Este documento presenta información sobre aminoácidos y proteínas. Detalla las características de los aminoácidos como su comportamiento anfótero y punto isoeléctrico. Explica la clasificación de los 20 aminoácidos comunes y la formación del enlace peptídico. Además, describe las diferentes estructuras de las proteínas incluyendo la estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria y los factores que contribuyen a su conformación tridimensional.
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Este documento presenta información sobre aminoácidos y proteínas. Detalla las características de los aminoácidos como su comportamiento anfótero y punto isoeléctrico. Explica la clasificación de los 20 aminoácidos comunes y la formación del enlace peptídico. Además, describe las diferentes estructuras de las proteínas incluyendo la estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria y los factores que contribuyen a su conformación tridimensional.
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UNIVERSIDAD NACIONAL FEDERICO VILLARREAL
FACULTAD DE MEDICINA “HIPÓLITO UNANUE”
DAPARTAMENTO DE CIENCIAS FISIOLOGICAS ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA CURSO: BIOQUÍMICA APLICADA A LA MEDICINA
AMINOÁCIDOS Y PROTEÍNAS
DRA. MIRTHA YARLEQUÉ CHOCAS
Competencias • Conoce las características de los aminoácidos . • Identifica los principales enlaces en los péptidos y proteínas. • Reconoce las estructuras de las proteínas. Anfótero • En medios intracelular, el grupo amino (- NH2) acepta un protón hasta convertirse en -NH3 + y el grupo carboxilo dona un protón convirtiéndose en -COO- disociado. Los aminoácidos puestos en una solución de pH neutro se comportan como iones dipolares. • Sirve de amortiguador y resiste cambios en el pH cuando se agrega un ácido o una base. Aminoácidos ¿Qué es el punto isoeléctrico? Es el valor de pH del medio al cual el aminoácido se halla con carga eléctrica global 0. Es decir, es el pH al cual hallamos el aminoácido en forma zwiteriónica. En los aminoácidos neutros que presentan únicamente como grupos ionizables el -NH2 y el -COOH, para calcularlo basta hacer la media aritmética de los dos valores de pKa, es decir: pI de aminoácidos R: neutro R: carga negativa R: carga positiva Clasificación de los aminoácidos Los 20 L-aminoácidos Los aminoácidos se agrupan, según las propiedades de sus cadenas R. Isomería de los Aminoácidos • El carbono alfa de un aminoácido es un carbono asimétrico. • Cada aminoácido puede presentarse en dos enantiómeros distintos: L-isómero y D-isómero. • En el laboratorio se produce una mezcla de isómeros L y D. • Los de los seres vivos son casi exclusivamente L-isómeros. Una excepción serían los pocos aminoácidos D presentes en los antibióticos producidos por los hongos. Formación de Enlace Peptídico • El enlace covalente que une dos aminoácidos se denomina enlace peptídico. Cuando dos aminoácidos se combinan, se forma un dipéptido; una cadena más larga recibe el nombre polipéptido. Nomenclatura de los oligopéptidos • Oligopéptidos.- si el nº de aminoácidos es de 2 a 9. • Dipéptidos, Tripéptidos, Tetrapéptidos. En los oligopéptido se considera como AA principal al que conserva el grupo carboxilo. El resto de los AA se nombran como sustituyentes, comenzando por el AA que ocupa el extremo amino. Ejemplo
Un tripéptido Pro-Tyr-Lys se denominará prolil-tirosil-lisina.
Polipéptidos • Polipéptidos o cadenas polipeptídicas.- si el nº de aminoácidos es de 10 máximo hasta 49. • Cada péptido se suele escribir, de izquierda a derecha, empezando por el extremo N-terminal que posee un grupo amino libre y finalizando por el extremo C-terminal en el que se encuentra un grupo carboxilo La insulina contiene 51 unidades de aminoácidos unidos en dos cadenas enlazadas. Proteínas: Estructura Primaria Las proteínas poseen mayor de 50 aa pudiendo alcanzar altos pesos como 1000 Daltons. La secuencia de aminoácidos en una cadena de polipéptidos determina su estructura primaria.
Hb. Alterada anemia falciforme.
(ácido Glu→Val) Hb S Estructura Secundaria: hélice alfa La estructura helicoidal se mantiene mediante puentes de hidrógeno entre los aminoácidos en los giros sucesivos de la espiral. • Giro a la derecha de los carbonos alfa • R se encuentran hacia el exterior de la hélice • 3,6 aa por vuelta • La distancia entre dos espiras consecutivas es constante • Es estable por los puentes de H entre CO con NH • Los R no establecen la estructura • Los aa con carga o con R muy grandes no brindan estabilidad, aparece secuencia irregular para continuar la estructura alfa La hélice alfa es la unidad estructural básica de las proteínas fibrosas como la lana, cabello, piel y uñas. Estructura Secundaria: Beta o lámina plegada • Se pliega de tal manera que los C alfa se encuentran ángulos donde se produce los plegamientos. • Los R están dispuestos hacia arriba y hacia debajo de la lámina. • La cadena se pliega sobre sí misma para estabilizarse • Enlaces de H entre CO y NH de los enlaces peptídicos Estructura Secundaria: Beta plegada Las cadenas de una lámina β pueden ser paralelas en la misma dirección o antiparalelas en direcciones opuestas Los aminoácidos como el triptófano, la tirosina y la fenilalanina, que tienen grandes grupos R, se encuentran a menudo en las láminas β, quizá porque la estructura de estas proporciona suficiente espacio para las cadenas laterales. La fibroína, la proteína de la seda, está caracterizada por una estructura de lámina plegada beta; el núcleo de muchas proteínas globulares también está formado por láminas beta. Estructura secundaria: Beta plegada Estructuras supersecundarias Las Estructuras Supersecundarias pueden definirse como combinaciones de alfa-hélices y estructuras Beta conectadas a través de asas o lazos o motivos, que forman patrones que están presentes en muchas proteínas diferentes. Estos plegamientos se estabilizan a través de la misma clase de enlaces que mantiene a la estructura terciaria. La prolina se encuentra normalmente en las asas, regiones no estructuradas en las estructuras secundarias. La Estructura Terciaria • La estructura terciaria es la estructura tridimensional relacionada con su función. • Cuatro factores que se deben a interacciones entre los grupos R: 1. Puentes de hidrógeno entre los grupos R de las subunidades de aminoácidos 2. Atracción iónica o electrostáticas entre los grupos R con cargas positivas y con cargas negativas. 3. Interacciones hidrófobas derivadas de la tendencia de los grupos R no polares para asociarse hacia el centro de la estructura globular, lejos del líquido que los rodea. 4. Los enlaces disulfuro, que son covalentes (-S-S-), unen los átomos de azufre de dos subunidades de cisteína. Estos enlaces pueden unir dos porciones de una misma cadena o dos cadenas distintas ESTRUCTURA CUATERNARIA Está representada por el acoplamiento de varias cadenas polipeptídicas, iguales o diferentes, con estructuras terciarias (protómeros) que quedan autoensambladas por enlaces débiles. Esta estructura no la poseen, tampoco, todas las proteínas. Algunas que sí la presentan son: la hemoglobina y los enzimas alostéricos. Dominios de las proteínas Plegamientos en proteínas Motivos estructurales Estructura cuaternaria de la Hb Estructuras de las proteínas Conclusiones