CÁC BIẾN THỂ CỦA PHƯƠNG PHÁP PCR 1.LAMP PCR (LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION) :sự khuếch đại ADN ở điều kiện đẳng nhiệt thông qua cấu trúc vòng loop Phương pháp này dựa trên sự tổng hợp ADN thay thế chuỗi tự xoay vòng được thực hiện bởi một DNA polymerase và hai cặp mồi trong và mồi ngoài được thiết kế đặc biệt.  2.RAPD PCR (Random amplified polymorphic DNA) sử dụng những đoạn mồi ngắn (khoảng 10 nucleotide) có trình tự biết trước, bắt cặp và nhân bản ngẫu nhiên những đoạn DNA có trình tự bổ sung với trình tự của các đoạn mồi 3.RT- PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction) PCR phiên mã ngược : dùng để khuếch đại ADN từ ARN. Enzyme phiên mã ngược sao mã ngược ARN tạo thành ADNc, sau đó ADNc này được khuếch đại bằng PCR. 4.REALTIME PCR là kỹ thuật PCR mà kết quả khuếch đại DNA đích hiển thị được ngay sau mỗi chu kỳ nhiệt của phản ứng, chính vì vậy nên được gọi là real-time Thực chất hệ thống Real time PCR gồm máy luân nhiệt (PCR) được nối với máy quang phổ huỳnh quang và máy vi tính. 5. Multiplex PCR(PCR đa mồi) sử dụng nhiều cặp mồi đặc hiệu cho các đoạn ADN đích đặc hiệu. => nhiều gen đích được khuếch đại cùng một lúc, nhiều thông tin thu được từ một lần chạy mà không đòi hỏi nhiều hóa chất và thời gian thực hiện 6.Nested PCR (PCR lồng hoặc tổ) sử dung 2 cặp mồi( 1 là cặp ngoài, 2 là cặp trong) Gồm 2 giai đoạn 1-PCR VÒNG NGOÀI:dùng cặp mồi ngoài để khuếch đại một đoạn ADN trong đó có chứa trình tự đích 2-PCR VÒNG TRONG:dùng sp PCR vòng ngoài cho vào ống PCR có cặp mòi trong để khuếch đại ADN đích Ưu điểm - Tăng tính đặc hiệu là do sự bắt cặp của primer thứ hai chỉ xảy ra chủ yếu với đoạn gen được nhân lên bởi phản ứng PCR thứ nhất. Nếu ban đầu khuôn DNA bị khuếch đại sai thì khả năng khuếch đại ở lần thứ hai sẽ rất thấp - Tăng độ nhạy nhờ tổng số chu kỳ được thực hiện nhiều hơn Nested PCR áp dụng trong trường hợp có rất ít mẫu gốc 7.QF-PCR (quantitative fluorescence PCR).  dùng để khuếch đại các đoạn DNA ngắn đặc hiệu, đánh dấu bằng tín hiệu huỳnh quang và định lượng bằng điện di mao quản. 8.RFLP PCR (Restriction Fragment Length Polymorphisms) là 1 bước của kĩ thuật nghiên cứu tính đa hình chiều dài của các phân tử ADN (dựa trên điểm cắt của các enzim giới hạn) . Sản phẩm của PCR sẽ được ủ với enzim cắt giới hạn sau đó đem điện di