Bioenergética

y tipos de
reacciones
bioquímicas

Nelson & Cox, introducción parte

2 y capítulo 13
Metabolismo
• Actividad celular altamente
coordinada, ejecutada por
enzimas (de forma
cooperativa).
• Propósitos:
• Obtención de energía
• Conversión de nutrientes en
moléculas propias
• Construcción de
macromoléculas (polímeros)
• Sintetizar / degradar
biomoléculas requeridas
para funciones especiales
Nelson & Cox, 2021
Fuentes de energía y
carbono en los
organismos
• Organismos
autótrofos y
heterótrofos

¿Cuáles son las fuentes de energía

y carbono de los seres humanos?
¿Cómo se clasifican?

Nelson & Cox, 2013

Ciclos del carbono y del
nitrógeno Interdependencia
entre autótrofos y
heterótrofos

¡Equilibrio!

Nelson & Cox, 2013 y 2021

Metabolismo

• Metabolismo implica una serie de reacciones

catalizadas por enzimas, rutas metabólicas.
• Catabolismo: fase degradativa, libera energía y
electrones, es oxidativo.
• Anabolismo: fase biosintética, consume energía y
utiliza electrones, es reductivo.
• Metabolitos
• Moneda energética: ATP
• Acarreadores universales de electrones:
NAD+/NADH, NADP+/NADPH, FAD/FADH2
Oxidada/ Reducida Oxidada/ Reducida Oxidada/ Reducida

Nelson & Cox, 2013

Rutas
metabólicas
• Secuencia ordenada de reacciones,
catalizadas por enzimas, en la que el
producto de una reacción es el sustrato
de la siguiente.
• Son reguladas de manera coordinada y
recíproca (catabolismo y anabolismo).
• Regulación a diferentes niveles.
• Abarca cientos de reacciones, las rutas
centrales del metabolismo son
claramente similares entre todas (o casi
todas) las formas de vida.

Nelson & Cox, 2021

 Metabolismo,
organización de
rutas metabólicas
• Catabolismo: rutas convergentes.
• Anabolismo: rutas divergentes.
• Existencia de rutas cíclicas.
• Rutas metabólicas se localizan en
diferentes compartimentos
celulares.
• Implica la existencia de
mecanismos de transporte de
metabolitos y coenzimas entre
compartimentos, sistemas de
transporte tipo lanzadera o Nelson & Cox, 2021
transportadores específicos.
Regulación
metabólica
• Catabolismo y anabolismo transcurren
simultáneamente
• Metabolismo debe adaptarse a variaciones
nutricionales y fisiológicas.
• Requieren regulación coordinada y recíproca.
• Regulación de enzimas específicas.
• Actividades en compartimientos separados.
• Mecanismos diferentes.
• Niveles superiores de regulación (hormonal) en
organismos multicelulares.

Nelson & Cox, 2013

Análisis del metabolismo

En la medida en que estudiemos cada ruta metabólica, será importante

preguntarse

¿Dónde encaja esta reacción en el metabolismo general?

¿Cómo se conecta esta ruta con otras que transcurren

simultáneamente en la misma célula para producir energía y productos
celulares necesarios para crecer y sobrevivir?
¿Cuál sería el impacto en los defectos de funcionamiento de esta
enzima o ruta metabólica?
Energía
• Organismos ejecutan trabajo biológico para mantenerse vivos
aprovechando y canalizando toda forma de energía disponible.
• Realizan amplia variedad de transducciones energéticas,
¿mecanismos?
• Antoine Lavoisier (1743-1794) reconoce que la respiración es la combustión
de compuestos carbonados.
• Transducciones energéticas celulares responden a las mismas leyes
físicas y químicas que gobiernan el universo.
• Característica única: regulación exquisita y sensible que emplea diversos
mecanismos para responder a cambios en circunstancias internas / externas
de la célula y el organismo.
Principios generales
• Transformaciones energéticas celulares se rigen por las leyes de la
termodinámica.
• El cambio de energía libre (ΔG) es la máxima energía que puede obtenerse de
una reacción química para realizar trabajo biológico.
• Las múltiples reacciones que ocurren en la biósfera pueden agruparse en
pocos tipos de reacciones.
• El ATP es la moneda universal de energía.
• Las reacciones de óxido – reducción proveen, indirectamente, energía para la
síntesis de ATP.
• Las células regulan la actividad de sus enzimas para responder a los cambios
internos celulares.
Bioenergética

Estudio cuantitativo de las

transducciones energéticas celulares y
la naturaleza y función de estas
transducciones energéticas.
Transducción energética:
transformaciones energéticas que
ocurren en los organismos. Se rigen
por las mismas leyes físicas y químicas
que gobiernan el universo.
Termodinámica

Parte de la física que estudia la

acción mecánica del calor y las
restantes formas de energía.
Describe cambios de energía
observados en las reacciones
químicas, incluyendo
reacciones químicas celulares.

Leyes de termodinámica: reglas

físicas sobre la transferencia
de energía.
Primera ley de
termodinámica
• Principio de conservación de la energía.
Ante cualquier cambio físico o químico la
energía del universo permanece
constante, puede cambiar de forma o de
lugar, pero no se crea ni destruye.

• ¿Cómo cumplen las células esta ley?

Alberts, 2008
 Segunda ley de
termodinámica
• En todos los procesos naturales, la entropía del
universo aumenta.
• Entropía: expresión cuantitativa del grado de
aleatoriedad o desorden de un sistema.
• ¿Características de todos los organismos vivos?
• ¿Cómo cumplen las células la segunda ley de
termodinámica?
• Células, sistemas abiertos que constantemente
intercambian materia y energía con su entorno, sin
alcanzar nunca el equilibrio con éste.
• Si los productos de una reacción son más sencillos
y menos organizados que los reactivos, la entropía
aumenta

Alberts, 2008
Fuentes de energía celulares
• Células sistemas isotérmicos, no pueden emplear cambios de T como
fuente de energía.
• Energía usada por las células, energía libre de Gibbs, permite:
• Predecir dirección en que transcurre una reacción química (hacia productos o
reactivos)
• Punto de equilibrio (punto en que velocidad de formación de reactivos y productos
es igual, no hay cambio neto)
• Cantidad de trabajo que se puede realizar con dicha reacción.
• Organismos quimioheterótrofos obtienen energía por oxidación de
nutrientes.
• Organismos fotoautótrofos obtienen energía por fotosíntesis.
Cantidades termodinámicas
• Energía libre de Gibbs, G: cantidad de energía que puede emplearse
para realizar un trabajo durante una reacción a temperatura y
presión constantes.
• Entalpía, H: calor contenido en el sistema que reacciona. Refleja el
número y tipo de enlaces químicos en reactivos y productos
• G y H se expresan en J/mol o cal/mol
• Entropía, S: expresión cuantitativa del grado de desorden de un
sistema.
• S se expresa en J/mol*K o cal/mol*K
• G = H - TS (donde T representa la temperatura absoluta, K)
 • Cambio de energía libre de Gibbs,
Cantidades ΔG: diferencia de G entre productos
y reactivos al finalizar una reacción.
termodinámicas • ΔG = ΔH – T*ΔS
• ΔG es negativo, reacción
exergónica, libera energía al
entorno (productos tienen menos
energía que reactivos), la reacción
procede de manera espontánea.
• ΔG es positivo, reacción
endergónica, requiere energía para
llevarse a cabo (productos tienen
más energía que reactivos)

• Cambio de entalpía, ΔH
• ΔH negativo, se liberó calor al entorno,
reacción exotérmica (menor calor en
productos).
Ferrier, 2018 • ΔH positivo, captación de calor del
entorno, reacción endotérmica (menor
calor en reactivos).
Relación entre ΔG y Keq • Equilibrio de la reacción
• Constante de equilibrio de una
reacción Keq: concentración
molar de reactivos y productos
observados al equilibrio.

• La tendencia de una reacción a

alcanzar el equilibrio es la fuerza
que favorece la transformación,
su magnitud de se expresa como
ΔG
• El valor de Keq puede ayudar a
predecir si una reacción es
exergónica (ΔG negativo), o
endergónica (ΔG positivo)
Nelson & Cox, 2013
Relación entre • ¿Concentración de reactivos y productos?

ΔG y Keq • ¿Está la reacción al equilibrio?

Condición estándar: condiciones controladas de reacción que implican concentración 1 M de

reactivos y productos, T de 25°C (298 K), presión 1 atm.

Ferrier, 2018
 ΔG°: Cambio de energía libre a condiciones
«estándar», controladas en laboratorio. Implica
H+ 1M = pH 0 concentración 1M reactivos y productos, 298K (25°C)
y 1 atm, depende de Keq. Constante

Además, considera ΔG’°: Cambio de energía libre a condiciones

[H2O] = 5.55 M y «estándar transformadas» (adaptadas a la
[Mg2+] = 1 mM Bioquímica), las mismas condiciones anteriores, pero
(constante) [H+] = 10-7 M que implica pH = 7. Constante

ΔG: Cambio de energía libre real, implica condiciones

celulares de concentración de reactivos y productos
Formas de (Q o cociente de acción de masas), T celular.
Variable
expresar ΔG
Calculando ΔG’° para una reacción
química
• ΔG’° depende de concentración (molar) de reactivos y productos
cuando la reacción se encuentra al equilibrio, emplea el valor de Keq.

R: constante de los gases, 8.315 J/mol*K

• Convenciones empleadas en Bioquímica:

• En análisis de reacciones bioquímicas, cuando H+, H2O y/o Mg2+ son reactivos o
productos en la reacción, sus concentraciones no son incluidas en las
ecuaciones
Nelson & Cox, 2021
Valores de
ΔG’° para
reacciones
importantes
del
metabolismo

Nelson & Cox, 2013

Calculando ΔG

Nelson & Cox, 2021

• ¿Qué representa ΔG?
• Cambio real de energía libre a condiciones celulares (lejanas al equilibrio)

• Para calcular ΔG se toma en cuenta la concentración celular de reactivos

y productos (molar), la temperatura de la célula (en K) y el valor de ΔG’°
• Emplea el cociente de acción de masas Q
• Q = [productos] / [reactivos]
Reacciones secuenciales
• Para reacciones secuenciales, cada
reacción posee su valor de Keq y ΔG’° o ΔG
propios.
• Los valores de ΔG’° o ΔG son aditivos para
reacciones secuenciales, permiten obtener
el valor de ΔG’° o ΔG global.
• Considere las siguientes reacciones
secuenciales y establezca el valor de ΔG’°
global de la reacción.
• Las reacciones pueden «acoplarse»
respondiendo a las necesidades celulares Nelson & Cox, 2021
 Reacciones
acopladas
• ¿Qué estrategia emplea la
célula para promover que
transcurran reacciones
que NO son Ferrier, 2018
termodinámicamente
favorables?
• Acopla reacciones
exergónicas con
reacciones endergónicas,
favoreciendo la reacción
global.
Nelson & Cox, 2013
Reacciones
acopladas
• ¿Qué sucede cuando solo
conozco los valores de Keq para
dos reacciones acopladas?

• Los valores de Keq se multiplican

para obtener la Keq global, luego
se calcula ΔG’° global
• Otra opción es calcular ΔG’° de
cada reacción a partir de su valor
de Keq, y luego realizar la suma
algebraica de dichos valores.
Nelson & Cox, 2013
Reacciones favorables

• Que una reacción sea favorable no implica que se lleve a cabo a

la tasa que la requiere la célula

• El ΔG de una reacción es independiente de la ruta de la

reacción, depende de la naturaleza y concentración de reactivos
y productos.

• Participación de las enzimas en reacciones celulares.

Lógica de las reacciones
Bioquímicas
• Las reacciones químicas que se llevan a cabo en los sistemas
biológicas se determinan por:
• Su relevancia para un sistema metabólico en particular
• Su tasa o velocidad
• Una reacción relevante es la que emplea un sustrato disponible y lo
convierte en un producto útil.
• Las reacciones empleadas por las células son una «caja de
herramientas» empleada por la evolución para permitir que transcurran
aquellas reacciones que, desde el punto de vista termodinámico,
parecieran imposibles de realizar.
Lógica de las reacciones
Bioquímicas
• Gran cantidad de reacciones bioquímicas,
mantenimiento de patrones comunes en
la «química de la vida».
• El rompimiento de enlaces covalentes
puede seguir dos patrones:
• Homolítico: cada átomo conserva un electrón
(e-), se forman especies radicales.
• Heterolítico: un átomo retiene los 2 e-
adquiriendo carga negativa, el átomo que
pierde los e- adquiere carga positiva.
Nelson & Cox, 2013
Lógica de las reacciones
Bioquímicas
• Muchas reacciones bioquímicas implican
participación de nucleófilos y electrófilos.
• Nucleófilos: grupos funcionales ricos en
electrones, capaces de donarlos.
• Electrófilos: grupos funcionales deficientes en
electrones, buscan obtenerlos.

Nelson & Cox, 2013

Principales tipos de
reacciones metabólicas
• Formación y rompimiento de enlaces carbono –
carbono
• Rompimiento heterolítico, formación de carbocatión
(C+) y carbanión (C-)
• Carbocationes y carbaniones inestables, requieren
grupos funcionales con átomos electronegativos
(O, N) para su formación, carbonilo e imino los más
comunes
• Muchas reacciones metabólicas implican
formación de un carbonilo en posición próxima al
sitio de rompimiento.
• Un C- también puede formarse por eliminación de
un buen «grupo saliente» como pirofosfato
Nelson & Cox, 2013
Principales tipos de reacciones metabólicas
• Reorganizaciones internas, isomerizaciones y eliminaciones
• Rearreglos intramoleculares con redistribución de electrones y sin modificar el estado de
oxidación de la molécula, solo de los átomos involucrados.
• También implica cambio en posición o rearreglo cis – trans de dobles enlaces.
• Reacciones de radicales libres
• Resultado de rompimiento homolítico
• Incluye isomerizaciones y descarboxilaciones iniciadas por una especie radical, reacciones de
algunas reductasas y algunos rearreglos.

Nelson & Cox, 2013 y 2021

Principales tipos de
reacciones metabólicas
• Transferencia de grupos
• Transferencia de grupos acilo, glucosilo y fosforilo muy
común.
• Unión de un «buen grupo saliente» a un intermediario
metabólico para «activarlo» para la siguiente reacción,
reacción muy común, fosfato inorgánico.
• Reacciones de óxido – reducción (redox)
• Transiciones entre estados de oxidación del C son
importantes en el metabolismo
• Papel de deshidrogenasas, oxidasas.
• Reconocimiento donador y aceptor de electrones en la
reacción

Nelson & Cox, 2013

Nelson & Cox, capítulo 13

TRANSFERENCIA DE GRUPOS
FOSFORILO Y ATP
ACARREADORES DE ELECTRONES
 CICLOS DE ENERGÍA
CELULARES
• Adenosina trifosfato (ATP), moneda de
energía que enlaza catabolismo y
anabolismo
• Energía obtenida por reacciones catabólicas
es empleada para sintetizar ATP, molécula
que aporta energía a las reacciones
anabólicas.
• En algunas ocasiones ATP dona energía a
procesos endergónicos celulares para
favorecer que procedan según las
Alberts et al, 2008 necesidades celulares
ATP: CAMBIO DE ENERGÍA
LIBRE GRANDE Y NEGATIVO
• Liberación de repulsión electrostática por hidrólisis del
enlace fosfoanhidro de fosfato γ (también β) y
estabilización del producto por resonancia
• Diferencias en ΔG’° (- 30.5 kJ/mol) y ΔG (variable) de
hidrólisis de ATP dependen de variabilidad de
concentraciones de ATP, ADP y Pi en diferentes tipos
celulares. ΔG de hidrólisis de ATP llamado potencial
de fosforilación o ΔGp, es diferente entre células.
• Reacciones en que participa ATP requieren Mg2+
como cofactor, enzimas quinasas.
Nelson & Cox, 2013
 • Depende de concentración celular
POTENCIAL DE • Tarea: calcular el valor de ΔGp para los cinco tipos celulares

FOSFORILACIÓN contemplados en la tabla 13-5, comparar los valores.

• ¿Qué elementos es necesario conocer para resolver la tarea?
ΔGp • Concentraciones M, temperatura, reacción de hidrólisis de ATP
• ¿Por qué algunos tipos celulares generan más ATP que otros?
• Entregar para el próximo día de clase.

Nelson & Cox, 2013

 ENERGÍA DEL ATP PROVIENE
DE TRANSFERENCIA DE
GRUPO
• Hidrólisis de ATP libera calor, acoplamiento de
hidrólisis de ATP a impulso energético de
reacciones endergónicas implica transferencia
temporal de grupo (Pi, PPi o AMP) para formar
intermediario, energizándolo (reacción de dos
pasos)
• Pi, PPi y AMP, «buenos grupos salientes» que al
ser desplazados favorecen las transformaciones en
las que participan.
• Algunos procesos sí implican únicamente
hidrólisis de ATP (ej. proteínas G monoméricas)
Nelson & Cox, 2013
OTROS COMPUESTOS CON ALTA ENERGÍA DE HIDRÓLISIS
• Fosfoenolpiruvato (PEP), hidrólisis de
enlace éster fosfato, genera piruvato
estabilizado por tautomería.
• 1,3 bifosfoglicerato, hidrólisis de enlace
fosfoanhidro, producto estabilizado por
resonancia.
• Fosfocreatina, liberación de Pi, se
estabiliza por resonancia.
• Acetil coenzima A (acetil CoA),
rompimiento de enlace tioéster, liberación
de acetato estabilizado por resonancia.
• Compuestos fosfatados se dividen en alta
energía de hidrólisis (ΔG’° - 25 kJ/mol o
más negativo), y baja energía de
Nelson & Cox, 2013
hidrólisis.
¿QUÉ HACE QUE LAS REACCIONES DE ESTOS
COMPUESTOS LIBEREN TANTA ENERGÍA?
• Reacciones de hidrólisis de compuestos fosfato de alta energía y tioésteres presentan
valores de ΔG’° muy negativos que son altamente exergónicos.
• Razones
• Se libera la repulsión electrostática que se observa en el sustrato (ej. hidrólisis de ATP).
• Los productos de la reacción son estabilizados por ionización (ej. ATP, acilfosfatos, tioésteres).
• Los productos de reacción son estabilizados por isomerización o tautomerización (ej. PEP)
• Los productos de reacción son estabilizados por resonancia (ej. creatina, carboxilato liberado de
acilfosfatos y tioésteres).
• En todos los casos los productos son más estables que los sustratos que los generaron.
• Rompimiento de enlace fosfoanhidro en fosfato γ
libera grupo fosforilo (–PO32-) que se transfiere a
sustrato (reacción de dos pasos), y ADP. ΔG’° - 30.5
kJ/mol
DESPLAZAMIENTO
• Rompimiento de enlace fosfoanhidro en fosfato β NUCLEOFÍLICO EN ATP
libera pirofosforilo (PPi) que se transfiere al sustrato y
AMP, ΔG’° - 45.6 kJ/mol .
• El PPi liberado del sustrato es hidrolizado luego por
pirofosfatasa inorgánica ΔG’° - 19.2 kJ/mol
• Rompimiento enlace fosfoéster en fosfato α libera PPi
(que se hidroliza) y transfiere AMP al sustrato
(reacción de adenilación) ΔG’° - 45.6 kJ/mol (más
energía de hidrólisis de PPi)
• Debido a su alto rendimiento energético, reacciones
de adenilación son empleadas, con frecuencia,
como reacciones de activación de sustratos (ej.
activación de ácidos grasos para oxidación)
Nelson & Cox, 2013
PROCESOS QUE REQUIEREN ENERGÍA
Formación de polímeros con una secuencia específica (ADN, ARN, proteínas), energía permite
condensación de monómeros en un orden específico.

Transporte activo de solutos (ej. bomba Na+/K+)

Cambios en interacción actina – miosina, mediados por hidrólisis de ATP, que favorecen
contracción muscular y movimiento.

Generación de bioluminescencia, activación de luciferina por adenilación y su posterior

descarboxilación oxidativa por acción de luciferasa (recuadro 13-1).

Muchos otros más.

IMPORTANCIA • La célula requiere ATP como principal moneda
energética, pero también requiere los otros
DE ATP nucleótidos y desoxinucleótidos trifosfato, los cuales
FUENTES QUE son equivalentes energéticamente al ATP.

GARANTIZAN • Nucleótidos tri fosfato (ATP, CTP, UTP, GTP) y

desoxinúcleótido tri fosfato (dATP, dTTP, dCTP,
ADECUADA dGTP), cumplen otros roles biológicos.

DISPONIBILIDAD • ATP es producido principalmente por procesos

catabólicos (glucólisis, fosforilación oxidativa, entre
otros), sin embargo, existen reacciones enzimáticas
que permiten intercambio de ATP entre nucleótidos,
para aumentar la disponibilidad de ATP (y otros
nucleótidos trifosfato).
• Reacciones de translocación de grupos fosfato.
TRANSLOCACIONES DE
GRUPOS FOSFATO
• Reacciones reversibles catalizadas enzimáticamente Nucleósido difosfato quinasa

• Nucleósido difosfato quinasa, ubicua. Reacción de doble

desplazamiento (mecanismo tipo ping-pong), trabaja tanto
con NDPs como con dNDPs.
• Adenilato quinasa, disminuye concentración de ADP
acumulado por hidrólisis de ATP, reponiendo parcialmente Adenilato quinasa
ATP.
• Creatina quinasa, fosforilación de ADP a partir de
fosfocreatina (PCr), actúa en músculo Creatina quinasa

Nelson & Cox, 2013

COENZIMAS QUE • La primera parte de la sección 13.4 será revisada
ACTÚAN COMO junto al tema fosforilación oxidativa (capítulo19).
TRANSPORTADO • Coenzimas hidrosolubles NAD+/NADH,
RES NADP+/NADPH, FAD/FADH2, FMN/FMNH2,
UNIVERSALES DE participan en las múltiples reacciones de óxido –
reducción que se llevan a cabo en el catabolismo,
ELECTRONES reciben electrones y quedan, temporalmente
reducidas (reacción reversible).
• Conservan energía libre derivada de procesos
oxidativos
• Reacciones de óxido – reducción biológicas,
principal fuente de energía en organismos
quimioheterótrofos.
 • Mecanismo de acción similar a su
análogo dinucleótido de nicotinamida
DINUCLEÓTIDO DE NICOTINAMIDA y adenina fosforilado

Y ADENINA (NAD+/NADH) (NADP+/NADPH).

• También llamados nucleótidos de
pirimidina (por estructura de anillo
nicotinamida, derivado de niacina).
• Cosustratos solubles de enzimas
deshidrogenasas, se desplazan de una
enzima a otra realizando la reducción
reversible del anillo nicotinamida de
manera simultánea a la oxidación de
sustratos energéticos. Intercambian un
par de electrones al aceptar un ión
hidruro (:H-).
• Absorben luz UV a diferente longitud
de onda forma oxidada (NAD+) y
Nelson & Cox, 2013
reducida (NADH)
NUCLEÓTIDOS
DE FLAVINA • Flavoproteínas enzimas que catalizan
reacciones de óxido – reducción usando
el mononucleótido de flavina
(FMN/FMNH2) o el dinucleótido de
flavina – adenina (FAD/FADH2).
Flavina derivada de la riboflavina.
• Actúan como grupos prostéticos,
intercambian dos electrones en dos
pasos secuenciales, recibiendo un
electrón en cada paso y formando
especies radicales transitorias.
Nelson & Cox, 2013 • Actúan en conjunto con enzimas
deshidrogenasas.
ASOCIACIÓN DESHIDROGENASAS CON
COENZIMAS QUE TRANSPORTAN ELECTRONES
Cada enzima es específica para el tipo de coenzima con la cual trabaja.
En las tablas se presentan las principales enzimas asociadas a un tipo específico de cofactor
enzimático para reacciones redox.

Nelson & Cox, 2013