Estructura de Ácidos Nucleicos

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DEL
M AT E R I A L G E N É T I C O
UNIDAD I
LOGROS DE APRENDIZAJE
ESPERADOS
Estructura ácidos Organización Bases moleculares

nucleicos genómica de la mutación
Diferenciar según su Enunciar y estudiar Relacionar mediante

secuencia y parámetros experimentalmente o dar ejemplos entre los
analíticos entre ejemplos de organización fenómenos de mutagénesis
aislados de ADN y de genomas simples y y el tipo de mutaciones que
ARN. complejos. estos provocan
CÉLULAS Y GENOMAS
EL
M AT E R I A L
GENÉTICO
CÓDIGO GENÉTICO UNIVERSAL
ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS
SECUENCIA
• Nucleótidos • Funciones nucleótidos
• Monómeros de ác. 1. Constituyen ác. nucleicos
nucleicos 2. Garantizan intercambio
energético
• Azúcar, base
3. Señales químicas intra cel
nitrogenada, fosfato
4. Cofactores e intermediarios
• Sin fosfato nucleósido metabólicos
PENTOSAS
BASES NITROGENADAS
1. Bases
2. Hidrofobicidad y
coplanar
3. Tautomería
4. Absorción de luz
Adenina Guanina
ESTRUCTURA DNA
E L A P I L A M I E N TO D E L A S B A S E S ( ‘ S TAC K I N G ’ )
TA M B I É N C O N T R I B U Y E A DA R L E E S TA B I L I DA D A L A
E S T R U C T U R A
Interacciones en los surcos
A : Aceptor
·D : Donador
·H : No polar
·M : Grupo metilo
Cristalografía de Rayos X
Aportes importantes:
·Discriminación entre dos formas de ADN en
los cristales la ‘A’ y la ‘B’
·La imagen dejaba fuera de dudas la
naturaleza helicoidal de la molécula, el paso
de la hélice en 34 A y la distancia entre nt. =
3,4 A.
·Localización interna de los nucleótidos.
Modelo Helicoidal, con paso 3,4
A y 10 pb por vuelta.·Modelo
‘bases adentro’y ‘fosfatos
afuera’
·Dos cadenas antiparalelas
·Las cadenas se mantienen juntas

por puentes de hidrógeno
formados por A:T y G:C;
importancia de la configuración
ceto, y no enol, de las bases;
reglas de Chargaff
Los artículos de ‘Nature’
Nature, 25 Abril 1953 vol

171
Watson y Crick
Modelo de la estructura
del ADN, apareamiento
de bases, mecanismo
para la replicación.
Wilkins, Stokes y Wilson
Evidenciade 2 cadenas,
y espaciamiento a 3,4 A.
También
reproducibilidad del
patrón en diferentes
muestras.
Franklin y Gosling
·Evidencia de 2 cadenas
y espaciamiento a 3,4 A.
Podrian ser 10 pb por
vuelta.
Importancia del modelo de doble hélice
·Forma de replicación
Basada en la complementariedad de las bases
·Especificidad genética
Basada en las enormes posibilidades de variación
en la secuencia
·Mecanismo para la mutación

Basado en las posibles formas de apareamiento no
‘estándar’ entre las bases.
· Punto singular en el desarrollo de la biología, en
particular de la biología molecular (considerado
revolucionario por Lederberg, Beadle, Medawar,
Delbruck, etc).
·Se convirtió en un marco donde generar hipótesis

de trabajo contrastables para multiplicidad de
procesos celulares y moleculares (naturaleza del
gen, replicación, transcripción, regulación,
mutación)
ESTRUCTURA
DOBLE HÉLICE
DE ADN
• La estructura duplex del ADN es muy flexible, y su
habilidad para cambiar su organización es un factor
crucial en su función
• El número de bases por vuelta no es fijo
• La doble hebra se puede superenrrollar.
• El ADN puede ser temporalmente separado en sus
dos hebras componentes.
• EL ADN puede ser denaturado y renaturado, involucra
la separación de las dos hebras por la ruptura de los
puentes H entre las bases, se puede inducir con calor
o a bajas cantidades de sales.
Trabajo colaborativo N°1

Mapa conceptual
Efecto hipercrómico, las bases al
estar separadas aumentan su
absorción a 260 nm
• 3) mononucleotidos
• 2) DNA enrollado al azar
• 1) DNA helicoidal
M O N I T O R E O D E L A
D E S N A T U R A L I Z A C I Ó N / R E N A T U R A L I Z A C I Ó N
“ A B S O R B A N C I A ”
Desnaturalización DNA se sigue por
aumento de DO260 y se describe por
la Tm
Cada especie tiene Tm característico
Tm aumenta 0,4°C por cada 1% mas de GC

DNA 40% GC DNA 60% GC
Tm 87°C Tm 95°C Δ = 20% → 20 x 0,4°C = 8°C
Dependencia de la desnaturalización térmica del ADN de
D. pneumoniae respecto a la fuerza iónica. pH 7,0
Dependencia de la desnaturalización respecto al
contenido en GC y la concentración salina
Los genomas contienen entre un 40 y un
60% de G-C, lo que implica que la Tm se
mueve entre 85 y 95°C.
Para oligonucleotidos (fragmentos cortos)
Para oligonucleótidos largos se debe

considerar su longitud (L) y la
concentración de cationes monovalentes
(M)
Basándose en múltiples estudios de la densidad de los ADNs de diferentes
organismos y de su composición en bases nitrogenadas, se ha establecido
una fórmula empírica que relaciona la densidad de flotación (ρ) con el
contenido en G+C expresado en moles por ciento.
Está fórmula es la siguiente: ρ = 1,660 + 0,00098(G+C).

Meselson y col. (1957) desarrollaron una técnica de centrifugación en gradiente de densidad. Cuando se centrifuga a alta velocidad un
solución densa (saturada) de un soluto de bajo peso molecular (ClCs 7,7 M, sacarosa, etc.) se produce un equilibrio entre dos fuerzas
opuestas, la de difusión del soluto y la fuerza de sedimentación, como consecuencia se produce un gradiente de densidad que aumenta
en la dirección de la fuerza centrifuga (aumenta a medida que avanzamos hacia el fondo del tubo de centrifuga).
Basándose en múltiples estudios de la densidad de los ADNs de diferentes organismos y de su composición en
bases nitrogenadas, se ha establecido una fórmula empírica que relaciona la densidad de flotación (ρ) con el
contenido en G+C expresado en moles por ciento.
Está fórmula es la siguiente: ρ = 1,660 + 0,00098(G+C).

• La denaturación del
ADN es un proceso
reversible…
Renaturación…
“annealing”
•
• La propiedad de
desnaturalización-
renaturalización del ADN
es crucial para la biología
molecular… PCR!
CONFORMACIONES DEL
ADN DOBLE HEBRA
ESTRUCTURA ADN
• B-ADN representa la estructura general del ADN en las condiciones
celulares. Dextrógira
• A-ADN más parecida a la conformación doble hebra del ARN. Tiene
más bases por vuelta. El surco mayor es más profundo. Dextrógira
• C-ADN Se puede inducir al ADN para que tome esta forma en
condiciones particulares, como humedad relativamente baja y la
presencia de ciertos iones , como Li + o Mg 2+ , pero el ADN en forma C
no es muy estable y no ocurre naturalmente en los organismos vivos.
• Z-ADN. Conformación levógira del ADN. Tiene aún más bases por vuelta
y menos giro. El esqueleto azúcar fosfato describe una forma en zigzag.
Probablemente esta conformación no se genere in vivo.
A por Artificial (ARN-ADN)
https://www.asturnatura.com/articulos/nucleotidos- B por bicatenario?
acido-nucleico-adn/variaciones-estructura-dna.php C por semicristalino
Z por zig-zag
DNA SUPERENROLLADO
El dúplex es girado en el espacio sobre su

propio eje.
Solo en moléculas cerradas (circulares).
Molécula relajada cuando no hay torsión en
ella.
Si un enlace se corta la molécula se desenrolla.
https://biomodel.uah.es/an/super/3naturaleza.htm
http://www.biorom.uma.es/contenido/av_bma/apuntes/t3/superenrr.html
PROPORCIÓN DE
BASES NITROGENADAS
REGLAS DE CHARGAFF
H T T P S : / / P E N D I E N T E D E M I G R A C I O N . U C M . E S / I N F O / G E N E T I C A /
G R U P O D / E S T R U A D N / E S T R U A D N . H T M
REGLAS DE CHARGAFF PARA ADN DOBLE HEBRA
• La proporción de Adenina (A) es igual a la de Timina (T). A = T .

La relación entre Adenina y Timina es igual a la unidad (A/T = 1).
• La proporción de Guanina (G) es igual a la de Citosina (C). G= C.

La relación entre Guanina y Citosina es igual a la unidad ( G/C=1).
• La proporción de bases púricas (A+G) es igual a la de las bases pirimidínicas (T+C). (A+G) = (T + C).
La relación entre (A+G) y (T+C) es igual a la unidad (A+G)/(T+C)=1.
• Sin embargo, la proporción entre (A+T) y (G+C) era característica de cada organismo, pudiendo
tomar por tanto, diferentes valores según la especie estudiada.
Este resultado indicaba que los ácidos nucleicos no eran la repetición monótona de un tetranucleótido.
Existía variabilidad en la composición de bases nitrogenadas.
Demostró que las proporciones de las bases
nitrogenadas eran diferentes en los distintos
organismos.
Estas proporciones no cambian para los individuos de

la misma especie y no guardan relación con la edad,
estado nutricional o variaciones del entorno.
Por lo tanto, la composición del DNA es

característica de cada especie.
Procedencia del ADN A G C T 5-Me-C DISCUTA LA CORRELACIÓN
Timo de Bovino 28,2 21,5 21,2 27,8 1,3 SEGÚN CRITERIOS LAS RC
Esperma de bovino 28,7 22,2 20,7 27,3 1,3
Germen de trigo 27,3 22,7 16,8 27,1 6,0
Saccharomyces 31,3 18,7 17,1 32,9 -
Escherichia coli 26,0 24,9 25,2 23,9 -
Mycobacterium tuberculosis 15,1 34,9 35,4 14,6 -
ØX174 24,3 24,5 18,2 32,3 -

T3 23,7 26,2 27,7 23,5 -
T5 30,3 19,5 19,5 30,8 -
T7 32,4 18,3 32,4 17,0 HMC
Virus ARN A G C U
Mosaico del tabaco (TMV) 29,8 25,4 18,5 26,3
Mosaico amarillo nabo 22,6 17,2 38,0 22,2

Poliomielitis 28,6 24,0 22,0 25,4
Encéfalo miocarditis del ratón 27,3 23,5 23,2 25,9
Reovirus Tipo 3 28,0 22,3 22,0 27,9

Tumor de las heridas 31,1 18,6 19,1 31,3
Todos los ADN estudiados cumplen la relación A=T
y G=C, excepto el ADN del bacteriofago ØX174. El
ADN de este virus es de una sola hélice.
En los virus ARN no se cumple la equimolaridad de

las bases excepto en el caso del virus del Tumor de las
heridas y de los Reovirus que tienen ARN de doble
hélice. En estos virus se cumple que A=U y G=C,
además se cumple que A+G/U+C=1.
El fago T2 y los otros fagos T-pares (T4 y T6) en vez

de citosina tienen hidroximetil-citosina (HMC).
Algunos organismos tiene en su ADN una pequeña

proporción de 5-metil-citosina (5-Me-C) que sustituye
a la citosina.
Organismo Tejido A+T/G+C
Escherichia coli - 1,00
Diplococcus pneumoniae - 1,59
Mycobacterium tuberculosis - 0,42
Levadura - 1,79 La proporción A+T/G+C es específica de
cada organismo y guarda relación con las
Paracentrolus lividus (erizo mar) Esperma 1,85 propiedades físico- químicas de los ácidos
Arenque Esperma 1,23 nucleicos ( la densidad y la temperatura de
Rata Médula ósea 1,33 fusión-Tm)
Hombre Timo 1,52
Hombre Hígado 1,53
Hombre Esperma 1,52
1. Indique a qué tipo de acido nucleico corresponde
2. Escriba la secuencia complementaria a la hebra de ADN indicada en a
3. Escriba la secuencia de ARN complementaria
4. El ADN presente en una determinada especie bacteriana posee, sobre el total de

bases nitrogenadas, un 18% de citosina. Calcula el porcentaje de las restantes bases
nitrogenadas presentes en el genoma bacteriano

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ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DEL

Estructura ácidos Organización Bases moleculares

Diferenciar según su Enunciar y estudiar Relacionar mediante

·Dos cadenas antiparalelas

·Las cadenas se mantienen juntas

Nature, 25 Abril 1953 vol

·Mecanismo para la mutación

·Se convirtió en un marco donde generar hipótesis

Trabajo colaborativo N°1

• 2) DNA enrollado al azar

Tm aumenta 0,4°C por cada 1% mas de GC

Para oligonucleotidos (fragmentos cortos)

Para oligonucleótidos largos se debe

Está fórmula es la siguiente: ρ = 1,660 + 0,00098(G+C).

Está fórmula es la siguiente: ρ = 1,660 + 0,00098(G+C).

El dúplex es girado en el espacio sobre su

• La proporción de Adenina (A) es igual a la de Timina (T). A = T .

• La proporción de Guanina (G) es igual a la de Citosina (C). G= C.

Estas proporciones no cambian para los individuos de

Por lo tanto, la composición del DNA es

Mycobacterium tuberculosis 15,1 34,9 35,4 14,6 -

ØX174 24,3 24,5 18,2 32,3 -

T7 32,4 18,3 32,4 17,0 HMC

Mosaico del tabaco (TMV) 29,8 25,4 18,5 26,3

Mosaico amarillo nabo 22,6 17,2 38,0 22,2

Encéfalo miocarditis del ratón 27,3 23,5 23,2 25,9

Reovirus Tipo 3 28,0 22,3 22,0 27,9

En los virus ARN no se cumple la equimolaridad de

El fago T2 y los otros fagos T-pares (T4 y T6) en vez

Algunos organismos tiene en su ADN una pequeña

2. Escriba la secuencia complementaria a la hebra de ADN indicada en a

3. Escriba la secuencia de ARN complementaria

4. El ADN presente en una determinada especie bacteriana posee, sobre el total de

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