Bioquima y Sus Partes

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A. Macías Alvia et al.

CAPÍTULO I: BIOMOLÉCULAS Y CÉLULAS


Aida Macías Alvia. M.Sc.
Universidad Estatal del Sur de Manabí
Janeth Reina Hurtado Astudillo. Ph. D.
Universidad Técnica de Babahoyo
Dolores Mirella Cedeño Holguín. M.Sc.
Universidad Estatal del Sur de Manabí
1.1. Introducción
1.1.1. Bioquímica, definición y su objeto
La Bioquímica constituye una disciplina que junto con la Química Orgánica que
permiten o facilitan sentar las bases para la comprensión de los fenómenos que
ocurren en los microorganismos y su papel en las los procesos bioquímicos.
La Bioquímica es una de las disciplinas que mayor desarrollo ha alcanzado en el siglo
XX. La labor de los bioquímicos en técnicas tan importantes como la nutrición, el
control de enfermedades y la protección de cosechas, ha proporcionado aportes
importantes en la tarea de alimentar a la población mundial, Además, el elevado
desarrollo científico alcanzado por la bioquímica en los últimos años ha contribuido
a aumentar los conocimientos acerca de las bases químicas de la vida.
El prefijo bio procede de bios, término griego que significa “vida”. Su objetivo
principal es el conocimiento de la estructura y comportamiento de las moléculas
biológicas, que son compuestos de carbono que forman las diversas partes de la
célula y llevan a cabo las reacciones químicas que le permiten crecer, alimentarse,
reproducirse y usar y almacenar energía.
La sustancia compleja denominada protoplasma representa la materia viva, y desde el
punto de vista de su composición química, no es posible distinguir sus diferencias con
la materia inanimada. Sin embargo, en el protoplasma ocurren reacciones químicas
que tienen como finalidad modificar sustancias que llegan a él como resultado de
su intercambio constante con el exterior. En virtud de este intercambio y de las
transformaciones, el protoplasma manifiesta la actividad vital que caracteriza a los
organismos vivos y los diferencia de la materia inanimada. Como bien expresa el
materialismo dialéctico, la vida es de naturaleza material, es una forma especial del
movimiento de la materia y se origina y se destruye siguiendo determinadas leyes.
No es, sin embargo, una propiedad inherente a toda la materia en general; carecen
de ella los objetos del mundo inorgánico. La materia, en su constante movimiento,
asciende a peldaños superiores que determinan formas de movimiento cada vez
más complejas, por lo tanto, la vida constituye una forma superior de movimiento
de la materia, un determinado nivel de su desarrollo histórico caracterizado por el
surgimiento de esa nueva cualidad.
El objetivo que persigue la asignatura es propiciar los conocimientos básicos que
le permitan a los estudiantes que se forman como Ingenieros Agrónomos, aplicar
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Introducción al estudio de la bioquímica

a un nivel productivo, los principios y los conceptos básicos del metabolismo así
como la cinética enzimática de las biomoléculas a los procesos biotecnológicos y
de la industria alimentaria, para predecir las posibles causas de contaminación de
productos, disminución de rendimiento durante la biosíntesis de sustancias activas,
etc.
1.2. Partes de la bioquímica
Para penetrar en la esencia de los procesos vitales (fenómenos bioquímicos), es
condición necesaria el conocimiento de la composición química de los organismos
y de las características químicas de las sustancias que los constituyen. Del estudio
de las diversas sustancias que componen la materia viva, se ocupa una parte de la
bioquímica que recibe el nombre de bioquímica estática. Este estudio también es
objetivo de la química de los productos naturales. Pero la tarea más específica de la
bioquímica consiste en investigar las transformaciones que ocurren en las sustancias,
desde el momento de su entrada en el organismo hasta su devolución al exterior
como productos finales innecesarios. Por otra parte la bioquímica dinámica es el
conjunto de todas estas transformaciones, de complicadas cadenas de reacciones
de síntesis y de degradación que es el metabolismo, que representa el objeto de
estudio del aspecto más importante de la bioquímica:
Todas las reacciones bioquímicas son aceleradas catalíticamente por sustancias de
naturaleza protéica. Los biocatalizadores (Enzimas) son indispensables para la vida,
se encuentran presentes en todas las células y actúan en cantidades mínimas. Son
sustancias específicas y es característico de ellos actuar bajo condiciones fisiológicas
específicas de temperatura, presión, acidez y otros factores presentes en los
organismos vivos. Puede decirse que el estudio del metabolismo es una ampliación
del estudio de las enzimas y que es fundamental conocer sus mecanismos de
reacción para la plena comprensión de los procesos vitales.
El análisis de la naturaleza química de los enzimas y el mecanismo de su actividad es
el objeto de estudio de una parte importante de la bioquímica dinámica denominada
enzimología. El desarrollo de la enzimología está íntimamente relacionado con los
progresos de la química de las proteínas y de la química-física. Si se mezclan en
forma arbitraria todos los componentes de la materia viva: proteínas, carbohidratos,
ácidos nucleicos, lípidos, etc., más otras sustancias también indispensables a la
materia viva como son los ácidos inorgánicos, el agua y las sales minerales, no se
obtendría materia viva, toda vez que en esta mezcla se producirían reacciones
químicas desordenadas y violentas que llegarían a detenerse. Esto indica que la vida
está caracterizada no sólo por una composición química definida, sino también por
una estructura igualmente determinada.

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1.3. Composición química de los organismos bióticos


1.3.1. La célula
El descubrimiento de la célula es una consecuencia directa del desarrollo de las
lentes de aumento por Robert Hooke (1665), quien observó la estructura del corcho
mediante estas lentes. Grew y Malpihi repitieron estas observaciones en animales
vivos donde reconocieron ciertas cavidades en la pared celular.
Fue Leeuwenhoek (1674) quien con sus investigaciones reconoció la existencia de
células aisladas, así como cierto nivel de organización en estas, especialmente el
núcleo de ciertos eritrocitos. Sin embargo, estas investigaciones permanecieron
estacionarias por más de 100 años hasta que Schwann (1839) y Schleiden (1838)
plantearon la teoría celular, la cual representa la importante generalización de
que todos los seres vivientes están compuestos por células y productos celulares.
Como consecuencia de esta teoría, quedó establecido que cada célula se forma
por división de otra: más tarde el progreso de la bioquímica demostró que existen
semejanzas fundamentales en la composición química y actividades metabólicas de
cada célula, reconociéndose además que el funcionamiento de un organismo como
una unidad es el resultado de las actividades e interacciones de todas las células que
lo constituyen.
La célula representa, por tanto, la unidad funcional y estructurada de todo ser vivo,
definiéndose como un sistema abierto isotérmico que se ensambla, ajusta y perpetúa
por si misma. El sistema está constituido por reacciones orgánicas consecutivas y
ligadas, promovidas por catalizadores producidos por la propia célula. La célula
representa la forma avanzada del desarrollo de la materia en el universo.
Componentes químicos de la célula
El análisis químico de las sustancias que integran la población molecular de las
células demuestra la presencia de componentes orgánicos e inorgánicos según se
muestra en la siguiente tabla.
Tabla 1. Porcentaje relativo de componentes químicos presentes en la célula viva.
Componentes %
Inorgánicos
Agua 75-85
Sales e iones minerales 1
Orgánicos
Proteínas 10-20
Lípidos 2-3
Carbohidratos 1
Ácidos nucléicos y otros 1
Como puede observarse en la Tabla 1, el agua representa el constituyente más
abundante de las células y en general de los organismos vivos, siguiéndole en orden
de importancia cuantitativa las proteínas, por ser constituyentes importantes en la
mayoría de las estructuras celulares (orgánulos. membranas. etcétera).

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Componentes inorgánicos
AGUA
Representa el componente más abundante en la célula. Una parte del agua se
encuentra libre (aproximadamente 95 % del total) el resto, en forma combinada. El
agua libre no se encuentra asociada a ningún componente celular y representa el
medio líquido de transporte en la célula. El agua combinada aparece solo unida a las
proteínas mediante puentes de hidrógeno y muy particularmente se une a los grupos
positivos y negativos de los aminoácidos (actúa como un dipolo), orientándose
según las cargas de estos en una proporción aproximada de 2 a 6 moléculas de agua
por cada grupo amino. La distribución de agua en los organismos varía con la edad,
naturaleza de la célula y actividad metabólica en los vegetales influyen grandemente
el medio y la especie vegetal. En la célula, las funciones del agua se derivan, en
esencia, de sus propiedades fisicoquímicas, entre ellas: su calor especifico, calores
latentes de vaporización y fusión, constante dieléctrica, poder disolvente. Entre sus
funciones más notables pueden citarse:
1. Es un componente estructural celular: en las membranas representa
30-40 %: en mitocondrias y cloroplastos no menos de 60 %.
2. Interviene en el mantenimiento y forma estructural de la célula.
3. Representa el medio dispersante del contenido protoplasmático: es
el disolvente por excelencia de los componentes solubles.
4. Contribuye al transporte de metabolitos residuales y al movimiento
y distribución de sales e iones minerales dentro de la célula.
5. Participa activamente en reacciones metabólicas, por ejemplo,
en las reacciones de hidrólisis provoca el desdoblamiento de
componentes complejos en otros más sencillos: en la fotosíntesis
aporta los electrones necesarios para que se realice el proceso,
y en la cadena respiratoria también cede electrones para que se
produzca la reducción del oxigeno.
6. Es un factor importante en el rendimiento celular, pues forma parte
de estructuras celulares, y además, la masa protoplasmática celular
presenta el mayor porcentaje de agua con respecto al resto de los
componentes celulares: por esta razón las células, para llegar a su
estado adulto, deben incorporar agua a su interior a medida que se
desarrollan, para adquirir su volumen final. Es preciso destacar que
alcanzar su volumen final no implica que la célula deje de incorporar
agua: este proceso continúa, pero regulándose la plasmolisis por la
concentración salina interior.
7. Presenta acción termorreguladora, ya que permite la regulación de
la temperatura en el interior de la célula.

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SALES E IONES MINERALES


La presencia y cantidad de iones minerales es muy variable en los diferentes tipos
de células por ejemplo Fe, Cu, Mn y Zn se encuentran en muy pequeñas cantidades
(microelementos), mientras que otros como CI, Na, K, P y Mg son necesarios en mayor
proporción (macroelementos) iones minerales en los diferentes tipos de células
tienen una importancia relativa: el magnesio por ejemplo, tiene gran importancia en
las células de los vegetales fotosintetizadores, sin embargo, en las células animales
es menos importante, aunque tiene función destacada en la activación enzimática.
Funciones. Las funciones de las sales e iones minerales más importantes son las
siguientes:
1. Contribuyen al equilibrio ácido-base, CO32─ PO43─ .
2. Contribuyen a mantener la presión osmótica celular.
3. Tienen participación en la biocatálisis actuando como activadores
enzimáticos, como grupos prostéticos de enzimas, etcétera.
4. Presentan función estructural; forman parte de tejidos y líquidos
celulares, por ejemplo, el Ca participa en la estructura del tejido
óseo, el Fe en la hemoglobina de la sangre y el Mg en la clorofila.
5. Participan en los mecanismos de transporte de energía.
6. Participan en los procesos de transporte activo a través de las
membranas.
Componentes orgánicos
Como componentes orgánicos más importantes y abundantes en las células se
encuentran las proteínas, los lípidos, los carbohidratos y los ácidos nucleicos.
También, menos abundantes, pero no por ello menos importantes, están las
hormonas y las vitaminas.
PROTEÍNAS
Representan las moléculas orgánicas más abundantes en el interior de la célula, pues
constituyen alrededor del 50 % o más, de su peso seco. Son fundamentales en todos
los aspectos de la estructura celular y de sus funciones, puesto que constituyen los
instrumentos moleculares mediante los cuales se expresa la información genética.
Las proteínas son macromoléculas de elevado peso molecular, pero al efectuarse la
hidrólisis ácida de estas, se obtienen una serie de compuestos orgánicos sencillos de
bajo peso molecular: los α-aminoácidos, los cuales difieren entre si en la estructura
de sus grupos R o cadenas laterales. Por lo común, solamente se encuentran veinte
aminoácidos diferentes, de los 170 conocidos, como sillares estructurales de las
proteínas presentes en los organismos superiores.
En las moléculas proteicas, los aminoácidos se unen entre sí mediante enlaces
peptídicos. Tomando como base su composición, las proteínas se dividen en dos
clases principales: proteínas simples y proteínas conjugadas.

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Proteínas simples. Son proteínas que por hidrólisis producen solamente aminoácidos
sin ningún otro componente principal orgánico o inorgánico. Habitualmente
contienen:
Carbono 50%
Hidrógeno 7%
Oxígeno 23%
Nitrógeno 16%
Azufre 0-3%
Proteínas conjugadas. Son proteínas que por hidrólisis no sólo producen
aminoácidos, sino también otros componentes orgánicos e inorgánicos. A la porción
no aminoácida de una proteína conjugada se le denomina grupo prostético y de
acuerdo con la naturaleza química del grupo prostético pueden ser:
Nucleoproteínas ácidos nucleicos
Lipoproteínas lípidos
Glucoproteínas glúcidos
Metaloproteínas metales: Fe. Cu. Etcétera.
Funciones. Entre las funciones más destacadas de las proteínas pueden citarse:
1. Tienen función estructural (proteínas en membranas etc.).
2. Funcionan como biocatalizadores (enzimas).
3. Constituyen reserva de materiales nutritivos (proteínas) Actúan
como vehículo de transporte (hemoglobina, seroalbúmina).
4. Presentan función protectora o inmunológica (globulinas).
5. Presentan función reguladora (hormonas).
ÁCIDOS NUCLEICOS
Representan estructuras moleculares de gran importancia en las células, por cuanto
participan directamente en la transmisión y codificación de la información genética.
La hidrólisis de los ácidos nucleicos muestra que en la composición de estos se
encuentran:
1. Azúcares del tipo de las pentosas: ribosa y desoxirribosa.
2. Bases orgánicas heterocíclicas: púricas y pirimidinicas.
3. Ácido fosfórico.
La unión a través de un enlace N-glicosídico de la base nitrogenada heterocíclica
con la pentosa conforma la estructura denominada nucleósido. Denominándosele
nucleótido a la estructura del nucleósido que presente esterificación en la posición
2’ o 3’ de la pentosa por el ácido fosfórico.
La unión de los diferentes nucleótidos a través de enlaces esterfosfóricos 3’, 5’ entre
las pentosas de los nucleótidos, conforma los ácidos nucleicos, los cuales resultan
ser, por tanto, polímeros de nucleótidos. La célula presenta dos clases de ácidos
nucleicos: El ácido desoxiribonucléico (ADN) y el ácido rubonucléico (ARN).

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Funciones. Estos polímeros tienen como función la síntesis de las proteínas. El ADN
se localiza en el núcleo celular fundamentalmente y posee la codificación genética
de la célula. Actúa como herramienta molecular mediante la cual se expresa la
información genética. El ARN es sintetizado en el núcleo por el ADN, se localiza
fundamentalmente en el citoplasma celular y participa en la biosíntesis de proteínas
en los ribosomas. Se conocen tres tipos de ARN: el ARN mensajero, el ARN de
transferencia y el ARN ribosomal, cada uno de los cuales tiene su característica y
función específica en el mecanismo de la biosíntesis proteica. Se ha determinado
recientemente la presencia de ácidos nucleicos del tipo ARN y del tipo ADN en
orgánulos celulares como mitocondrias y cloroplastos, lo que hace suponer una
cierta independencia en los procesos de reproducción de estos orgánulos.
CARBOHIDRATOS
Los carbohidratos representan otro de los componentes orgánicos de gran
abundancia e importancia celular. Su estructura química indica que estas sustancias
son polihidroxialdehidos y polihidroxicetonas cuya fórmula general es (CH2O)n.
Se clasifican, de acuerdo con el número de unidades monoméricas de que estén
constituidos, en monosacáridos o azúcares simples, oligosacáridos y polisacáridos.
Entre los monosacáridos el más abundante es la glucosa, la que representa un
metabolito muy importante en los animales para la obtención de energía química y
para la formación de sustancias de reserva, que en los animales está representada
por la molécula de glucógeno. En las plantas, la glucosa se polimeriza para formar el
polisacárido almidón, el cual representa la sustancia de reserva principal en raíces,
frutos y tubérculos. El almidón está conformado químicamente por unidades glucosa
unidas por enlaces α – l,4 glucosídicos y α – 1.6 glucosidicos, lo que permite que esta
molécula presente ramificaciones en su estructura.
Funciones. Los carbohidratos presentan las siguientes funciones biológicas:
1. Energética: porque constituyen por su abundancia, el combustible
celular por excelencia.
2. Estructural: pues se encuentran formando parte estructural de las
membranas celulares.
3. Reserva: porque se encuentran almacenadas en forma de polímeros
en animales y plantas cuyos componentes principales son el
glucógeno y el almidón respectivamente.
4. Sostén y protección: pues en los vegetales, los carbohidratos
forman estructuras poliméricas, por ejemplo, la celulosa, que forma
la pared celular que recubre las células vegetales, constituyendo
dicha pared celular un elemento importante corno sostén en el
vegetal.

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LÍPIDOS
Bajo la denominación de lípidos se conoce todo un conjunto de sustancias
estructuralmente heterogéneas, las cuales pueden ser extraídas de tejidos vegetales
o animales al ser tratados con disolventes orgánicos apolares.
Los lípidos se clasifican como simples, entre los que se encuentran las grasas neutras
formadas por la unión entre la glicerina y los ácidos grasos y complejos entre los que
se incluyen los esteroides las lecitinas y otros.
De las grasas neutras estudiaremos uno de sus componentes principales: los ácidos
grasos aunque sólo aparecen en trazas en la célula. Los ácidos grasos revisten
gran importancia porque constituyen los sillares estructurales de diferentes tipos
de lípidos. Estos ácidos grasos pueden ser saturados o insaturados la mayoría de
los que están presentes en plantas y animales poseen un número par de átomos
de carbono, siendo los más abundantes los de 16 y 18 carbonos (C16 palmítico. C18
esteárico).
Los ácidos grasos insaturados predominan en las grasas neutras de ciertas especies,
presentándose con más frecuencia la insaturación entre los carbonos 9 y 10. Como
ejemplo de ácido graso insaturado tenemos el ácido oléico C17H33COOH.
Los ácidos grasos presentes en las grasas neutras pueden ser iguales o diferentes,
ocupando posiciones variables con respecto al grupo hidróxilo que esterifiquen, de
manera que podrá presentarse gran diversidad de triacilglicéridos.
Los triacilglicéridos son los componentes principales, en los depósitos de grasas en
células animales y vegetales: los más abundantes resultan ser: tripalmitilglicérido,
triestearilglicérido y trioleilglicérido.
Funciones. Entre las principales funciones de los lípidos están las siguientes:
1. Constituyen componentes estructurales de membranas, pues
conjuntamente con las proteínas forman la llamada membrana
unidad lipoprotéica en todos los sistemas membranosos celulares.
2. Son material energético celular, porque estas sustancias presentan
un gran contenido energético por su estado reducido.
3. Constituyen sustancias de reserva. Los lípidos se almacenan en
tejidos y semillas, por ejemplo, en el tejido adiposo y en las grasas
vegetales.
4. Tienen función protectora. Están presentes en:
• paredes celulares de bacterias y plantas,
• exoesqueleto de insectos,
• piel de vertebrados.

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1.3. Jerarquía molecular de las estructuras celulares.


Características de los organismos bióticos
Las Biomoléculas son los compuestos orgánicos simples de los cuales están formados
todos los organismos, propios solamente del mundo viviente y en las condiciones
actuales del planeta, son el resultado de la actividad biológica. Estos compuestos
llamados biomoléculas, juegan el papel de bloques constructores en la formación de
estructuras biológicas.
Estas biomoléculas tienen gran diversidad funcional, así las hay que cumplen
funciones de transporte, componentes estructurales, metabolitos intermedios,
protección, biocatalizadores, nutrientes energéticos, entre otros.
Jerarquía molecular:
La célula. Es la unidad mínima de un organismo capaz de actuar de manera autónoma.
Si la célula se descompone en moléculas individuales y después se ubican según su
grado de complejidad, se obtiene una escala peculiar de organización de la célula.
Tabla 2. Organización jerárquica de la célula.
Célula
MM: Masa molar MM: 1012 -1015

Núcleo,
mitocondrias,
Orgánulos lisosomas,
MM:1011-1013 Cloroplastos

Complejos
Estructuras enzimáticos,
supramoleculares ribosomas
MM: 106-1010 Sistemas
contráctiles
Macromoléculas Polisacáridos
complejas
MM:103-106 Ácidos Nucleicos Proteínas Lípidos
Monómeros
biológicos
Sillares Nucleótidos Aminoácidos Monosacáridos Ácidos grasos
estructurales Glicerina
MM: 100-350
Compuestos
químicos
intermedios Piruvato Citrato Malato Gliceraldehido
MM: 50 - 250 3 - fosfato

Precursores del
entorno CO2, N2, NH3, H2O,
MM: 18 - 44 O2 KPO4,

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La estructura de la célula
Una de las diferencias más importantes entre las células procariontes y eucariontes
está relacionada con los elementos membranosos derivados de la membrana
citoplasmática. De esta como una consecuencia directa del grado de jerarquización de
las diferentes moléculas que integran la célula, se derivan un conjunto de estructuras
(perfectamente definidas en las células eucariontes) que, presentes y constantes,
permiten a la célula el desarrollo funcional que caracteriza a la materia viva.
Al estudiar la morfología celular con ayuda de técnicas especiales tales como la
polarización óptica la difracción de rayos X y la microscopia electrónica, se verá que
esta presenta los siguientes elementos:
1. Una membrana que la delimita llamada membrana celular.
2. Un medio dispersante, donde se encuentran inmersos diferentes
orgánulos celulares llamado citoplasma.
3. Una estructura especial dentro del conjunto de orgánulos presentes
en el citoplasma de tamaño variable (en dependencia del tipo de
célula) y estructura definida, llamada núcleo.
Las células procariontes no presentan una organización tan compleja en cuanto a su
morfología, pero sí es de destacar en estos la membrana celular, el citoplasma y el
núcleo, el cual presenta un cierto carácter difuso y no definido.

Célula vegetal

Célula animal

1.4. Metabolismo primario y metabolismo secundario. Estado


estacionario. Secuencias metabólicas
La dialéctica del desarrollo de la materia en el universo indica que su grado de
complejidad es variable, oscilando desde un grado de organización relativamente
simple hasta un grado de organización relativamente complejo, de forma tal que

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la integración en el grado de complejidad nos permite agrupar los elementos que


cumplan con la característica de responder a leyes naturales comunes en sistemas
naturales.
Es una característica primordial que en todos los sistemas se operen cambios y
transformaciones que conduzcan a su desarrollo, de manera que la materia estará
en constante transformación, desde la forma más simple a la más compleja, y
viceversa.
El análisis de la estructura celular muestra, a la luz del desarrollo actual de la ciencia,
que dicha estructura ha sido consecuencia de la jerarquía en la organización molecular
de la materia durante el proceso evolutivo de la Tierra, representando la célula, de
hecho, un sistema natural (biológico) en el que los cambios y transformaciones que
en ella ocurren reciben el nombre de metabolismo. El metabolismo representa, por
tanto, la forma de desarrollo del sistema biológico.
El metabolismo se define como el conjunto de procesos fisico-químico-fisiológicos
que ocurren en los organismos capaces de intercambiar sus componentes y energía
con el entorno, lo cual les permite su autoconservación y autorreproducción.
Representa la actividad celular altamente integrada y plagada de propósitos, en la
que participan muchos sistemas multienzimáticos con la finalidad de intercambiar
sustancias y energía con el entorno, y propiciar, por tanto, el desarrollo y la vida
celular.
Las funciones específicas del metabolismo son:
1. Obtener energía química del entorno, de los elementos orgánicos
nutritivos o de la luz solar.
2. Convertir los elementos nutritivos exógenos en los sillares de
construcción o precursores de los componentes macromoleculares
de las células.
3. Reunir los sillares moleculares para formar proteínas, ácidos
nucleicos, lípidos y otros componentes celulares.
4. Formar y degradar aquellas biomoléculas necesarias para las
funciones vitales.
El metabolismo como proceso presenta dos fases antagónicas, mutuamente
excluyentes, que reciben el nombre de catabolismo y anabolismo, las cuales
representan una manifestación, a nivel biológico, de la categoría filosófica de unidad
y lucha de contrarios.
El metabolismo puede dividirse también, para su mejor estudio en tres aspectos
diferentes pero íntimamente ligados:
• Catabolismo que es la suma de reacciones exergónicas que permiten
liberar la energía en los nutrientes o sustratos y ser acumulada en
forma de Adenosíntrifosfato (ATP) u otros compuestos.

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Las reacciones en esta fase son esencialmente degradantes:


grandes moléculas orgánicas se transforman en constituyentes más
simples. En el proceso degradante ocurren reacciones oxidativas,
en las que se desprende energía químicamente utilizable (ATP);
energía necesaria para: sostenimiento, multiplicación, crecimiento
y desarrollo del organismo, para el trabajo osmótico, mecánico,
generación de impulsos nerviosos, etcétera.
• Anfibolismo o metabolismo intermediario, que es el conjunto de
reacciones en que los productos de hidrólisis del catabolismo y
algunos nutrientes son transformados en ácidos orgánicos, esteres
fosfóricos y otros compuestos como aminoácidos.
• Anabolismo o metabolismo biosintético que es la parte del
metabolismo implicado en la síntesis de macromoléculas, tales
como: ácidos nucleicos, proteínas, sustancias de reserva y otros,
estas son todas reacciones endergónicas (que consumen energía).
Representa la fase constructiva del metabolismo. Se caracteriza por
presentar reacciones biosintéticas con la formación de estructuras
moleculares complejas a partir de estructuras más simples. El
anabolismo suele tener etapas reductoras y consume energía
potencial (ATP, NADH +H+ y otros).
En el siguiente esquema se pueden ver la integración de estos procesos.
Fuente Orgánica
Catabolismo Anfibolismo Anabolismo
de Energía
Procesos intermedios Biosíntesis de:
Degradación Glucosa – Fosfato Aminoácidos
Nutrientes oxidativa de los Fosfoenolpiruvato Ácidos nucléicos
nutrientes Piruvato Proteínas
Acetil CoA Sustancias de reserva
ATP
Se comprende de lo anteriormente expuesto, que el concepto de metabolismo como
proceso principal en la célula, se hace extensible al tejido, al órgano y al organismo
en su conjunto. El metabolismo está regulado, o sea, tiene sus mecanismos de
control, los que están dados por:
Factores intrínsecos (hereditarios)
a) síntesis de proteínas específicas;
b) genoma celular;
c) síntesis enzimática y regulación.
Factores extrínsecos (fisiológicos y ambientales)
a) factores determinantes del medio: concentración osmótica, pH y
otros;
b) nutrición y su influencia en la fisiología celular.

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Los citados mecanismos de control, considerados de conjunto, constituyen un


“todo” interconectado en tiempo y espacio. El metabolismo es una consecuencia
del equipo enzimático de que está dotada la célula.
INTERACCIÓN ENTRE EL CATABOLISMO Y EL ANABOLISMO
Se ha expresado en párrafos anteriores que las fases o procesos del metabolismo
ocurren de manera simultánea, no aisladas una de la otra, por lo que ambas están
relacionadas a través de una zona central del proceso que se caracteriza por reacciones
intermedias, a manera de diferentes vías metabólicas, las que al conectarse con las
reacciones que corresponden a las diferentes secuencias anabólicas y catabólicas,
integran el metabolismo intermediario.
El nexo del anabolismo con el catabolismo se manifiesta en tres niveles:
1. En lo referente a las fuentes carbonadas. Los productos del
catabolismo se transforman en sustrato de procesos anabólicos, a
causa de la interconversión de las reacciones que caracterizan a la
zona central.
2. En el suministro energético. El catabolismo produce energía química
en forma de ATP o compuestos fácilmente convertibles en este. El
anabolismo requiere energía o consumo de ATP.
3. En lo referente al poder reductor. El catabolismo es esencialmente
oxidativo. Consume poder oxidante y genera poder reductor. El
anabolismo es, esencialmente, un proceso reductivo, consumiendo
el poder reductor aportado por el catabolismo.
Tabla 3. Cuadro sinóptico.
Catabolismo Anabolismo
Degrada biomoléculas Fabrica biomoléculas
Produce energía (la almacena como ATP) Consume energía (usa las ATP)
Implica procesos de oxidación Implica procesos de reducción
Sus rutas son convergentes Sus rutas son divergentes
Ejemplos: glucólisis, ciclo de Krebs, Ejemplos: fotosíntesis, síntesis de
fermentaciones, cadena respiratoria proteínas
Secuencias metabólicas
Secuencia o ruta metabólica es un conjunto ordenado de reacciones en las que el
producto final de una reacción es el sustrato inicial de la siguiente (como la glucólisis
o glicólisis).
Mediante las distintas reacciones que se producen en una ruta un sustrato inicial
se transforma en un producto final, y los compuestos intermedios de la ruta se
denominan metabolitos. Todas estas reacciones están catalizadas por enzimas
específicas.

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Tipos de rutas metabólicas


Las rutas metabólicas pueden ser:
Lineales. Cuando el sustrato de la primera reacción (sustrato inicial de la ruta) es
diferente al producto final de la última reacción.
Cíclicas. Cuando el producto de la última reacción es el sustrato de la reacción inicial,
en estos casos el sustrato inicial de la ruta es un compuesto que se incorpora en la
primera reacción y el producto final de la ruta es algún compuesto que se forma en
alguna etapa intermedia y que sale de la ruta.
Frecuentemente los metabolitos o los productos finales de una ruta suelen ser
sustratos de reacciones de otras rutas, por lo que las rutas están enlazadas entre sí
formando redes metabólicas complejas.
Resumiendo las rutas metabólicas son un conjunto de reacciones que caracterizan
un proceso bioquímico determinado como pueden ser el metabolismo de los
carbohidratos llamada glucólisis, que puede ser anaeróbica: fermentación o
aeróbica respiración, también tenemos el metabolismo de lípidos o beta-oxidación,
o reacciones de las proteínas como la desaminación o descarboxilación, que
conducen al Ciclo de Krebs como proceso central del metabolismo que a su vez
conduce a la transferencia de electrones y a la Fosforilación oxidativa. La fotosíntesis
es la reacción por la cual las plantas proveen de energía a todos los seres vivos.
Transformaciones energéticas en las células vivas. La célula como sistema abierto
en estado estacionario
A un nivel superior de organización de la materia, la célula representa un sistema
biológico que funciona en estado estacionario. Este estado estacionario celular
representa el mantenimiento constante de las concentraciones de metabolitos
celulares, así como de las velocidades de transformación de estas en el tiempo.
Ello implicará que una célula pueda soportar “períodos de ayuno” en los cuales no
penetren nutrientes del entorno sin que se afecten sus funciones principales.
En las plantas y en los animales superiores, los procesos de nutrición y circulación
contribuyen a dotar a cada célula de los alimentos necesarios, pero estos procesos de
nutrición dependen de la composición del entorno celular, del pH, de la oxigenación,
de la temperatura, etc., de manera que los alimentos llegarán de forma irregular
en el tiempo a las diferentes células; sin embargo, a pesar de esta irregularidad,
ocurre que los procesos bioquímicos intracelulares deben ser capaces de adaptarse
al ritmo que demanda en cada momento el organismo en su conjunto, de forma que
dichos procesos tiendan a ocurrir a velocidad constante. Además, la composición
y estructura también tienden a permanecer constantes, lo que implica que a nivel
celular no exista un estado de equilibrio, sino un estado especial que constituye
un equilibrio dinámico y que recibe el nombre de estado estacionario, siendo, por
tanto, el estado estacionario el que caracteriza a los sistemas abiertos.
Veamos un ejemplo de cómo se manifiesta el estado estacionario en la célula:

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A. Macías Alvia et al.

Los alimentos y el 02 penetran en la célula constantemente; parte de la glucosa


satisface la demanda continua de componentes químicos y energía, y parte se
almacena como sustancia de reserva. En la figura se muestra cómo la composición
química y las velocidades de las reacciones tienden a mantenerse constantes,
adaptándose a los valores que demanda el funcionamiento de la célula en su
conjunto a cada instante, de manera que si el consumo, en cierto momento, es
mayor al suministro exterior, la célula moviliza las reservas y satisface una necesidad
funcional. Si por el contrario, el suministro externo es superior al consumo, la célula
acumula el excedente sin afectarse la velocidad y composición de las reacciones.

Figura 1. Esquema del estado estacionario de las células.


El proceso metabólico representa un conjunto de reacciones catalizadas por enzimas,
que conducen al rompimiento y a la estructuración continua e ininterrumpida
del esqueleto covalente de macromoléculas, asociado esto al consumo y
desprendimiento de energía.
1.5. Papel de las enzimas en el metabolismo. Regulación del
metabolismo
Los cambios químicos que se verifican en los seres vivos ofrecen la extraordinaria
particularidad de efectuarse, casi en su totalidad, por la acción activadora de
catalizadores específicos denominados enzimas.
No sólo se utilizan los catalizadores para activar aquellas reacciones que por su
naturaleza nunca se verificarían a velocidades lo suficientemente rápidas, sino que
también se utilizan para contener, aquellas otras reacciones que tienden a producirse
vigorosamente en las suaves condiciones que prevalecen en el medio celular.
Los enzimas pueden definirse como catalizadores orgánicos producidos en los seres
vivos y capaces de funcionar fuera de la célula u organismo que los producen.
Una parte importante del estudio de la bioquímica está, hoy día, dedicado a
las enzimas, puesto que todas las funciones fisiológicas, como por ejemplo la
contracción muscular, la conducción de los impulsos nerviosos, la excreción por el
riñón, la respiración, etc., están íntimamente unidas a la acción de las enzimas.

23 Volver al índice
Introducción al estudio de la bioquímica

Muchas de estas reacciones han sido estudiadas como sistemas aislados con enzimas
cristalinas puras, y por ello, la enzimología tiene como objetivo reproducir in vitro los
cambios que ocurren en los diferentes órganos, tejidos, etc., del organismo. Además,
desde el punto de vista de la clínica, el estudio de la actividad, inhibición o falta de
algunas enzimas, tiene gran importancia, pues, generalmente, las enfermedades
son consecuencia de un disturbio metabólico y no existe prácticamente en la célula
reacción alguna que no esté catalizada por las enzimas.
La actividad de las enzimas puede estar regulada a varios niveles:
1. Por factores externos como el pH, la temperatura T, la concentración
de sustrato [s], y la concentración de enzima [E].
2. Por acción de enzimas reguladores que se encuentran localizadas
al inicio de una secuencia metabólica determinada y reciben el
nombre de enzimas alostéricas o reguladoras y su actividad puede
estar determinada por la concentración en que se encuentre
el producto final, o el sustrato inicial de la secuencia metabólica
donde ellas participan. De forma general, estas enzimas regulan la
velocidad de la vía metabólica completa.
1.6. Transferencia de información
Como ya se explicó los ácidos nucleicos son responsables de la conservación
y transferencia de la información genética de los seres vivos garantizando su
funcionamiento, conservación y evolución en el tiempo.
Desde el punto de vista biológico, la expresión de la información genética de un
organismo y su transmisión entre generaciones es un proceso complejo en el que
interviene un gran número de proteínas y de mecanismos. Estos mecanismos
aseguran la fidelidad de la copia de la información desde el ADN al ARN para asegurar
la expresión, y del ADN a una nueva molécula de ADN para asegurar la transmisión.
Sin embargo, además de la traducción del ARN por los ribosomas, para que se
produzca una correcta expresión del mensaje genético ha de estar controlado el
momento de dicha expresión, ha de asegurarse que el mensaje (proteína) adquiera
la conformación correcta para su funcionamiento y se coloque en el lugar celular
correspondiente.
Desde el punto de vista biotecnológico, todos estos procesos son manipulables para
poder conseguir la expresión artificial de proteínas de interés industrial en procesos
llevados a cabo por microorganismos.
1.7. Papel del ATP y las reacciones redox en la transferencia de
energía en el metabolismo
La energía de que se valen los organismos para efectuar los procesos inherentes
a la materia viva puede provenir de varias fuentes, de las cuales, la proveniente
del Sol es la más importante. La energía solar es utilizada por los organismos
autótrofos fotosintetizadores para llevar a cabo la fotosíntesis, proceso que permite

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A. Macías Alvia et al.

la acumulación de esa energía como energía química de macromoléculas, las que a


su vez representan la fuente energética de los organismos heterótrofos.
La energía libre de los combustibles celulares se conserva como energía química,
específicamente como energía del enlace fosfato del trifosfato de adenosina (ATP)
de alto contenido energético. La formación de moléculas de ATP se produce a partir
del ADP y del fosfato inorgánico en reacciones de transferencia del grupo fosfato,
acoplados a etapas de oxidación durante el catabolismo. El ATP así formado,
difunde hacia aquellos procesos celulares en que sea necesaria la energía potencial,
constituyendo esta molécula una forma de transporte energético celular.
La energía de los enlaces fosfato del ATP, se transfiere a determinadas moléculas o
aceptores específicos, de manera que la molécula aceptora eleva su nivel energético
y puede, por consiguiente, realizar trabajo al oxidarse.
Estructura del ATP y sus productos de hidrólisis
El trifosfato de adenosina (ATP) es la principal fuente de energía de los seres vivos. El
ATP alimenta casi todas las actividades celulares, entre ellas el movimiento muscular,
la síntesis de proteínas, la división celular y la transmisión de señales nerviosas.

Figura 2. Estructura del ATP y sus productos de hidrólisis.


El ATP se origina por el metabolismo de los alimentos en unos orgánulos especiales
de la célula llamados mitocondrias. El ATP se comporta como una coenzima, ya que
su función de intercambio de energía y la función catalítica (trabajo de estimulación)
de las enzimas están íntimamente relacionadas. La parte adenosina de la molécula
está constituida por adenina, un compuesto que contiene nitrógeno (también uno
de los componentes principales de los genes) y ribosa, un azúcar de cinco carbonos.

25 Volver al índice
Introducción al estudio de la bioquímica

Figura 3. Molécula de ATP: Su fórmula es C10H16N5O13P3.


Una segunda forma de transporte energético está dada por las reacciones redox
del catabolismo; las reacciones anabólicas necesitan energía, esta transferencia
energética se produce en forma de electrones. Por ejemplo en la síntesis de
biomoléculas como los ácidos grasos y el colesterol, requieren electrones e hidrógeno
para la reducción de los dobles enlaces a simples enlaces.
En las células, los electrones son transportados enzimáticamente, desde las
oxidaciones productoras de electrones del catabolismo, hasta aquellos grupos que
necesitan electrones tales como los dobles enlaces C=C o C=O, mediante coenzimas
transportadores de electrones; entre las más importantes está el nicotinamin-
adenin-dinucleótido-fosfato (NADP+). De esta manera, el NADP+ desempeña el papel
de transportador de electrones ricos en energía desde las reacciones catabólicas a
las anabólicas que los necesitan, tal como el ATP transporta grupos fosfato ricos en
energía desde las reacciones del catabolismo a las de anabolismo
1.8. Mecanismo de transporte a nivel de membrana
Como se explicó en entre las funciones de los iones metálicos están las de participar
en los procesos de transporte activo a través de las membranas, este se produce
en contra de la difusión de los componentes de las células por lo que requiere de
energía, no así el transporte pasivo que se produce espontáneamente a expensas de
la presión osmótica generada por la diferencia de concentración de los componentes
disuelto en el líquido protoplasmático.
El transporte activo permite a la célula regular y controlar el movimiento de
sustancias, transportándolas al interior o al exterior.
La membrana de la célula es un “portero molecular” muy selectivo. Contiene
una capa continua de lípidos y proteínas que actúa como una barrera selectiva
para regular la composición química de la célula. El paso de la mayoría de las
sustancias disueltas está regulado por unas proteínas especiales llamadas proteínas
transportadoras, que están incrustadas en esa espesa capa. La sustancia se une
al transportador en un lado de la membrana. En el transporte activo, la proteína

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A. Macías Alvia et al.

transportadora utiliza energía para “bombear” la sustancia a través de la membrana


al área de concentración alta, en contra del gradiente de concentración. La energía
es proporcionada por el trifosfato de adenosina (ATP), que traslada su energía a
la proteína transportadora, convirtiéndose ella misma en una forma de energía
baja, llamada difosfato de adenosina (ADP). La proteína transportadora utiliza la
energía para cambiar su forma o configuración, transportar la sustancia a través de
la membrana y liberarla en el otro lado.
Conclusiones
La bioquímica es la ciencia que estudia la composición química, la estructura y
las interacciones de las sustancias que constituyen a los seres vivos. Su objetivo
fundamental es el estudio del metabolismo o conjunto de reacciones químicas que
ocurren en los seres vivos, para la autoconservación y autorreproducción de estos.
En sus inicios, la bioquímica estuvo ligada a la medicina, logrando su consolidación
como disciplina independiente a principios del siglo XX.
Los componentes químicos que participan en la estructura de la materia viva son los
mismos que integran el mundo inorgánico, sin embargo, el grado de complejidad
que ellos adoptan en esta, determina la formación de estructuras que se integran
para dar origen a los componentes básicos de la unidad morfológica y fisiológica de
la materia viva: la célula, con todos los atributos que la caracterizan: movimiento,
reproducción, etc. Estos elementos básicos o estructuras submoleculares son, entre
otros, las membranas, el núcleo, las mitocondrias, los cloroplastos y otros, cada uno
de los cuales realiza una función específica dentro del conjunto de funciones que se
llevan a efecto en la célula.
El metabolismo celular es un proceso propio de la materia viva; está caracterizado por
un conjunto de reacciones que implican degradación y síntesis de macromoléculas,
con la consiguiente liberación y el consumo de energía potencial respectivamente
(ATP-NADP+). El metabolismo presenta dos fases: anabolismo y catabolismo; ambas
se encuentran interrelacionadas a tres niveles: 1ro. En lo referente a las cadenas
carbonadas: 2do. En cuanto al suministro energético y 3ro. Relacionado con el poder
reductor.
Las reacciones generales que caracterizan el proceso metabólico están reguladas
por el equipo enzimático celular y son reacciones de transferencia, hidrólisis,
redox, etc. En el metabolismo la energía es constantemente liberada y consumida,
constituyendo la fuente energética primaria para la vida, la energía proveniente del
Sol. El ATP y el NADP+ constituyen moléculas transportadoras de energía química;
el ATP la almacena y la transporta en los enlaces fosfato y el NADP+ transporta
electrones ricos en energía.
Cuestionario
1. ¿Qué objetivos persigue la bioquímica?
2. ¿Cómo se interpreta la expresión: La vida surgió del mundo
inorgánico como producto de su desarrollo histórico?

27 Volver al índice
Introducción al estudio de la bioquímica

3. ¿Qué formas de la actividad práctica utiliza la bioquímica para


conocer la realidad objetiva?
4. ¿Por qué se dice que el metabolismo es un atributo de la materia
viva? Explicar.
5. ¿Cómo se interpreta la expresión de Engels: “Cada ser vivo
organizado es a cada instante el mismo y sin embargo otro”?
6. ¿Qué es una célula? ¿Cuál es su composición química?
7. ¿Cuáles son las funciones que realizan los compuestos inorgánicos
celulares?
8. ¿Cuáles son las funciones que realizan los compuestos orgánicos
celulares?
9. Explique cómo se produce la jerarquización de las estructuras
orgánicas en la célula, y basado en ello decir cuál es la implicación
biológica de este proceso.
10. Haga un esquema de una célula eucariótica típica y señale cada uno
de sus orgánulos:
11. Explique la importancia del núcleo para la vida celular.
12. Defina el término de metabolismo. Señale las fases en que este se
subdivide y explique las características distintivas de una y otra fase.
13. Explique la función celular de las siguientes moléculas:
a) ATP
b) NADP+

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