ITGAL

ITGAL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4IXD, 1CQP, 1DGQ, 1LFA, 1MJN, 1MQ8, 1MQ9, 1MQA, 1RD4, 1T0P, 1XDD, 1XDG, 1XUO, 1ZON, 1ZOO, 1ZOP, 2ICA, 2K8O, 2M3E, 2O7N, 3BN3, 3BQM, 3BQN, 3E2M, 3EOA, 3EOB, 3F74, 3F78, 3HI6, 3M6F, 3TCX, 5E6S, 5E6R, 5E6U
Ідентифікатори
Символи	ITGAL, CD11A, LFA-1, LFA1A, integrin subunit alpha L
Зовнішні ІД	OMIM: 153370 MGI: 96606 HomoloGene: 1666 GeneCards: ITGAL
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032403 protein-containing complex binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • ICAM-3 receptor activity • cell adhesion molecule binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integrin alphaL-beta2 complex • мембрана • cell surface • integrin complex • екзосома • клітинна мембрана • specific granule membrane Біологічний процес • leukocyte cell-cell adhesion • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell • extracellular matrix organization • receptor clustering • адгезія клітин • regulation of immune response • integrin-mediated signaling pathway • cell-matrix adhesion • inflammatory response • leukocyte migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • Фагоцитоз • neutrophil degranulation • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3683	16408
Ensembl	ENSG00000005844	ENSMUSG00000030830
UniProt	P20701	P24063
RefSeq (мРНК)	NM_001114380 NM_002209	NM_001253872 NM_001253873 NM_001253874 NM_008400
RefSeq (білок)	NP_001107852 NP_002200	NP_001240801 NP_001240802 NP_001240803 NP_032426
Локус (UCSC)	Хр. 16: 30.47 – 30.52 Mb	Хр. 7: 126.9 – 126.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ITGAL (англ. Integrin subunit alpha L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 170 амінокислот, а молекулярна маса — 128 770.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKDSCITVMA		MALLSGFFFF		APASSYNLDV		RGARSFSPPR		AGRHFGYRVL
QVGNGVIVGA		PGEGNSTGSL		YQCQSGTGHC		LPVTLRGSNY		TSKYLGMTLA
TDPTDGSILA		CDPGLSRTCD		QNTYLSGLCY		LFRQNLQGPM		LQGRPGFQEC
IKGNVDLVFL		FDGSMSLQPD		EFQKILDFMK		DVMKKLSNTS		YQFAAVQFST
SYKTEFDFSD		YVKRKDPDAL		LKHVKHMLLL		TNTFGAINYV		ATEVFREELG
ARPDATKVLI		IITDGEATDS		GNIDAAKDII		RYIIGIGKHF		QTKESQETLH
KFASKPASEF		VKILDTFEKL		KDLFTELQKK		IYVIEGTSKQ		DLTSFNMELS
SSGISADLSR		GHAVVGAVGA		KDWAGGFLDL		KADLQDDTFI		GNEPLTPEVR
AGYLGYTVTW		LPSRQKTSLL		ASGAPRYQHM		GRVLLFQEPQ		GGGHWSQVQT
IHGTQIGSYF		GGELCGVDVD		QDGETELLLI		GAPLFYGEQR		GGRVFIYQRR
QLGFEEVSEL		QGDPGYPLGR		FGEAITALTD		INGDGLVDVA		VGAPLEEQGA
VYIFNGRHGG		LSPQPSQRIE		GTQVLSGIQW		FGRSIHGVKD		LEGDGLADVA
VGAESQMIVL		SSRPVVDMVT		LMSFSPAEIP		VHEVECSYST		SNKMKEGVNI
TICFQIKSLI		PQFQGRLVAN		LTYTLQLDGH		RTRRRGLFPG		GRHELRRNIA
VTTSMSCTDF		SFHFPVCVQD		LISPINVSLN		FSLWEEEGTP		RDQRAQGKDI
PPILRPSLHS		ETWEIPFEKN		CGEDKKCEAN		LRVSFSPARS		RALRLTAFAS
LSVELSLSNL		EEDAYWVQLD		LHFPPGLSFR		KVEMLKPHSQ		IPVSCEELPE
ESRLLSRALS		CNVSSPIFKA		GHSVALQMMF		NTLVNSSWGD		SVELHANVTC
NNEDSDLLED		NSATTIIPIL		YPINILIQDQ		EDSTLYVSFT		PKGPKIHQVK
HMYQVRIQPS		IHDHNIPTLE		AVVGVPQPPS		EGPITHQWSV		QMEPPVPCHY
EDLERLPDAA		EPCLPGALFR		CPVVFRQEIL		VQVIGTLELV		GEIEASSMFS
LCSSLSISFN		SSKHFHLYGS		NASLAQVVMK		VDVVYEKQML		YLYVLSGIGG
LLLLLLIFIV		LYKVGFFKRN		LKEKMEAGRG		VPNGIPAEDS		EQLASGQEAG
DPGCLKPLHE		KDSESGGGKD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Larson R.S., Corbi A.L., Berman L., Springer T. (1989). Primary structure of the leukocyte function-associated molecule-1 alpha subunit: an integrin with an embedded domain defining a protein superfamily. J. Cell Biol. 108: 703—712. PMID 2537322 DOI:10.1083/jcb.108.2.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shelley C.S., Farokhzad O.C., Arnaout M.A. (1993). Identification of cell-specific and developmentally regulated nuclear factors that direct myeloid and lymphoid expression of the CD11a gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5364—5368. PMID 8099450 DOI:10.1073/pnas.90.11.5364
• Cornwell R.D., Gollahon K.A., Hickstein D.D. (1993). Description of the leukocyte function-associated antigen 1 (LFA-1 or CD11a) promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 4221—4225. PMID 8097887 DOI:10.1073/pnas.90.9.4221
• Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes. Nat. Immunol. 3: 151—158. PMID 11812992 DOI:10.1038/ni755
• Barber D.F., Faure M., Long E.O. (2004). LFA-1 contributes an early signal for NK cell cytotoxicity. J. Immunol. 173: 3653—3659. PMID 15356110 DOI:10.4049/jimmunol.173.6.3653

Див. також

• Хромосома 16