15 Purificacion de Proteinas
15 Purificacion de Proteinas
15 Purificacion de Proteinas
AUTÓNOMA DE MÉXICO
PURIFICACIÓN DE PROTEINAS
BCT I (1453)
Número de aminoácidos
Ciclos de congelación-descongelación
Prensa francesa
Física Macerado con nitrógeno líquido
Macerado con CO2 sólido
Sonicado Ultrasonido
Lisis
Choque osmótico
Tolueno 10% de la
Disolución lipídica
biomasa
Química Detergentes
Enzimas Lisozimas
Tratamiento alcalino
RANGO DINÁMICO DE UNA PROTEINAS
Indica el órdenes de magnitud (número de copias por célula o
por ml de fluido) en los que se encuentran las proteínas en una
determinada muestra.
Ejemplo:
la concentración de albúmina y de glucagón en plasma difieren
en 9 órdenes de magnitud.
Tamaño
Solubilidad
Carga
Adsorción
Afinidad
Característica Procedimientos
Tamaño Dialisis – ultrafiltración
Electroforesis en gel
Cromatografia de exclusión molecular
Ultracentrifufacion
Solubidad Precipitación con Sales
Precipitación con solventes organicos
Precipitación por pH
70,6 g/100 ml (0 ° C)
74.4 g/100 mL (20 °C)
103.8 g/100 mL (100 °C)
La concentración inicial y
final de sulfato de
amonio, expresada como
porcentaje de
saturación, se encuentra
en las escalas vertical y
horizontal,
respectivamente.
PROCEDIMIENTO 2
Dializar contra 5 litros la bolsa se [sulfato de
de agua hincha hasta amonio] = 20 mM
110 ml
Dializar contra 5 litros no hay [sulfato de
de agua hinchamiento amonio] en el
de la bolsa equilibrio = 0.4
mM
TAMAÑO
Ultrafiltración
Se utiliza una membrana semipermeable que retiene las
proteínas
La presión o fuerza centrífuga se usa para separar por
filtración el medio acuoso y las moléculas de tamaño
pequeño
• Uso de celofán o membranas
Ultrafiltración
En la ultrafiltración consiste en aplicar vacío
o fuerza centrífuga al recipiente en que se
encuentra la membrana semipermeable
cargada con la muestra.
Ultrafiltración
Diaflo (Amicon).
Volumen
de columna
Matriz
Tapón
poroso
Intercambio catiónico
Fase estacionaria cargada
negativamente
Intercambio aniónico
Fase estacionaria
cargada positivamente
ELUCIÓN CON GRADIENTE DE CONCENTRACIÓN
CROMATOGRAFÍA DE INTERCAMBIO IÓNICO
FACTORES QUE AFECTAN A LA RETENCIÓN
1. Fuerza Iónica
2. pH
3. Modificadores Orgánicos
CROMATOGRAFÍA DE AFINIDAD
Utiliza la alta
especificidad entre las
moléculas biológicas
para separar
componentes
específicos de mezclas
complejas.
(Antígeno-Anticuerpos)
RECONOCIMIENTO MOLECULAR
VENTAJAS:
No hay restricción por volumen.
Especificidad
Pureza del producto final
DESVENTAJAS:
Precio (alto)
Condiciones de elución drásticas
Ligando específico no disponible o inadecuado
Tamaño
Cromatografía de filtración o de exclusión
molecular
Las columnas se rellenan de polimeros inertes
pH
Fuerza iónica
Disolvente
Temperatura
Solubilidad-pH
La carga neta de las proteínas depende del
contenido de aminoácidos ácidos y de
aminoácidos básicos.
Solubilidad es mínina
Ej: contenido de aminoácidos ácidos pI bajo
(4-5)
Solubilidad-pH
SOLUBILIDAD-FUERA IÓNICA
Salting in
Salting out
Salting in
aumenta con la [ sales] Salting in
Al aumentar la [sales]
proteina se rodea de contraiones
más soluble por > interacción proteína-solvente
40-50oC inestabilidad
DESNATURALIZAN ( solubilidad)
Purificación de Proteínas
Ensayo de actividad
Debe ser una prueba específica para la proteína de
interés
A más específico el ensayo, mejor calidad de
purificación
¿CÓMO RECONOCER A LA
PROTEÍNA QUE SE BUSCA?
Es importante tener un punto de referencia:
cantidad total de proteínas en la muestra
Métodos para la determinación de proteínas
Métodos espectrofotométricos
Ventajas de la técnica
Rápida
Precisa
Versátil
Fácil de usar
Eficiente en costo
MÉTODO VENTAJAS DESVENTAJAS
Método de Absorción No se pierden las Interfieren compuestos
muestras que absorben en el UV
MÉTODOS
COLORIMÉTRICOS
Biuret Específico para Poca sensibilidad
proteínas, muestra pocas 1 a 6 mg/mL
interferencias es barato
Lowry Tiene bastante No todas las proteínas
sensibilidad reaccionan igual.
de 0,1-1 mg/mL. Muestra interferencias
con detergentes no
iónicos, sulfato de
amonio
Bradford Muy sensible Muestra interferencias
0,5 -1,4 mg/mL con detergentes
EVALUACIÓN DE LA
PURIFICACIÓN ENZIMÁTICA
GRADO DE PURIFICACIÓN
Incremento de actividad específica respecto a la de partida
RENDIMIENTO
Porcentaje de enzima purificada
Concentración de proteínas
Actividad enzimática
Tabla de Purificación
Rendimiento
UNIDADES DE ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
Unidad internacional de actividad enzimática se
define como la cantidad de enzima que cataliza la
transformación de 1 micromol de sustrato por minuto
en condiciones estándar
Katal, cantidad de enzima que consume un mol
de sustrato por segundo
1 kcat = 60 106 UI
ACTIVIDAD ESPECÍFICA
Es el resultado de dividir la actividad en UI por la
cantidad de proteína presente en la fracción
Pureza
Purificar es un procedimiento secuencial
Preparación
Fuente Técnica de
separación
No
Ensayo de la cantidad de proteínas
Ensayo de la actividad enzimática
No SI Combinar Pura?
Desechar Control de
Fracciones
Hay actividad? pureza
SI
Test de pureza
- Isoelectroenfoque.
-Espectrometria de masas
Test de actividad
TÉCNICAS DE PURIFICACIÓN
Diseño de enzimas:
Proteína
Aislamiento de una proteína
Se requiere conocimiento de la proteína
De que tipo de célula proviene
De que parte de la célula
Qué hace esa proteína
Particularmente útil si se conoce :
Tamaño
Composición
Aislamiento de una proteína
Selección de la fuente proteica