BIOQUIMICA

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Bioqu�mica

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Representaci�n esquem�tica de la mol�cula de ADN, la mol�cula portadora de la


informaci�n gen�tica.
La bioqu�mica es una rama de la ciencia que estudia la composici�n qu�mica de los
seres vivos, especialmente las prote�nas, carbohidratos, l�pidos y �cidos
nucleicos, adem�s de otras peque�as mol�culas presentes en las c�lulas y las
reacciones qu�micas que sufren estos compuestos (metabolismo) que les permiten
obtener energ�a (catabolismo) y generar biomol�culas propias (anabolismo). La
bioqu�mica se basa en el concepto de que todo ser vivo contiene carbono y en
general las mol�culas biol�gicas est�n compuestas principalmente de carbono,
hidr�geno, ox�geno, nitr�geno, f�sforo y azufre.

Es la ciencia que estudia la base qu�mica de las mol�culas que componen algunas
c�lulas y los tejidos, que catalizan las reacciones qu�micas del metabolismo
celular como la digesti�n, la fotos�ntesis y la inmunidad, entre otras muchas
cosas.

Podemos entender la bioqu�mica como una disciplina cient�fica integradora que


elabora el estudio de las biomas y biosistemas. Integra de esta forma las leyes
qu�mico-f�sicas y la evoluci�n biol�gica que afectan a los biosistemas y a sus
componentes. Lo hace desde un punto de vista molecular y trata de entender y
aplicar su conocimiento a amplios sectores de la medicina (terapia gen�tica y
biomedicina), la agroalimentaci�n, la farmacolog�a.

Constituye un pilar fundamental de la biotecnolog�a, y se ha consolidado como una


disciplina esencial para abordar los grandes problemas y enfermedades actuales y
del futuro, tales como el cambio clim�tico, la escasez de recursos agroalimentarios
ante el aumento de poblaci�n mundial, el agotamiento de las reservas de
combustibles f�siles, la aparici�n de nuevas alergias, el aumento del c�ncer, las
enfermedades gen�ticas, la obesidad, etc.

La bioqu�mica es una ciencia experimental y por ello recurrir� al uso de numerosas


t�cnicas instrumentales propias y de otros campos, pero la base de su desarrollo
parte del hecho de que lo que ocurre en vivo a nivel subcelular se mantiene o se
conserva tras el fraccionamiento subcelular, y a partir de ah�, podemos estudiarlo.

�ndice
1 Historia
1.1 Siglo XIX y primera mitad del XX
1.2 Segunda mitad del siglo XX
2 Ramas de la bioqu�mica
3 T�cnicas bioqu�micas b�sicas
4 Expectativas y retos de la bioqu�mica
5 Importantes bioqu�micos iberoamericanos
6 Etimolog�a
7 V�ase tambi�n
8 Referencias
9 Enlaces externos
Historia
Siglo XIX y primera mitad del XX
La historia de la bioqu�mica moderna como la conocemos hoy en d�a es pr�cticamente
moderna; desde el siglo XIX se comenz� a direccionar una buena parte de la biolog�a
y la qu�mica a la creaci�n de una nueva disciplina integradora: la qu�mica
fisiol�gica o la bioqu�mica. Pero la aplicaci�n de la bioqu�mica y su conocimiento
probablemente comenz� hace 5000 a�os, con la producci�n de pan usando levaduras, en
un proceso conocido como fermentaci�n.
Es dif�cil abordar la historia de la bioqu�mica, en cuanto que, es una mezcla
compleja de qu�mica org�nica y biolog�a, y en ocasiones, se hace complicado
discernir entre lo exclusivamente biol�gico y lo exclusivamente qu�mico org�nico y
es evidente que la contribuci�n a esta disciplina ha sido muy extensa. Aunque es
cierto que existen datos experimentales que son b�sicos en la bioqu�mica.

Se suele situar el inicio de la bioqu�mica en los descubrimientos en 1828 de


Friedrich W�hler que public� un art�culo acerca de la s�ntesis de urea, probando
que los compuestos org�nicos pueden ser creados artificialmente, en contraste con
la creencia com�nmente aceptada durante mucho tiempo, de que la generaci�n de estos
compuestos era posible solo en el interior de los seres vivos.

La diastasa fue la primera enzima descubierta. En 1833 se extrajo de la soluci�n de


malta por Anselme Payen y Jean-Fran�ois Persoz, dos qu�micos de una f�brica de
az�car francesa.1?

A mediados del siglo XIX, Louis Pasteur demostr� los fen�menos de isomer�a qu�mica
existente entre las mol�culas de �cido tart�rico provenientes de los seres vivos y
las sintetizadas qu�micamente en el laboratorio. Tambi�n estudi� el fen�meno de la
fermentaci�n y descubri� que interven�an ciertas levaduras, y por tanto no era
exclusivamente un fen�meno qu�mico como se hab�a defendido hasta ahora (entre ellos
el propio Liebig); as� Pasteur escribi�: �la fermentaci�n del alcohol es un acto
relacionado con la vida y la organizaci�n de las c�lulas de las levaduras, y no con
la muerte y la putrefacci�n de las c�lulas�. Adem�s desarroll� un m�todo de
esterilizaci�n de la leche, el vino y la cerveza (pasteurizaci�n) y contribuy�
enormemente a refutar la idea de la generaci�n espont�nea de los seres vivos.

En 1869 se descubre la nucle�na y se observa que es una sustancia muy rica en


f�sforo. Dos a�os m�s tarde, Albrecht Kossel concluye que la nucle�na es rica en
prote�nas y contiene las bases p�ricas adenina y guanina y las pirimid�nicas
citosina y timina. En 1889 se a�slan los dos componentes mayoritarios de la
nucle�na:

Prote�nas (70 %)
Sustancias de car�cter �cido: �cidos nucleicos (30 %)
En 1878 el fisi�logo Wilhelm K�hne acu�� el t�rmino enzima para referirse a los
componentes biol�gicos desconocidos que produc�an la fermentaci�n. La palabra
enzima fue usada despu�s para referirse a sustancias inertes tales como la pepsina.

En 1897 Eduard Buchner comenz� a estudiar la capacidad de los extractos de levadura


para fermentar az�car a pesar de la ausencia de c�lulas vivientes de levadura. En
una serie de experimentos en la Universidad Humboldt de Berl�n, encontr� que el
az�car era fermentado incluso cuando no hab�a elementos vivos en los cultivos de
c�lulas de levaduras. Llam� a la enzima que causa la fermentaci�n de la sacarosa,
�zimasa�. Al demostrar que las enzimas podr�an funcionar fuera de una c�lula viva,
el siguiente paso fue demostrar cu�l era la naturaleza bioqu�mica de esos
biocatalizadores. El debate fue extenso; muchos, como el bioqu�mico alem�n Richard
Willst�tter, discrepaban de que la prote�na fuera el catalizador enzim�tico, hasta
que en 1926, James B. Sumner demostr� que la enzima ureasa era una prote�na pura y
la cristaliz�. La conclusi�n de que las prote�nas puras pod�an ser enzimas fue
definitivamente probada en torno a 1930 por John Howard Northrop y Wendell Meredith
Stanley, quienes trabajaron con diversas enzimas digestivas como la pepsina, la
tripsina y la quimotripsina.

En 1903 Mija�l Tswett inicia los estudios de cromatograf�a para separaci�n de


pigmentos.

En torno a 1915 Gustav Embden y Otto Meyerhof realizan sus estudios sobre la
gluc�lisis.

En 1920 se descubre que en las c�lulas hay ADN y ARN y que difieren en el az�car
que forma parte de su composici�n: desoxirribosa o ribosa. El ADN reside en el
n�cleo. Unos a�os m�s tarde, se descubre que en los espermatozoides hay
fundamentalmente ADN y prote�nas, y posteriormente Feulgen descubre que hay ADN en
los cromosomas con su tinci�n espec�fica para este compuesto.

En 1925 Theodor Svedberg demuestra que las prote�nas son macromol�culas y


desarrolla la t�cnica de ultracentrifugaci�n anal�tica.

En 1928, Alexander Fleming descubre la penicilina y desarrolla estudios sobre la


lisozima.

Richard Willst�tter (en torno 1910) estudia la clorofila y comprueba la similitud


que hay con la hemoglobina. Posteriormente Hans Fischer en torno a 1930, investiga
la qu�mica de las porfirinas de las que derivan la clorofila o el grupo porfir�nico
de la hemoglobina. Consigui� sintetizar hemina y bilirrubina. Paralelamente
Heinrich Otto Wieland formula teor�as sobre las deshidrogenaciones y explica la
constituci�n de muchas otras sustancias de naturaleza compleja, como la pteridina,
las hormonas sexuales o los �cidos biliares.

En la d�cada de 1940, Melvin Calvin concluye el estudio del ciclo de Calvin en la


fotos�ntesis y Albert Claude la s�ntesis del ATP en las mitocondrias.

En torno a 1945 Gerty Cori, Carl Cori, y Bernardo Houssay completan sus estudios
sobre el ciclo de Cori.

En 1953 James Dewey Watson y Francis Crick, gracias a los estudios previos con
cristalograf�a de rayos X de ADN de Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, y los
estudios de Erwin Chargaff sobre apareamiento de bases nitrogenadas, deducen la
estructura de doble h�lice del ADN. En 1957, Matthew Meselson y Franklin Stahl
demuestran que la replicaci�n del ADN es semiconservativa.

Segunda mitad del siglo XX


En la segunda mitad del siglo XX, comienza la aut�ntica revoluci�n de la bioqu�mica
y la biolog�a molecular moderna, especialmente gracias al desarrollo de las
t�cnicas experimentales m�s b�sicas como la cromatograf�a, la centrifugaci�n, la
electroforesis, las t�cnicas radioisot�picas y la microscop�a electr�nica, y las
t�cnicas m�s complejas como la cristalograf�a de rayos X, la resonancia magn�tica
nuclear, la PCR (Kary Mullis), el desarrollo de la inmuno-t�cnicas.

Desde 1950 a 1975 , se conocen en profundidad y detalle aspectos del metabolismo


celular inimaginables hasta ahora (fosforilaci�n oxidativa (Peter Dennis Mitchell),
ciclo de la urea y ciclo de Krebs (Hans Adolf Krebs), as� como otras rutas
metab�licas), se produce toda una revoluci�n en el estudio de los genes y su
expresi�n; se descifra el c�digo gen�tico (Francis Crick, Severo Ochoa, Har Gobind
Khorana, Robert W. Holley y Marshall Warren Nirenberg), se descubren las enzimas de
restricci�n (finales de 1960, Werner Arber, Daniel Nathans y Hamilton Smith), la
ADN ligasa (en 1972, Mertz y Davis) y finalmente en 1973 Stanley Cohen y Herbert
Boyer producen el primer ser vivo recombinante, naciendo as� la ingenier�a
gen�tica, convertida en una herramienta poderos�sima con la que se supera la
frontera entre especies y con la que podemos obtener un beneficio hasta ahora
impensable.

En 1970, un argentino, Luis Federico Leloir, m�dico, bioqu�mico y farmac�utico


recibi� el Premio Nobel de Qu�mica por sus investigaciones sobre los nucle�tidos de
az�car, y el rol que cumplen en la fabricaci�n de los hidratos de carbono.2?
En 1984, otro argentino, C�sar Milstein, oriundo de la ciudad de Bah�a Blanca,
recibe el Premio Nobel de Medicina por sus investigaciones sobre anticuerpos
monoclonales, hoy utilizados para tratar muchas enfermedades, incluidos algunos
tipos de c�ncer.3?

De 1975 hasta principios del siglo XXI, comienza a secuenciarse el ADN (Allan
Maxam, Walter Gilbert y Frederick Sanger), comienzan a crearse las primeras
industrias biotecnol�gicas (Genentech), se aumenta la creaci�n de f�rmacos y
vacunas m�s eficaces, se eleva el inter�s por las inmunolog�a y las c�lulas madres
y se descubre la enzima telomerasa (Elizabeth Blackburn y Carol Greider). En 1989
se utiliza la biorremediaci�n a gran escala en el derrame del petrolero Exxon
Valdez en Alaska. Se clonan los primeros seres vivos, se secuencia el ADN de
decenas de especies y se publica el genoma completo del hombre (Craig Venter,
Celera Genomics y Proyecto Genoma Humano), se resuelven decenas de miles de
estructuras proteicas y se publican en PDB, as� como genes, en GenBank. Comienza el
desarrollo de la bioinform�tica y la computaci�n de sistemas complejos, que se
constituyen como herramientas muy poderosas en el estudio de los sistemas
biol�gicos. Se crea el primer cromosoma artificial y se logra la primera bacteria
con genoma sint�tico (2007, 2009, Craig Venter). Se fabrican las nucleasas con
dedos de zinc. Se inducen artificialmente c�lulas, que inicialmente no eran
pluripotenciales, a c�lulas madre pluripotenciales (Shin'ya Yamanaka). Comienzan a
darse los primeros pasos.

Ramas de la bioqu�mica

Esquema de una c�lula t�pica animal con sus org�nulos y estructuras.


El pilar fundamental de la investigaci�n bioqu�mica cl�sica se centra en las
propiedades de las prote�nas, muchas de las cuales son enzimas. Sin embargo,
existen otras disciplinas que se centran en las propiedades biol�gicas de
carbohidratos (glucobiolog�a)4? y l�pidos (lipobiolog�a).5?

Por razones hist�ricas la bioqu�mica del metabolismo de la c�lula ha sido


intensamente investigada, en importantes l�neas de investigaci�n actuales (como el
Proyecto Genoma, cuya funci�n es la de identificar y registrar todo el material
gen�tico humano), se dirigen hacia la investigaci�n del ADN, el ARN, la s�ntesis de
prote�nas, la din�mica de la membrana celular y los ciclos energ�ticos.

Las ramas de la bioqu�mica son muy amplias y diversas, y han ido variando con el
tiempo y los avances de la biolog�a, la qu�mica y la f�sica.

Bioqu�mica estructural: es un �rea de la bioqu�mica que pretende comprender la


arquitectura qu�mica de las macromol�culas biol�gicas, especialmente de las
prote�nas y de los �cidos nucleicos (ADN y ARN). As� se intenta conocer las
secuencias pept�dicas, su estructura y conformaci�n tridimensional, y las
interacciones f�sico-qu�micas at�micas que posibilitan a dichas estructuras. Uno de
sus m�ximos retos es determinar la estructura de una prote�na conociendo solo la
secuencia de amino�cidos, que supondr�a la base esencial para el dise�o racional de
prote�nas (ingenier�a de prote�nas). 6?
Qu�mica org�nica: es un �rea de la qu�mica que se encarga del estudio de los
compuestos org�nicos (es decir, aquellos que tienen enlaces covalentes carbono-
carbono o carbono-hidr�geno) que provienen espec�ficamente de seres vivos. Se trata
de una ciencia �ntimamente relacionada con la bioqu�mica cl�sica, ya que en la
mayor�a de los compuestos biol�gicos participa el carbono. Mientras que la
bioqu�mica cl�sica ayuda a comprender los procesos biol�gicos con base en
conocimientos de estructura, enlace qu�mico, interacciones moleculares y
reactividad de las mol�culas org�nicas, la qu�mica bioorg�nica intenta integrar los
conocimientos de s�ntesis org�nica, mecanismos de reacci�n, an�lisis estructural y
m�todos anal�ticos con las reacciones metab�licas primarias y secundarias, la
bios�ntesis, el reconocimiento celular y la diversidad qu�mica de los organismos
vivos. De all� surge la Qu�mica de Productos Naturales (V. Metabolismo
secundario).7?
Enzimolog�a: estudia el comportamiento de los catalizadores biol�gicos o enzimas,
como son algunas prote�nas y ciertos ARN catal�ticos, as� como las coenzimas y
cofactores como metales y vitaminas. As� se cuestiona los mecanismos de cat�lisis,
los procesos de interacci�n de las enzimas-sustrato, los estados de transici�n
catal�ticos, las actividades enzim�ticas, la cin�tica de la reacci�n y los
mecanismos de regulaci�n y expresi�n enzim�ticas, todo ello desde un punto de vista
bioqu�mico. Estudia y trata de comprender los elementos esenciales del centro
activo y de aquellos que no participan, as� como los efectos catal�ticos que
ocurren en la modificaci�n de dichos elementos; en este sentido, utilizan
frecuentemente t�cnicas como la mutag�nesis dirigida.8?
Bioqu�mica metab�lica: es un �rea de la bioqu�mica que pretende conocer los
diferentes tipos de rutas metab�licas a nivel celular, y su contexto org�nico. De
esta forma son esenciales conocimientos de enzimolog�a y biolog�a celular. Estudia
todas las reacciones bioqu�micas celulares que posibilitan la vida, y as� como los
�ndices bioqu�micos org�nicos saludables, las bases moleculares de las enfermedades
metab�licas o los flujos de intermediarios metab�licos a nivel global. De aqu�
surgen disciplinas acad�micas como la bioenerg�tica (estudio del flujo de energ�a
en los organismos vivos), la bioqu�mica nutricional (estudio de los procesos de
nutrici�n asociados a| rutas metab�licas)9? y la bioqu�mica cl�nica (estudio de las
alteraciones bioqu�micas en estado de enfermedad o traumatismo). La metabol�mica es
el conjunto de ciencias y t�cnicas dedicadas al estudio completo del sistema
constituido por el conjunto de mol�culas que constituyen los intermediarios
metab�licos, metabolitos primarios y secundarios, que se pueden encontrar en un
sistema biol�gico.
Xenobioqu�mica: es la disciplina que estudia el comportamiento metab�lico de los
compuestos cuya estructura qu�mica no es propia en el metabolismo regular de un
organismo determinado. Pueden ser metabolitos secundarios de otros organismos (por
ejemplo las micotoxinas, los venenos de serpientes y los fitoqu�micos cuando
ingresan al organismo humano) o compuestos poco frecuentes o inexistentes en la
naturaleza.10? La farmacolog�a es una disciplina que estudia a los xenobi�ticos que
benefician al funcionamiento celular en el organismo debido a sus efectos
terap�uticos o preventivos (f�rmacos). La farmacolog�a tiene aplicaciones cl�nicas
cuando las sustancias son utilizadas en el diagn�stico, prevenci�n, tratamiento y
alivio de s�ntomas de una enfermedad as� como el desarrollo racional de sustancias
menos invasivas y m�s eficaces contra dianas biomoleculares concretas. Por otro
lado, la toxicolog�a es el estudio que identifica, estudia y describe, la dosis, la
naturaleza, la incidencia, la severidad, la reversibilidad y, generalmente, los
mecanismos de los efectos adversos (efectos t�xicos) que producen los xenobi�ticos.
Actualmente la toxicolog�a tambi�n estudia el mecanismo de los componentes
end�genos, como los radicales libres de ox�geno y otros intermediarios reactivos,
generados por xenobi�ticos y endobi�ticos.
Inmunolog�a: �rea de la biolog�a, la cual se interesa por la reacci�n del organismo
frente a otros organismos como las bacterias y virus. Todo esto tomando en cuenta
la reacci�n y funcionamiento del sistema inmune de los seres vivos. Es esencial en
esta �rea el desarrollo de los estudios de producci�n y comportamiento de los
anticuerpos.11?
Endocrinolog�a: es el estudio de las secreciones internas llamadas hormonas, las
cuales son sustancias producidas por c�lulas especializadas cuyo fin es de afectar
la funci�n de otras c�lulas. La endocrinolog�a trata la bios�ntesis, el
almacenamiento y la funci�n de las hormonas, las c�lulas y los tejidos que las
secretan, as� como los mecanismos de se�alizaci�n hormonal. Existen subdisciplinas
como la endocrinolog�a m�dica, la endocrinolog�a vegetal y la endocrinolog�a
animal. 12?
Neuroqu�mica: es el estudio de las mol�culas org�nicas que participan en la
actividad neuronal. Este t�rmino es empleado con frecuencia para referir a los
neurotransmisores y otras mol�culas como las drogas neuro-activas que influencian
la funci�n neuronal.
Quimiotaxonom�a: es el estudio de la clasificaci�n e identificaci�n de organismos
de acuerdo a sus diferencias y similitudes demostrables en su composici�n qu�mica.
Los compuestos estudiados pueden ser fosfol�pidos, prote�nas, p�ptidos,
heter�sidos, alcaloides y terpenos. John Griffith Vaughan fue uno de los pioneros
de la quimiotaxonom�a. Entre los ejemplos de las aplicaciones de la quimiotaxonom�a
pueden citarse la diferenciaci�n de las familias Asclepiadaceae y Apocynaceae seg�n
el criterio de la presencia de l�tex; la presencia de agarofuranos en la familia
Celastraceae; las sesquiterpenlactonas con esqueleto de germacrano que son
caracter�sticas de la familia Asteraceae o la presencia de abietanos en las partes
a�reas de plantas del g�nero Salvia del viejo Mundo a diferencia de las del Nuevo
Mundo que presentan principalmente neo-clerodanos.13?
Ecolog�a qu�mica: es el estudio de los compuestos qu�micos de origen biol�gico
implicados en las interacciones de organismos vivos. Se centra en la producci�n y
respuesta de mol�culas se�alizadoras (semioqu�micos), as� como los compuestos que
influyen en el crecimiento, supervivencia y reproducci�n de otros organismos
(aleloqu�micos).
Virolog�a: �rea de la biolog�a, que se dedica al estudio de los biosistemas m�s
elementales: los virus. Tanto en su clasificaci�n y reconocimiento, como en su
funcionamiento y estructura molecular. Pretende reconocer dianas para la actuaci�n
de posibles de f�rmacos y vacunas que eviten su directa o preventivamente su
expansi�n. Tambi�n se analizan y predicen, en t�rminos evolutivos, la variaci�n y
la combinaci�n de los genomas v�ricos, que podr�an hacerlos eventualmente, m�s
peligrosos. Finalmente suponen una herramienta con mucha proyecci�n como vectores
recombinantes, y han sido ya utilizados en terapia g�nica.14?

Imagen: Prote�na mioglobina


Gen�tica molecular e ingenier�a gen�tica: es un �rea de la bioqu�mica y la biolog�a
molecular que estudia los genes, su herencia y su expresi�n. Molecularmente, se
dedica al estudio del ADN

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