“製造方法”の特許問題としてお尋ねですが、BあるいはB'なる物質が、製品 を分析して検出可能であって製法を判別するのに有効であれば、製法特許で はなく、製品特許として捉えた方が適切と思います。 製品を分析して判るものとした場合、御社の製法の特徴は、Bではなく、B'を 添加することであり、また、B'はその分野で当該目的で使われていないとすれ ば、御社の製品はZ社特許に抵触しないように思います。 ご質問では、御社の製品にCが含まれるか記載がありませんが、製品を分析し てCあるいはCと同様の性質の物質が含まれるのであれば、抵触の可能性が高く なりそうです。 これ以上については、当該技術分野の専門家や特許の専門家に判断を求める 必要があるものと思います。 なお、B及びB'なる物質が、製品を分析しても検出不可能（本来の意味の製 法特許）であれば、御社が製法を完全に秘密にしておけば、Z社から訴えら れる可能性は低いでしょう。

専門家ではないので確実な事は言えませんが。。。 その特許の内容にもよるんじゃないですかね。 例えば、「酸化防止剤を添加する事が画期的」な技術なのであれば、 酸化防止剤が何であれ抵触する可能性はあると思います。 ですが、「Bを含むCを添加」するという事が画期的なのであれば、 BとB'の類似性次第では、回避できる事になるんじゃないかと思います。 具体的にそれが何であるかはこういう場には書けないでしょうから、 弁理士さんなどに相談した方がよろしいのではないでしょうか。

特許の権利は、登録登録になってから初めて発生します。 公開のみでは権利の発生はありません。 後年Ｚ社が審査請求を行い登録になった場合、問題になるかもしれません。