ARBOL 

FILOGENÉTICO DEL DOMINIO BACTERIA

DIVERSIDAD FILOGENÉTICA 
Tenericutes • SECUENCIA FIRMA    AAACUCAAA 
Fusobacteria Firmicutes presente en todos los organismos 
Gemmatimonadetes Actinobacteria
incluidos  en el dominio ( solo aparece    
Lentisphaerae Bacteroidetes en el 3% de Archaea  y nunca en 
Acidobacteria Eukarya ) 
Fibrobacteres

Verrucomicrobia Nitrospira

Gammaproteobacteria
Chlamydiae
Betaproteobacteria
Alphaproteobacteria Filo Proteobacteria 
Planctomycetes
Mitochondria
Cyanobacteria Deltaproteobacteria
Epsilonproteobacteria
Plastids

Chlorobi

Spirochaetes
Thermodesulfobacteria
Thermotogae
Chloroflexi Aquificae
Deinococcus–
Thermus

LUCA
Last Universal Common Ancestor)

Origin of life
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

FILO PROTEOBACTERIAS  (Linaje evolutivo)
αβγ
•BACTERIAS FOTOTRÓFICAS ROJAS
•BACTERIAS QUIMIOLITOTROFAS
•BACTERIAS METANOTROFAS y  METILOTROFAS
•GRUPO DE Pseudomonas
•BACTERIAS DEL ÁCIDO ACÉTICO
•BACTERIAS DEL GRUPO DE Rhizobium CATEGORIAS 
•ENTEROBACTERIAS FUNCIONALES 
•Vibrio y Photobacterium (Vibrionaceas)
•Pasteurella y Haemophilus (Pasteurellaceas)
•Proteobacterias Patógenas: Neisseria, Legionella, Brucella, Bordetella
•RIQUETTSIAS
•BACTERIAS CON VAÍNA 
•BACTERIAS ESPIRILADAS Y CURVADAS 
•BACTERIAS GEMANTES y/o CON APÉNDICES 

•BACTERIAS REDUCTORAS DEL SULFATO y DEL AZUFRE  
•Bdellovibrio
•MIXOBACTERIAS                        DELTA PROTEOBACTERIAS LINAJES  δ ε
EVOLUTIVOS 
‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐
•Campylobacter, Helicobacter EPSILON PROTEOBACTERIAS 
CATEGORÍA FUNCIONAL 
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

GRUPO DE Pseudomonas

Morfología : Bacilos Gram negativos , flagelación polar
Fisiología : Quimiorganotrofos aerobios. Gran versatilidad nutricional. Degradan 
gran número de sustratos . No realizan fermentaciones (salvo 
excepciones). Algunos producen pigmentos amarillo verdoso, azul….,  
oxidasa positivo.
Varios subgrupos (fluorescente, acidovorans, etc) .

Hábitat : Aguas , suelos , aguas residuales ,  plantas (especies fitopatógenas),      
patógenos oportunistas de animales y del  hombre 

Papel ecológico: Importante en aguas y suelos donde degradan una amplia  variedad 
de compuestos   orgánicos ( restos de animales y plantas, recalcitrantes,   
xenobióticos y  otros tóxicos). MINERALIZACIÓN y BIORREMEDIACIÓN . 
Especies de interés industrial , importantes en experimentación (biofilms)
Géneros representativos : Pseudomonas, Conmamonas , Ralstonia, Burkholderia, 
Zooglea, Zymomonas, Xhantomonas
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Pseudomonas ( subgrupo fluorescente)

Pseudomonas aeruginosa
‐ Bacilo piociánico  (azul)
‐ Bacteria del suelo (desnitrificante)
‐ A veces patógeno oportunista (infecciones 
supurativas  de tracto respiratorio y urinario)
‐ Infecta quemaduras (hospitales)
‐ Resistencia a antibióticos (Plásmido R)
Pseudomonas  aeruginosa. 
Fluorescencia  a la luz UV
Pseudomonas fluorescens
‐ Crece a 4º C
‐ Deterioro de leche, carne, huevos y mariscos (degrada lípidos y proteínas)
‐ Degrada restos vegetales y animales en suelos y ambientes acuáticos, también  compuestos recalcitrantes 
como, Tolueno, Xilol,  Alcanfor y otros (Plásmidos conjugativos)
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Burkholderia

‐ Acumula PHB
‐ Utiliza hasta 100 sustratos orgánicos
diferentes: Ácidos grasos, Azúcares,
Polialcoholes. Compuestos aromáticos,
Aminoácidos, etc  (Biorremediación)

‐ Patógeno  oportunista (contaminación de material 
hospitalario. Infecciones respiratorias)
‐ Patógeno de plantas (podredumbre de la cebolla)

Burkholderia cepacia MINERALIZACIÓN

Genes nodulación .Simbiosis leguminosas

Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Zooglea

‐ Bacteria acuática 
‐ Forma un polímero extracelular que permite la agregación.
‐ Actúa como sustrato al que se adhieren otros 
microorganismos, protozoos, y otras bacterias presentes en su 
medio
‐ Principal componente de los lodos o fangos activados de las 
EDAR (fase aerobia de la depuración )
‐ Permite la formación de flóculos compactos que  sedimentan 

Zooglea ramigera
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

TRATAMIENTO DE AGUAS RESIDUALES : PROCESO GLOBAL

TRATAMIENTO PRIMARIO: NO BIOLOGICO.    
SEPARACIÓN FÍSICA  DE LOS SÓLIDOS SEDIMENTABLES
Eliminación de material en forma de partículas  insolubles mediante  
cribado, sedimentación, adición de agentes coagulantes y otros.
Elimina  del 20‐30% de la DBO

TRATAMIENTO SECUNDARIO :TRANSFORMACIÓN  BIOLÓGICA DE LA MATERIA 
ORGÁNICA DISUELTA  EN BIOMASA MICROBIANA Y CO2
Filtros de goteo, LODOS (FANGOS) ACTIVADOS ,  lagunas  y 
digestores anaeróbicos.

Elimina del 90‐95% de la DBO y muchas bacterias patógenas

TRATAMIENTO TERCIARIO: ELIMINACIÓN QUÍMICA DE CONTAMINANTES 
materia orgánica no biodegradable , metales pesados y minerales.
A veces eliminación biológica de sales de Nitrógeno (Desnitrificación) y 
compuestos de fósforo.
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

AGUAS RESIDUALES  CLARIFICADOR (TANQUE DE 
(Tanques de aireación) SEDIMENTACIÓN)

FLÓCULOS FILAMENTOSOS NO 
SEDIMENTABLES (predominio de bacterias  FLÓCULOS COMPACTOS SEDIMENTABLES
filamentosas , Sphaerotilus, Tiothrix, 
(predominio de Zooglea)
Beggiatoa, entre otras)
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

PROCESOS AERÓBICOS DEL TRATAMIENTO DE AGUAS RESIDUALES : 
FANGOS ACTIVADOS

A.R. tras  el tratamiento primario

TANQUE DE SEDIMENTACIÓN ( CLARIFICADOR)

Efluente claro

Fango activado

TANQUE DE AIREACIÓN

Aire

Retorno del  fango activado Exceso de fango
(inóculo) Digestor anaeróbico  
de fango
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Xhantomonas :
X. campestris y otras especies producen polímeros extracelulares (polisacáridos) , Xantanos  o gomas 
xantanas. 
Especies  parásitas de plantas (X. citri )  producen lesiones necróticas.

XANTANOS
• Polímeros de alta viscosidad (PM aprox. 200000)
•Estable en condiciones físicas y químicas extremas con propiedades similares a un plástico.
•Utilización : agentes estabilizantes, emulsificantes y espesantes
En la industria petrolera (disminuye viscosidad)
En industria alimentaria: bebidas, jugos de fruta y aderezos de ensaladas, pasta de dientes..
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Zymomonas
• Única especie fermentadora del grupo
• Fermentación alcohólica a partir de azúcares, ágave, caña de azúcar, miel y melazas.
• Muy tolerante a elevadas concentraciones de azúcares y de alcohol
• Deteriora zumos y cerveza asociada a las bacterias del ácido acético
• Producción de bioetanol a partir de residuos lignocelulósicos
• Muy utilizada en industria en Ámerica, Africa y Asia

Z. mobilis 
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

ESPECIES  FITOPATÓGENAS

• MANCHAS Y QUEMADOS: 
Quemado del tabaco Pseudomonas syringae. 
Manchado del grano de arroz Xanthomonas campestris.
GRUPO PSEUDOMONAS 

• MARCHITAMIENTO VASCULAR:
Quemado de perales y manzanas Erwinia amylovora
Moko del plátano Pseudomonas solanacearum
• PODREDUMBRES BLANDAS:
En patata, pepino… Erwinia carotovora
Amargor de la cebolla Burkholderia cepacia
• ULCERACIONES: 
Chancro de frutas con pepita Pseudomonas syringae
CATEGORÍA FUNCIONAL 
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

BACTERIAS DEL ACIDO ACÉTICO

Morfología : Bacilos Gram negativos aerobios, Móviles por flagelos. Son alfa Proteobacterias

‐Fisiología : Realizan oxidación incompleta de alcoholes/azúcares acumulando ácidos 
orgánicos como productos finales
Etanol Ac. Acético
Glucosa Ac. Glucónico
Galactosa Ac. Galactónico
Arabinosa Ac. Arabinónico

Toleran muy bien la acidez (pH<5)
Hábitat : sidra, vino, …….
Interés industrial : producción de Ac. Orgánicos y vitamina C
Géneros representativos: Acetobacter, Gluconobacter
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Acetobacter

Producción de vinagre 

Acetobacter aceti en un medio con Carbonato Cálcico y etanol. La

zona clara alrededor de las colonias se debe a la disolución del
Carbonato por el ácido acético producido por la bacteria

CH3CH2OH CH3CHO CH3COOH

Etanol Acetaldehído Ácido acético

Oxidación del etanol
Además oxida Glucosa, Galactosa y Arabinosa 
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

BIOTRANSFORMACION
Acido Ascórbico

Acetobacter suboxydans

PRODUCCIÓN  DEL ACIDO ASCORBICO (VITAMINA C)
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Schizosaccharomyces yeast cells in a culture of "Kombucha" tea. Acetobacter (purple) is rod‐

shaped, Gram‐negative and motile. It is one of the acetic acid bacteria. Schizosaccharomyces
(oval) is a yeast fungus. The bacteria & fungi are in a cellulose matrix (strands). These bacteria &
yeast cells are used in the making of Kombucha, a fermented tea originating from Russia. Strong
tea sweetened with sugar has a culture of the bacteria and yeast added to it. The tea ferments
and is thought to have health giving properties. Magnification: x2770.

Matriz exterior de celulosa  
producida por la bacteria 

Schizosaccharomyces  pombe

Acetobacter
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Gluconobacter oxidans Obtención de Gluconatos a partir de glucosa

UTILIDADES  
•Regular acidez en alimentos 
•Eliminar depósitos calcáreos /óxidos , productos limpieza
•Industria textil y papel 
•Tratamientos de deficiencias nutritivas en el ser humano (gluconatos  de Fe y Calcio)
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

BACTERIAS FIJADORAS DE NITRÓGENO (GRUPO DE Rhizobium )

CATEGORÍA FUNCIONAL 

Azotobacter vinelandii Rhizobium melliloti
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

•FIJADORES DE VIDA LIBRE
Morfología: Bacilos grandes (diámetro de 2‐4 micras) con cápsula o “slime” en medios 
con carbohidratos. Forman cistos.
Fisiología: Fijación del Nitrógeno atmosférico. Tasa respiratoria elevadísima.
Hábitat : Viven en suelos alcalinos.
‐ Papel ecológico : Ciclo del Nitrógeno. Poca eficacia (fijan 0,3 Kg N2 /Ha / año ) pero amplia 
distribución. 
‐ Géneros representativos: Azotobacter,Azospirillum, Azomonas, Beijerinkia, Derxia y otras No 
Proteobacterias, pertencientes a Gram +, Arqueas y Cianobacterias

•FIJADORES EN SIMBIOSIS (Rizobios)
Morfología : Todos son alfa‐Proteobacterias, Bacilos Gram ‐ , móviles y aerobios  en vida libre. 
Forman capas de mucílago. En simbiosis se transforman .
Fisiología : Fijación del Nitrógeno atmosférico. Utilizan fuentes de Carbono muy  variadas
Hábitat : Establecen simbiosis con plantas leguminosas, mayoritariamente. La infección de las 
plantas conduce a la formación de Nódulos en raíces o tallos.
‐Papel ecológico : Ciclo del Nitrógeno .
‐Géneros representativos Rhizobium, Bradyrhizobium, Sinorhizobium, Azorhizobium
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

FIJADORES DE VIDA LIBRE

Azotobacter vinelandii.  Beijerinckia (vive en suelos ácidos )

a) células vegetativas b) Cistos

• Bacteria capsulada de suelos alcalinos . Aerobia
• Forma cistos  (formas de resistencia  frente a desecación,  UV, y ruptura mecánica, pero  no  al calor)
• A. chroococcum ,  Nitrogenasa con Vanadio y/o Magnesio (Alternativas)

CICLO DEL NITRÓGENO
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

ESTRATEGIAS DE PROTECCION DE LA NITROGENASA

Fijadores de vida libre:

•Producción de material mucilaginosos en elevadas cantidades a partir de azúcares para evitar        
la difusión del Oxígeno. 
•Tasa respiratoria muy elevada, para  consumir el Oxígeno a nivel de la membrana. 
•Cadenas transportadoras de electrones muy ramificadas.
para evitar el desequilibro entre  los niveles de ATP/ADP como consecuencia de esta tasa 
respiratoria ( pequeños saltos energéticos que rinden poca cantidad de ATP).

EFICACIA DE FIJACIÓN

•Azotobacter  necesita 100 g de azúcares /gramo de nitrógeno fijado, por lo que sólo  fijan 0.3 Kg de 
Nitrógeno /hectárea / año. 

•El nitrógeno fijado se incorpora  en las moléculas de la propia bacteria.

•Compensan su baja eficacia con una  distribución casi universal. 

•Se desarrollan en la rizosfera y  producen hormonas que estimulan la formación de pelos radicales, lo 
que aumenta la captación de nutrientes.
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

a b FIJADORAS EN SIMBIOSIS

Vida libre  Bacteroide

Rhizobium leguminosarum Rhizobium melliloti
Nódulos en la raíz de una leguminosa

• Establecen simbiosis específicas con leguminosas: lenteja, guisante, trébol, alfalfa
• Forman nódulos  en raíces donde se transforman en  Bacteroides que fijan el Nitrógeno 
atmosférico  (Simbiosis mutualista)
•En vida libre NO FIJAN NITRÓGENO
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

FIJACIÓN DE NITRÓGENO: reacción global

N2 +  8 H+ +  8 e‐ +  16  Mg‐ATP

NITROGENASA

2NH3 +  H2 + 16 Mg – ADP  + 16 Pi

(RECORDAR)
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

EL COMPLEJO DE LA NITROGENASA

COMPLEJO NITROGENASA

PM
PM
55 ‐ 66 103
220‐–270. 103

2 at 2 
4 
Mo /   mol subunidades subunidades
Nitrogenasa 
Nitrogenasa reductasa

22 ‐–24 at Fe /  Vida aerobia 4 at.

mol Vida aerobia 
5 ‐ 10 min 1 sg Fe / mol
4 at
COMPONENTE I:  S / mol
MOLIBDOFERROPROTEÍNA
DINITROGENASA COMPONENTE II : FERROPROTEÍNA
DEHIDROGENASA REDUCTASA
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

FUNCIONAMIENTO DE LA NITROGENASA

Fd oxidada FeMo‐cofactor

Fd reducida
8e‐

nMg‐ATP

nMg‐ADP + nPi
C2H2 + 2H+
C2H4
DEHIDROGENASA REDUCTASA DINITROGENASA
(Ferroproteína) (II) (Molibdoferroproteína) (I)
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

CICLO  DE ÓXIDO‐REDUCCIÓN DEL NITRÓGENO

FIJADORAS DE VIDA LIBRE
Azotobacter,Azospirillum, 
Azomonas, Beijerinkia, Derxia
………………..

FIJACIÓN DEL  FIJADORAS EN SIMBIOSIS 
NITRÓGENO Rhizobium, Bradyrhizobium, 
Sinorhizobium, Azorhizobium …….
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Agrobacterium

• Bacteria del grupo de los rizobios, NO fijadora de nitrógeno
• Especie fitopatógena
• Provocan la aparición de tumores en plantas ( agallas ) y raíces pilosas
• Lleva a cabo un proceso de transformación natural por la presencia del plásmido Ti (Inductor de 
tumores)
• Ti se utiliza como vector para la transformación de plantas : resistencia a insectos, a herbicidas              
( Biotecnología vegetal). 
•Agrobacterium  tumefaciens,  A. rhizogenes (Ri)

Agallas en plantas infectadas por A. tumefaciens.

Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

Plásmido Ti de A. tumefaciens

T‐ DNA ( 20 Kpb) : Región que se transfiere a la planta
(onc : oncogenes, ops: genes de síntesis de opinas)

Genes de transmisibilidad

Genes vir Genes para el catabolismo de las 
opinas 

Plásmido Ti (200 Kpb)

Opinas: aminoácidos modificados producidos por células transformadas , (octopina, nopalina).
Fuente de C, N, fosfato para la bacteria.
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

MECANISMO DE TRANSFERENCIA  DEL T‐DNA
Adhesión de la 
bacteria a la  A B Corte de una 
herida sola cadena
Compuestos fenólicos

MP de la 
bacteria
Endonucleasa

Transcripción de 
otros genes Vir. Vir 
C, Vir D
Inserción en el  ADN de 
Vir E, Vir B
la planta y producción 
de Hormonas y Opinas

Proteína de unión a cs
MP de la célula vegetal

Bacteria
C D
 Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

PRODUCCIÓN DE PLANTAS TRANSGÉNICAS MEDIANTE UN VECTOR BINARIO 

Plásmido Ti  Transferencia a  PLANTA

Región movilizada
desarmado   Células de plantas TRANSGÉNICA 
DNA foráneo
Cromosomas
R+  D‐Ti
Kanamicina

Transferencia 
Origen por conjugación
A. tumefaciens Nucleus
Origen E. coli
R+ Espectinomiciana E. coli A. tumefaciens
Plant cell

Vector de clonación                        +                                   Plásmido colaborador (D‐ Ti)

Extremos t‐DNA (rojo)
DNA foráneo (amarillo)
Marcadores de resistencia  (verde)
Microbiología II: Biodiversidad de los microorganismos                                                                        Bloque 2.B            

PLANTAS TRANSGÉNICAS

Plantas transgénicas  de soja resistentes a  Plantas transgénicas  de tabaco resistentes a larvas 
herbicidas. Expresan el gen de resistencia al  de insectos .Expresan la toxina Bt
glifosato.
 PREGUNTAS

1. Hábitat y papel ecológico de las siguientes bacterias:
Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacea, Zooglea ramigera, Azotobacter vinelandii, 
Zymomonas, Rhizobium leguminosarum, Pseudomonas fluorescens, Xhantomonas
campestris, Agrobacterium tumefaciens
2. Cite algunas patologías producidas por Pseudomonas
3. Interés industrial de las bacterias del acido acético
4. Defina biotransformación (en relación a un proceso industrial) 
5. Que induce la activación de los genes vir del plásmido Ti de Agrobacterium
6. Papel de los genes vir  A y vir D del plásmido Ti
7. De las especies  estudiadas diga cual/es son patógenos oportunistas y cuales fitopatógenas