan rnanifestaciones clásicas de control.
FORMAS INACTIVAS
DNA
transcripción
*
RNA
traducción
*
ENZIMA
Jf *
FORMAS ACTIVAS
SUSTRATOS 1 PRODUCTOS
(precursores) *
Cofactores
1l
Co:tactores no disponibles
1 38
Además, cualquier fluctuación en la concentración de sustrato
debe ser extremadamente importante en la regulación de la velocidad de
una reacción. Ya que la mayoría de los sustratos para un conjunto de
enzimas son a su vez los productos de otro conjunto de reacciones enzi-
máticas, una fluctuación en la concentración de un sustrato, tenderá a mo
dificar la cadena de reacciones enzimáticas. Del mismo modo una altera
ción en un enzima afectará a la velocidad de todas las reacciones de la
cadena.
Finalmente, un aspecto de la regulación , la velocidad de
transporte de metabolitos dentro y fuera de la célula o de determinado
compartimento intracelular, es extremadamente importante, ya que regu
la niveles de sustratos, coenzimas y productos.
139
Regulación _a ni~_~_l d~--~~a~sc~i,pci_ón. Los conceptos de induc
ción enzimática (o desrepresiÓn) y de represión enzimática están basa
dos en el tipo de evidencia experimental representada en la Figura 1.
Se quita S
.,...., Se añade P
N
,...
1) ro
(])
'U
......-4
::J l
:a:; ,.___ _,Se quita .
rn :> Se añade
(])
"O
~
"O
.....
e 1-iernpo tiempo
~
140
Para explicar los fenómenos de inducción y represión, Jacob
y Monod en 1961 propusieron el modelo del operón como la unidad fun-
cional de la expresión genética en bacterias. Un operón es una secuel_!_
cia lineal de genes,implicados normalmente en una misma ruta bioquí-
mica,y que se transcriben a la vez para dar lugar a un Único RNA-mel_!_
sajero policistrónico. Intimamente relacionados con el operón en el
cromosoma bacteriano, hay que mencionar el gen regulador que codifica
para la proteína del _represor, la región del operador (O) por la que tie
ne afinidad el represor y la re gi.Ón del promotor ( P) a la que se une la
RNA-polimerasa. El modelo, tal como se describió en 1961, define a la
sede reguladora como parte del cromosoma y especifica que la regula
ción está afectada al nivel de transcripción. En contraste con el gen
operador, localizado en el cromosoma que controla, los otros genes
regulador y promotor no han de estar necesariamente localizados en él
y pueden controlar genes estructurales en otros cromosomas.
141
Operon de la ~- galactosidasa
~--------------~- ________________
.._ ~
'
Operador
Gen Regulador (i) (o):' ( z) (y) (a)
_ _ _ _ _ ......___ _ _ _ ~ ~ ,_ _ _..A._ _ __
1 ,.( ~
Prornoto~ ~
(p) \ ""
!
" .
No hay s1ntes1s
mRNA
TR~osoma
••••
••
Represores
•••
••• .•
)-Galactosidasa Galactosido Transacetilasa
Represores •• permeasa
/J- Galactósidos
(inductores)
142
TABLA l. lVfUTACIONES QUE AFECTAN A LA FORlVIACION DE ¡.9.GALACTOSIDASA EN
ESCHERICHIA COLI
144
Aún cuando este modelo fué postulado en principio como con
trol a nivel de transcripción, hoy en día se duda de si pudiera tratarse
de un control a nivel de traducción. Esto está apoyado por ciertos datos
experimentales. A sí el histidil-tRNA es más efectivo que la histidina
en la represión del "operón his" en Salmonella.
145
na de la envuelta se necesita en un gran número de copias para hacer
la cápsida del virus, la replicasa en pequenas cantidades para catali-
zar la síntesis del RN A viral y el factor de maduración en pequef'las
cantidades para producir el ensamblamiento de la partícula total de
virus. La proteína de la envuelta no contiene histidina y la incorpora
ción de histidina proporciona un método directo para el ensayo de la
replicasa y del factor de maduración. Se ha observado "in vitro", que
al añadir proteína de la envuelta, la síntesis de la RNA-replicasa y del
factor de maduración se interrumpen.por lo que se ha propuesto que la
proteína de la envuelta se cornbina Ct)r: ei RNl-\ en un punto de la prime
ra mitad del gen para la replicasa : dt este n1odo reprime todo el proce
so de traducción más allá de este punto (Figura 3). La conveniencia de
este tipo de represión es obvio. En las etapas tempranas de la síntesis
146
EL GENOMIO DE f2 (RNA) EN LAS ETAPAS TEMPRANAS DE LA
TRADUCCION
a b c
Traducción l
Proteína de la RNA replicasa
!
Factor de
envuelta
• • ••
,,,, Maduración
• ••••
••••
(a)
SISTEMA REPRIMIDO
a
* b
c
Traducción
!
••••
•• •••
(b)
SISTEMAS IN VITRO
DE PROTEINAS Incorporación de Aminoácidos
His Otros
RNA de f2 100 100
RNA de f2 proteína envuelta o 50-80
(c)
147
enlaces peptídicos.
- Efectores específicos.
148
Compartimentación
-----
de enzin1as v rnetabolitos.
------------------- --- ---------------
-~
En la célula
existen diversos con1partimentos, separados por barreras de permeabi
lidad,a través de las cuales han de ser transportados los sustratos. Los
enzimas, unos en solución y otros integrados en los elementos estructu
rales de la célula (particulados), sólo pueden transformar al sustrato
presente en el mismo compartimento celular que ellos. Por otra par-
te, el drenaje de productos influirá sobre la actividad enzimática ya que
el producto inhibe por ley de acción de masas.
149
,
efectos, ciertos iones, incluyendo los protones, actuan como efectores
alostéricos.
1 .)Ü
V o ----------------
151
Tanto la glicógeno sintasa como la fosforilasa,se interconvie_!:
ten,a partir de sus precursores más inactivos,por una secuencia de reac
-
ciones de fosforilación-defosforilación,que implica la actuación de foef!
tasas y fosfoproteinaquinasas. Mientras que la fosforilación activa a la
fosforilasa,inactiva a la sintasa,y viceversa, la defosforilación inactiva
a la fosforilasa y activa a la sintasa.
Epinefrina, glucagón
y otras hormonas
j
A denil ciclasa
ATP _ _ _ _ _ _...,.. AMP cíclico + PPi
~----r----
Fosforilasa quinasa ~ z.
'-......____ (proteína quinasa)
.
"""""""" _______ -----------=--
_.,-(
Fo sforilasa quinasa a
4 p~orilasa fosfata~ 20
152
Se conocen tan1bii•n otros casos de interconversión de formas
moleculares de un enzirna por ejen1plo el de la nitrato reductasa, en
el que la reacción de inierconversión es de oxidación-reducción.
153
Cuando las asociaciones de sustrato y de efector al enzima no
son mutuamente excluyentes pueden ocurrir dos situaciones:
Ki K3 [Es][r]
E+S ES~E+P • = Ksr Vo = K3 [ES]
[ESI)
K2
[E] 1
ES + I ESI • = Km - V = Ks [Es] = K3 ([E]+~S]+{ESI])
[ES] s max
154
Vo [ES] 1
V
= - --------~--------
[E]+[ES] +[ESI] _ 1 [ I]
K . - - + 1+ --- -
n1 s Ksr
v/,J2l
Ksr V'
VO = = -----··------
1+ 1Smji)rJ K;n --s1 + 1
s Ks1
.,
expres1on en la que se con1prueba que tanto la constante de Michaelis
como la velocidad máxima aparentes, K~ y V', son dependientes de
la concentración de inhibidor e independientes de la de sustrato.
155
cos. En ambos casos la unión a la primera sede puede afectar a la unión
a la segunda sede bien positivarr1ente (activación o cooperatividad positi-
va} Ó negativamente (inhibición o cooperatividad negativa}.
156
sede para el ligando. Las dos sedes interaccionan de tal manera que
cuando el ligando se une a la prin1era sede, la afinidad de la segunda
sede por el ligando aumenta (en el caso de cooperatividad positiva). El
modelo simétrico especifica que la simetría molecular ha de ser rete-
nida siempre por la molécula, y ,por tanto, cualquier cambio conforma-
cional en la primera subunidad promovido por la unión del ligando, va
acompafiado inmediatamente por un cambio conformacional en la segun
da. El modelo secuencial, no obstante ,considera que pueden ocurrir
distintos tipos de interacciones entre las sedes, siendo la que ocasiona
la conservación de la simetría un caso especial.Con el modelo secuen-
cial también es posible considerar un amplio espectro de otras interac
ciones. El caso general de un enzin1a con dos subunidades se repre-
senta en la Figura 5, donde se incluyen todo tipo de interacciones en-
tre sedes, desde la cooperatividad positiva (K 1 > K 2 ) hasta la no interac
ción (K1 = K 2 ) o la cooperatividad negativa (K1 ( K2). La representación
se basa en un modelo secuencial y solamente en el caso B se satisface
el requerimiento de conservación de la simetría. Solamente se pueden
explicar los efectos homotrópicos anticooperativos (caso D) por el mo
delo secuencial. Ya que está hoy en día bien documentado un caso de
cooperatividad negativa (unión del NA o+ a la triosafosfa to deshidrogenasa),
está claro que el modelo simétrico no puede tener validez universal.
Los enzimas alostéricos con sedes separadas para los efectores (caso
de la aspartato transcarbamilasa), han proporcionado el soporte experi
mental más conveniente para el modelo simétrico, pero también estos
sistemas pueden ser satisfactoriamente tratados por el modelo secuen
cial.
157
Reacción global: E+S;::::ES
ES+ S;:: ES2
Conservación
de la Simetría Coopera ti vi dad
A.K1=K 2 m
Kl
CE] -- [i][§J
K2
no no
DC§J ---
Ki K2
B. Ki > K2 m -- [§][§] si si:+
C. Ki ) K2 co Ki
(JW~~C§J
K2_
no si:+
Ki K')
<JW ---- ~w
.....
__,_
D. K 1 > K2 OJ no si: -
(a)
no
Sl
158
Retroin~~1!_~5it?_~ de un .Eª~_C?__ ~atalizado por más de un enzima.
\
, , ''
- - - - - -- -
-... --- ,, ,,
, \
.;
... -
,.,,.
,;
;1"" - -
\
\
LISINA ~ ~
k"
Dihidrodipicolinato
--~
__ ,,,,"""
,. --
-------- --- - --....................
.... " '
.....
'
\
Homoserina ~ Homoserina-P ---+ TREONINA
,.,.--- -f ,.,.----¡'
I Cista tionina 1/ ol-Cetobutirato
'
1
I
¡ ,' !
1
I ''~ !
'METIONINA ' .... ISOLEUCINA
159
incluso en presencia de un exceso de uno de los aminoácidos producto
final de la vía, pero la velocidad de síntesis global de aspartil-P de-
pende del grado en que cada vía sea opera ti va. Para dirigir al aspar
til-P por la vía metabólica apropiada son necesarios controles adiciona
les que norrnalmente actúan en la primera reacción enzimática después
de la ramificación (Figura 6).
160
Retroinhíbición acurnulatíva. En este caso. la retroinhibición
por cada producto es separada e independiente, y se presenta cuan
do una Única reacción es común a un gran número de productos finales.
Un ejemplo lo proporciona el caso de la glutaminsintetasa, cuyo produ~
Clu taminsintetasa
ADP+ Pi
CA RBA1\1IL-FOSFATO
TRIPTOFANO
GLUCOSAMINA-6-P
HISTIDINA
CTP
~GIVIP
i\l\!I P
161
enzima puede ser totalmente inhibido . .:\sí, si triptófano inhibe el 16 %,
CTP el 14 %, carbamil-P el 13 %, y Al\1P el 41 %, cuando los cuatro
01
efectores se afladen juntos inhibirán un 6:3 0 de la actividad original
(O, 16 +O, 84 X O, 14+ º· 72 X O, 13 + º· 63 X O, 41 :r 63 %).
1 62
HE.ACCJC)NES DE J>.'\HDE.A:\1IENTO EN ALIMENTOS
Requiere
Mecanisn10 Requiere o2 grupos -NH2
pH Óptimo
-------·-~-
163
PARDEAMIENTO ENZIMATICO C ..~TALIZADO POR FENOLASA
+[o]
fenolhidroxilasa
OH
_,_[o]
OH-OCHr~H-COOH
polifenoloxidasa
NH 2
164
Para la reacción primera el sustrato es un monofenol y para la segunda
es un difenol. Finalmente la quinona sufre una serie de transformacio-
nes para formar un compuesto rojo el dopacromo {5, 6-quinona indol-2-
carbox!lico) que contiene un heterociclo derivado del cierre de la cadena
lateral aminocarboxílica. El dopacromo sufre polimerizaciones posterio
res a melaninas.
OH-o OH
+[O]
o Q + H 20
o
catecol o-benzoquinona
OH-o-OH
OH
o- benzoq uinona trihidroxibenceno
OH-o-OH oyoH
o
OH
º=<d-º
OH
trihidroxibenceno ~ -benzoquinona hidroxiquinonas
De esta serie de reacciones solamente la primera es enzimática y re-
quiere oxígeno. Los productos finales hidroxiquinonas sufren polimeri
zaciones y se convierten progresivamente en sustancias pardo-rojizas
y finalmente en melaninas pardas.
165
la de participar en la biosíntesis de lignina, la de jugar un papel importan
te en el mecanismo de protección de heridas vegetales, etc.
OH OH
OH OH
Catecol Ac. Cafeico Ac. Protocatéquico
OH CH=CH-COC!!
O-CH3
O-CH 3
OH
Guaya col A c .FerÚlico
L66
Control del pai:-.d~miento enzimático. producido por la fenolasa.
La reacción inicial de la fenolasa implica la conversión del con1puesto
fenÓlico a la correspondiente quinona, requiere la presencia de cobre
como grupo prostético y de oxígeno. Se suelen tener en cuenta estas
circunstancias para controlar o prevenir este tipo de pardeamiento en zi
má tico en alünentos.
1 G7
100
90
80
70
60
50
40
30
20
10
'
0 .__~_._.~~~~~~--'-~-_l.__ 'J l
30 40 so 60 70 80 80 100
Temperatura. QC
168
E~nhÍdrid~__s_~_lft~~':_~_º_iS<?2)_y los sulfitos (S03) son inhibido
res potentes de la fenolasa. Se emplean con generalidad en la industria
de los alimentos, por ejemplo, en las patatas pre-peladas, y enlama-
nufactura de manzanas y n1elocotones.
169
o OH
1
R - e" - H + Na H 803 - - - - - - - ,
R - C - H
glucosa S0 3 Na
o<.. -hidro:xisulfona to
8
e
o 0,4
~
"'1"
ctS O, 3 l pprn S02
ctS
•..-4
()
e:: 0,2
ctS
..o
~
o
00
O, 1 10 ppm so 2
..o
<:
o
1 2 3
Tiempo, minutos
17 o
regular el flujo de las ni ismas hacia las etapas de escaldado y freiduría.
Este método de inhibición presenta la desventaja de que el fruto u hortali
za se ennegrece al reexponerlo al aire.
171
no puede utilizarse en frutos.pues las concentraciones relativamente
altas (O, 3 %) que hay que emplear,hacen al fruto no apto para el consu
mo.
172
100
80
b~
"O
O\
60
ro
"O
.......
:>
....... 40
+-"
()
~
20
o
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
pH
o- difenol + ~ 02
17 3
Se han llegado a af\arlir n1ti'- rlp 600 n,~- de ácido ascórbico por
kilo de fruto para evitar pardearnientos en n1anzanas enlatadas.
HEACCION DE MAILLARD
H H OH H O
1 1 1 1 "'-
rH 2oH- e - r -e -e - e
1 1 1 1 'II
OH C>H H ()H
17 4
Esta primera etapa de la reacción de Maillard puede transcu-
rrir a pH ácido o alcalino, si l)ien se ve favorecida en condiciones alca-
linas. Por tanto,los alirnentos muy ácidos, como p. e. los encurtidos,
serán menos susceptibles a esta reacción. Análogamente, alimentos
tamponados en la zona alcalina serán rnás propensos a este tipo de par-
deamiento pues los productos acídicos resultantes finales de la reacción
no podrán llevar el pH a la zona ácida n1enos propicia.
175
aminoácidos que parecen participar. si bien en mucha menor escala v de
forma no bien establecida, son arginina, triptófano e histidina. Además,
conforme aumenta la temperatura muchos más aminoácidos resultan blo-
queados, lo cual no está aún bien explicado, pues no se produce al misn10
tiempo escisión notable de enlaces peptÍdicos. Horn, basándose en este
tipo de observaciones experimentales, sugirió que el grupo imido del
enlace peptÍdico pudiera estar implicado en la reacción de Maillard, sus
tituyéndose el hidrógeno unido al N por un residuo carbohidrato. El com
plejo resultante sería inatacable por enzirnas proteolíticos intestinales.
R - NH R - NH R - NH
1 1 1
H - c CH CH
~o
1 1 1
H - e +H+ H - e - OH -H• C - OH
1 ::. 1 1
OH - C-H OH - e - H OH - C - H
1 1 1
h~
H - H- e - OH H - C .. OH
1 1
H - H- e - OH H - C - OH
1
1
CH20H CH20H CH 2 0H
] 7 fi
La !_er~e~~- etapa d~_l_a ~-~a~~iól! de 1\!Iaillard conduce a la forma
ción de productos pardos a trav~s de lina serie de reacciones no bien defi
nidas. Dos de las tres vías propuestas aparecen muy resumidas en el
sigui Pn te esquema:
Aldosa + Aminoácido
jf
Glicosilamina-N-sustituída
Jr
1-A mino-1-deoxi-2- cetosa-N-sustituída
VIA 1
~HO ~
VIA II
/ CfH3
Metil dicarbonil C=O
1
C=O
, 3-Deoxi-hexo sonas
intermediarios C=O C-H intermediarios
1 "
CHOH C
J
- H
Pigmentos rnelanoidÍnicos
177
de los aminoácidos, que tiene lugar en esta etapa, da lugar a la forma-
ción del correspondiente aldehído con un átomo de carbono menos con
liberación de co 2 . Son necesarios compuestos dicarbonilicos para que
se lleve a cabo esta reacción. Para el aminoácido alanina, la reacción
"
seria:
O O NH
" " \ 2
R- c - c - R' + CH3 - CH - COOH
Aroma
Aminoácido
lOOQ C 1soº e
- ninguno caramelo
valina pan de centeno penetrante, chocolate
leucina cho cola te dulce queso quemado
prolina proteína quemada aroma de panadería
lisina (hidrocloruro) ninguno pan
178
de compuestos dicarbonílicos. Aden1ás demostró que el co 2 se seguía
produciendo cuando el anünoácido era reemplazado por aminas prima-
rias, secundarias y terciarias. En estos Últimos casos otras vías dis-
tintas de la degradación de Strecker deben estar operando.
o 6,0
i::
·~
sro en
5, o 20QC
1 o
\JJ 'O -20QC
en
ro 4,0
i::
o o
o.·~
:::s 3,0
s...
C)
C)
OQC
bD ro(])
2,0
(]) s...
"O
~ 1, o
o 1 2 3 4
Tiempo de reacción, días
179
CARAMELIZACION
o OHOH
1 1
CH 2 0H-(CHOH)4- C - H " CH20H - (CHOH) 3- e =e - H
A continuación se producen una serie de etapas de deshidrata
ción que conducen a un producto cíclico el 5-(hidroximetil) ... 2-furaldehido.
H - e OH H e1 = o H-C=O H- C::: O
11 1
e - OH
H 20
e - OH C=O
H20
C=O
H 20
1 11 1
OH - e -
1
H ./:.. e -H
1
CH 2
1
_/ ::i.. CH L ~
H - e - OH H - e - OH H- C- OH CH
1 1 1 1
H - e ... OH H - e- OH H - C - OH H - C- OH
1 1 1 1
CH 2 0H CH 2 0H CH 0H CH 2 0H
2
1, 2 dienol 3- deo xi o sulo sa
ctt 2 oHOCHO
ciclación o
5-( hidroxime til )- 2- fu raldehído
180
Después de la l'orrnaciÓn de los furfurales las vías que condu
cen a la producción de lus productos coloreados no están bien definidas,
pero se cree que implican una cornplicada serie de reacciones de poli-
merización. Acidos orgánicos, incluído el m·álico, se ha visto que ace
leran el proceso de pardea1niento.
CHO H - C - OH CHO
OH- 1 1
H-C-OH C - OH OH - C - H
1 1 1
OH-C-H OH - C - H OH - C - H
1t OH-
CH20H
1
e == o
OH - C - H'
D-Fructosa
181
Finalmente la formación de pigmentos pardos implica una
serie de reacciones de condensación y polimerización entre los varios
aldehídos y cetonas intermedios.
2, 5-di~_~ti~_eir(izina 2, 3, 5-trimetilpirazina
182
c1"t ricos.
. .A den1ás el áci du ~, 3- dicetogulónico, un producto de degra-
dación del ácido ascórbicu, produce co 2 cuando se calienta en solución
acuosa. Otro de los productos de degradación del ascórbico es el áci
do oxálico.
o o
11 ll
~--=-i
COOH
LoH
,, o 1 C=O
1 o
1
C=O
1 C0 2
CHO
1
fi:IO
_ _.L~_ _ _., ~H
?~
C=O
H-C
?" º
H-C
1 1
H- C- OH
1 1 1 ~HJ
OH- C - H OH- C - H OH- C- H CH
1 1
CH 2 0H CH 2 0H CH 2 0H
183
tadas. El pH es superior en verduras ( 5, 3 - 6, ,) que en jugos de fru-
tas, y ello favorece poco la formación de furfural por la vía descrita
anteriormente. Algunos autores han postulado la existencia de interac
ciones ácido ascórbico - aminoácido, y de una degradación de Strecker
a baja concentración de agua. La formación de ácido dehidroascÓrbico
y ácido dicetogulónico a partir del ácido ascÓrbico, tendr{a lugar al fina.l
184
empaquetado, reduce la posibilidad dP oxidación de lipido, que podría
dar lugar a su8tancias reducroras capaces de interaccionar con ami-
noácidos.
o OH
1
"
CH 2 0H - (CHOH) - C - H + NaHS0 3 - - · CH20H - (CHOH)4- e - S03Na
185
probablemente irnplique un proceso por radicales libres.
186
LOS ENZIMAS EN L_i'\ INDUSTRL!\ DEL-~ -~LIMENTACION
187
TABLA 1. Enzimas importantes en la industria de los alimentos
OXIDOREDUCTASAS
Glucosa-oxidasa ~ -D-Glucosa:0 2 oxidoreductasa l. l. 3. 4. ,-i-D-Glucosa + o 2 __.. D-Glucono-)-lactona +
H202
Fenolasa O-Difenol:0 2 oxidoreductasa l. 10. 3. l. " 0-Difenol + o2 - 0-Quinona + 2H 2 0
Acido ascórbico-oxidaaa L-Ascorbato:0 2 o.ddoreductasa l. 10. 3. 3, A c. L-A scórbico + 0 __.. Ac. -DehidroascÓ!
2
bico + 2H 0
2
Catalasa H 2 0 2 : H 2 0 2 oxidoreductasa 1.11.1.6. H 2o 2 + H 2 0 2 ___.. 02H 0 +
22
Peroxidasa Donador:H 2 o 2 oxidoreductaaa 1.11.1.7. Donador + H 2 o 2 - - Donador oxidado + 2H 2 0
Lipoxídasa 1.99.2.1. Grasa insaturada + o 2 -Peróx:ido de la
grasa insaturada
HIDROLASAS
Lipasa Glicerolester hidrolasa 3.1.1.3. Tríglicérido -t- H 0 ___..Glicerol -t- Acidos
2
Grasos
Pe e tin rn e til e sterasa Pectinpectil hidrolasa 3. l. l. 11 Pectina+ n H 2 0 - Ac. Péctico + n Metano}
Clorofilasa Clorofilclorofilido hidrolasa 3.1.1.14 Clorofila + H 2 0 ___:i.. Fitol + ClorofÍlido
Fosfatasa (ácida o alcalina) Monoeste¡¡ortofosfÓrico fosfohidrolasa 3. l. 3. (1, 2) MonoestePOrtofosfórico + tt o ~ Alcohol +
2
P0 4 H 3
oL -Amilf..sa ol-1. 4-Glucan 4-glucano hídrolasa 3. 2. l. l. -Hidrólisis interna al azar
fi -Amilasa a( -1, 4-Glucan malt.ohidrolasa 3.2.1.2. Hidrólisis de enlaces -Hidrólisis de unidades
•-1.4-glucano ·de maltosa
Glucoamilasa 11(-1, 4-Glucan 4-glucanohidrolasa 3.2.1.3. -HidrÓlisis de unidades
de glucosa
Celulasa A-1, 4-Glucan 4-gkcanohidrolasa 3.2.1.4. Hidroliza enlaces ...A-1, 4-Glucano en celulosa
Amilopectin-1, 6-glu~osidasa A milopectin 6- glucanohidrolasa 3.2.1.9. Hidroliza enlaces o( -1, 6-Glucano en amilope~
tina
Poligalacturona ea Poligalacturónido glucanohidrolasa 3.2.1.15 ACido péctico + (x-l)H 2 0 - x ol-D-Ac.
Gala e tu rónido
TABLA 1. Enzimas importantes en la industria de los alimentos (continuación)
190
cosechas. La harina obtenida a partir de trigo cosechado por las nue-
vas técnicas, produce panes de inferior color, volun1en y textura, y esto
se debe a una deficiencia parcial en r::í.. -amilasa. Este es un enzima
cuya actividad aumenta considerablemente en el grano germinado y con
las nuevas técnicas, al mismo tiempo que se producen más daflos mecá
nicos en embriones que quedan así imposibilitados de germinar, el pro
ceso total es tan rápido que no llegan a producirse las condiciones de
humedad, etc,para que parte de los granos sanos lo hagan. Una conse-
cuencia directa es una casi total ausencia del enzima, que necesita ser
suplementado por fuentes externas.
80
~·
"'O
~
60
ctS
"'O
·~
>
._,
•.-1 40
c.>
<!'.;
20
o---------'------------------------
60 65 70 75 80
Temperatura, QC
FIGURA 1. Estabilidades térmicas de enzimas amITolíticos. ~ , amilasa
bacteriana; x , amilasa cereal; o, amilasa fÚngica.
191
La primera etapa de la panificación, es el proceso de ferrner_i
tación. durante el cual la DI.. -amilasa cataliza la dextrinización de los
o 7,0 289
5 8,5 324
10 9, 9 362
20 14,9 416
- - - - ---------- - .
192
la temperatura del horno .
193
de su acción carecen de propiedades coloidales, lo que facilita una ráp_i
da sedimentación de las partículas formadoras de turbios que pueden
ser centrifugados o filtrados. De esta manera se obtiene la clarificación
del vino o del zumo de frutas. El término pectinasa se aplica a una pre
paración enzimática que contiene poligalacturonasa y pectinmetilesterasa,
obtenida a partir de varios hongos de los géneros Penicillium y A spergi-
llus.
194
del gluten, que es la responsable de las propiedades viscoelásticas de
la harina. La cantidad y calidad del gluten es el factor crítico que
determina la fuerza de una harina. Una al ta concentración proteica es
11
tá asociada normalmente con una harina de gran fuerza 11 , que tolera
un amasado prolongado. Esta propiedad puede modificarse con agentes
mejoran tes, tales como broma tos o peróxidos, que aumentan la fuerza
de la harina, o con agentes reductores, tales como cisteína y glutatión,que
ejercen el efecto opuesto. La acción de las proteasas es análoga a la
ejercida por los agentes reductores, ya que ambos disminuyen la visco
sidad de la harina. Esta disminución en la viscosidad ocasiona una dis
minución del tiempo de amasado para obtener la retención Óptima de
gas en la masa. Existe el peligro de que un ablandamiento excesivo
conduzca a una masa pegajosa, si la concentración de enzima es dema-
siado elevada.
195
semanas. Después de la resolución del "rigor mortis". que ocurre
inicialmente, existe un ablandamiento posterior debido a los enzimas
del mú aculo (ca tepsina s).
196
taninos con polipéptidos.También pueden participar carbohidratos y meta
les pesados. En líneas generales pueden distinguirse dos etapas que
conducen a este tipo de forn1ación de turbios: 1) la polimerización de
las moléculas de tanino y 2) la reacción entre estos polímeros y las mo
léculas polipeptÍdicas. Se cree que el proceso es análogo al que ocurre
en el curtido de las pieles.
I I
ButÍrico Caproico Capr:Úico Caprico Laurico
Fuente y mayor
198
carbono, con la producción del consiguiente aroma característico de la
leche de cabra que es el de los quesos italianos. Se ha demostrado que
la concentración de butÍrico es crítica para la producción del sabor
característico en quesos Romano y Provolone.. En el queso de Roquefort,
el hongo implicado Penicillium roquefortii, produce una lipasa hidroso-
luble que hidroliza la grasa de la leche produciendo fundamentalmente
ácidos caproico, caprílico y cáprico.
199
glucosa oxidasa
' o
FAD
7"'\
lactonasa o
espontánea
CH 2 0H
OH
OH e'= O
ac. D-glucónico
200
de agua oxigenada añadida con10 preservativo, por ejemplo, en el trata
miento de la leche para la fabricación del queso.
A H2 + ROOH - - - A + H 20 + ROH
Se piensa que la peroxidasa está también implicada en el
deterioro oxidativo de verduras durante el almacenamiento. Este es un
enzima muy termoestable y se suele utilizar por ello como un indicador
de la efectividad del escaldado. Su actividad se reduce en un 50 o/o calen
tanda a 85Q C durante :32 minutos Ó a 145º C durante 24 segundos. El
inconveniente que presenta la peroxidasa como indicador de la efectivi-
dad de un tratamiento térmico, reside en el hecho de que se regenera
su actividad al cabo de cierto tiempo (desnaturalización reversible).
L-ascÓrbico + o2 dehidroascÓrbico + H 2 0 2
201
INACTIVACION DE ENZIMAS EN LA INDUSTRIA ALIMENTARIA
202
inactiva n1uchos enzimas tales corno fenolasa, lipoxidasa, clorofilasa y
ácido ascórbico oxidasa. La efectividad del escaldado se comprueba
por la ausencia de actividad peroxidásica, que es uno de los enzimas
más termoresistentes. Sin embargo, la peroxidasa puede renaturali-
zarse después de su inacti vación térmica, de modo que se han propues
to otros enzimas como indicadores de aquélla (fenolasa, etc). El escal
dado es un pretratamiento esencial en frutas y verduras antes de su en
latado, congelado y deshidratación.
203
Inactivación por sustancias químicas. A pesar de que los
inhibidores de enzimas alimentarios son numerosos, sin embargo, el
tipo de inhibidor que se puede utilizar en un alimento está muy limitado
debido a problemas de toxicidad, aromas extraflos y economía. Los
métodos más frecuentemente usados son aplicación de calor, cambios
en valores de pH,o aplicación de S02 Ó sulfitos. Ciertos inhibidores
pueden ser eliminados después de la inactivación enzimática. Ya se ha
visto como el exceso de SO se quitaba aplicando vacío. El dietilpiro-
2
carbonato, utilizado como un preservativo del vino, aún cuando es muy
tóxico para la levadura, se hidroliza lentamente a etanol y dióxido de
carbono, sin dejar residuo tóxico alguno:
C 2H 5 -0-C0-0-CO-OC 2 H
5
+ H 20
204
Los enzimas industriales se suelen obtener en forma de con-
centrados parcialmente purificados a partir de tejidos vegetales o anim_!
les y a partir de microorganismos.
205
TABLA 4. Fuentes de enzimas corr1erciales
Fuente Enzima
ANIMAL
I
Pancreas porcino o bovino Pancreatina, Tripsina, Quimo
tripsina. Lipasa, 11(-Amilasa
,,.
Mucosa del estomago porcino Pepsina
Cuarto estómago de bóvidos jóvenes Renina
Hígado bovino Cata lasa
VEGETAL
Cebada malteada ol. ... y fi-A milasas
I
Látex de papaya Papa1na
Pifla Rromelaina
Látex de higo Ficina
HONGOS
ENZIMAS LIGADOS
207
zación utilizado. Uno de los primeros intentos de producir enzimas li
gados fué el de Nelson y Griffin en 1916, quienes adsorbieron invertasa
en carbón o alúmina y observaron que la preparación ligada aún exhib{a
cierta actividad. Bar-Eli y Katcjalski (1960), ligaron químicamente
tripsina a un copolÍmero de p-aminofenilalanina y encontraron que los
enzimas ligados eran más estables durante el almacenamiento que los
correspondientes enzimas libres. En 19 62, Manecke insolubilizaba la
alcohol deshidrogenasa.
Celulosa - CH 0H
2
+ ClCH 2 - COOH
l NaOH
l CH 3 0H
l N02 H
l H 2N-Enzima
208
Quimotripsina, ribonucleasa y galactosidasa han sido ligadas
por este tipo de procedimiento.
209
Impreso e11 la E.T.S. <le Ingenieros Agrónomo~ de Madrid.- Ciudad Universitaria· Madrid· 3
l.S.B.N. 84-500-7094-5
H-115/275 ·1 ~
..
7
-
UNIVERSIDAD POLITECNICA DE MADRID
111~~11~~0200672764
m11~Hm1~ H